MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Desulfohalobium retbaense DSM 5692 chromosome

Total Repeats: 51711

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
41501	NC_013223	CTT	2	6	2299107	2299112	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
41502	NC_013223	TCT	2	6	2299153	2299158	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
41503	NC_013223	GA	3	6	2299195	2299200	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
41504	NC_013223	CA	3	6	2299233	2299238	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
41505	NC_013223	CA	3	6	2299306	2299311	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
41506	NC_013223	AGG	2	6	2299324	2299329	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
41507	NC_013223	GTCG	2	8	2299386	2299393	0 %	25 %	50 %	25 %	258406122
41508	NC_013223	GCT	2	6	2299731	2299736	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258406122
41509	NC_013223	TC	3	6	2299775	2299780	0 %	50 %	0 %	50 %	258406122
41510	NC_013223	CAA	2	6	2299900	2299905	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258406122
41511	NC_013223	CTT	2	6	2299913	2299918	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258406122
41512	NC_013223	CGA	2	6	2300017	2300022	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258406122
41513	NC_013223	AT	3	6	2300138	2300143	50 %	50 %	0 %	0 %	258406122
41514	NC_013223	CTGA	2	8	2300166	2300173	25 %	25 %	25 %	25 %	258406122
41515	NC_013223	TGG	2	6	2300313	2300318	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258406122
41516	NC_013223	TGC	2	6	2300362	2300367	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258406122
41517	NC_013223	AGA	2	6	2300375	2300380	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258406122
41518	NC_013223	CAA	2	6	2300435	2300440	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258406122
41519	NC_013223	GGGC	2	8	2300519	2300526	0 %	0 %	75 %	25 %	258406122
41520	NC_013223	TG	3	6	2300555	2300560	0 %	50 %	50 %	0 %	258406122
41521	NC_013223	A	6	6	2300574	2300579	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
41522	NC_013223	CCA	2	6	2300745	2300750	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
41523	NC_013223	TCT	2	6	2300790	2300795	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
41524	NC_013223	AGC	2	6	2300876	2300881	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
41525	NC_013223	AGC	2	6	2300885	2300890	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
41526	NC_013223	CCA	2	6	2300974	2300979	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
41527	NC_013223	TCAA	2	8	2300982	2300989	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
41528	NC_013223	A	6	6	2301072	2301077	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
41529	NC_013223	ATA	2	6	2301126	2301131	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
41530	NC_013223	CAAC	2	8	2301214	2301221	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
41531	NC_013223	ATC	2	6	2301223	2301228	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
41532	NC_013223	CA	3	6	2301323	2301328	50 %	0 %	0 %	50 %	258406123
41533	NC_013223	GT	3	6	2301451	2301456	0 %	50 %	50 %	0 %	258406123
41534	NC_013223	TAA	2	6	2301678	2301683	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	258406123
41535	NC_013223	CG	3	6	2301726	2301731	0 %	0 %	50 %	50 %	258406123
41536	NC_013223	CTG	2	6	2301746	2301751	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258406123
41537	NC_013223	ACT	2	6	2301768	2301773	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258406123
41538	NC_013223	CAG	2	6	2301776	2301781	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258406123
41539	NC_013223	CAG	2	6	2301815	2301820	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258406123
41540	NC_013223	A	6	6	2301829	2301834	100 %	0 %	0 %	0 %	258406123
41541	NC_013223	TGA	2	6	2301909	2301914	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
41542	NC_013223	G	6	6	2301926	2301931	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
41543	NC_013223	GAA	2	6	2301965	2301970	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
41544	NC_013223	GA	3	6	2301998	2302003	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
41545	NC_013223	GTT	2	6	2302015	2302020	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
41546	NC_013223	TGGG	2	8	2302059	2302066	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
41547	NC_013223	G	7	7	2302064	2302070	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
41548	NC_013223	TGG	2	6	2302074	2302079	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
41549	NC_013223	GAA	2	6	2302083	2302088	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
41550	NC_013223	CA	3	6	2302158	2302163	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
41551	NC_013223	GGCT	2	8	2302222	2302229	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
41552	NC_013223	T	6	6	2302335	2302340	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
41553	NC_013223	CCTT	2	8	2302420	2302427	0 %	50 %	0 %	50 %	258406124
41554	NC_013223	CGA	2	6	2302496	2302501	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258406124
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41557	NC_013223	ACA	2	6	2302576	2302581	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258406124
41558	NC_013223	CGC	2	6	2302609	2302614	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258406124
41559	NC_013223	CGC	2	6	2302656	2302661	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258406124
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41562	NC_013223	CGA	2	6	2303000	2303005	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258406124
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41570	NC_013223	GCA	2	6	2303687	2303692	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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41572	NC_013223	CGG	2	6	2303780	2303785	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
41573	NC_013223	AG	3	6	2303808	2303813	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
41574	NC_013223	GGCG	2	8	2303910	2303917	0 %	0 %	75 %	25 %	258406126
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41579	NC_013223	GCCCG	2	10	2304145	2304154	0 %	0 %	40 %	60 %	258406126
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41582	NC_013223	GCG	2	6	2304391	2304396	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258406126
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41589	NC_013223	TGC	2	6	2304858	2304863	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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41592	NC_013223	GCTGG	2	10	2305099	2305108	0 %	20 %	60 %	20 %	258406127
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41594	NC_013223	ACGCT	2	10	2305151	2305160	20 %	20 %	20 %	40 %	258406127
41595	NC_013223	CTG	2	6	2305186	2305191	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258406127
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41605	NC_013223	GGC	2	6	2305707	2305712	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258406127
41606	NC_013223	TCG	2	6	2305790	2305795	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258406127
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41612	NC_013223	GGA	2	6	2306292	2306297	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258406127
41613	NC_013223	CGT	2	6	2306340	2306345	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258406127
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41620	NC_013223	ATG	2	6	2306768	2306773	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258406127
41621	NC_013223	GCA	2	6	2306814	2306819	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258406127
41622	NC_013223	C	6	6	2306845	2306850	0 %	0 %	0 %	100 %	258406127
41623	NC_013223	GCC	2	6	2306885	2306890	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258406127
41624	NC_013223	GGC	2	6	2306908	2306913	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258406127
41625	NC_013223	CAA	2	6	2306929	2306934	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258406127
41626	NC_013223	CCA	2	6	2306964	2306969	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258406127
41627	NC_013223	ACC	2	6	2306987	2306992	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258406127
41628	NC_013223	ATC	2	6	2307114	2307119	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
41629	NC_013223	GGAT	2	8	2307175	2307182	25 %	25 %	50 %	0 %	258406128
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41633	NC_013223	GCT	2	6	2307469	2307474	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258406128
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41650	NC_013223	CTG	2	6	2308328	2308333	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258406129
41651	NC_013223	ACGCC	2	10	2308366	2308375	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
41652	NC_013223	GCC	2	6	2308635	2308640	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258406130
41653	NC_013223	CCCG	2	8	2308663	2308670	0 %	0 %	25 %	75 %	258406130
41654	NC_013223	GCG	2	6	2308690	2308695	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258406130
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41658	NC_013223	ACC	2	6	2308764	2308769	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258406130
41659	NC_013223	CCT	2	6	2308834	2308839	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	258406130
41660	NC_013223	CA	3	6	2308898	2308903	50 %	0 %	0 %	50 %	258406130
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41663	NC_013223	TC	4	8	2309083	2309090	0 %	50 %	0 %	50 %	258406130
41664	NC_013223	C	6	6	2309090	2309095	0 %	0 %	0 %	100 %	258406130
41665	NC_013223	GGC	2	6	2309429	2309434	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258406130
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41669	NC_013223	TCAT	2	8	2309583	2309590	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
41670	NC_013223	GAAA	2	8	2309641	2309648	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
41671	NC_013223	A	6	6	2309654	2309659	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
41672	NC_013223	GCA	2	6	2309688	2309693	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258406131
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41725	NC_013223	GCA	2	6	2311997	2312002	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258406131
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41728	NC_013223	CCA	2	6	2312114	2312119	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258406131
41729	NC_013223	T	7	7	2312165	2312171	0 %	100 %	0 %	0 %	258406131
41730	NC_013223	TGT	2	6	2312206	2312211	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258406132
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41732	NC_013223	TGCC	2	8	2312241	2312248	0 %	25 %	25 %	50 %	258406132
41733	NC_013223	GCA	2	6	2312392	2312397	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258406132
41734	NC_013223	G	6	6	2312513	2312518	0 %	0 %	100 %	0 %	258406132
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41736	NC_013223	GCG	2	6	2312556	2312561	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258406132
41737	NC_013223	CAG	2	6	2312589	2312594	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258406132
41738	NC_013223	GGCC	2	8	2312634	2312641	0 %	0 %	50 %	50 %	258406132
41739	NC_013223	A	6	6	2312655	2312660	100 %	0 %	0 %	0 %	258406132
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41749	NC_013223	CGTC	2	8	2313456	2313463	0 %	25 %	25 %	50 %	258406133
41750	NC_013223	GCG	2	6	2313649	2313654	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258406133
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41771	NC_013223	GCC	2	6	2314494	2314499	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258406133
41772	NC_013223	GAC	2	6	2314500	2314505	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258406133
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41774	NC_013223	AGA	2	6	2314561	2314566	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258406133
41775	NC_013223	CGG	2	6	2314679	2314684	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258406133
41776	NC_013223	AGCG	2	8	2314690	2314697	25 %	0 %	50 %	25 %	258406133
41777	NC_013223	GGGA	2	8	2314738	2314745	25 %	0 %	75 %	0 %	258406133
41778	NC_013223	TGG	2	6	2314749	2314754	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
41779	NC_013223	TTGGCC	2	12	2314767	2314778	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258406134
41780	NC_013223	TTTG	2	8	2314810	2314817	0 %	75 %	25 %	0 %	258406134
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41798	NC_013223	A	6	6	2315756	2315761	100 %	0 %	0 %	0 %	258406135
41799	NC_013223	CTT	2	6	2315766	2315771	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258406135
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41807	NC_013223	CCG	2	6	2316236	2316241	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258406135
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41809	NC_013223	TCG	2	6	2316452	2316457	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258406135
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41815	NC_013223	AT	3	6	2316731	2316736	50 %	50 %	0 %	0 %	258406135
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41817	NC_013223	GAT	2	6	2316880	2316885	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258406135
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41820	NC_013223	TCGCC	2	10	2317116	2317125	0 %	20 %	20 %	60 %	258406136
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41822	NC_013223	CTGGCC	2	12	2317204	2317215	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	258406136
41823	NC_013223	GTC	2	6	2317264	2317269	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258406136
41824	NC_013223	CGG	2	6	2317398	2317403	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258406136
41825	NC_013223	CTC	2	6	2317435	2317440	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	258406136
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41827	NC_013223	GAT	2	6	2317513	2317518	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258406137
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41831	NC_013223	TGA	2	6	2317683	2317688	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258406137
41832	NC_013223	ACCCCA	2	12	2317733	2317744	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258406137
41833	NC_013223	GCA	2	6	2317767	2317772	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258406137
41834	NC_013223	AAGA	2	8	2317825	2317832	75 %	0 %	25 %	0 %	258406137
41835	NC_013223	CCG	2	6	2317868	2317873	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258406137
41836	NC_013223	CCGC	2	8	2317949	2317956	0 %	0 %	25 %	75 %	258406137
41837	NC_013223	GCT	2	6	2317965	2317970	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258406137
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41840	NC_013223	CCA	2	6	2318005	2318010	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258406137
41841	NC_013223	GGGT	2	8	2318012	2318019	0 %	25 %	75 %	0 %	258406137
41842	NC_013223	GTG	2	6	2318026	2318031	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258406137
41843	NC_013223	GC	3	6	2318048	2318053	0 %	0 %	50 %	50 %	258406137
41844	NC_013223	A	6	6	2318168	2318173	100 %	0 %	0 %	0 %	258406137
41845	NC_013223	CCTTG	2	10	2318222	2318231	0 %	40 %	20 %	40 %	258406138
41846	NC_013223	CAG	2	6	2318241	2318246	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258406138
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41849	NC_013223	CTT	2	6	2318354	2318359	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258406138
41850	NC_013223	ACC	2	6	2318395	2318400	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258406138
41851	NC_013223	TAA	2	6	2318456	2318461	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	258406138
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41853	NC_013223	CAGA	2	8	2318493	2318500	50 %	0 %	25 %	25 %	258406138
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41972	NC_013223	CCCGT	2	10	2324877	2324886	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
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41982	NC_013223	TGC	2	6	2325488	2325493	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258406147
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41999	NC_013223	TCCGG	2	10	2326235	2326244	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
42000	NC_013223	CGG	2	6	2326246	2326251	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding

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