MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Desulfohalobium retbaense DSM 5692 chromosome

Total Repeats: 51711

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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41002	NC_013223	TTG	2	6	2271192	2271197	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258406098
41003	NC_013223	ACC	2	6	2271298	2271303	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258406098
41004	NC_013223	TGC	2	6	2271368	2271373	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258406098
41005	NC_013223	GCCG	2	8	2271416	2271423	0 %	0 %	50 %	50 %	258406098
41006	NC_013223	CCCGC	2	10	2271469	2271478	0 %	0 %	20 %	80 %	258406098
41007	NC_013223	G	6	6	2271490	2271495	0 %	0 %	100 %	0 %	258406098
41008	NC_013223	AC	3	6	2271509	2271514	50 %	0 %	0 %	50 %	258406098
41009	NC_013223	CA	3	6	2271596	2271601	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
41010	NC_013223	CAC	2	6	2271639	2271644	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
41011	NC_013223	CCA	2	6	2271810	2271815	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
41012	NC_013223	CCCGGC	2	12	2271910	2271921	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258406099
41013	NC_013223	A	6	6	2271925	2271930	100 %	0 %	0 %	0 %	258406099
41014	NC_013223	A	6	6	2271982	2271987	100 %	0 %	0 %	0 %	258406099
41015	NC_013223	CAA	2	6	2272000	2272005	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258406099
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41017	NC_013223	AGC	2	6	2272064	2272069	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258406099
41018	NC_013223	CAA	2	6	2272134	2272139	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258406099
41019	NC_013223	GCC	2	6	2272214	2272219	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258406099
41020	NC_013223	CAC	2	6	2272237	2272242	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258406099
41021	NC_013223	GCTC	2	8	2272247	2272254	0 %	25 %	25 %	50 %	258406099
41022	NC_013223	AAG	2	6	2272288	2272293	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258406099
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41025	NC_013223	TTC	2	6	2272531	2272536	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258406099
41026	NC_013223	TG	3	6	2272545	2272550	0 %	50 %	50 %	0 %	258406099
41027	NC_013223	AGGCA	2	10	2272552	2272561	40 %	0 %	40 %	20 %	258406099
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41039	NC_013223	ACC	2	6	2273376	2273381	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
41040	NC_013223	CGC	2	6	2273682	2273687	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258406100
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41049	NC_013223	GCCTT	2	10	2274108	2274117	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
41050	NC_013223	TGG	2	6	2274173	2274178	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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41052	NC_013223	CAG	2	6	2274330	2274335	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
41053	NC_013223	CCA	2	6	2274349	2274354	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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41056	NC_013223	GCA	2	6	2274515	2274520	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258406101
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41091	NC_013223	A	6	6	2276787	2276792	100 %	0 %	0 %	0 %	258406103
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41102	NC_013223	TAC	2	6	2277620	2277625	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258406103
41103	NC_013223	TGA	2	6	2277751	2277756	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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41106	NC_013223	CTG	2	6	2277883	2277888	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258406104
41107	NC_013223	A	7	7	2277979	2277985	100 %	0 %	0 %	0 %	258406104
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41116	NC_013223	ACC	2	6	2278429	2278434	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258406104
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41118	NC_013223	GGC	2	6	2278585	2278590	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258406104
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41122	NC_013223	GCT	2	6	2278749	2278754	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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41235	NC_013223	AGA	2	6	2285422	2285427	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
41236	NC_013223	CATC	2	8	2285681	2285688	25 %	25 %	0 %	50 %	258406110
41237	NC_013223	TCA	2	6	2285767	2285772	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258406110
41238	NC_013223	AGA	2	6	2285919	2285924	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258406110
41239	NC_013223	GGTA	2	8	2285975	2285982	25 %	25 %	50 %	0 %	258406110
41240	NC_013223	CTG	2	6	2286073	2286078	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258406110
41241	NC_013223	T	6	6	2286084	2286089	0 %	100 %	0 %	0 %	258406110
41242	NC_013223	A	8	8	2286115	2286122	100 %	0 %	0 %	0 %	258406110
41243	NC_013223	CAAA	2	8	2286151	2286158	75 %	0 %	0 %	25 %	258406110
41244	NC_013223	TTG	2	6	2286211	2286216	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258406110
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41249	NC_013223	ACAT	2	8	2286701	2286708	50 %	25 %	0 %	25 %	258406110
41250	NC_013223	CA	3	6	2286774	2286779	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
41251	NC_013223	AGG	2	6	2286780	2286785	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
41252	NC_013223	GTT	2	6	2286798	2286803	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
41253	NC_013223	CGA	2	6	2286840	2286845	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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41255	NC_013223	A	8	8	2286913	2286920	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
41256	NC_013223	ATC	2	6	2286922	2286927	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
41257	NC_013223	A	6	6	2286973	2286978	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
41258	NC_013223	ATA	2	6	2287008	2287013	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
41259	NC_013223	TTTA	2	8	2287043	2287050	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
41260	NC_013223	TGT	2	6	2287134	2287139	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
41261	NC_013223	AT	4	8	2287181	2287188	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
41262	NC_013223	ATT	2	6	2287217	2287222	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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41268	NC_013223	GAA	2	6	2287661	2287666	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258406111
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41292	NC_013223	CAG	2	6	2288611	2288616	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258406111
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41319	NC_013223	CAGA	2	8	2289600	2289607	50 %	0 %	25 %	25 %	258406112
41320	NC_013223	A	7	7	2289659	2289665	100 %	0 %	0 %	0 %	258406112
41321	NC_013223	A	6	6	2289710	2289715	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
41322	NC_013223	TA	3	6	2289744	2289749	50 %	50 %	0 %	0 %	258406113
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41340	NC_013223	A	6	6	2290848	2290853	100 %	0 %	0 %	0 %	258406114
41341	NC_013223	GGA	2	6	2290861	2290866	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258406114
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41352	NC_013223	TGA	2	6	2291352	2291357	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258406114
41353	NC_013223	AAT	2	6	2291418	2291423	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	258406114
41354	NC_013223	TTG	2	6	2291450	2291455	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258406114
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41356	NC_013223	GGA	2	6	2291676	2291681	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258406114
41357	NC_013223	TCA	2	6	2291693	2291698	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258406114
41358	NC_013223	CCA	2	6	2291702	2291707	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258406114
41359	NC_013223	ACT	2	6	2291778	2291783	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258406115
41360	NC_013223	T	6	6	2291840	2291845	0 %	100 %	0 %	0 %	258406115
41361	NC_013223	CTGC	2	8	2291866	2291873	0 %	25 %	25 %	50 %	258406115
41362	NC_013223	CGA	2	6	2291980	2291985	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258406115
41363	NC_013223	TCCT	2	8	2292016	2292023	0 %	50 %	0 %	50 %	258406115
41364	NC_013223	GCA	2	6	2292106	2292111	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258406115
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41371	NC_013223	TA	4	8	2292688	2292695	50 %	50 %	0 %	0 %	258406115
41372	NC_013223	CTC	2	6	2292763	2292768	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	258406115
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41378	NC_013223	GAT	2	6	2292938	2292943	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258406115
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41472	NC_013223	TATG	2	8	2297616	2297623	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
41473	NC_013223	GGT	2	6	2297628	2297633	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
41474	NC_013223	CCA	2	6	2297710	2297715	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258406119
41475	NC_013223	TTTCCG	2	12	2297717	2297728	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	258406119
41476	NC_013223	GGC	2	6	2297883	2297888	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258406119
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41479	NC_013223	TCG	2	6	2297970	2297975	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258406119
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41497	NC_013223	AATC	2	8	2298952	2298959	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
41498	NC_013223	AGCA	2	8	2298965	2298972	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
41499	NC_013223	TGT	3	9	2298988	2298996	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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