MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Desulfohalobium retbaense DSM 5692 chromosome

Total Repeats: 51711

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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38002	NC_013223	CAG	2	6	2106912	2106917	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258405957
38003	NC_013223	GCC	2	6	2107006	2107011	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258405957
38004	NC_013223	CTC	2	6	2107074	2107079	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	258405957
38005	NC_013223	GTCC	2	8	2107101	2107108	0 %	25 %	25 %	50 %	258405957
38006	NC_013223	CTG	2	6	2107116	2107121	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258405957
38007	NC_013223	CCA	2	6	2107142	2107147	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258405957
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38011	NC_013223	CCA	2	6	2107394	2107399	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258405957
38012	NC_013223	G	6	6	2107443	2107448	0 %	0 %	100 %	0 %	258405957
38013	NC_013223	CCA	2	6	2107595	2107600	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258405957
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38016	NC_013223	CAT	2	6	2107784	2107789	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258405957
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38020	NC_013223	CGG	2	6	2108096	2108101	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258405957
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38023	NC_013223	GTC	2	6	2108166	2108171	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258405957
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38053	NC_013223	GCC	2	6	2109806	2109811	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
38054	NC_013223	AT	3	6	2109881	2109886	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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38095	NC_013223	AT	3	6	2112350	2112355	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
38096	NC_013223	GTA	2	6	2112457	2112462	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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38099	NC_013223	A	6	6	2112551	2112556	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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38107	NC_013223	CTCC	2	8	2113207	2113214	0 %	25 %	0 %	75 %	258405962
38108	NC_013223	C	6	6	2113240	2113245	0 %	0 %	0 %	100 %	258405962
38109	NC_013223	G	7	7	2113275	2113281	0 %	0 %	100 %	0 %	258405962
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38118	NC_013223	GCA	2	6	2113873	2113878	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258405962
38119	NC_013223	TGGAC	2	10	2114021	2114030	20 %	20 %	40 %	20 %	258405962
38120	NC_013223	CCG	2	6	2114038	2114043	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258405962
38121	NC_013223	GCG	2	6	2114070	2114075	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258405962
38122	NC_013223	TCGG	2	8	2114179	2114186	0 %	25 %	50 %	25 %	258405962
38123	NC_013223	GCC	2	6	2114211	2114216	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258405962
38124	NC_013223	GCA	2	6	2114249	2114254	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258405962
38125	NC_013223	GGCCT	2	10	2114307	2114316	0 %	20 %	40 %	40 %	258405962
38126	NC_013223	CGG	2	6	2114333	2114338	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258405962
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38129	NC_013223	CGG	2	6	2114500	2114505	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258405962
38130	NC_013223	CCT	2	6	2114566	2114571	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	258405962
38131	NC_013223	CGA	2	6	2114645	2114650	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258405962
38132	NC_013223	TTC	2	6	2114667	2114672	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258405962
38133	NC_013223	CAG	2	6	2114697	2114702	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258405962
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38135	NC_013223	CCA	2	6	2114791	2114796	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258405962
38136	NC_013223	G	6	6	2114943	2114948	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
38137	NC_013223	GCCT	2	8	2115015	2115022	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
38138	NC_013223	AGG	2	6	2115109	2115114	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
38139	NC_013223	CA	3	6	2115147	2115152	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
38140	NC_013223	GAG	2	6	2115185	2115190	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
38141	NC_013223	CAT	2	6	2115209	2115214	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258405963
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38143	NC_013223	TGG	2	6	2115394	2115399	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258405963
38144	NC_013223	CCCG	2	8	2115451	2115458	0 %	0 %	25 %	75 %	258405963
38145	NC_013223	CAC	2	6	2115464	2115469	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258405963
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38150	NC_013223	GGC	2	6	2115702	2115707	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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38152	NC_013223	CCT	2	6	2115833	2115838	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
38153	NC_013223	TTG	2	6	2115841	2115846	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
38154	NC_013223	CGG	2	6	2115850	2115855	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
38155	NC_013223	CGT	2	6	2115938	2115943	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
38156	NC_013223	TGCT	2	8	2116028	2116035	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
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38159	NC_013223	TC	3	6	2116085	2116090	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
38160	NC_013223	CGG	2	6	2116093	2116098	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
38161	NC_013223	GCA	2	6	2116176	2116181	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258405964
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38181	NC_013223	ACC	2	6	2117748	2117753	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
38182	NC_013223	CAT	2	6	2117805	2117810	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258405967
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38219	NC_013223	CCA	2	6	2119341	2119346	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258405967
38220	NC_013223	ACA	2	6	2119371	2119376	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258405967
38221	NC_013223	GAA	2	6	2119421	2119426	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
38222	NC_013223	A	6	6	2119429	2119434	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
38223	NC_013223	TCGGCT	2	12	2119609	2119620	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
38224	NC_013223	CCG	2	6	2119621	2119626	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
38225	NC_013223	AAG	2	6	2119649	2119654	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
38226	NC_013223	AGAA	2	8	2119849	2119856	75 %	0 %	25 %	0 %	258405968
38227	NC_013223	ACC	2	6	2120012	2120017	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258405968
38228	NC_013223	CTTC	2	8	2120079	2120086	0 %	50 %	0 %	50 %	258405968
38229	NC_013223	GAC	2	6	2120137	2120142	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258405968
38230	NC_013223	CTG	2	6	2120149	2120154	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258405968
38231	NC_013223	GCA	3	9	2120202	2120210	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258405968
38232	NC_013223	TCG	2	6	2120243	2120248	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258405968
38233	NC_013223	GTG	2	6	2120285	2120290	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258405968
38234	NC_013223	CT	3	6	2120338	2120343	0 %	50 %	0 %	50 %	258405968
38235	NC_013223	GCA	2	6	2120370	2120375	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258405968
38236	NC_013223	CT	3	6	2120428	2120433	0 %	50 %	0 %	50 %	258405968
38237	NC_013223	CGCT	2	8	2120443	2120450	0 %	25 %	25 %	50 %	258405968
38238	NC_013223	CTC	2	6	2120503	2120508	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	258405968
38239	NC_013223	AGG	2	6	2120519	2120524	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258405968
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38241	NC_013223	GCA	2	6	2120587	2120592	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258405969
38242	NC_013223	CG	3	6	2120603	2120608	0 %	0 %	50 %	50 %	258405969
38243	NC_013223	TGG	2	6	2120694	2120699	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258405969
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38270	NC_013223	CA	3	6	2122019	2122024	50 %	0 %	0 %	50 %	258405971
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38292	NC_013223	CGGG	2	8	2123182	2123189	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
38293	NC_013223	CAA	2	6	2123227	2123232	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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38301	NC_013223	GGA	2	6	2123516	2123521	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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38335	NC_013223	GTCGC	2	10	2125268	2125277	0 %	20 %	40 %	40 %	258405973
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38337	NC_013223	CCGC	2	8	2125467	2125474	0 %	0 %	25 %	75 %	258405973
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38339	NC_013223	GATCC	2	10	2125551	2125560	20 %	20 %	20 %	40 %	258405973
38340	NC_013223	G	6	6	2125577	2125582	0 %	0 %	100 %	0 %	258405973
38341	NC_013223	AACG	2	8	2125593	2125600	50 %	0 %	25 %	25 %	258405973
38342	NC_013223	GGT	2	6	2125635	2125640	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258405973
38343	NC_013223	AGCC	2	8	2125722	2125729	25 %	0 %	25 %	50 %	258405973
38344	NC_013223	C	6	6	2125981	2125986	0 %	0 %	0 %	100 %	258405973
38345	NC_013223	A	6	6	2126126	2126131	100 %	0 %	0 %	0 %	258405973
38346	NC_013223	GAC	2	6	2126133	2126138	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258405973
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38348	NC_013223	C	6	6	2126176	2126181	0 %	0 %	0 %	100 %	258405973
38349	NC_013223	CAC	2	6	2126232	2126237	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258405973
38350	NC_013223	GCG	2	6	2126282	2126287	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258405973
38351	NC_013223	CCAG	2	8	2126291	2126298	25 %	0 %	25 %	50 %	258405973
38352	NC_013223	A	7	7	2126359	2126365	100 %	0 %	0 %	0 %	258405973
38353	NC_013223	GCCC	2	8	2126384	2126391	0 %	0 %	25 %	75 %	258405973
38354	NC_013223	CAC	3	9	2126409	2126417	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258405973
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38472	NC_013223	ACGC	2	8	2133242	2133249	25 %	0 %	25 %	50 %	258405980
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38474	NC_013223	GCG	2	6	2133265	2133270	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258405980
38475	NC_013223	GAA	2	6	2133296	2133301	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258405980
38476	NC_013223	GCG	2	6	2133327	2133332	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258405980
38477	NC_013223	AAGA	2	8	2133353	2133360	75 %	0 %	25 %	0 %	258405980
38478	NC_013223	CAC	2	6	2133362	2133367	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258405980
38479	NC_013223	A	6	6	2133408	2133413	100 %	0 %	0 %	0 %	258405980
38480	NC_013223	CG	3	6	2133426	2133431	0 %	0 %	50 %	50 %	258405980
38481	NC_013223	GGA	2	6	2133456	2133461	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258405980
38482	NC_013223	GGTCC	2	10	2133592	2133601	0 %	20 %	40 %	40 %	258405981
38483	NC_013223	AGG	2	6	2133722	2133727	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258405981
38484	NC_013223	GATC	2	8	2133763	2133770	25 %	25 %	25 %	25 %	258405981
38485	NC_013223	GCC	2	6	2133836	2133841	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258405981
38486	NC_013223	CGC	2	6	2133868	2133873	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258405981
38487	NC_013223	CGT	2	6	2133898	2133903	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258405981
38488	NC_013223	ATC	2	6	2134146	2134151	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258405982
38489	NC_013223	TCC	2	6	2134158	2134163	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	258405982
38490	NC_013223	T	6	6	2134164	2134169	0 %	100 %	0 %	0 %	258405982
38491	NC_013223	GA	3	6	2134184	2134189	50 %	0 %	50 %	0 %	258405982
38492	NC_013223	G	6	6	2134190	2134195	0 %	0 %	100 %	0 %	258405982
38493	NC_013223	CCT	2	6	2134271	2134276	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
38494	NC_013223	CAG	2	6	2134302	2134307	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
38495	NC_013223	ATC	2	6	2134373	2134378	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
38496	NC_013223	T	6	6	2134432	2134437	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
38497	NC_013223	GCA	2	6	2134446	2134451	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
38498	NC_013223	CAA	2	6	2134460	2134465	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258405983
38499	NC_013223	TACC	2	8	2134466	2134473	25 %	25 %	0 %	50 %	258405983
38500	NC_013223	CAC	2	6	2134493	2134498	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258405983

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