MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Desulfohalobium retbaense DSM 5692 chromosome

Total Repeats: 51711

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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37502	NC_013223	AGC	2	6	2079566	2079571	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258405929
37503	NC_013223	CG	3	6	2079580	2079585	0 %	0 %	50 %	50 %	258405929
37504	NC_013223	GAA	2	6	2079595	2079600	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258405929
37505	NC_013223	CGG	2	6	2079719	2079724	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258405929
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37508	NC_013223	CGG	2	6	2079792	2079797	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258405929
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37510	NC_013223	GCCTG	2	10	2080037	2080046	0 %	20 %	40 %	40 %	258405929
37511	NC_013223	TGCG	2	8	2080060	2080067	0 %	25 %	50 %	25 %	258405929
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37588	NC_013223	GC	3	6	2083678	2083683	0 %	0 %	50 %	50 %	258405933
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37600	NC_013223	CCT	2	6	2084290	2084295	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
37601	NC_013223	GGCA	2	8	2084335	2084342	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
37602	NC_013223	T	6	6	2084369	2084374	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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37604	NC_013223	CAAA	2	8	2084412	2084419	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
37605	NC_013223	CGAG	2	8	2084455	2084462	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
37606	NC_013223	GGA	2	6	2084493	2084498	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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37617	NC_013223	GAC	2	6	2084963	2084968	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258405934
37618	NC_013223	TGG	2	6	2085021	2085026	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258405934
37619	NC_013223	CG	3	6	2085095	2085100	0 %	0 %	50 %	50 %	258405934
37620	NC_013223	GCACGA	2	12	2085103	2085114	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258405934
37621	NC_013223	TGG	2	6	2085126	2085131	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258405934
37622	NC_013223	CCTGGC	2	12	2085148	2085159	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	258405934
37623	NC_013223	GCC	2	6	2085182	2085187	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258405934
37624	NC_013223	TCTGC	2	10	2085205	2085214	0 %	40 %	20 %	40 %	258405934
37625	NC_013223	GCC	2	6	2085251	2085256	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258405934
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37628	NC_013223	TGC	2	6	2085462	2085467	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258405934
37629	NC_013223	TCGAC	2	10	2085553	2085562	20 %	20 %	20 %	40 %	258405934
37630	NC_013223	GCT	2	6	2085602	2085607	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258405934
37631	NC_013223	CGA	2	6	2085633	2085638	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258405934
37632	NC_013223	CCA	2	6	2085935	2085940	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258405935
37633	NC_013223	AAC	2	6	2085951	2085956	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258405935
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37635	NC_013223	C	6	6	2086000	2086005	0 %	0 %	0 %	100 %	258405935
37636	NC_013223	GGA	2	6	2086065	2086070	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258405935
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37639	NC_013223	CTT	2	6	2086254	2086259	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258405935
37640	NC_013223	TGCTC	2	10	2086283	2086292	0 %	40 %	20 %	40 %	258405935
37641	NC_013223	GCA	2	6	2086445	2086450	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258405935
37642	NC_013223	CGA	2	6	2086568	2086573	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258405935
37643	NC_013223	TCC	2	6	2086585	2086590	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	258405935
37644	NC_013223	TATCGT	2	12	2086682	2086693	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	258405935
37645	NC_013223	AT	3	6	2086754	2086759	50 %	50 %	0 %	0 %	258405935
37646	NC_013223	GAT	2	6	2086763	2086768	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258405935
37647	NC_013223	A	6	6	2086779	2086784	100 %	0 %	0 %	0 %	258405935
37648	NC_013223	CTAT	2	8	2086792	2086799	25 %	50 %	0 %	25 %	258405935
37649	NC_013223	ATTG	2	8	2086805	2086812	25 %	50 %	25 %	0 %	258405935
37650	NC_013223	AGGC	2	8	2086813	2086820	25 %	0 %	50 %	25 %	258405935
37651	NC_013223	GGA	2	6	2086886	2086891	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258405935
37652	NC_013223	TCG	2	6	2086906	2086911	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258405935
37653	NC_013223	GCC	2	6	2086980	2086985	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258405936
37654	NC_013223	TGC	2	6	2087020	2087025	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258405936
37655	NC_013223	G	6	6	2087031	2087036	0 %	0 %	100 %	0 %	258405936
37656	NC_013223	GTC	2	6	2087097	2087102	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258405936
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37659	NC_013223	CTTT	2	8	2087239	2087246	0 %	75 %	0 %	25 %	258405936
37660	NC_013223	CTG	2	6	2087292	2087297	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258405936
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37664	NC_013223	TTGCCG	2	12	2087701	2087712	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258405936
37665	NC_013223	TCG	2	6	2087812	2087817	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258405936
37666	NC_013223	GAA	2	6	2087841	2087846	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258405936
37667	NC_013223	A	6	6	2087845	2087850	100 %	0 %	0 %	0 %	258405936
37668	NC_013223	ACCGAG	2	12	2087859	2087870	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258405936
37669	NC_013223	AAGC	2	8	2087997	2088004	50 %	0 %	25 %	25 %	258405936
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37672	NC_013223	CT	3	6	2088080	2088085	0 %	50 %	0 %	50 %	258405937
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37677	NC_013223	GTCC	2	8	2088455	2088462	0 %	25 %	25 %	50 %	258405937
37678	NC_013223	GTC	2	6	2088521	2088526	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258405937
37679	NC_013223	CTG	2	6	2088538	2088543	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258405937
37680	NC_013223	C	7	7	2088582	2088588	0 %	0 %	0 %	100 %	258405937
37681	NC_013223	GCC	2	6	2088735	2088740	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258405938
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37683	NC_013223	A	6	6	2088786	2088791	100 %	0 %	0 %	0 %	258405938
37684	NC_013223	GTG	2	6	2088816	2088821	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258405938
37685	NC_013223	ACC	2	6	2088885	2088890	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258405938
37686	NC_013223	TGCC	2	8	2088899	2088906	0 %	25 %	25 %	50 %	258405938
37687	NC_013223	GCG	2	6	2089041	2089046	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258405938
37688	NC_013223	CCA	2	6	2089083	2089088	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258405938
37689	NC_013223	GAT	2	6	2089099	2089104	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258405938
37690	NC_013223	ATT	2	6	2089148	2089153	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	258405938
37691	NC_013223	CTT	2	6	2089309	2089314	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258405938
37692	NC_013223	AAG	2	6	2089355	2089360	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258405938
37693	NC_013223	GCA	2	6	2089459	2089464	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
37694	NC_013223	T	6	6	2089539	2089544	0 %	100 %	0 %	0 %	258405939
37695	NC_013223	CAC	2	6	2089633	2089638	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258405939
37696	NC_013223	GTTCAA	2	12	2089662	2089673	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	258405939
37697	NC_013223	ACG	2	6	2089706	2089711	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258405939
37698	NC_013223	TCG	2	6	2089731	2089736	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258405939
37699	NC_013223	CCT	2	6	2089797	2089802	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	258405939
37700	NC_013223	TC	3	6	2089839	2089844	0 %	50 %	0 %	50 %	258405939
37701	NC_013223	CA	3	6	2089921	2089926	50 %	0 %	0 %	50 %	258405939
37702	NC_013223	CCG	2	6	2089927	2089932	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258405939
37703	NC_013223	CCT	2	6	2089950	2089955	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	258405939
37704	NC_013223	GGGCCA	2	12	2090175	2090186	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	258405939
37705	NC_013223	GCA	2	6	2090229	2090234	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258405939
37706	NC_013223	GAC	2	6	2090394	2090399	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258405939
37707	NC_013223	CCA	2	6	2090457	2090462	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258405939
37708	NC_013223	CGGT	2	8	2090493	2090500	0 %	25 %	50 %	25 %	258405939
37709	NC_013223	CTT	2	6	2090544	2090549	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258405939
37710	NC_013223	GCC	2	6	2090751	2090756	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258405940
37711	NC_013223	TGA	2	6	2090804	2090809	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258405940
37712	NC_013223	CGG	2	6	2090813	2090818	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258405940
37713	NC_013223	AGGGC	2	10	2090954	2090963	20 %	0 %	60 %	20 %	258405940
37714	NC_013223	A	6	6	2090967	2090972	100 %	0 %	0 %	0 %	258405940
37715	NC_013223	ACG	2	6	2090983	2090988	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258405940
37716	NC_013223	AGGCC	2	10	2091158	2091167	20 %	0 %	40 %	40 %	258405940
37717	NC_013223	GAA	2	6	2091202	2091207	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258405940
37718	NC_013223	AGG	2	6	2091233	2091238	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258405940
37719	NC_013223	GAG	2	6	2091255	2091260	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258405940
37720	NC_013223	ACA	2	6	2091289	2091294	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258405940
37721	NC_013223	A	6	6	2091294	2091299	100 %	0 %	0 %	0 %	258405940
37722	NC_013223	CCGG	2	8	2091374	2091381	0 %	0 %	50 %	50 %	258405940
37723	NC_013223	TGA	2	6	2091505	2091510	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258405941
37724	NC_013223	GAC	2	6	2091533	2091538	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258405941
37725	NC_013223	CGGT	2	8	2091637	2091644	0 %	25 %	50 %	25 %	258405941
37726	NC_013223	TCT	2	6	2091841	2091846	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258405941
37727	NC_013223	TCT	2	6	2091855	2091860	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258405941
37728	NC_013223	ATCC	2	8	2091864	2091871	25 %	25 %	0 %	50 %	258405941
37729	NC_013223	CGT	2	6	2091883	2091888	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258405941
37730	NC_013223	TTC	2	6	2092022	2092027	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258405941
37731	NC_013223	TCA	2	6	2092036	2092041	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258405941
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37933	NC_013223	GTTT	2	8	2103032	2103039	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
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37946	NC_013223	CGCAA	2	10	2103618	2103627	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
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37963	NC_013223	C	6	6	2104421	2104426	0 %	0 %	0 %	100 %	258405954
37964	NC_013223	GCCAG	2	10	2104491	2104500	20 %	0 %	40 %	40 %	258405954
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