MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Desulfohalobium retbaense DSM 5692 chromosome

Total Repeats: 51711

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
35001	NC_013223	CAT	2	6	1939434	1939439	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258405806
35002	NC_013223	C	6	6	1939442	1939447	0 %	0 %	0 %	100 %	258405806
35003	NC_013223	TCCACC	2	12	1939505	1939516	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	258405806
35004	NC_013223	GCC	2	6	1939541	1939546	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258405806
35005	NC_013223	GTC	2	6	1939564	1939569	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258405806
35006	NC_013223	CGG	2	6	1939585	1939590	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258405806
35007	NC_013223	TTC	2	6	1939603	1939608	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258405806
35008	NC_013223	GCC	2	6	1939653	1939658	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258405806
35009	NC_013223	TCCTGC	2	12	1939694	1939705	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	258405806
35010	NC_013223	GGT	2	6	1939717	1939722	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258405806
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35012	NC_013223	CGC	2	6	1939902	1939907	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258405807
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35014	NC_013223	TGG	2	6	1940149	1940154	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258405807
35015	NC_013223	GCC	2	6	1940280	1940285	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258405807
35016	NC_013223	CTG	2	6	1940289	1940294	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258405807
35017	NC_013223	GGGC	2	8	1940468	1940475	0 %	0 %	75 %	25 %	258405807
35018	NC_013223	TGC	2	6	1940503	1940508	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258405807
35019	NC_013223	A	6	6	1940602	1940607	100 %	0 %	0 %	0 %	258405807
35020	NC_013223	TTG	2	6	1940685	1940690	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258405807
35021	NC_013223	TGCA	2	8	1940716	1940723	25 %	25 %	25 %	25 %	258405807
35022	NC_013223	TCT	2	6	1940726	1940731	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
35023	NC_013223	CCG	3	9	1940753	1940761	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
35024	NC_013223	GCG	2	6	1940778	1940783	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
35025	NC_013223	CGTC	2	8	1940784	1940791	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
35026	NC_013223	ACC	2	6	1941022	1941027	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258405808
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35028	NC_013223	CGC	2	6	1941082	1941087	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258405808
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35031	NC_013223	GCAGA	2	10	1941216	1941225	40 %	0 %	40 %	20 %	258405808
35032	NC_013223	A	7	7	1941277	1941283	100 %	0 %	0 %	0 %	258405808
35033	NC_013223	CAC	2	6	1941288	1941293	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258405808
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35036	NC_013223	TGC	2	6	1941500	1941505	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258405808
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35039	NC_013223	TTC	2	6	1941684	1941689	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258405808
35040	NC_013223	A	7	7	1941710	1941716	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
35041	NC_013223	AGGC	2	8	1941753	1941760	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
35042	NC_013223	TCG	2	6	1941873	1941878	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258405809
35043	NC_013223	TC	3	6	1941895	1941900	0 %	50 %	0 %	50 %	258405809
35044	NC_013223	GCG	2	6	1941966	1941971	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258405809
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35052	NC_013223	CT	3	6	1942308	1942313	0 %	50 %	0 %	50 %	258405809
35053	NC_013223	GCG	2	6	1942351	1942356	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258405809
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35055	NC_013223	C	6	6	1942415	1942420	0 %	0 %	0 %	100 %	258405809
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35083	NC_013223	GGGAG	2	10	1943910	1943919	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
35084	NC_013223	GAAG	2	8	1943946	1943953	50 %	0 %	50 %	0 %	258405811
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35105	NC_013223	GCT	2	6	1945275	1945280	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258405811
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35114	NC_013223	GTC	2	6	1945943	1945948	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258405811
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35143	NC_013223	GCC	2	6	1947583	1947588	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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35146	NC_013223	GC	3	6	1947713	1947718	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
35147	NC_013223	GTCA	2	8	1947838	1947845	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
35148	NC_013223	CT	3	6	1947891	1947896	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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35234	NC_013223	CT	3	6	1951911	1951916	0 %	50 %	0 %	50 %	258405814
35235	NC_013223	TGC	2	6	1951967	1951972	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258405814
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35237	NC_013223	ACA	2	6	1952023	1952028	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258405814
35238	NC_013223	TCA	2	6	1952054	1952059	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258405814
35239	NC_013223	CCG	2	6	1952064	1952069	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258405814
35240	NC_013223	GCCGT	2	10	1952194	1952203	0 %	20 %	40 %	40 %	258405814
35241	NC_013223	GTA	2	6	1952265	1952270	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258405814
35242	NC_013223	TCA	2	6	1952293	1952298	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258405814
35243	NC_013223	CGT	2	6	1952318	1952323	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258405814
35244	NC_013223	ATC	2	6	1952343	1952348	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258405814
35245	NC_013223	CACC	2	8	1952369	1952376	25 %	0 %	0 %	75 %	258405814
35246	NC_013223	TCG	2	6	1952398	1952403	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258405814
35247	NC_013223	CTC	2	6	1952441	1952446	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	258405814
35248	NC_013223	AGC	2	6	1952472	1952477	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258405814
35249	NC_013223	GGA	2	6	1952484	1952489	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258405814
35250	NC_013223	CTC	2	6	1952538	1952543	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	258405814
35251	NC_013223	A	6	6	1952560	1952565	100 %	0 %	0 %	0 %	258405814
35252	NC_013223	TCGCCG	2	12	1952575	1952586	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	258405814
35253	NC_013223	CCG	2	6	1952635	1952640	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258405814
35254	NC_013223	CGC	2	6	1952693	1952698	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258405814
35255	NC_013223	GTG	2	6	1952761	1952766	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258405814
35256	NC_013223	CGT	2	6	1952783	1952788	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258405814
35257	NC_013223	GA	3	6	1952809	1952814	50 %	0 %	50 %	0 %	258405814
35258	NC_013223	TGA	2	6	1952897	1952902	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258405814
35259	NC_013223	TTG	2	6	1952913	1952918	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258405814
35260	NC_013223	TCG	2	6	1952989	1952994	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258405814
35261	NC_013223	GCGGTG	2	12	1953019	1953030	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	258405814
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35263	NC_013223	AT	3	6	1953096	1953101	50 %	50 %	0 %	0 %	258405814
35264	NC_013223	CTT	2	6	1953113	1953118	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258405814
35265	NC_013223	GTGCCT	2	12	1953245	1953256	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258405814
35266	NC_013223	CAT	2	6	1953293	1953298	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258405814
35267	NC_013223	TGA	2	6	1953315	1953320	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258405814
35268	NC_013223	TCG	2	6	1953442	1953447	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258405814
35269	NC_013223	GGA	2	6	1953471	1953476	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258405814
35270	NC_013223	TGG	2	6	1953506	1953511	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258405814
35271	NC_013223	C	6	6	1953522	1953527	0 %	0 %	0 %	100 %	258405814
35272	NC_013223	TTC	2	6	1953747	1953752	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258405814
35273	NC_013223	AAT	2	6	1953792	1953797	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	258405814
35274	NC_013223	ATCC	2	8	1953990	1953997	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
35275	NC_013223	AGATG	2	10	1954011	1954020	40 %	20 %	40 %	0 %	258405815
35276	NC_013223	TC	3	6	1954042	1954047	0 %	50 %	0 %	50 %	258405815
35277	NC_013223	CCT	2	6	1954197	1954202	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	258405815
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35279	NC_013223	CTG	2	6	1954318	1954323	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258405815
35280	NC_013223	C	6	6	1954365	1954370	0 %	0 %	0 %	100 %	258405816
35281	NC_013223	TGGA	2	8	1954438	1954445	25 %	25 %	50 %	0 %	258405816
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35284	NC_013223	GCT	2	6	1954532	1954537	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258405816
35285	NC_013223	A	6	6	1954616	1954621	100 %	0 %	0 %	0 %	258405816
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35290	NC_013223	CAC	2	6	1955012	1955017	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258405817
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35295	NC_013223	ACGA	2	8	1955526	1955533	50 %	0 %	25 %	25 %	258405818
35296	NC_013223	AGA	2	6	1955537	1955542	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258405818
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35299	NC_013223	AT	4	8	1955726	1955733	50 %	50 %	0 %	0 %	258405818
35300	NC_013223	TGA	2	6	1955791	1955796	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258405818
35301	NC_013223	A	6	6	1955811	1955816	100 %	0 %	0 %	0 %	258405818
35302	NC_013223	ATTT	2	8	1955902	1955909	25 %	75 %	0 %	0 %	258405818
35303	NC_013223	CACC	2	8	1955937	1955944	25 %	0 %	0 %	75 %	258405818
35304	NC_013223	CTG	2	6	1955982	1955987	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258405818
35305	NC_013223	CGA	2	6	1956000	1956005	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258405818
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35307	NC_013223	CAT	2	6	1956045	1956050	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258405818
35308	NC_013223	TCCG	2	8	1956070	1956077	0 %	25 %	25 %	50 %	258405818
35309	NC_013223	A	6	6	1956116	1956121	100 %	0 %	0 %	0 %	258405818
35310	NC_013223	A	6	6	1956204	1956209	100 %	0 %	0 %	0 %	258405818
35311	NC_013223	CAT	2	6	1956210	1956215	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258405818
35312	NC_013223	ATA	2	6	1956227	1956232	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	258405818
35313	NC_013223	TAT	2	6	1956354	1956359	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	258405819
35314	NC_013223	AAATT	2	10	1956425	1956434	60 %	40 %	0 %	0 %	258405819
35315	NC_013223	ACT	2	6	1956445	1956450	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258405819
35316	NC_013223	ACA	2	6	1956452	1956457	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258405819
35317	NC_013223	T	7	7	1956478	1956484	0 %	100 %	0 %	0 %	258405819
35318	NC_013223	TAG	2	6	1956513	1956518	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258405819
35319	NC_013223	ATC	2	6	1956647	1956652	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258405819
35320	NC_013223	ACA	3	9	1956689	1956697	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
35321	NC_013223	CAAAA	2	10	1956838	1956847	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
35322	NC_013223	T	7	7	1956899	1956905	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
35323	NC_013223	AAC	2	6	1956941	1956946	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
35324	NC_013223	ACC	2	6	1956948	1956953	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
35325	NC_013223	A	7	7	1956965	1956971	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
35326	NC_013223	A	7	7	1957060	1957066	100 %	0 %	0 %	0 %	258405820
35327	NC_013223	GCC	2	6	1957147	1957152	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258405820
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35329	NC_013223	CGG	2	6	1957207	1957212	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258405820
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35334	NC_013223	CAG	2	6	1957564	1957569	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258405820
35335	NC_013223	GCT	2	6	1957581	1957586	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258405820
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35338	NC_013223	A	6	6	1957950	1957955	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
35339	NC_013223	GC	3	6	1957995	1958000	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
35340	NC_013223	CTG	2	6	1958006	1958011	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
35341	NC_013223	TGC	2	6	1958086	1958091	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
35342	NC_013223	TCG	2	6	1958124	1958129	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258405821
35343	NC_013223	ACCG	2	8	1958153	1958160	25 %	0 %	25 %	50 %	258405821
35344	NC_013223	TCGGT	2	10	1958179	1958188	0 %	40 %	40 %	20 %	258405821
35345	NC_013223	CGC	2	6	1958260	1958265	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258405821
35346	NC_013223	GCTGTG	2	12	1958462	1958473	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	258405821
35347	NC_013223	ACC	2	6	1958891	1958896	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258405822
35348	NC_013223	CAA	2	6	1959018	1959023	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258405822
35349	NC_013223	CGCCAC	2	12	1959150	1959161	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	258405822
35350	NC_013223	TTTGCC	2	12	1959163	1959174	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	258405822
35351	NC_013223	GCC	2	6	1959200	1959205	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258405822
35352	NC_013223	GCCC	2	8	1959243	1959250	0 %	0 %	25 %	75 %	258405822
35353	NC_013223	AGA	2	6	1959258	1959263	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258405822
35354	NC_013223	CGCCC	2	10	1959264	1959273	0 %	0 %	20 %	80 %	258405822
35355	NC_013223	TC	3	6	1959300	1959305	0 %	50 %	0 %	50 %	258405822
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35473	NC_013223	CGA	2	6	1966015	1966020	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258405829
35474	NC_013223	CCAGA	2	10	1966050	1966059	40 %	0 %	20 %	40 %	258405829
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35476	NC_013223	CGA	2	6	1966135	1966140	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258405829
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35496	NC_013223	CAC	2	6	1967113	1967118	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
35497	NC_013223	ACACA	2	10	1967195	1967204	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
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