MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Desulfohalobium retbaense DSM 5692 chromosome

Total Repeats: 51711

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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33002	NC_013223	CGC	2	6	1826367	1826372	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258405696
33003	NC_013223	GCC	2	6	1826380	1826385	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258405696
33004	NC_013223	CTGG	2	8	1826439	1826446	0 %	25 %	50 %	25 %	258405696
33005	NC_013223	CTCG	2	8	1826447	1826454	0 %	25 %	25 %	50 %	258405696
33006	NC_013223	TGCT	2	8	1826508	1826515	0 %	50 %	25 %	25 %	258405696
33007	NC_013223	C	6	6	1826573	1826578	0 %	0 %	0 %	100 %	258405696
33008	NC_013223	CGA	2	6	1826699	1826704	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258405696
33009	NC_013223	GCT	2	6	1826705	1826710	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258405696
33010	NC_013223	TGA	2	6	1826747	1826752	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258405696
33011	NC_013223	CTG	2	6	1826809	1826814	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258405696
33012	NC_013223	CCG	2	6	1826890	1826895	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258405696
33013	NC_013223	GCG	2	6	1826938	1826943	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258405696
33014	NC_013223	CAA	2	6	1826972	1826977	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258405696
33015	NC_013223	GAG	2	6	1827028	1827033	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258405696
33016	NC_013223	CGG	2	6	1827047	1827052	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258405696
33017	NC_013223	ATT	2	6	1827078	1827083	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	258405696
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33019	NC_013223	TCAA	2	8	1827263	1827270	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
33020	NC_013223	A	6	6	1827280	1827285	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
33021	NC_013223	AAT	2	6	1827318	1827323	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
33022	NC_013223	GTG	2	6	1827455	1827460	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
33023	NC_013223	CAC	2	6	1827465	1827470	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
33024	NC_013223	GAG	2	6	1827546	1827551	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
33025	NC_013223	TGT	2	6	1827576	1827581	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258405697
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33027	NC_013223	GACCT	2	10	1827665	1827674	20 %	20 %	20 %	40 %	258405697
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33037	NC_013223	TCCA	2	8	1828169	1828176	25 %	25 %	0 %	50 %	258405698
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33039	NC_013223	T	6	6	1828312	1828317	0 %	100 %	0 %	0 %	258405698
33040	NC_013223	ACG	2	6	1828377	1828382	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258405698
33041	NC_013223	GTC	2	6	1828442	1828447	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258405698
33042	NC_013223	AATCTC	2	12	1828502	1828513	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258405698
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33050	NC_013223	CAT	2	6	1828987	1828992	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258405698
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33054	NC_013223	TGG	2	6	1829298	1829303	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258405698
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33088	NC_013223	CTG	2	6	1831181	1831186	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258405700
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33101	NC_013223	GA	3	6	1832248	1832253	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
33102	NC_013223	TCC	2	6	1832378	1832383	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	258405701
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33111	NC_013223	CCGG	2	8	1832936	1832943	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
33112	NC_013223	GAA	2	6	1832986	1832991	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
33113	NC_013223	TCCTGG	2	12	1833179	1833190	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258405702
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33116	NC_013223	CGA	2	6	1833273	1833278	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258405702
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33229	NC_013223	AACC	2	8	1838853	1838860	50 %	0 %	0 %	50 %	258405708
33230	NC_013223	TGC	2	6	1838894	1838899	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258405708
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33235	NC_013223	A	7	7	1839136	1839142	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
33236	NC_013223	GCC	2	6	1839145	1839150	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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33352	NC_013223	GTC	2	6	1846015	1846020	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258405716
33353	NC_013223	ATC	2	6	1846030	1846035	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258405716
33354	NC_013223	CAT	2	6	1846129	1846134	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258405716
33355	NC_013223	CCA	2	6	1846174	1846179	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258405717
33356	NC_013223	GGC	2	6	1846189	1846194	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258405717
33357	NC_013223	CGG	2	6	1846195	1846200	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258405717
33358	NC_013223	ACTTC	2	10	1846201	1846210	20 %	40 %	0 %	40 %	258405717
33359	NC_013223	CAG	2	6	1846247	1846252	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258405717
33360	NC_013223	AGC	2	6	1846257	1846262	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258405717
33361	NC_013223	TGA	2	6	1846282	1846287	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258405717
33362	NC_013223	CTT	2	6	1846384	1846389	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258405717
33363	NC_013223	AGC	2	6	1846497	1846502	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258405717
33364	NC_013223	GGTG	2	8	1846519	1846526	0 %	25 %	75 %	0 %	258405717
33365	NC_013223	ACCA	2	8	1846538	1846545	50 %	0 %	0 %	50 %	258405717
33366	NC_013223	T	7	7	1846570	1846576	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
33367	NC_013223	CA	3	6	1846584	1846589	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
33368	NC_013223	ATCCTG	2	12	1846592	1846603	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
33369	NC_013223	GCC	2	6	1846710	1846715	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258405718
33370	NC_013223	AGA	2	6	1846775	1846780	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258405718
33371	NC_013223	GGC	2	6	1846843	1846848	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258405718
33372	NC_013223	GTGG	2	8	1846990	1846997	0 %	25 %	75 %	0 %	258405718
33373	NC_013223	TCC	2	6	1847000	1847005	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	258405718
33374	NC_013223	GGC	2	6	1847031	1847036	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258405718
33375	NC_013223	A	7	7	1847216	1847222	100 %	0 %	0 %	0 %	258405718
33376	NC_013223	CGG	2	6	1847277	1847282	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258405718
33377	NC_013223	A	7	7	1847349	1847355	100 %	0 %	0 %	0 %	258405718
33378	NC_013223	AGA	2	6	1847400	1847405	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258405718
33379	NC_013223	CAG	2	6	1847613	1847618	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
33380	NC_013223	CAA	2	6	1847632	1847637	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258405719
33381	NC_013223	AAGA	2	8	1847764	1847771	75 %	0 %	25 %	0 %	258405719
33382	NC_013223	ACC	2	6	1847831	1847836	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258405719
33383	NC_013223	TGC	2	6	1847901	1847906	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258405719
33384	NC_013223	TCC	2	6	1847990	1847995	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	258405719
33385	NC_013223	GTCAG	2	10	1848020	1848029	20 %	20 %	40 %	20 %	258405719
33386	NC_013223	ATCA	2	8	1848084	1848091	50 %	25 %	0 %	25 %	258405720
33387	NC_013223	AGA	2	6	1848152	1848157	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258405720
33388	NC_013223	TCG	2	6	1848199	1848204	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258405720
33389	NC_013223	CGC	2	6	1848260	1848265	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258405720
33390	NC_013223	TTC	2	6	1848414	1848419	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258405720
33391	NC_013223	ACA	2	6	1848451	1848456	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258405720
33392	NC_013223	AT	3	6	1848526	1848531	50 %	50 %	0 %	0 %	258405720
33393	NC_013223	ATCTG	2	10	1848605	1848614	20 %	40 %	20 %	20 %	258405720
33394	NC_013223	GAG	2	6	1848683	1848688	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
33395	NC_013223	CGC	2	6	1848756	1848761	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258405721
33396	NC_013223	T	6	6	1848782	1848787	0 %	100 %	0 %	0 %	258405721
33397	NC_013223	TCT	2	6	1848802	1848807	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258405721
33398	NC_013223	CGC	2	6	1848857	1848862	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258405721
33399	NC_013223	CCG	2	6	1848891	1848896	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258405721
33400	NC_013223	AGGCCG	2	12	1848900	1848911	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	258405721
33401	NC_013223	GAA	2	6	1848917	1848922	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258405721
33402	NC_013223	TTTG	2	8	1848962	1848969	0 %	75 %	25 %	0 %	258405721
33403	NC_013223	TCA	2	6	1849135	1849140	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258405721
33404	NC_013223	CCG	2	6	1849147	1849152	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258405721
33405	NC_013223	CGC	2	6	1849189	1849194	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258405721
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33408	NC_013223	TAGACG	2	12	1849287	1849298	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	258405721
33409	NC_013223	CCG	2	6	1849326	1849331	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258405721
33410	NC_013223	CTG	2	6	1849335	1849340	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258405721
33411	NC_013223	TCC	2	6	1849389	1849394	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	258405721
33412	NC_013223	TCT	2	6	1849485	1849490	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258405721
33413	NC_013223	CAG	2	6	1849514	1849519	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258405721
33414	NC_013223	GCGG	2	8	1849535	1849542	0 %	0 %	75 %	25 %	258405721
33415	NC_013223	CGA	2	6	1849576	1849581	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258405721
33416	NC_013223	GGC	2	6	1849616	1849621	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258405721
33417	NC_013223	AGG	2	6	1849731	1849736	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258405721
33418	NC_013223	TTC	2	6	1849787	1849792	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258405721
33419	NC_013223	GT	3	6	1849899	1849904	0 %	50 %	50 %	0 %	258405721
33420	NC_013223	TCC	2	6	1849905	1849910	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	258405721
33421	NC_013223	TCT	2	6	1849953	1849958	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258405721
33422	NC_013223	G	6	6	1850056	1850061	0 %	0 %	100 %	0 %	258405721
33423	NC_013223	GCT	2	6	1850071	1850076	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258405721
33424	NC_013223	TTG	2	6	1850090	1850095	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258405721
33425	NC_013223	TC	4	8	1850126	1850133	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
33426	NC_013223	TCGT	2	8	1850173	1850180	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
33427	NC_013223	TG	3	6	1850204	1850209	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
33428	NC_013223	GCA	2	6	1850226	1850231	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
33429	NC_013223	CTGG	2	8	1850339	1850346	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
33430	NC_013223	GCG	2	6	1850358	1850363	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
33431	NC_013223	TGG	2	6	1850419	1850424	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
33432	NC_013223	CAA	2	6	1850543	1850548	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258405722
33433	NC_013223	GAT	2	6	1850571	1850576	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258405722
33434	NC_013223	CTG	2	6	1850685	1850690	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258405722
33435	NC_013223	TCG	2	6	1850695	1850700	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258405722
33436	NC_013223	GGC	3	9	1850783	1850791	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258405722
33437	NC_013223	CGC	2	6	1850795	1850800	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258405722
33438	NC_013223	TCG	2	6	1850869	1850874	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258405722
33439	NC_013223	CCT	2	6	1850879	1850884	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	258405722
33440	NC_013223	TGGG	2	8	1851046	1851053	0 %	25 %	75 %	0 %	258405722
33441	NC_013223	CGA	2	6	1851119	1851124	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258405722
33442	NC_013223	CGC	2	6	1851273	1851278	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258405723
33443	NC_013223	GCG	2	6	1851357	1851362	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258405723
33444	NC_013223	GCA	2	6	1851375	1851380	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258405723
33445	NC_013223	TCG	2	6	1851386	1851391	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258405723
33446	NC_013223	CCGGT	2	10	1851419	1851428	0 %	20 %	40 %	40 %	258405723
33447	NC_013223	CCT	2	6	1851432	1851437	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	258405723
33448	NC_013223	GGT	2	6	1851465	1851470	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258405723
33449	NC_013223	GCCCAT	2	12	1851487	1851498	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	258405723
33450	NC_013223	GCC	2	6	1851499	1851504	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258405723
33451	NC_013223	GCC	2	6	1851518	1851523	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258405723
33452	NC_013223	CTG	2	6	1851673	1851678	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258405723
33453	NC_013223	CCG	2	6	1851708	1851713	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258405723
33454	NC_013223	GTC	2	6	1851735	1851740	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258405723
33455	NC_013223	CCG	2	6	1851802	1851807	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258405724
33456	NC_013223	TCC	3	9	1851889	1851897	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	258405724
33457	NC_013223	TCC	2	6	1851910	1851915	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	258405724
33458	NC_013223	ACG	2	6	1852033	1852038	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258405724
33459	NC_013223	GCT	2	6	1852073	1852078	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258405724
33460	NC_013223	CCA	2	6	1852085	1852090	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258405724
33461	NC_013223	GGC	2	6	1852119	1852124	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258405724
33462	NC_013223	AGCC	2	8	1852249	1852256	25 %	0 %	25 %	50 %	258405724
33463	NC_013223	GCCG	2	8	1852257	1852264	0 %	0 %	50 %	50 %	258405724
33464	NC_013223	GAT	2	6	1852278	1852283	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258405724
33465	NC_013223	GCC	2	6	1852315	1852320	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258405724
33466	NC_013223	GAG	2	6	1852349	1852354	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258405725
33467	NC_013223	GCCCT	2	10	1852379	1852388	0 %	20 %	20 %	60 %	258405725
33468	NC_013223	GCT	2	6	1852397	1852402	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258405725
33469	NC_013223	GTC	2	6	1852493	1852498	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258405725
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33471	NC_013223	TTG	2	6	1852566	1852571	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258405725
33472	NC_013223	GCC	2	6	1852668	1852673	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258405725
33473	NC_013223	GCC	2	6	1852748	1852753	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258405725
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