MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Desulfohalobium retbaense DSM 5692 chromosome

Total Repeats: 51711

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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19002	NC_013223	GCTC	2	8	1045202	1045209	0 %	25 %	25 %	50 %	258405011
19003	NC_013223	CGG	2	6	1045250	1045255	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258405011
19004	NC_013223	GGC	2	6	1045392	1045397	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258405011
19005	NC_013223	TCG	2	6	1045548	1045553	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258405011
19006	NC_013223	AGATCG	2	12	1045566	1045577	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	258405011
19007	NC_013223	CTGA	2	8	1045628	1045635	25 %	25 %	25 %	25 %	258405011
19008	NC_013223	TTC	2	6	1045659	1045664	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258405011
19009	NC_013223	CCT	2	6	1045726	1045731	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	258405011
19010	NC_013223	CTT	2	6	1045804	1045809	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258405011
19011	NC_013223	CAG	2	6	1045940	1045945	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258405011
19012	NC_013223	TTC	2	6	1046021	1046026	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258405011
19013	NC_013223	GACCG	2	10	1046102	1046111	20 %	0 %	40 %	40 %	258405011
19014	NC_013223	AGA	3	9	1046206	1046214	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258405011
19015	NC_013223	ATG	2	6	1046262	1046267	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258405011
19016	NC_013223	TCA	2	6	1046401	1046406	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258405011
19017	NC_013223	AAT	2	6	1046437	1046442	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	258405011
19018	NC_013223	GGC	2	6	1046461	1046466	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258405011
19019	NC_013223	GAT	2	6	1046513	1046518	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258405011
19020	NC_013223	TCGGGC	2	12	1046646	1046657	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	258405011
19021	NC_013223	GCC	2	6	1046686	1046691	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258405011
19022	NC_013223	GGC	2	6	1046773	1046778	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258405011
19023	NC_013223	A	6	6	1046811	1046816	100 %	0 %	0 %	0 %	258405011
19024	NC_013223	AAT	2	6	1046902	1046907	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	258405011
19025	NC_013223	T	6	6	1046915	1046920	0 %	100 %	0 %	0 %	258405011
19026	NC_013223	T	6	6	1046929	1046934	0 %	100 %	0 %	0 %	258405011
19027	NC_013223	GAATC	2	10	1046986	1046995	40 %	20 %	20 %	20 %	258405011
19028	NC_013223	CAG	2	6	1047037	1047042	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258405011
19029	NC_013223	A	6	6	1047108	1047113	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
19030	NC_013223	AT	4	8	1047131	1047138	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19031	NC_013223	GGC	2	6	1047283	1047288	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
19032	NC_013223	CGT	2	6	1047323	1047328	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19033	NC_013223	T	6	6	1047337	1047342	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
19034	NC_013223	TGG	2	6	1047359	1047364	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
19035	NC_013223	T	7	7	1047441	1047447	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
19036	NC_013223	T	7	7	1047534	1047540	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
19037	NC_013223	TTC	2	6	1047574	1047579	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19038	NC_013223	CGG	2	6	1047724	1047729	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258405012
19039	NC_013223	CCT	2	6	1047819	1047824	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	258405012
19040	NC_013223	GAG	2	6	1047883	1047888	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258405012
19041	NC_013223	AGG	2	6	1047947	1047952	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258405012
19042	NC_013223	GAT	2	6	1047975	1047980	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258405012
19043	NC_013223	ATA	2	6	1048037	1048042	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	258405012
19044	NC_013223	GCA	2	6	1048053	1048058	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258405012
19045	NC_013223	GGA	2	6	1048158	1048163	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258405012
19046	NC_013223	AGC	2	6	1048220	1048225	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258405012
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19048	NC_013223	AT	3	6	1048245	1048250	50 %	50 %	0 %	0 %	258405012
19049	NC_013223	ATTCC	2	10	1048292	1048301	20 %	40 %	0 %	40 %	258405012
19050	NC_013223	GGC	2	6	1048316	1048321	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258405012
19051	NC_013223	TGG	2	6	1048391	1048396	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258405012
19052	NC_013223	ACG	2	6	1048534	1048539	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258405012
19053	NC_013223	GAG	2	6	1048585	1048590	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258405012
19054	NC_013223	ACTGG	2	10	1048695	1048704	20 %	20 %	40 %	20 %	258405012
19055	NC_013223	CACGC	2	10	1048782	1048791	20 %	0 %	20 %	60 %	258405012
19056	NC_013223	ATC	2	6	1048942	1048947	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258405012
19057	NC_013223	CGA	2	6	1048950	1048955	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258405012
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19063	NC_013223	GAA	2	6	1049257	1049262	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258405012
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19071	NC_013223	GCA	2	6	1049795	1049800	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258405012
19072	NC_013223	GC	3	6	1049839	1049844	0 %	0 %	50 %	50 %	258405013
19073	NC_013223	TA	4	8	1049863	1049870	50 %	50 %	0 %	0 %	258405013
19074	NC_013223	GCGGA	2	10	1049957	1049966	20 %	0 %	60 %	20 %	258405013
19075	NC_013223	A	6	6	1050019	1050024	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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19077	NC_013223	GCC	2	6	1050049	1050054	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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19079	NC_013223	ATACAT	2	12	1050222	1050233	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
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19089	NC_013223	GCG	2	6	1050782	1050787	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258405014
19090	NC_013223	CCCT	2	8	1050870	1050877	0 %	25 %	0 %	75 %	258405014
19091	NC_013223	G	6	6	1050981	1050986	0 %	0 %	100 %	0 %	258405014
19092	NC_013223	GCC	2	6	1051021	1051026	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258405014
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19106	NC_013223	GCG	2	6	1051912	1051917	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
19107	NC_013223	CG	3	6	1051933	1051938	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
19108	NC_013223	CGGG	2	8	1051993	1052000	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
19109	NC_013223	AAG	2	6	1052033	1052038	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258405015
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19115	NC_013223	GCG	2	6	1052428	1052433	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258405015
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19234	NC_013223	GTG	2	6	1059266	1059271	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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19236	NC_013223	C	6	6	1059402	1059407	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
19237	NC_013223	T	10	10	1059422	1059431	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
19238	NC_013223	C	6	6	1059455	1059460	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
19239	NC_013223	TCCC	2	8	1059468	1059475	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
19240	NC_013223	GTC	2	6	1059510	1059515	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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19242	NC_013223	G	6	6	1059570	1059575	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
19243	NC_013223	TG	4	8	1059578	1059585	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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19250	NC_013223	TGG	2	6	1059899	1059904	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258405021
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19349	NC_013223	G	6	6	1065000	1065005	0 %	0 %	100 %	0 %	258405025
19350	NC_013223	A	6	6	1065017	1065022	100 %	0 %	0 %	0 %	258405025
19351	NC_013223	GCC	2	6	1065043	1065048	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
19352	NC_013223	GCC	2	6	1065056	1065061	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258405026
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19354	NC_013223	CAT	2	6	1065131	1065136	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258405026
19355	NC_013223	G	6	6	1065230	1065235	0 %	0 %	100 %	0 %	258405026
19356	NC_013223	AG	3	6	1065238	1065243	50 %	0 %	50 %	0 %	258405026
19357	NC_013223	CGC	2	6	1065296	1065301	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258405026
19358	NC_013223	GGT	2	6	1065371	1065376	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258405026
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19467	NC_013223	GCC	2	6	1072237	1072242	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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19472	NC_013223	TGT	2	6	1072439	1072444	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258405032
19473	NC_013223	CAGC	2	8	1072520	1072527	25 %	0 %	25 %	50 %	258405032
19474	NC_013223	GAA	2	6	1072555	1072560	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258405032
19475	NC_013223	ATG	2	6	1072568	1072573	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258405032
19476	NC_013223	ATT	2	6	1072673	1072678	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	258405032
19477	NC_013223	GCC	2	6	1072795	1072800	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258405032
19478	NC_013223	CAT	2	6	1072842	1072847	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258405032
19479	NC_013223	ACA	2	6	1072886	1072891	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258405032
19480	NC_013223	GCG	2	6	1072910	1072915	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258405032
19481	NC_013223	GGATT	2	10	1072956	1072965	20 %	40 %	40 %	0 %	258405032
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19484	NC_013223	TCA	2	6	1073207	1073212	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258405032
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19487	NC_013223	CCT	2	6	1073258	1073263	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
19488	NC_013223	G	6	6	1073311	1073316	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
19489	NC_013223	T	8	8	1073323	1073330	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
19490	NC_013223	TCT	2	6	1073372	1073377	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19491	NC_013223	TTG	2	6	1073483	1073488	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19492	NC_013223	CA	3	6	1073578	1073583	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
19493	NC_013223	T	8	8	1073637	1073644	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
19494	NC_013223	G	6	6	1073688	1073693	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
19495	NC_013223	GTT	2	6	1073776	1073781	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19496	NC_013223	GAT	2	6	1073894	1073899	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258405033
19497	NC_013223	G	6	6	1073900	1073905	0 %	0 %	100 %	0 %	258405033
19498	NC_013223	CGA	2	6	1074124	1074129	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258405033
19499	NC_013223	CGG	2	6	1074135	1074140	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258405033
19500	NC_013223	CCA	2	6	1074397	1074402	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258405033

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