MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Desulfohalobium retbaense DSM 5692 chromosome

Total Repeats: 51711

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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18502	NC_013223	GGC	2	6	1017697	1017702	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258404986
18503	NC_013223	GGC	2	6	1017749	1017754	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258404986
18504	NC_013223	CGC	3	9	1017771	1017779	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258404986
18505	NC_013223	AGC	2	6	1017849	1017854	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258404986
18506	NC_013223	TTG	2	6	1017855	1017860	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258404986
18507	NC_013223	TGC	2	6	1017876	1017881	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258404986
18508	NC_013223	CTG	2	6	1017899	1017904	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258404986
18509	NC_013223	GT	3	6	1018015	1018020	0 %	50 %	50 %	0 %	258404986
18510	NC_013223	CGG	2	6	1018021	1018026	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258404986
18511	NC_013223	TGC	2	6	1018087	1018092	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258404986
18512	NC_013223	T	6	6	1018104	1018109	0 %	100 %	0 %	0 %	258404986
18513	NC_013223	GGT	3	9	1018123	1018131	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258404986
18514	NC_013223	AAGA	2	8	1018211	1018218	75 %	0 %	25 %	0 %	258404986
18515	NC_013223	AG	3	6	1018333	1018338	50 %	0 %	50 %	0 %	258404986
18516	NC_013223	TTC	2	6	1018536	1018541	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258404986
18517	NC_013223	TCG	3	9	1018647	1018655	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258404986
18518	NC_013223	GCC	2	6	1018691	1018696	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258404986
18519	NC_013223	GCCT	2	8	1018700	1018707	0 %	25 %	25 %	50 %	258404986
18520	NC_013223	GCCA	2	8	1018978	1018985	25 %	0 %	25 %	50 %	258404986
18521	NC_013223	GAG	3	9	1019009	1019017	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258404986
18522	NC_013223	GC	3	6	1019032	1019037	0 %	0 %	50 %	50 %	258404986
18523	NC_013223	GGT	2	6	1019059	1019064	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258404986
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18525	NC_013223	AGCC	2	8	1019099	1019106	25 %	0 %	25 %	50 %	258404986
18526	NC_013223	A	6	6	1019168	1019173	100 %	0 %	0 %	0 %	258404986
18527	NC_013223	GCC	2	6	1019252	1019257	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258404986
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18532	NC_013223	ACG	2	6	1019462	1019467	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258404986
18533	NC_013223	GGCGG	2	10	1019534	1019543	0 %	0 %	80 %	20 %	258404986
18534	NC_013223	CGC	2	6	1019587	1019592	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258404986
18535	NC_013223	A	7	7	1019611	1019617	100 %	0 %	0 %	0 %	258404986
18536	NC_013223	TGG	2	6	1019628	1019633	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258404986
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18545	NC_013223	GAC	2	6	1020372	1020377	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258404988
18546	NC_013223	T	6	6	1020483	1020488	0 %	100 %	0 %	0 %	258404988
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18548	NC_013223	GAT	2	6	1020638	1020643	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18549	NC_013223	AG	3	6	1020648	1020653	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
18550	NC_013223	GGC	2	6	1020662	1020667	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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18552	NC_013223	CGC	2	6	1020825	1020830	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
18553	NC_013223	GGC	2	6	1020842	1020847	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
18554	NC_013223	GCCA	2	8	1020924	1020931	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
18555	NC_013223	GTG	2	6	1020945	1020950	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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18567	NC_013223	GAT	2	6	1021719	1021724	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258404990
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18581	NC_013223	CGATC	2	10	1022707	1022716	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
18582	NC_013223	TTGC	2	8	1022838	1022845	0 %	50 %	25 %	25 %	258404991
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18590	NC_013223	GGC	2	6	1023151	1023156	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258404991
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18606	NC_013223	GC	3	6	1023665	1023670	0 %	0 %	50 %	50 %	258404991
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18614	NC_013223	G	6	6	1024318	1024323	0 %	0 %	100 %	0 %	258404992
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18617	NC_013223	CAA	2	6	1024653	1024658	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18618	NC_013223	A	7	7	1024657	1024663	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
18619	NC_013223	T	7	7	1024678	1024684	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
18620	NC_013223	CG	3	6	1024716	1024721	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
18621	NC_013223	AGA	2	6	1024731	1024736	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18622	NC_013223	CGT	2	6	1024748	1024753	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258404993
18623	NC_013223	TCA	2	6	1024821	1024826	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258404993
18624	NC_013223	T	6	6	1024849	1024854	0 %	100 %	0 %	0 %	258404993
18625	NC_013223	GTC	2	6	1024904	1024909	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258404993
18626	NC_013223	CCT	2	6	1024979	1024984	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
18627	NC_013223	GTT	2	6	1025055	1025060	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18628	NC_013223	TTC	2	6	1025233	1025238	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18629	NC_013223	GC	3	6	1025281	1025286	0 %	0 %	50 %	50 %	258404994
18630	NC_013223	GAGG	2	8	1025298	1025305	25 %	0 %	75 %	0 %	258404994
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18633	NC_013223	T	6	6	1025596	1025601	0 %	100 %	0 %	0 %	258404994
18634	NC_013223	CGCGA	2	10	1025628	1025637	20 %	0 %	40 %	40 %	258404994
18635	NC_013223	GCG	2	6	1025748	1025753	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
18636	NC_013223	TCC	2	6	1025789	1025794	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
18637	NC_013223	C	6	6	1025793	1025798	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
18638	NC_013223	G	6	6	1025835	1025840	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
18639	NC_013223	GAT	2	6	1025919	1025924	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258404995
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18663	NC_013223	TCG	2	6	1027486	1027491	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258404995
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18672	NC_013223	GTT	2	6	1027915	1027920	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18673	NC_013223	CTG	2	6	1027947	1027952	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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18684	NC_013223	TGC	2	6	1028527	1028532	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258404997
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18738	NC_013223	GGC	2	6	1031667	1031672	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258405000
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18742	NC_013223	GAT	2	6	1031817	1031822	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258405000
18743	NC_013223	GAT	2	6	1031865	1031870	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258405000
18744	NC_013223	GGA	2	6	1031876	1031881	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258405000
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18750	NC_013223	GGGT	2	8	1032238	1032245	0 %	25 %	75 %	0 %	258405002
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18826	NC_013223	GTT	2	6	1036290	1036295	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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18830	NC_013223	GTG	3	9	1036469	1036477	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
18831	NC_013223	GGGA	2	8	1036501	1036508	25 %	0 %	75 %	0 %	258405005
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18842	NC_013223	TGG	2	6	1037250	1037255	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258405005
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18846	NC_013223	GTC	3	9	1037395	1037403	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258405005
18847	NC_013223	A	7	7	1037405	1037411	100 %	0 %	0 %	0 %	258405005
18848	NC_013223	TCC	2	6	1037438	1037443	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	258405005
18849	NC_013223	TTG	2	6	1037534	1037539	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258405005
18850	NC_013223	T	8	8	1037554	1037561	0 %	100 %	0 %	0 %	258405005
18851	NC_013223	GCG	2	6	1037595	1037600	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258405005
18852	NC_013223	GGT	2	6	1037662	1037667	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258405005
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