MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Desulfohalobium retbaense DSM 5692 chromosome

Total Repeats: 51711

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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18002	NC_013223	C	6	6	989049	989054	0 %	0 %	0 %	100 %	258404962
18003	NC_013223	G	7	7	989308	989314	0 %	0 %	100 %	0 %	258404962
18004	NC_013223	AAC	2	6	989406	989411	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258404962
18005	NC_013223	TTTTC	2	10	989495	989504	0 %	80 %	0 %	20 %	258404962
18006	NC_013223	ATC	2	6	989520	989525	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258404962
18007	NC_013223	CGTC	2	8	989533	989540	0 %	25 %	25 %	50 %	258404962
18008	NC_013223	GGT	2	6	989556	989561	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258404962
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18010	NC_013223	AT	3	6	989614	989619	50 %	50 %	0 %	0 %	258404962
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18012	NC_013223	CCG	2	6	989770	989775	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258404962
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18015	NC_013223	G	6	6	989975	989980	0 %	0 %	100 %	0 %	258404962
18016	NC_013223	CTG	2	6	989997	990002	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258404962
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18020	NC_013223	CAT	2	6	990198	990203	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258404962
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18045	NC_013223	CTG	2	6	991780	991785	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18046	NC_013223	G	7	7	991785	991791	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
18047	NC_013223	GA	3	6	991824	991829	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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18123	NC_013223	TCC	2	6	995876	995881	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
18124	NC_013223	ATTTT	2	10	995893	995902	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
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18128	NC_013223	TGGC	2	8	996277	996284	0 %	25 %	50 %	25 %	258404966
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18151	NC_013223	TTGT	2	8	997676	997683	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
18152	NC_013223	CCTG	2	8	997684	997691	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
18153	NC_013223	CGGG	2	8	997757	997764	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
18154	NC_013223	TCG	2	6	997825	997830	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258404968
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18202	NC_013223	GC	3	6	1001153	1001158	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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18228	NC_013223	T	7	7	1002665	1002671	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
18229	NC_013223	AGG	2	6	1002755	1002760	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
18230	NC_013223	CGG	2	6	1002806	1002811	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258404972
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18232	NC_013223	TGTT	2	8	1002865	1002872	0 %	75 %	25 %	0 %	258404972
18233	NC_013223	T	6	6	1002874	1002879	0 %	100 %	0 %	0 %	258404972
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18243	NC_013223	AGC	2	6	1003212	1003217	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258404973
18244	NC_013223	GCTTG	2	10	1003256	1003265	0 %	40 %	40 %	20 %	258404973
18245	NC_013223	TGC	2	6	1003285	1003290	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258404973
18246	NC_013223	GAG	2	6	1003449	1003454	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258404973
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18248	NC_013223	GGA	2	6	1003550	1003555	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258404973
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18250	NC_013223	CGA	2	6	1003838	1003843	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258404973
18251	NC_013223	TCCC	2	8	1003879	1003886	0 %	25 %	0 %	75 %	258404973
18252	NC_013223	AAG	2	6	1003935	1003940	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258404973
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18254	NC_013223	TCAA	2	8	1004050	1004057	50 %	25 %	0 %	25 %	258404973
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18259	NC_013223	GCA	2	6	1004300	1004305	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258404973
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18272	NC_013223	G	6	6	1004941	1004946	0 %	0 %	100 %	0 %	258404974
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18295	NC_013223	G	6	6	1005963	1005968	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
18296	NC_013223	GAAG	2	8	1006085	1006092	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
18297	NC_013223	GGC	2	6	1006136	1006141	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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18361	NC_013223	TTG	2	6	1009368	1009373	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258404978
18362	NC_013223	TTCG	2	8	1009401	1009408	0 %	50 %	25 %	25 %	258404978
18363	NC_013223	TGG	2	6	1009474	1009479	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258404978
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18382	NC_013223	GCA	2	6	1010645	1010650	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258404978
18383	NC_013223	GA	3	6	1010683	1010688	50 %	0 %	50 %	0 %	258404978
18384	NC_013223	CCG	2	6	1010785	1010790	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258404978
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18387	NC_013223	GCAG	2	8	1010931	1010938	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
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18389	NC_013223	CGT	2	6	1011010	1011015	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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18391	NC_013223	C	6	6	1011093	1011098	0 %	0 %	0 %	100 %	258404979
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18397	NC_013223	CAGT	2	8	1011690	1011697	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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18407	NC_013223	TTG	2	6	1012297	1012302	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258404981
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18473	NC_013223	GGAA	2	8	1016252	1016259	50 %	0 %	50 %	0 %	258404985
18474	NC_013223	GAG	2	6	1016276	1016281	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258404985
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18476	NC_013223	CCG	2	6	1016318	1016323	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258404985
18477	NC_013223	TTC	2	6	1016350	1016355	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258404985
18478	NC_013223	GA	3	6	1016375	1016380	50 %	0 %	50 %	0 %	258404985
18479	NC_013223	GGT	2	6	1016464	1016469	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258404985
18480	NC_013223	GTA	2	6	1016539	1016544	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258404985
18481	NC_013223	TCA	2	6	1016589	1016594	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258404985
18482	NC_013223	CCT	2	6	1016607	1016612	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	258404985
18483	NC_013223	CCG	2	6	1016641	1016646	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258404985
18484	NC_013223	ACC	2	6	1016669	1016674	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258404985
18485	NC_013223	TCA	2	6	1016723	1016728	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258404985
18486	NC_013223	CCG	2	6	1016734	1016739	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258404985
18487	NC_013223	ATC	2	6	1016920	1016925	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258404985
18488	NC_013223	ATCGTG	2	12	1016962	1016973	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	258404985
18489	NC_013223	CCGCC	2	10	1017084	1017093	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
18490	NC_013223	AG	3	6	1017141	1017146	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
18491	NC_013223	GAT	2	6	1017176	1017181	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18492	NC_013223	T	8	8	1017181	1017188	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
18493	NC_013223	AG	3	6	1017198	1017203	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
18494	NC_013223	TTG	2	6	1017293	1017298	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258404986
18495	NC_013223	CA	3	6	1017372	1017377	50 %	0 %	0 %	50 %	258404986
18496	NC_013223	CAC	2	6	1017409	1017414	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258404986
18497	NC_013223	GCT	2	6	1017485	1017490	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258404986
18498	NC_013223	CCGC	2	8	1017559	1017566	0 %	0 %	25 %	75 %	258404986
18499	NC_013223	TGG	2	6	1017624	1017629	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258404986
18500	NC_013223	GGC	2	6	1017632	1017637	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258404986

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