MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Desulfohalobium retbaense DSM 5692 chromosome

Total Repeats: 51711

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
15501	NC_013223	CCAGG	2	10	851325	851334	20 %	0 %	40 %	40 %	258404844
15502	NC_013223	CGG	2	6	851357	851362	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258404844
15503	NC_013223	TCCT	2	8	851424	851431	0 %	50 %	0 %	50 %	258404844
15504	NC_013223	GGGT	2	8	851464	851471	0 %	25 %	75 %	0 %	258404844
15505	NC_013223	GGT	2	6	851504	851509	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258404844
15506	NC_013223	GCAG	2	8	851516	851523	25 %	0 %	50 %	25 %	258404844
15507	NC_013223	ATTCCA	2	12	851564	851575	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258404844
15508	NC_013223	GCG	2	6	851598	851603	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258404844
15509	NC_013223	CG	3	6	851624	851629	0 %	0 %	50 %	50 %	258404844
15510	NC_013223	GGC	2	6	851676	851681	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258404844
15511	NC_013223	GGC	2	6	851790	851795	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258404844
15512	NC_013223	GCT	2	6	851798	851803	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258404844
15513	NC_013223	GGC	2	6	851883	851888	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258404844
15514	NC_013223	GCG	2	6	851899	851904	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258404844
15515	NC_013223	GA	3	6	851918	851923	50 %	0 %	50 %	0 %	258404844
15516	NC_013223	CTTTG	2	10	851927	851936	0 %	60 %	20 %	20 %	258404844
15517	NC_013223	CG	3	6	851937	851942	0 %	0 %	50 %	50 %	258404844
15518	NC_013223	GAG	2	6	852030	852035	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258404844
15519	NC_013223	TCC	2	6	852045	852050	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	258404844
15520	NC_013223	CAG	2	6	852059	852064	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258404844
15521	NC_013223	T	6	6	852101	852106	0 %	100 %	0 %	0 %	258404845
15522	NC_013223	CAG	2	6	852116	852121	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258404845
15523	NC_013223	GATG	2	8	852160	852167	25 %	25 %	50 %	0 %	258404845
15524	NC_013223	AGG	2	6	852210	852215	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258404845
15525	NC_013223	GTA	2	6	852272	852277	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258404845
15526	NC_013223	CTC	2	6	852332	852337	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	258404845
15527	NC_013223	TCC	2	6	852387	852392	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	258404845
15528	NC_013223	GA	3	6	852418	852423	50 %	0 %	50 %	0 %	258404845
15529	NC_013223	CGT	2	6	852478	852483	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258404845
15530	NC_013223	T	6	6	852501	852506	0 %	100 %	0 %	0 %	258404845
15531	NC_013223	CCA	2	6	852508	852513	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258404845
15532	NC_013223	GCG	2	6	852543	852548	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258404845
15533	NC_013223	GCC	2	6	852594	852599	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258404845
15534	NC_013223	ATC	2	6	852612	852617	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258404845
15535	NC_013223	TTG	2	6	852639	852644	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258404845
15536	NC_013223	CAT	2	6	852710	852715	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258404845
15537	NC_013223	CGGC	2	8	852774	852781	0 %	0 %	50 %	50 %	258404845
15538	NC_013223	CGG	2	6	852832	852837	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258404845
15539	NC_013223	GT	3	6	852935	852940	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
15540	NC_013223	TGG	2	6	852945	852950	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
15541	NC_013223	GGC	2	6	852956	852961	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
15542	NC_013223	TTGCCA	2	12	853036	853047	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
15543	NC_013223	AGA	2	6	853048	853053	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15544	NC_013223	GAT	2	6	853114	853119	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258404846
15545	NC_013223	ACCG	2	8	853180	853187	25 %	0 %	25 %	50 %	258404846
15546	NC_013223	AGA	2	6	853192	853197	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258404846
15547	NC_013223	GCG	2	6	853303	853308	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258404846
15548	NC_013223	ACG	2	6	853377	853382	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15549	NC_013223	GGA	2	6	853404	853409	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
15550	NC_013223	TC	3	6	853411	853416	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
15551	NC_013223	GCCA	2	8	853462	853469	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
15552	NC_013223	TGG	2	6	853595	853600	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
15553	NC_013223	GA	3	6	853606	853611	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
15554	NC_013223	TCTT	2	8	853613	853620	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
15555	NC_013223	AGG	2	6	853680	853685	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
15556	NC_013223	GTA	2	6	853731	853736	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258404847
15557	NC_013223	GCG	2	6	853783	853788	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258404847
15558	NC_013223	TGAC	2	8	853887	853894	25 %	25 %	25 %	25 %	258404847
15559	NC_013223	AGG	3	9	853926	853934	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258404847
15560	NC_013223	GC	3	6	853954	853959	0 %	0 %	50 %	50 %	258404847
15561	NC_013223	ATA	2	6	854010	854015	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	258404847
15562	NC_013223	AGA	2	6	854065	854070	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258404847
15563	NC_013223	AGA	2	6	854082	854087	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258404847
15564	NC_013223	ATACA	2	10	854126	854135	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
15565	NC_013223	ATT	2	6	854211	854216	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	258404848
15566	NC_013223	GGAT	2	8	854225	854232	25 %	25 %	50 %	0 %	258404848
15567	NC_013223	TCT	2	6	854237	854242	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258404848
15568	NC_013223	CTC	2	6	854328	854333	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	258404848
15569	NC_013223	TGG	2	6	854518	854523	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
15570	NC_013223	T	8	8	854555	854562	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15571	NC_013223	GCGGG	2	10	854573	854582	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
15572	NC_013223	GAAA	2	8	854645	854652	75 %	0 %	25 %	0 %	258404849
15573	NC_013223	A	6	6	854650	854655	100 %	0 %	0 %	0 %	258404849
15574	NC_013223	GTCC	2	8	854659	854666	0 %	25 %	25 %	50 %	258404849
15575	NC_013223	CTCG	2	8	854676	854683	0 %	25 %	25 %	50 %	258404849
15576	NC_013223	TGC	2	6	854744	854749	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258404849
15577	NC_013223	CGG	2	6	854774	854779	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258404849
15578	NC_013223	GCAA	2	8	854824	854831	50 %	0 %	25 %	25 %	258404849
15579	NC_013223	ATG	2	6	854888	854893	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258404849
15580	NC_013223	GAGCC	2	10	854928	854937	20 %	0 %	40 %	40 %	258404849
15581	NC_013223	TAC	3	9	854986	854994	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258404849
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15584	NC_013223	CCG	2	6	855067	855072	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258404849
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15586	NC_013223	GAA	2	6	855240	855245	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258404849
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15588	NC_013223	GACG	2	8	855300	855307	25 %	0 %	50 %	25 %	258404849
15589	NC_013223	GGA	2	6	855408	855413	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258404849
15590	NC_013223	C	6	6	855461	855466	0 %	0 %	0 %	100 %	258404849
15591	NC_013223	GGGA	2	8	855525	855532	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
15592	NC_013223	CTG	2	6	855564	855569	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258404850
15593	NC_013223	GA	3	6	855602	855607	50 %	0 %	50 %	0 %	258404850
15594	NC_013223	CGT	2	6	855649	855654	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258404850
15595	NC_013223	ACGG	2	8	855701	855708	25 %	0 %	50 %	25 %	258404850
15596	NC_013223	GCA	2	6	855727	855732	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258404850
15597	NC_013223	A	6	6	855750	855755	100 %	0 %	0 %	0 %	258404850
15598	NC_013223	ACG	2	6	855825	855830	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258404850
15599	NC_013223	CGG	2	6	855925	855930	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258404850
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15601	NC_013223	ACG	2	6	856088	856093	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258404850
15602	NC_013223	GC	3	6	856156	856161	0 %	0 %	50 %	50 %	258404850
15603	NC_013223	CCA	2	6	856269	856274	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
15604	NC_013223	CG	3	6	856410	856415	0 %	0 %	50 %	50 %	258404851
15605	NC_013223	GCGAT	2	10	856452	856461	20 %	20 %	40 %	20 %	258404851
15606	NC_013223	TGGA	2	8	856518	856525	25 %	25 %	50 %	0 %	258404851
15607	NC_013223	GCG	2	6	856551	856556	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258404851
15608	NC_013223	GACG	2	8	856603	856610	25 %	0 %	50 %	25 %	258404851
15609	NC_013223	CTG	2	6	856623	856628	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258404851
15610	NC_013223	ACA	2	6	856674	856679	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258404851
15611	NC_013223	TTGT	2	8	856758	856765	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
15612	NC_013223	CGT	2	6	856769	856774	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15613	NC_013223	GGT	2	6	856838	856843	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258404852
15614	NC_013223	CGT	2	6	856965	856970	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258404852
15615	NC_013223	CGC	2	6	857057	857062	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258404853
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15619	NC_013223	TTG	2	6	857328	857333	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258404853
15620	NC_013223	GACC	2	8	857345	857352	25 %	0 %	25 %	50 %	258404853
15621	NC_013223	TCTGA	2	10	857366	857375	20 %	40 %	20 %	20 %	258404853
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15623	NC_013223	TGG	2	6	857489	857494	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258404853
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15993	NC_013223	TCG	2	6	877533	877538	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258404871
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