MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Desulfohalobium retbaense DSM 5692 chromosome

Total Repeats: 51711

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
15001	NC_013223	TGA	2	6	827070	827075	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258404820
15002	NC_013223	GCA	2	6	827113	827118	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258404820
15003	NC_013223	TCC	2	6	827386	827391	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	258404821
15004	NC_013223	TCA	2	6	827423	827428	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258404821
15005	NC_013223	GGA	2	6	827468	827473	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258404821
15006	NC_013223	CCT	2	6	827575	827580	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
15007	NC_013223	GGT	2	6	827584	827589	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
15008	NC_013223	GCC	2	6	827660	827665	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
15009	NC_013223	CCA	2	6	827679	827684	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
15010	NC_013223	G	6	6	827748	827753	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
15011	NC_013223	T	6	6	827760	827765	0 %	100 %	0 %	0 %	258404822
15012	NC_013223	GCC	2	6	827766	827771	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258404822
15013	NC_013223	TCG	2	6	827818	827823	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258404822
15014	NC_013223	CTGG	2	8	827831	827838	0 %	25 %	50 %	25 %	258404822
15015	NC_013223	GGTGG	2	10	827853	827862	0 %	20 %	80 %	0 %	258404822
15016	NC_013223	AG	3	6	827962	827967	50 %	0 %	50 %	0 %	258404822
15017	NC_013223	CGT	2	6	827968	827973	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258404822
15018	NC_013223	CGC	2	6	828095	828100	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258404822
15019	NC_013223	CGG	2	6	828101	828106	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258404822
15020	NC_013223	ATG	2	6	828121	828126	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258404822
15021	NC_013223	CGC	2	6	828128	828133	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258404822
15022	NC_013223	CCGG	2	8	828145	828152	0 %	0 %	50 %	50 %	258404822
15023	NC_013223	GCA	2	6	828167	828172	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258404822
15024	NC_013223	CTC	2	6	828228	828233	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
15025	NC_013223	TTC	2	6	828284	828289	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15026	NC_013223	GTC	2	6	828296	828301	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15027	NC_013223	CGC	2	6	828337	828342	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
15028	NC_013223	TCC	2	6	828395	828400	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
15029	NC_013223	GCA	2	6	828410	828415	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15030	NC_013223	GTG	2	6	828433	828438	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
15031	NC_013223	GTT	2	6	828590	828595	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258404823
15032	NC_013223	GTT	2	6	828639	828644	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258404823
15033	NC_013223	CCG	2	6	828655	828660	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258404823
15034	NC_013223	CCCGG	2	10	828669	828678	0 %	0 %	40 %	60 %	258404823
15035	NC_013223	GAG	2	6	828771	828776	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258404823
15036	NC_013223	GCG	2	6	829006	829011	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258404823
15037	NC_013223	CTT	2	6	829202	829207	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258404823
15038	NC_013223	GCG	2	6	829285	829290	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258404823
15039	NC_013223	GTC	2	6	829293	829298	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258404823
15040	NC_013223	ACG	2	6	829306	829311	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258404823
15041	NC_013223	TCA	2	6	829340	829345	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258404823
15042	NC_013223	GTC	2	6	829411	829416	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258404823
15043	NC_013223	GTC	2	6	829423	829428	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258404824
15044	NC_013223	CTC	2	6	829519	829524	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	258404824
15045	NC_013223	GGT	2	6	829609	829614	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258404824
15046	NC_013223	GCC	4	12	829693	829704	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258404824
15047	NC_013223	CGGCA	2	10	829726	829735	20 %	0 %	40 %	40 %	258404824
15048	NC_013223	GAT	2	6	829765	829770	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258404824
15049	NC_013223	GA	3	6	829817	829822	50 %	0 %	50 %	0 %	258404824
15050	NC_013223	TCA	2	6	829884	829889	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258404824
15051	NC_013223	GTG	2	6	830032	830037	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258404824
15052	NC_013223	T	6	6	830038	830043	0 %	100 %	0 %	0 %	258404824
15053	NC_013223	ACC	2	6	830084	830089	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258404824
15054	NC_013223	CCG	2	6	830189	830194	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258404824
15055	NC_013223	GTC	2	6	830254	830259	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258404824
15056	NC_013223	GGC	2	6	830310	830315	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258404824
15057	NC_013223	TCT	2	6	830492	830497	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258404824
15058	NC_013223	GTCC	2	8	830653	830660	0 %	25 %	25 %	50 %	258404824
15059	NC_013223	GA	3	6	830682	830687	50 %	0 %	50 %	0 %	258404824
15060	NC_013223	T	6	6	830688	830693	0 %	100 %	0 %	0 %	258404824
15061	NC_013223	TGT	2	6	830708	830713	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258404824
15062	NC_013223	TCT	2	6	830743	830748	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15063	NC_013223	TAAA	2	8	830823	830830	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
15064	NC_013223	TGAG	2	8	830870	830877	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
15065	NC_013223	T	7	7	830957	830963	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15066	NC_013223	GGT	2	6	831082	831087	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
15067	NC_013223	TGG	2	6	831138	831143	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258404825
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15070	NC_013223	G	6	6	831267	831272	0 %	0 %	100 %	0 %	258404825
15071	NC_013223	TGG	2	6	831327	831332	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258404825
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15074	NC_013223	GCC	2	6	831546	831551	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258404825
15075	NC_013223	AGGC	2	8	831552	831559	25 %	0 %	50 %	25 %	258404825
15076	NC_013223	GGC	2	6	831561	831566	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258404825
15077	NC_013223	TCTG	2	8	831573	831580	0 %	50 %	25 %	25 %	258404825
15078	NC_013223	GGGC	2	8	831592	831599	0 %	0 %	75 %	25 %	258404825
15079	NC_013223	GGC	2	6	831610	831615	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258404825
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15082	NC_013223	CGC	2	6	831681	831686	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258404825
15083	NC_013223	CTGGG	2	10	831710	831719	0 %	20 %	60 %	20 %	258404825
15084	NC_013223	TCCC	2	8	831790	831797	0 %	25 %	0 %	75 %	258404825
15085	NC_013223	CGG	2	6	831828	831833	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258404825
15086	NC_013223	TCCT	2	8	831861	831868	0 %	50 %	0 %	50 %	258404825
15087	NC_013223	CAGG	2	8	831943	831950	25 %	0 %	50 %	25 %	258404825
15088	NC_013223	CGA	2	6	831964	831969	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258404825
15089	NC_013223	TGC	2	6	832085	832090	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258404826
15090	NC_013223	GCA	2	6	832091	832096	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258404826
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15092	NC_013223	CCT	2	6	832154	832159	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	258404826
15093	NC_013223	GTG	2	6	832204	832209	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258404826
15094	NC_013223	CGA	2	6	832217	832222	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258404826
15095	NC_013223	G	6	6	832223	832228	0 %	0 %	100 %	0 %	258404826
15096	NC_013223	GGTT	2	8	832394	832401	0 %	50 %	50 %	0 %	258404826
15097	NC_013223	AAC	2	6	832419	832424	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258404826
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15099	NC_013223	GCC	2	6	832575	832580	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
15100	NC_013223	CTG	3	9	832641	832649	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258404827
15101	NC_013223	GTTG	2	8	832688	832695	0 %	50 %	50 %	0 %	258404827
15102	NC_013223	AGA	2	6	832715	832720	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258404827
15103	NC_013223	A	6	6	832753	832758	100 %	0 %	0 %	0 %	258404827
15104	NC_013223	GGTTCG	2	12	832916	832927	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
15105	NC_013223	CAG	2	6	832967	832972	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15106	NC_013223	CGAG	2	8	832989	832996	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
15107	NC_013223	CTG	2	6	833103	833108	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258404828
15108	NC_013223	GCC	2	6	833137	833142	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258404828
15109	NC_013223	TCC	2	6	833212	833217	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	258404828
15110	NC_013223	GCA	2	6	833309	833314	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258404828
15111	NC_013223	GT	3	6	833323	833328	0 %	50 %	50 %	0 %	258404828
15112	NC_013223	ACG	2	6	833340	833345	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258404828
15113	NC_013223	TGTT	2	8	833346	833353	0 %	75 %	25 %	0 %	258404828
15114	NC_013223	AGC	2	6	833391	833396	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258404828
15115	NC_013223	TGG	2	6	833476	833481	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258404828
15116	NC_013223	CA	3	6	833490	833495	50 %	0 %	0 %	50 %	258404828
15117	NC_013223	CCG	2	6	833577	833582	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258404828
15118	NC_013223	AG	3	6	833588	833593	50 %	0 %	50 %	0 %	258404828
15119	NC_013223	GAC	2	6	833610	833615	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258404828
15120	NC_013223	CGG	2	6	833651	833656	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258404828
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15122	NC_013223	AGC	2	6	833803	833808	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258404828
15123	NC_013223	TGT	2	6	833837	833842	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258404828
15124	NC_013223	CCGG	2	8	833884	833891	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15125	NC_013223	ATGC	2	8	833917	833924	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
15126	NC_013223	G	6	6	833966	833971	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
15127	NC_013223	A	7	7	834028	834034	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15128	NC_013223	TCA	2	6	834070	834075	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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15130	NC_013223	CGC	2	6	834097	834102	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
15131	NC_013223	TGGCCA	2	12	834149	834160	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15132	NC_013223	GT	5	10	834214	834223	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
15133	NC_013223	AAG	2	6	834244	834249	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15134	NC_013223	TGT	2	6	834404	834409	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15135	NC_013223	T	6	6	834409	834414	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15136	NC_013223	GTT	2	6	834422	834427	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15137	NC_013223	T	6	6	834426	834431	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15138	NC_013223	AGG	2	6	834447	834452	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
15139	NC_013223	GCT	2	6	834454	834459	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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15141	NC_013223	GTG	2	6	834527	834532	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
15142	NC_013223	GGT	2	6	834534	834539	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
15143	NC_013223	AGC	2	6	834546	834551	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15144	NC_013223	TCTG	2	8	834584	834591	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
15145	NC_013223	ACG	2	6	834596	834601	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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15228	NC_013223	GGC	2	6	838712	838717	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258404832
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15230	NC_013223	CATGGC	2	12	838949	838960	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	258404832
15231	NC_013223	TCG	2	6	838980	838985	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258404832
15232	NC_013223	CCGGG	2	10	839129	839138	0 %	0 %	60 %	40 %	258404832
15233	NC_013223	CGGG	2	8	839175	839182	0 %	0 %	75 %	25 %	258404832
15234	NC_013223	GGCCT	2	10	839216	839225	0 %	20 %	40 %	40 %	258404832
15235	NC_013223	GCT	2	6	839273	839278	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258404832
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15237	NC_013223	GGACC	2	10	839387	839396	20 %	0 %	40 %	40 %	258404832
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15241	NC_013223	GCC	2	6	839699	839704	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258404833
15242	NC_013223	C	6	6	839810	839815	0 %	0 %	0 %	100 %	258404833
15243	NC_013223	CGC	2	6	839865	839870	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258404833
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15246	NC_013223	T	7	7	840086	840092	0 %	100 %	0 %	0 %	258404833
15247	NC_013223	CCACG	2	10	840177	840186	20 %	0 %	20 %	60 %	258404833
15248	NC_013223	CTG	2	6	840229	840234	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258404833
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15255	NC_013223	GT	4	8	840596	840603	0 %	50 %	50 %	0 %	258404833
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15259	NC_013223	TGG	3	9	840696	840704	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
15260	NC_013223	TGG	2	6	840718	840723	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
15261	NC_013223	T	6	6	840840	840845	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15262	NC_013223	GCG	2	6	840846	840851	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
15263	NC_013223	G	7	7	840884	840890	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
15264	NC_013223	A	6	6	840899	840904	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15265	NC_013223	CGG	2	6	840908	840913	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
15266	NC_013223	CCG	2	6	840925	840930	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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15282	NC_013223	TGG	2	6	841849	841854	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258404834
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15341	NC_013223	GAA	2	6	844506	844511	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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15487	NC_013223	GCCA	2	8	850593	850600	25 %	0 %	25 %	50 %	258404843
15488	NC_013223	GGC	2	6	850625	850630	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258404843
15489	NC_013223	CCCG	2	8	850663	850670	0 %	0 %	25 %	75 %	258404843
15490	NC_013223	AAG	2	6	850753	850758	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258404843
15491	NC_013223	CAG	2	6	850857	850862	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258404844
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15499	NC_013223	GCGGT	2	10	851233	851242	0 %	20 %	60 %	20 %	258404844
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