MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Desulfohalobium retbaense DSM 5692 chromosome

Total Repeats: 51711

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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14502	NC_013223	GCG	2	6	800239	800244	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258404799
14503	NC_013223	GGC	2	6	800391	800396	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258404799
14504	NC_013223	GCA	2	6	800422	800427	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258404799
14505	NC_013223	G	6	6	800571	800576	0 %	0 %	100 %	0 %	258404799
14506	NC_013223	AGA	2	6	800615	800620	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258404799
14507	NC_013223	GCA	2	6	800633	800638	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258404799
14508	NC_013223	ACA	2	6	800680	800685	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258404799
14509	NC_013223	TTG	2	6	800689	800694	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258404799
14510	NC_013223	TGT	2	6	800708	800713	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258404799
14511	NC_013223	ACCA	2	8	800716	800723	50 %	0 %	0 %	50 %	258404799
14512	NC_013223	CGGT	2	8	800791	800798	0 %	25 %	50 %	25 %	258404799
14513	NC_013223	GGC	2	6	800852	800857	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258404799
14514	NC_013223	TAG	2	6	800887	800892	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258404799
14515	NC_013223	GCC	2	6	800937	800942	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258404799
14516	NC_013223	TGT	2	6	801023	801028	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258404799
14517	NC_013223	TCGCTG	2	12	801079	801090	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258404799
14518	NC_013223	G	6	6	801122	801127	0 %	0 %	100 %	0 %	258404799
14519	NC_013223	GGGC	2	8	801152	801159	0 %	0 %	75 %	25 %	258404799
14520	NC_013223	TTC	2	6	801162	801167	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258404799
14521	NC_013223	GTC	2	6	801192	801197	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258404799
14522	NC_013223	ACG	2	6	801214	801219	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258404799
14523	NC_013223	CGC	2	6	801227	801232	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258404799
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14525	NC_013223	AGC	2	6	801378	801383	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258404799
14526	NC_013223	TTG	2	6	801408	801413	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258404799
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14528	NC_013223	AGA	2	6	801587	801592	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14529	NC_013223	ACG	2	6	801609	801614	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14530	NC_013223	ATCA	2	8	801621	801628	50 %	25 %	0 %	25 %	258404800
14531	NC_013223	CGA	2	6	801675	801680	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258404800
14532	NC_013223	ACG	2	6	801713	801718	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258404800
14533	NC_013223	GGC	2	6	801748	801753	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258404800
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14535	NC_013223	GCGG	2	8	801906	801913	0 %	0 %	75 %	25 %	258404800
14536	NC_013223	TCA	2	6	801917	801922	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258404800
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14542	NC_013223	GCG	2	6	802228	802233	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258404800
14543	NC_013223	GCCACA	2	12	802286	802297	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	258404800
14544	NC_013223	GAT	2	6	802387	802392	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258404800
14545	NC_013223	A	7	7	802442	802448	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14546	NC_013223	A	6	6	802468	802473	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14547	NC_013223	AAGAAA	2	12	802560	802571	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
14548	NC_013223	TGC	2	6	802741	802746	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14549	NC_013223	CGC	2	6	802768	802773	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14550	NC_013223	CGG	2	6	802786	802791	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
14551	NC_013223	GCG	2	6	802823	802828	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
14552	NC_013223	AGA	2	6	802859	802864	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14553	NC_013223	GAG	2	6	802912	802917	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14554	NC_013223	ACAG	2	8	803035	803042	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
14555	NC_013223	CAA	2	6	803057	803062	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14556	NC_013223	CTT	2	6	803074	803079	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14557	NC_013223	AG	3	6	803147	803152	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
14558	NC_013223	TCC	2	6	803206	803211	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	258404801
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14560	NC_013223	AGA	2	6	803262	803267	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258404801
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14562	NC_013223	TGC	2	6	803426	803431	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258404801
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14570	NC_013223	CGTCG	2	10	803821	803830	0 %	20 %	40 %	40 %	258404801
14571	NC_013223	T	7	7	803898	803904	0 %	100 %	0 %	0 %	258404801
14572	NC_013223	TAC	2	6	803926	803931	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258404801
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14579	NC_013223	GCT	2	6	804404	804409	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258404802
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14587	NC_013223	TCG	3	9	804568	804576	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258404802
14588	NC_013223	GCTCAT	2	12	804617	804628	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	258404802
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14592	NC_013223	GCG	2	6	804783	804788	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258404802
14593	NC_013223	GTT	2	6	804818	804823	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258404802
14594	NC_013223	AGCG	2	8	804897	804904	25 %	0 %	50 %	25 %	258404802
14595	NC_013223	TG	3	6	804931	804936	0 %	50 %	50 %	0 %	258404802
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14600	NC_013223	GCA	2	6	805172	805177	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258404802
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14602	NC_013223	CTC	2	6	805316	805321	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	258404802
14603	NC_013223	GT	3	6	805378	805383	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
14604	NC_013223	A	6	6	805387	805392	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14605	NC_013223	GTC	2	6	805420	805425	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14606	NC_013223	GGT	2	6	805426	805431	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14607	NC_013223	CCA	2	6	805504	805509	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14608	NC_013223	TCC	2	6	805682	805687	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14609	NC_013223	TG	3	6	805720	805725	0 %	50 %	50 %	0 %	258404803
14610	NC_013223	GCC	2	6	805772	805777	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258404803
14611	NC_013223	CGGG	2	8	805819	805826	0 %	0 %	75 %	25 %	258404803
14612	NC_013223	CT	3	6	805852	805857	0 %	50 %	0 %	50 %	258404803
14613	NC_013223	CCT	2	6	805871	805876	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	258404803
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14618	NC_013223	AT	3	6	806154	806159	50 %	50 %	0 %	0 %	258404803
14619	NC_013223	T	6	6	806199	806204	0 %	100 %	0 %	0 %	258404803
14620	NC_013223	CCA	2	6	806217	806222	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258404803
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14622	NC_013223	CCTGG	2	10	806268	806277	0 %	20 %	40 %	40 %	258404803
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14744	NC_013223	CTCGG	2	10	812917	812926	0 %	20 %	40 %	40 %	258404811
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14866	NC_013223	G	8	8	819080	819087	0 %	0 %	100 %	0 %	258404817
14867	NC_013223	GAG	2	6	819096	819101	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258404817
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14984	NC_013223	TGC	2	6	826075	826080	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258404819
14985	NC_013223	GAC	2	6	826158	826163	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258404819
14986	NC_013223	ATGAC	2	10	826255	826264	40 %	20 %	20 %	20 %	258404819
14987	NC_013223	TGC	2	6	826300	826305	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258404819
14988	NC_013223	GAG	2	6	826320	826325	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258404819
14989	NC_013223	AAG	2	6	826383	826388	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258404819
14990	NC_013223	CCA	2	6	826420	826425	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258404819
14991	NC_013223	GT	3	6	826440	826445	0 %	50 %	50 %	0 %	258404819
14992	NC_013223	AGG	2	6	826522	826527	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258404819
14993	NC_013223	A	6	6	826560	826565	100 %	0 %	0 %	0 %	258404819
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14997	NC_013223	AAGG	2	8	826716	826723	50 %	0 %	50 %	0 %	258404819
14998	NC_013223	ATTGGG	2	12	826786	826797	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	258404819
14999	NC_013223	AGG	2	6	826852	826857	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258404819
15000	NC_013223	AGC	2	6	826870	826875	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258404819

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