MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Desulfohalobium retbaense DSM 5692 chromosome

Total Repeats: 51711

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
13001	NC_013223	GTGGC	2	10	717656	717665	0 %	20 %	60 %	20 %	258404728
13002	NC_013223	CGG	2	6	717675	717680	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258404728
13003	NC_013223	AT	3	6	717782	717787	50 %	50 %	0 %	0 %	258404729
13004	NC_013223	TG	3	6	717798	717803	0 %	50 %	50 %	0 %	258404729
13005	NC_013223	CCA	2	6	718021	718026	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258404729
13006	NC_013223	AAC	2	6	718065	718070	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258404729
13007	NC_013223	CAA	2	6	718148	718153	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258404729
13008	NC_013223	GCG	2	6	718168	718173	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258404729
13009	NC_013223	GAA	3	9	718284	718292	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258404729
13010	NC_013223	ACAA	2	8	718408	718415	75 %	0 %	0 %	25 %	258404729
13011	NC_013223	GGCT	2	8	718422	718429	0 %	25 %	50 %	25 %	258404729
13012	NC_013223	TGG	3	9	718645	718653	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258404730
13013	NC_013223	GCC	2	6	718796	718801	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258404730
13014	NC_013223	GGC	2	6	718869	718874	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258404730
13015	NC_013223	CTGT	2	8	718938	718945	0 %	50 %	25 %	25 %	258404730
13016	NC_013223	GTG	2	6	719274	719279	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258404730
13017	NC_013223	GA	3	6	719413	719418	50 %	0 %	50 %	0 %	258404730
13018	NC_013223	CCA	2	6	719419	719424	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258404730
13019	NC_013223	GAA	2	6	719454	719459	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258404730
13020	NC_013223	GCC	3	9	719508	719516	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258404730
13021	NC_013223	TGC	2	6	719602	719607	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258404730
13022	NC_013223	ACG	2	6	719625	719630	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13023	NC_013223	GGT	2	6	719633	719638	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13024	NC_013223	AGG	2	6	719650	719655	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13025	NC_013223	TCAG	2	8	719692	719699	25 %	25 %	25 %	25 %	258404731
13026	NC_013223	AAC	2	6	719728	719733	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258404731
13027	NC_013223	GAGG	2	8	719808	719815	25 %	0 %	75 %	0 %	258404731
13028	NC_013223	GCA	2	6	719827	719832	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258404731
13029	NC_013223	GCA	2	6	719837	719842	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258404731
13030	NC_013223	GAA	2	6	719850	719855	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258404731
13031	NC_013223	GTTGG	2	10	719901	719910	0 %	40 %	60 %	0 %	258404731
13032	NC_013223	TTC	2	6	719948	719953	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258404731
13033	NC_013223	T	6	6	719972	719977	0 %	100 %	0 %	0 %	258404731
13034	NC_013223	GAG	2	6	720005	720010	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13035	NC_013223	GAA	2	6	720037	720042	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13036	NC_013223	ATT	2	6	720074	720079	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13037	NC_013223	TGC	2	6	720109	720114	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13038	NC_013223	TA	3	6	720143	720148	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13039	NC_013223	TCT	2	6	720184	720189	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13040	NC_013223	CCA	2	6	720206	720211	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13041	NC_013223	TCTT	3	12	720212	720223	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
13042	NC_013223	TCA	2	6	720240	720245	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13043	NC_013223	CA	3	6	720316	720321	50 %	0 %	0 %	50 %	258404732
13044	NC_013223	GCCC	2	8	720350	720357	0 %	0 %	25 %	75 %	258404732
13045	NC_013223	TTG	2	6	720436	720441	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258404732
13046	NC_013223	TCT	2	6	720496	720501	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258404732
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13049	NC_013223	GTCA	2	8	720702	720709	25 %	25 %	25 %	25 %	258404732
13050	NC_013223	AT	3	6	720733	720738	50 %	50 %	0 %	0 %	258404732
13051	NC_013223	TCG	2	6	720854	720859	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258404732
13052	NC_013223	GAA	2	6	720957	720962	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258404732
13053	NC_013223	TTG	2	6	720971	720976	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258404732
13054	NC_013223	GA	3	6	721096	721101	50 %	0 %	50 %	0 %	258404732
13055	NC_013223	CAG	2	6	721139	721144	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258404732
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13058	NC_013223	TG	3	6	721565	721570	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
13059	NC_013223	TG	3	6	721638	721643	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
13060	NC_013223	T	6	6	721673	721678	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13061	NC_013223	TGA	2	6	721696	721701	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13062	NC_013223	TCCT	2	8	721773	721780	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
13063	NC_013223	TCC	2	6	721806	721811	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13064	NC_013223	CGC	2	6	721834	721839	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13065	NC_013223	TCT	2	6	721869	721874	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13066	NC_013223	TTC	2	6	721875	721880	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13067	NC_013223	CTCC	2	8	721882	721889	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
13068	NC_013223	AT	3	6	721993	721998	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13069	NC_013223	GACCAT	2	12	722075	722086	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	258404733
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13071	NC_013223	GCA	2	6	722210	722215	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258404733
13072	NC_013223	GC	3	6	722231	722236	0 %	0 %	50 %	50 %	258404733
13073	NC_013223	CG	3	6	722237	722242	0 %	0 %	50 %	50 %	258404733
13074	NC_013223	TACC	2	8	722276	722283	25 %	25 %	0 %	50 %	258404733
13075	NC_013223	GGC	2	6	722303	722308	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258404733
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13077	NC_013223	GTC	2	6	722349	722354	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258404734
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13080	NC_013223	GCC	2	6	722631	722636	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258404734
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13086	NC_013223	TGCG	2	8	722941	722948	0 %	25 %	50 %	25 %	258404735
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13090	NC_013223	TGA	2	6	723047	723052	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258404735
13091	NC_013223	T	7	7	723053	723059	0 %	100 %	0 %	0 %	258404735
13092	NC_013223	TGC	2	6	723133	723138	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258404735
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13094	NC_013223	A	6	6	723154	723159	100 %	0 %	0 %	0 %	258404735
13095	NC_013223	CT	3	6	723164	723169	0 %	50 %	0 %	50 %	258404735
13096	NC_013223	ATAG	2	8	723189	723196	50 %	25 %	25 %	0 %	258404735
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13100	NC_013223	TGG	2	6	723539	723544	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258404735
13101	NC_013223	GCT	2	6	723545	723550	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258404735
13102	NC_013223	TGA	2	6	723560	723565	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258404735
13103	NC_013223	GGT	2	6	723566	723571	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258404735
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13105	NC_013223	AAT	2	6	723672	723677	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	258404735
13106	NC_013223	T	7	7	723677	723683	0 %	100 %	0 %	0 %	258404735
13107	NC_013223	ACA	2	6	723741	723746	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258404735
13108	NC_013223	ACG	2	6	723930	723935	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258404735
13109	NC_013223	GGT	2	6	724005	724010	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258404735
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13111	NC_013223	TGA	2	6	724352	724357	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258404735
13112	NC_013223	ATG	2	6	724359	724364	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258404735
13113	NC_013223	GCAG	2	8	724477	724484	25 %	0 %	50 %	25 %	258404736
13114	NC_013223	GAT	2	6	724514	724519	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258404736
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13117	NC_013223	GGA	2	6	724747	724752	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258404736
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13119	NC_013223	GAT	2	6	724832	724837	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258404736
13120	NC_013223	GAA	2	6	724889	724894	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258404736
13121	NC_013223	GATAGA	2	12	724996	725007	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	258404736
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13123	NC_013223	TC	3	6	725024	725029	0 %	50 %	0 %	50 %	258404736
13124	NC_013223	GCA	2	6	725194	725199	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258404736
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13490	NC_013223	TCG	2	6	745203	745208	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13491	NC_013223	T	6	6	745271	745276	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13492	NC_013223	A	6	6	745361	745366	100 %	0 %	0 %	0 %	258404754
13493	NC_013223	TAC	2	6	745385	745390	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258404754
13494	NC_013223	ATCT	2	8	745442	745449	25 %	50 %	0 %	25 %	258404754
13495	NC_013223	CAT	2	6	745465	745470	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258404754
13496	NC_013223	T	6	6	745637	745642	0 %	100 %	0 %	0 %	258404754
13497	NC_013223	A	6	6	745829	745834	100 %	0 %	0 %	0 %	258404754
13498	NC_013223	TTTTC	2	10	745867	745876	0 %	80 %	0 %	20 %	258404754
13499	NC_013223	ACC	2	6	745880	745885	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258404754
13500	NC_013223	ACT	2	6	745887	745892	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258404754

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