MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Desulfohalobium retbaense DSM 5692 chromosome

Total Repeats: 51711

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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11502	NC_013223	GCG	2	6	634609	634614	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258404657
11503	NC_013223	ACG	2	6	634618	634623	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258404657
11504	NC_013223	GAG	2	6	634638	634643	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258404657
11505	NC_013223	CGGG	2	8	634700	634707	0 %	0 %	75 %	25 %	258404657
11506	NC_013223	CCGG	2	8	634725	634732	0 %	0 %	50 %	50 %	258404657
11507	NC_013223	TTG	2	6	634744	634749	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258404657
11508	NC_013223	GCG	2	6	634750	634755	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258404657
11509	NC_013223	GACG	2	8	634821	634828	25 %	0 %	50 %	25 %	258404657
11510	NC_013223	TGG	2	6	634834	634839	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258404657
11511	NC_013223	GCG	2	6	634891	634896	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258404657
11512	NC_013223	CAA	2	6	634928	634933	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258404657
11513	NC_013223	GCA	2	6	634972	634977	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258404657
11514	NC_013223	CGA	2	6	635036	635041	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258404657
11515	NC_013223	G	6	6	635183	635188	0 %	0 %	100 %	0 %	258404657
11516	NC_013223	GTG	2	6	635250	635255	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258404657
11517	NC_013223	ATC	2	6	635333	635338	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258404657
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11519	NC_013223	CGGT	2	8	635475	635482	0 %	25 %	50 %	25 %	258404657
11520	NC_013223	CGC	2	6	635483	635488	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258404657
11521	NC_013223	GGA	2	6	635549	635554	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258404657
11522	NC_013223	AGG	2	6	635644	635649	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258404657
11523	NC_013223	GGC	2	6	635654	635659	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258404657
11524	NC_013223	CGG	2	6	635673	635678	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258404657
11525	NC_013223	AGGGG	2	10	635696	635705	20 %	0 %	80 %	0 %	258404657
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11527	NC_013223	T	6	6	635720	635725	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11528	NC_013223	A	6	6	635738	635743	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11529	NC_013223	TA	3	6	635806	635811	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11530	NC_013223	T	6	6	635816	635821	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11531	NC_013223	TC	3	6	635861	635866	0 %	50 %	0 %	50 %	258404658
11532	NC_013223	GGC	2	6	635875	635880	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258404658
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11541	NC_013223	CGA	2	6	636208	636213	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258404658
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11546	NC_013223	GAT	2	6	636638	636643	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258404658
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11548	NC_013223	T	6	6	636858	636863	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11549	NC_013223	CTG	2	6	636931	636936	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258404659
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11554	NC_013223	GAC	2	6	637263	637268	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258404659
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11564	NC_013223	GACC	2	8	637789	637796	25 %	0 %	25 %	50 %	258404660
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11599	NC_013223	GCTG	2	8	639508	639515	0 %	25 %	50 %	25 %	258404661
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11622	NC_013223	C	6	6	640653	640658	0 %	0 %	0 %	100 %	258404662
11623	NC_013223	TGA	2	6	640667	640672	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258404662
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11626	NC_013223	CTG	2	6	640801	640806	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258404662
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11864	NC_013223	AGC	2	6	653241	653246	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258404676
11865	NC_013223	ATCCA	2	10	653272	653281	40 %	20 %	0 %	40 %	258404676
11866	NC_013223	GTG	2	6	653498	653503	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258404677
11867	NC_013223	CGCGG	2	10	653528	653537	0 %	0 %	60 %	40 %	258404677
11868	NC_013223	GCT	2	6	653542	653547	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258404677
11869	NC_013223	CCG	2	6	653649	653654	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258404677
11870	NC_013223	TCC	2	6	653682	653687	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	258404677
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11872	NC_013223	G	6	6	653767	653772	0 %	0 %	100 %	0 %	258404677
11873	NC_013223	TGGCCT	2	12	653788	653799	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258404677
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11876	NC_013223	T	6	6	654094	654099	0 %	100 %	0 %	0 %	258404678
11877	NC_013223	G	6	6	654103	654108	0 %	0 %	100 %	0 %	258404678
11878	NC_013223	CCG	2	6	654194	654199	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258404678
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11880	NC_013223	ATG	2	6	654416	654421	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258404678
11881	NC_013223	CCGG	2	8	654438	654445	0 %	0 %	50 %	50 %	258404678
11882	NC_013223	GCAG	2	8	654506	654513	25 %	0 %	50 %	25 %	258404678
11883	NC_013223	GCGG	2	8	654601	654608	0 %	0 %	75 %	25 %	258404678
11884	NC_013223	ATG	2	6	654617	654622	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258404678
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11901	NC_013223	GATT	2	8	655488	655495	25 %	50 %	25 %	0 %	258404678
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11904	NC_013223	CAGG	2	8	655627	655634	25 %	0 %	50 %	25 %	258404678
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11907	NC_013223	TCG	2	6	655805	655810	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258404678
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11909	NC_013223	C	6	6	655897	655902	0 %	0 %	0 %	100 %	258404678
11910	NC_013223	CGG	2	6	655930	655935	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258404678
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11935	NC_013223	GAT	2	6	657500	657505	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258404680
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11962	NC_013223	GAG	2	6	659158	659163	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11963	NC_013223	TGA	2	6	659193	659198	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258404681
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11967	NC_013223	ATGG	2	8	659344	659351	25 %	25 %	50 %	0 %	258404681
11968	NC_013223	GCACG	2	10	659415	659424	20 %	0 %	40 %	40 %	258404681
11969	NC_013223	CTTT	2	8	659482	659489	0 %	75 %	0 %	25 %	258404681
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11973	NC_013223	CCT	2	6	659618	659623	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	258404681
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11975	NC_013223	GATC	2	8	659634	659641	25 %	25 %	25 %	25 %	258404681
11976	NC_013223	TCA	2	6	659669	659674	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258404681
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11978	NC_013223	CGCT	2	8	659710	659717	0 %	25 %	25 %	50 %	258404681
11979	NC_013223	CGG	2	6	659731	659736	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258404681
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11982	NC_013223	TCC	2	6	659939	659944	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	258404681
11983	NC_013223	ACAA	2	8	660013	660020	75 %	0 %	0 %	25 %	258404681
11984	NC_013223	TAC	2	6	660067	660072	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258404681
11985	NC_013223	GAT	2	6	660376	660381	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258404681
11986	NC_013223	T	6	6	660414	660419	0 %	100 %	0 %	0 %	258404681
11987	NC_013223	CCG	2	6	660461	660466	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258404681
11988	NC_013223	GGAGC	2	10	660480	660489	20 %	0 %	60 %	20 %	258404681
11989	NC_013223	CTGAT	2	10	660520	660529	20 %	40 %	20 %	20 %	258404681
11990	NC_013223	CAC	2	6	660588	660593	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11991	NC_013223	CAAAA	2	10	660664	660673	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
11992	NC_013223	GGA	2	6	660725	660730	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11993	NC_013223	TCC	2	6	660771	660776	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11994	NC_013223	TGC	2	6	660856	660861	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258404682
11995	NC_013223	GCG	2	6	660878	660883	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258404682
11996	NC_013223	CGG	2	6	661006	661011	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258404682
11997	NC_013223	CGG	3	9	661045	661053	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258404682
11998	NC_013223	CTG	2	6	661061	661066	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258404682
11999	NC_013223	GCA	2	6	661101	661106	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258404682
12000	NC_013223	GCC	2	6	661163	661168	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258404682

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