MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Desulfohalobium retbaense DSM 5692 chromosome

Total Repeats: 51711

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
10501	NC_013223	GGCA	2	8	579835	579842	25 %	0 %	50 %	25 %	258404607
10502	NC_013223	GGA	3	9	579870	579878	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258404607
10503	NC_013223	TGA	2	6	579965	579970	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10504	NC_013223	GGT	2	6	580010	580015	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10505	NC_013223	CGC	2	6	580084	580089	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10506	NC_013223	GC	3	6	580115	580120	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10507	NC_013223	GA	3	6	580189	580194	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
10508	NC_013223	CCA	2	6	580282	580287	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258404608
10509	NC_013223	GTG	2	6	580309	580314	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258404608
10510	NC_013223	GGC	2	6	580342	580347	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258404608
10511	NC_013223	GCT	2	6	580348	580353	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258404608
10512	NC_013223	AT	3	6	580417	580422	50 %	50 %	0 %	0 %	258404608
10513	NC_013223	TTG	2	6	580460	580465	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258404608
10514	NC_013223	GGC	2	6	580534	580539	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258404608
10515	NC_013223	GCC	2	6	580569	580574	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258404608
10516	NC_013223	TTG	2	6	580616	580621	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258404608
10517	NC_013223	T	7	7	580629	580635	0 %	100 %	0 %	0 %	258404608
10518	NC_013223	T	6	6	580675	580680	0 %	100 %	0 %	0 %	258404608
10519	NC_013223	TCCA	2	8	580751	580758	25 %	25 %	0 %	50 %	258404608
10520	NC_013223	GCC	2	6	580775	580780	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258404608
10521	NC_013223	ATC	2	6	580820	580825	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258404608
10522	NC_013223	GCG	2	6	580840	580845	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258404608
10523	NC_013223	TAT	2	6	580846	580851	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	258404608
10524	NC_013223	CCG	2	6	580853	580858	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258404608
10525	NC_013223	CCAG	2	8	580863	580870	25 %	0 %	25 %	50 %	258404608
10526	NC_013223	GCC	2	6	581057	581062	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258404608
10527	NC_013223	ATTC	2	8	581107	581114	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
10528	NC_013223	AGC	2	6	581128	581133	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10529	NC_013223	CCA	2	6	581186	581191	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258404609
10530	NC_013223	GCG	2	6	581200	581205	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258404609
10531	NC_013223	ATC	2	6	581226	581231	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258404609
10532	NC_013223	GTG	2	6	581316	581321	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258404609
10533	NC_013223	GGA	2	6	581378	581383	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258404609
10534	NC_013223	CCGAA	2	10	581453	581462	40 %	0 %	20 %	40 %	258404609
10535	NC_013223	GAA	2	6	581580	581585	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258404609
10536	NC_013223	TGC	2	6	581587	581592	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258404609
10537	NC_013223	CGG	2	6	581642	581647	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258404609
10538	NC_013223	GCA	3	9	581648	581656	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258404609
10539	NC_013223	GTC	2	6	581796	581801	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258404609
10540	NC_013223	GGT	2	6	581867	581872	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258404609
10541	NC_013223	GGA	2	6	581873	581878	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258404609
10542	NC_013223	T	6	6	581895	581900	0 %	100 %	0 %	0 %	258404609
10543	NC_013223	CAGC	2	8	581904	581911	25 %	0 %	25 %	50 %	258404609
10544	NC_013223	AGTCTG	2	12	581999	582010	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
10545	NC_013223	CAA	2	6	582069	582074	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10546	NC_013223	TGA	2	6	582117	582122	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258404610
10547	NC_013223	CGG	2	6	582156	582161	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258404610
10548	NC_013223	TAT	2	6	582376	582381	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	258404610
10549	NC_013223	TTG	2	6	582389	582394	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258404610
10550	NC_013223	ATC	2	6	582410	582415	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258404610
10551	NC_013223	TGG	2	6	582418	582423	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258404610
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10553	NC_013223	ACC	2	6	582581	582586	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258404610
10554	NC_013223	CCA	2	6	582621	582626	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258404610
10555	NC_013223	TGA	2	6	582637	582642	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258404610
10556	NC_013223	AAGCCC	2	12	582645	582656	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	258404610
10557	NC_013223	GTT	2	6	582664	582669	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258404610
10558	NC_013223	TGG	2	6	582690	582695	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258404610
10559	NC_013223	CCAG	2	8	582696	582703	25 %	0 %	25 %	50 %	258404610
10560	NC_013223	CAG	2	6	582716	582721	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258404610
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10562	NC_013223	AAT	2	6	582833	582838	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	258404610
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10564	NC_013223	CAGCG	2	10	582932	582941	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
10565	NC_013223	CGC	2	6	582968	582973	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10566	NC_013223	AG	3	6	582999	583004	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
10567	NC_013223	GGT	2	6	583030	583035	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10568	NC_013223	CG	3	6	583058	583063	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10569	NC_013223	GGC	2	6	583128	583133	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10570	NC_013223	GCC	2	6	583139	583144	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10571	NC_013223	T	6	6	583148	583153	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10572	NC_013223	TGT	2	6	583232	583237	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258404611
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10579	NC_013223	TTG	2	6	583566	583571	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258404611
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10582	NC_013223	ATC	2	6	583626	583631	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258404611
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10585	NC_013223	GCG	2	6	583767	583772	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258404611
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10588	NC_013223	GGC	2	6	583943	583948	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258404611
10589	NC_013223	CTG	2	6	583998	584003	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258404611
10590	NC_013223	TGCG	2	8	584117	584124	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
10591	NC_013223	T	6	6	584149	584154	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10592	NC_013223	T	6	6	584170	584175	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10593	NC_013223	ATG	2	6	584235	584240	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10594	NC_013223	TAT	2	6	584272	584277	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	258404612
10595	NC_013223	GTG	2	6	584282	584287	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258404612
10596	NC_013223	GACC	2	8	584294	584301	25 %	0 %	25 %	50 %	258404612
10597	NC_013223	TCC	2	6	584373	584378	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	258404612
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10599	NC_013223	CGT	2	6	584535	584540	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258404612
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10601	NC_013223	CGC	2	6	584581	584586	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258404612
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10603	NC_013223	GC	3	6	584740	584745	0 %	0 %	50 %	50 %	258404612
10604	NC_013223	CAG	2	6	584873	584878	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10605	NC_013223	GAT	2	6	585006	585011	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258404613
10606	NC_013223	ACA	2	6	585037	585042	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258404613
10607	NC_013223	GTC	2	6	585111	585116	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258404613
10608	NC_013223	CGC	2	6	585152	585157	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258404613
10609	NC_013223	GCC	2	6	585207	585212	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258404613
10610	NC_013223	CGG	2	6	585236	585241	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258404613
10611	NC_013223	CTG	2	6	585288	585293	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258404613
10612	NC_013223	CG	3	6	585386	585391	0 %	0 %	50 %	50 %	258404613
10613	NC_013223	GCG	2	6	585417	585422	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258404613
10614	NC_013223	CGG	2	6	585427	585432	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258404613
10615	NC_013223	TCA	2	6	585538	585543	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258404613
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10617	NC_013223	A	6	6	585855	585860	100 %	0 %	0 %	0 %	258404613
10618	NC_013223	G	7	7	585861	585867	0 %	0 %	100 %	0 %	258404613
10619	NC_013223	GGA	2	6	585888	585893	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258404613
10620	NC_013223	AGC	2	6	585941	585946	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258404613
10621	NC_013223	TTGCC	2	10	586018	586027	0 %	40 %	20 %	40 %	258404613
10622	NC_013223	CAT	2	6	586058	586063	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258404613
10623	NC_013223	ATCA	2	8	586089	586096	50 %	25 %	0 %	25 %	258404613
10624	NC_013223	CGG	2	6	586160	586165	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258404613
10625	NC_013223	CA	3	6	586180	586185	50 %	0 %	0 %	50 %	258404613
10626	NC_013223	T	6	6	586427	586432	0 %	100 %	0 %	0 %	258404614
10627	NC_013223	TCG	2	6	586485	586490	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258404614
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10629	NC_013223	CTTTT	2	10	586578	586587	0 %	80 %	0 %	20 %	258404614
10630	NC_013223	GCC	2	6	586607	586612	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258404614
10631	NC_013223	GA	3	6	586620	586625	50 %	0 %	50 %	0 %	258404614
10632	NC_013223	TCC	2	6	586632	586637	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	258404614
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10634	NC_013223	CAT	2	6	586760	586765	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258404614
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10637	NC_013223	GCAG	2	8	586875	586882	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
10638	NC_013223	CATA	2	8	586919	586926	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
10639	NC_013223	T	6	6	586959	586964	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10640	NC_013223	CAA	2	6	586990	586995	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258404615
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10656	NC_013223	TCC	2	6	587964	587969	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	258404615
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10661	NC_013223	CCGC	2	8	588257	588264	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
10662	NC_013223	GCA	2	6	588285	588290	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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10721	NC_013223	GA	3	6	591352	591357	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
10722	NC_013223	AGCAA	2	10	591364	591373	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
10723	NC_013223	CT	3	6	591374	591379	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
10724	NC_013223	GCCT	2	8	591393	591400	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
10725	NC_013223	C	6	6	591510	591515	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
10726	NC_013223	GTCT	2	8	591536	591543	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
10727	NC_013223	ATTGGG	2	12	591573	591584	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	258404619
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10730	NC_013223	AGTCA	2	10	591875	591884	40 %	20 %	20 %	20 %	258404619
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10734	NC_013223	A	6	6	592548	592553	100 %	0 %	0 %	0 %	258404619
10735	NC_013223	CAT	2	6	592555	592560	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258404619
10736	NC_013223	GTG	2	6	592583	592588	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258404619
10737	NC_013223	GGA	2	6	592643	592648	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258404619
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10739	NC_013223	TGT	3	9	592835	592843	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258404620
10740	NC_013223	ATG	2	6	592865	592870	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258404620
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10864	NC_013223	GTT	2	6	600080	600085	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10865	NC_013223	TGG	2	6	600089	600094	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10866	NC_013223	GAT	2	6	600146	600151	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258404628
10867	NC_013223	CGT	2	6	600223	600228	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258404628
10868	NC_013223	GT	3	6	600292	600297	0 %	50 %	50 %	0 %	258404628
10869	NC_013223	GCGTT	2	10	600300	600309	0 %	40 %	40 %	20 %	258404628
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10872	NC_013223	CCGTG	2	10	600518	600527	0 %	20 %	40 %	40 %	258404628
10873	NC_013223	GGAC	2	8	600528	600535	25 %	0 %	50 %	25 %	258404628
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10974	NC_013223	A	9	9	605143	605151	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10975	NC_013223	TAT	2	6	605293	605298	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10976	NC_013223	T	8	8	605327	605334	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10977	NC_013223	TTA	2	6	605384	605389	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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