MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Desulfohalobium retbaense DSM 5692 chromosome

Total Repeats: 51711

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
10001	NC_013223	ATG	2	6	552230	552235	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258404584
10002	NC_013223	GCTT	2	8	552245	552252	0 %	50 %	25 %	25 %	258404584
10003	NC_013223	TCG	2	6	552284	552289	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258404584
10004	NC_013223	CGG	2	6	552294	552299	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258404584
10005	NC_013223	CAG	2	6	552319	552324	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258404584
10006	NC_013223	GTT	2	6	552421	552426	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258404584
10007	NC_013223	TCA	2	6	552456	552461	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258404584
10008	NC_013223	CGC	2	6	552489	552494	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258404584
10009	NC_013223	GGCAGC	2	12	552526	552537	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	258404584
10010	NC_013223	TGT	2	6	552591	552596	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258404584
10011	NC_013223	GTC	2	6	552601	552606	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258404584
10012	NC_013223	TCG	2	6	552623	552628	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258404584
10013	NC_013223	TCG	2	6	552665	552670	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258404584
10014	NC_013223	CGC	2	6	552807	552812	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258404584
10015	NC_013223	TGC	2	6	552891	552896	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258404584
10016	NC_013223	AGCTG	2	10	553087	553096	20 %	20 %	40 %	20 %	258404585
10017	NC_013223	CGG	2	6	553099	553104	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258404585
10018	NC_013223	GCA	2	6	553120	553125	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258404585
10019	NC_013223	GCC	2	6	553184	553189	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258404585
10020	NC_013223	CGG	3	9	553497	553505	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258404585
10021	NC_013223	CCT	2	6	553540	553545	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	258404585
10022	NC_013223	CGT	2	6	553642	553647	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258404585
10023	NC_013223	GCG	2	6	553651	553656	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258404585
10024	NC_013223	TGGTGT	2	12	553819	553830	0 %	50 %	50 %	0 %	258404585
10025	NC_013223	AGA	3	9	553845	553853	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258404585
10026	NC_013223	TGG	2	6	553858	553863	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258404585
10027	NC_013223	CTT	2	6	553881	553886	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10028	NC_013223	CAG	2	6	553908	553913	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10029	NC_013223	TCGG	2	8	554022	554029	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
10030	NC_013223	TGG	2	6	554126	554131	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10031	NC_013223	GCC	2	6	554206	554211	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10032	NC_013223	GTCCA	2	10	554215	554224	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
10033	NC_013223	CATT	2	8	554232	554239	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
10034	NC_013223	AGG	2	6	554253	554258	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10035	NC_013223	CTG	2	6	554329	554334	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258404586
10036	NC_013223	ATC	2	6	554389	554394	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258404586
10037	NC_013223	CGG	2	6	554415	554420	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258404586
10038	NC_013223	GCG	2	6	554429	554434	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258404586
10039	NC_013223	CAT	2	6	554475	554480	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258404586
10040	NC_013223	TTA	2	6	554512	554517	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	258404586
10041	NC_013223	TCAGT	2	10	554552	554561	20 %	40 %	20 %	20 %	258404586
10042	NC_013223	CGG	2	6	554681	554686	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258404586
10043	NC_013223	TTG	3	9	554692	554700	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258404586
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10045	NC_013223	CGG	2	6	554778	554783	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258404586
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10047	NC_013223	G	6	6	554857	554862	0 %	0 %	100 %	0 %	258404586
10048	NC_013223	TCG	2	6	554867	554872	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258404586
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10052	NC_013223	CGG	2	6	555072	555077	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258404586
10053	NC_013223	CTTG	2	8	555093	555100	0 %	50 %	25 %	25 %	258404586
10054	NC_013223	CCA	2	6	555143	555148	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258404586
10055	NC_013223	CAT	2	6	555153	555158	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258404586
10056	NC_013223	CGC	2	6	555242	555247	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258404586
10057	NC_013223	GCC	2	6	555310	555315	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258404586
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10060	NC_013223	GGC	2	6	555436	555441	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258404587
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10062	NC_013223	T	6	6	555526	555531	0 %	100 %	0 %	0 %	258404587
10063	NC_013223	T	6	6	555661	555666	0 %	100 %	0 %	0 %	258404587
10064	NC_013223	GCC	2	6	555760	555765	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258404587
10065	NC_013223	CAT	2	6	555792	555797	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258404587
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10068	NC_013223	CTGG	2	8	555910	555917	0 %	25 %	50 %	25 %	258404587
10069	NC_013223	CAG	2	6	555955	555960	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258404587
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10073	NC_013223	TGGCCC	2	12	556211	556222	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	258404587
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10075	NC_013223	AT	3	6	556245	556250	50 %	50 %	0 %	0 %	258404587
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10080	NC_013223	TGC	3	9	556769	556777	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258404587
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10084	NC_013223	AT	3	6	557058	557063	50 %	50 %	0 %	0 %	258404587
10085	NC_013223	CGG	2	6	557175	557180	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258404587
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10090	NC_013223	CTGA	2	8	557410	557417	25 %	25 %	25 %	25 %	258404587
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10104	NC_013223	TTCT	2	8	558073	558080	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
10105	NC_013223	GCA	2	6	558227	558232	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258404588
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10110	NC_013223	GCCCAG	2	12	558576	558587	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	258404588
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10113	NC_013223	GT	3	6	558847	558852	0 %	50 %	50 %	0 %	258404588
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10118	NC_013223	GGC	2	6	559272	559277	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258404588
10119	NC_013223	TGC	2	6	559328	559333	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258404588
10120	NC_013223	AGC	2	6	559357	559362	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258404588
10121	NC_013223	GCG	2	6	559371	559376	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258404588
10122	NC_013223	GGC	2	6	559395	559400	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10123	NC_013223	GTTC	2	8	559415	559422	0 %	50 %	25 %	25 %	258404589
10124	NC_013223	ACC	2	6	559717	559722	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258404589
10125	NC_013223	CGC	2	6	559723	559728	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258404589
10126	NC_013223	CGG	2	6	559736	559741	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258404589
10127	NC_013223	TCAG	2	8	559882	559889	25 %	25 %	25 %	25 %	258404589
10128	NC_013223	GCA	2	6	559920	559925	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258404589
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10130	NC_013223	GTCG	2	8	559960	559967	0 %	25 %	50 %	25 %	258404590
10131	NC_013223	T	8	8	560087	560094	0 %	100 %	0 %	0 %	258404590
10132	NC_013223	GCA	2	6	560170	560175	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258404590
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10135	NC_013223	TGTT	2	8	560327	560334	0 %	75 %	25 %	0 %	258404590
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10142	NC_013223	TTGGTC	2	12	560855	560866	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	258404590
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10149	NC_013223	TGG	2	6	561176	561181	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258404590
10150	NC_013223	TCG	2	6	561185	561190	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258404590
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10152	NC_013223	GGC	2	6	561232	561237	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258404590
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10154	NC_013223	GTA	2	6	561316	561321	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258404590
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10157	NC_013223	CTC	2	6	561419	561424	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10158	NC_013223	GTC	2	6	561581	561586	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258404591
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10161	NC_013223	GGCA	2	8	561689	561696	25 %	0 %	50 %	25 %	258404591
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10164	NC_013223	GCG	2	6	561897	561902	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258404591
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10177	NC_013223	CTT	2	6	562556	562561	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258404592
10178	NC_013223	TGA	2	6	562716	562721	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258404592
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10183	NC_013223	GGC	3	9	562996	563004	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258404592
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10199	NC_013223	GCG	2	6	563790	563795	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10200	NC_013223	GGT	2	6	563796	563801	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10201	NC_013223	CGT	2	6	563807	563812	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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10203	NC_013223	GCA	2	6	563840	563845	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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10205	NC_013223	GAG	2	6	564067	564072	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10206	NC_013223	GAG	2	6	564081	564086	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10207	NC_013223	AG	3	6	564129	564134	50 %	0 %	50 %	0 %	258404593
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10231	NC_013223	GGC	2	6	565393	565398	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258404594
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10238	NC_013223	CGG	2	6	566045	566050	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258404594
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10241	NC_013223	TGGCG	2	10	566177	566186	0 %	20 %	60 %	20 %	258404594
10242	NC_013223	GCC	2	6	566207	566212	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258404594
10243	NC_013223	T	7	7	566219	566225	0 %	100 %	0 %	0 %	258404594
10244	NC_013223	GCA	2	6	566236	566241	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258404594
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10319	NC_013223	CCGG	2	8	569691	569698	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10320	NC_013223	CG	3	6	569780	569785	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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10342	NC_013223	CTGCC	2	10	570848	570857	0 %	20 %	20 %	60 %	258404598
10343	NC_013223	CCG	2	6	570869	570874	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258404598
10344	NC_013223	GTT	2	6	571065	571070	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258404598
10345	NC_013223	TGACCC	2	12	571076	571087	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	258404598
10346	NC_013223	GAC	2	6	571146	571151	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10347	NC_013223	GGCA	2	8	571169	571176	25 %	0 %	50 %	25 %	258404599
10348	NC_013223	CGG	2	6	571210	571215	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258404599
10349	NC_013223	GTTTC	2	10	571233	571242	0 %	60 %	20 %	20 %	258404599
10350	NC_013223	TCTTTT	2	12	571283	571294	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	258404599
10351	NC_013223	CAT	2	6	571299	571304	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258404599
10352	NC_013223	GGC	2	6	571386	571391	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258404599
10353	NC_013223	T	6	6	571623	571628	0 %	100 %	0 %	0 %	258404599
10354	NC_013223	GTG	2	6	571634	571639	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258404599
10355	NC_013223	CGC	2	6	571671	571676	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258404599
10356	NC_013223	ATCT	2	8	571747	571754	25 %	50 %	0 %	25 %	258404599
10357	NC_013223	GAG	2	6	571756	571761	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258404599
10358	NC_013223	TCAATA	2	12	571799	571810	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	258404599
10359	NC_013223	GCA	2	6	571816	571821	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258404599
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10481	NC_013223	GGC	3	9	578474	578482	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10482	NC_013223	GAC	2	6	578484	578489	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10483	NC_013223	AGC	2	6	578503	578508	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10484	NC_013223	GTC	2	6	578529	578534	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10485	NC_013223	GTAT	2	8	578556	578563	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
10486	NC_013223	CAG	2	6	578670	578675	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258404606
10487	NC_013223	GTA	2	6	578734	578739	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258404606
10488	NC_013223	GTC	2	6	578878	578883	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258404606
10489	NC_013223	CCTT	2	8	578918	578925	0 %	50 %	0 %	50 %	258404606
10490	NC_013223	GCG	2	6	578926	578931	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258404606
10491	NC_013223	ATC	2	6	579058	579063	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258404606
10492	NC_013223	T	8	8	579119	579126	0 %	100 %	0 %	0 %	258404606
10493	NC_013223	CCT	2	6	579144	579149	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10494	NC_013223	CT	4	8	579159	579166	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
10495	NC_013223	CGC	2	6	579200	579205	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10496	NC_013223	TGT	2	6	579218	579223	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10497	NC_013223	GCG	2	6	579306	579311	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258404607
10498	NC_013223	ACG	3	9	579440	579448	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258404607
10499	NC_013223	AGG	2	6	579599	579604	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258404607
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