MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Desulfohalobium retbaense DSM 5692 chromosome

Total Repeats: 51711

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_013223	TG	3	6	28721	28726	0 %	50 %	50 %	0 %	258404164
502	NC_013223	TCCC	2	8	28831	28838	0 %	25 %	0 %	75 %	258404164
503	NC_013223	GGCC	2	8	28920	28927	0 %	0 %	50 %	50 %	258404165
504	NC_013223	CAT	2	6	28950	28955	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258404165
505	NC_013223	CTGG	2	8	28990	28997	0 %	25 %	50 %	25 %	258404165
506	NC_013223	CGG	2	6	29019	29024	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258404165
507	NC_013223	CTG	3	9	29185	29193	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258404165
508	NC_013223	GCA	2	6	29240	29245	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258404165
509	NC_013223	TAC	2	6	29320	29325	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258404165
510	NC_013223	CG	3	6	29369	29374	0 %	0 %	50 %	50 %	258404165
511	NC_013223	TCC	2	6	29399	29404	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	258404165
512	NC_013223	GTC	2	6	29428	29433	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258404165
513	NC_013223	CGT	2	6	29486	29491	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258404165
514	NC_013223	GAT	3	9	29526	29534	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258404165
515	NC_013223	CGC	2	6	29535	29540	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258404165
516	NC_013223	GACCT	2	10	29596	29605	20 %	20 %	20 %	40 %	258404165
517	NC_013223	TAT	2	6	29616	29621	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	258404165
518	NC_013223	T	7	7	29640	29646	0 %	100 %	0 %	0 %	258404165
519	NC_013223	CTGGTT	2	12	29647	29658	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	258404165
520	NC_013223	TGT	2	6	29713	29718	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
521	NC_013223	CGG	2	6	29810	29815	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
522	NC_013223	CTGC	2	8	29830	29837	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
523	NC_013223	CCGG	2	8	29857	29864	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
524	NC_013223	AGG	2	6	30003	30008	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
525	NC_013223	T	7	7	30009	30015	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
526	NC_013223	AGC	2	6	30030	30035	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258404166
527	NC_013223	AGT	2	6	30051	30056	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258404166
528	NC_013223	GT	4	8	30055	30062	0 %	50 %	50 %	0 %	258404166
529	NC_013223	CACGGC	2	12	30114	30125	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	258404166
530	NC_013223	TCC	2	6	30268	30273	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	258404166
531	NC_013223	CGG	2	6	30441	30446	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258404166
532	NC_013223	TGGG	2	8	30455	30462	0 %	25 %	75 %	0 %	258404166
533	NC_013223	CGG	2	6	30486	30491	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258404166
534	NC_013223	CCG	2	6	30500	30505	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258404166
535	NC_013223	A	6	6	30539	30544	100 %	0 %	0 %	0 %	258404166
536	NC_013223	GGA	2	6	30576	30581	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258404166
537	NC_013223	GAC	2	6	30622	30627	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258404166
538	NC_013223	CCG	2	6	30698	30703	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258404166
539	NC_013223	CGA	2	6	30807	30812	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258404166
540	NC_013223	CTG	2	6	30826	30831	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258404166
541	NC_013223	AT	3	6	30933	30938	50 %	50 %	0 %	0 %	258404166
542	NC_013223	ACC	2	6	30971	30976	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258404166
543	NC_013223	CCGC	2	8	30980	30987	0 %	0 %	25 %	75 %	258404166
544	NC_013223	ACG	2	6	31073	31078	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258404166
545	NC_013223	CCG	2	6	31082	31087	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258404166
546	NC_013223	TGGG	2	8	31129	31136	0 %	25 %	75 %	0 %	258404166
547	NC_013223	GC	3	6	31138	31143	0 %	0 %	50 %	50 %	258404166
548	NC_013223	GC	3	6	31159	31164	0 %	0 %	50 %	50 %	258404166
549	NC_013223	A	6	6	31169	31174	100 %	0 %	0 %	0 %	258404166
550	NC_013223	GAA	2	6	31185	31190	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258404166
551	NC_013223	ACG	2	6	31214	31219	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258404166
552	NC_013223	G	6	6	31236	31241	0 %	0 %	100 %	0 %	258404166
553	NC_013223	CGC	2	6	31275	31280	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258404166
554	NC_013223	TAC	2	6	31344	31349	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258404166
555	NC_013223	AT	3	6	31350	31355	50 %	50 %	0 %	0 %	258404166
556	NC_013223	GGC	2	6	31414	31419	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258404166
557	NC_013223	AGG	2	6	31628	31633	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258404166
558	NC_013223	CT	3	6	31717	31722	0 %	50 %	0 %	50 %	258404166
559	NC_013223	A	6	6	31761	31766	100 %	0 %	0 %	0 %	258404166
560	NC_013223	TGT	2	6	31821	31826	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258404166
561	NC_013223	CTC	2	6	31955	31960	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
562	NC_013223	GCT	2	6	31966	31971	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
563	NC_013223	GGC	2	6	32032	32037	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258404167
564	NC_013223	GGA	2	6	32044	32049	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258404167
565	NC_013223	GGT	2	6	32059	32064	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258404167
566	NC_013223	GGT	2	6	32119	32124	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258404167
567	NC_013223	GCA	2	6	32159	32164	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258404167
568	NC_013223	GTC	2	6	32267	32272	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258404167
569	NC_013223	CGT	2	6	32448	32453	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258404167
570	NC_013223	TCGGGG	2	12	32496	32507	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	258404167
571	NC_013223	G	6	6	32543	32548	0 %	0 %	100 %	0 %	258404167
572	NC_013223	GGC	2	6	32642	32647	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258404167
573	NC_013223	AAG	2	6	32669	32674	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258404167
574	NC_013223	GGT	2	6	32897	32902	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258404168
575	NC_013223	CCCCGG	2	12	32996	33007	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
576	NC_013223	GGT	2	6	33076	33081	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
577	NC_013223	CGCC	2	8	33098	33105	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
578	NC_013223	CCCCGG	2	12	33175	33186	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
579	NC_013223	GGT	2	6	33255	33260	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
580	NC_013223	TCGC	2	8	33276	33283	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
581	NC_013223	CCCCGG	2	12	33355	33366	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
582	NC_013223	CTG	2	6	33464	33469	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258404169
583	NC_013223	CCGG	2	8	33522	33529	0 %	0 %	50 %	50 %	258404169
584	NC_013223	GCC	2	6	33552	33557	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258404169
585	NC_013223	TCC	2	6	33619	33624	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	258404169
586	NC_013223	GCT	2	6	33752	33757	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258404169
587	NC_013223	T	7	7	33770	33776	0 %	100 %	0 %	0 %	258404169
588	NC_013223	GCGG	2	8	33801	33808	0 %	0 %	75 %	25 %	258404169
589	NC_013223	CGC	2	6	33846	33851	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258404169
590	NC_013223	GTG	2	6	33852	33857	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258404169
591	NC_013223	TTG	2	6	33873	33878	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258404169
592	NC_013223	ATC	2	6	33912	33917	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258404169
593	NC_013223	GC	3	6	34099	34104	0 %	0 %	50 %	50 %	258404169
594	NC_013223	GCG	2	6	34124	34129	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258404169
595	NC_013223	GGT	2	6	34175	34180	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258404169
596	NC_013223	TG	3	6	34186	34191	0 %	50 %	50 %	0 %	258404169
597	NC_013223	GCG	3	9	34282	34290	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258404169
598	NC_013223	GCC	2	6	34331	34336	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258404169
599	NC_013223	TGC	2	6	34393	34398	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258404169
600	NC_013223	GGA	2	6	34406	34411	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258404169
601	NC_013223	GGT	2	6	34471	34476	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258404170
602	NC_013223	GGC	2	6	34492	34497	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258404170
603	NC_013223	GGC	2	6	34506	34511	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258404170
604	NC_013223	GCGG	2	8	34590	34597	0 %	0 %	75 %	25 %	258404170
605	NC_013223	G	8	8	34609	34616	0 %	0 %	100 %	0 %	258404170
606	NC_013223	GCG	3	9	34633	34641	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258404170
607	NC_013223	GGT	2	6	34681	34686	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258404170
608	NC_013223	GGAC	2	8	34721	34728	25 %	0 %	50 %	25 %	258404170
609	NC_013223	GGCT	2	8	34739	34746	0 %	25 %	50 %	25 %	258404170
610	NC_013223	GAG	2	6	34781	34786	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258404170
611	NC_013223	ATC	2	6	34809	34814	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258404170
612	NC_013223	CG	3	6	34819	34824	0 %	0 %	50 %	50 %	258404170
613	NC_013223	GGA	2	6	34831	34836	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258404170
614	NC_013223	GCG	2	6	34842	34847	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258404170
615	NC_013223	TGC	2	6	34899	34904	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258404170
616	NC_013223	GGC	2	6	35026	35031	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258404170
617	NC_013223	CGT	2	6	35047	35052	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258404170
618	NC_013223	TTG	2	6	35054	35059	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258404170
619	NC_013223	AGG	2	6	35061	35066	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258404170
620	NC_013223	GCC	2	6	35086	35091	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258404170
621	NC_013223	GA	3	6	35094	35099	50 %	0 %	50 %	0 %	258404170
622	NC_013223	AATAA	2	10	35205	35214	80 %	20 %	0 %	0 %	258404170
623	NC_013223	A	7	7	35213	35219	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
624	NC_013223	CAA	2	6	35287	35292	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
625	NC_013223	ATC	2	6	35407	35412	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
626	NC_013223	TCC	2	6	35438	35443	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
627	NC_013223	C	6	6	35461	35466	0 %	0 %	0 %	100 %	258404171
628	NC_013223	TCCT	2	8	35487	35494	0 %	50 %	0 %	50 %	258404171
629	NC_013223	CCG	2	6	35498	35503	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258404171
630	NC_013223	GCC	2	6	35625	35630	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258404171
631	NC_013223	CGA	2	6	35735	35740	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258404171
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656	NC_013223	CA	3	6	37251	37256	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
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