MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Desulfohalobium retbaense DSM 5692 chromosome

Total Repeats: 51711

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
9001	NC_013223	GCT	2	6	498768	498773	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9002	NC_013223	TCG	2	6	498827	498832	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9003	NC_013223	GC	3	6	498943	498948	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
9004	NC_013223	CGC	2	6	499072	499077	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
9005	NC_013223	CCTTT	2	10	499104	499113	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
9006	NC_013223	GGT	2	6	499185	499190	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
9007	NC_013223	GCC	3	9	499191	499199	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
9008	NC_013223	GAG	2	6	499216	499221	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
9009	NC_013223	GAG	2	6	499273	499278	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
9010	NC_013223	GCCGG	2	10	499340	499349	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
9011	NC_013223	TTC	2	6	499373	499378	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9012	NC_013223	GGC	2	6	499411	499416	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
9013	NC_013223	GTT	2	6	499500	499505	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9014	NC_013223	GGA	2	6	499506	499511	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
9015	NC_013223	GAA	2	6	499516	499521	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9016	NC_013223	AAG	2	6	499583	499588	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9017	NC_013223	GAA	2	6	499592	499597	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9018	NC_013223	GAA	2	6	499616	499621	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9019	NC_013223	GAG	2	6	499632	499637	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
9020	NC_013223	GAA	2	6	499680	499685	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9021	NC_013223	GAA	2	6	499696	499701	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9022	NC_013223	GGT	2	6	499705	499710	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
9023	NC_013223	TTA	2	6	499721	499726	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9024	NC_013223	T	6	6	499753	499758	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
9025	NC_013223	TCTT	2	8	499767	499774	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
9026	NC_013223	A	10	10	499810	499819	100 %	0 %	0 %	0 %	258404542
9027	NC_013223	GAA	2	6	499833	499838	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258404542
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9030	NC_013223	TTG	2	6	500017	500022	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258404542
9031	NC_013223	ATCCC	2	10	500156	500165	20 %	20 %	0 %	60 %	258404542
9032	NC_013223	AAG	2	6	500240	500245	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258404542
9033	NC_013223	TGA	2	6	500427	500432	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258404542
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9035	NC_013223	GCA	2	6	500499	500504	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258404542
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9039	NC_013223	T	6	6	500618	500623	0 %	100 %	0 %	0 %	258404542
9040	NC_013223	CGA	2	6	500640	500645	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258404542
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9042	NC_013223	CGGAC	2	10	500751	500760	20 %	0 %	40 %	40 %	258404542
9043	NC_013223	AGG	2	6	500780	500785	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258404542
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9046	NC_013223	GT	3	6	500934	500939	0 %	50 %	50 %	0 %	258404542
9047	NC_013223	TAT	2	6	500941	500946	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	258404542
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9053	NC_013223	GCC	2	6	501274	501279	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258404542
9054	NC_013223	CAT	2	6	501282	501287	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258404542
9055	NC_013223	CT	3	6	501367	501372	0 %	50 %	0 %	50 %	258404542
9056	NC_013223	GCA	2	6	501381	501386	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258404542
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9058	NC_013223	GCA	2	6	501465	501470	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258404542
9059	NC_013223	T	7	7	501473	501479	0 %	100 %	0 %	0 %	258404542
9060	NC_013223	CGC	2	6	501530	501535	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258404542
9061	NC_013223	GCG	2	6	501568	501573	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258404542
9062	NC_013223	CGGG	2	8	501576	501583	0 %	0 %	75 %	25 %	258404542
9063	NC_013223	CTGCG	2	10	501585	501594	0 %	20 %	40 %	40 %	258404542
9064	NC_013223	GGGCA	2	10	501673	501682	20 %	0 %	60 %	20 %	258404542
9065	NC_013223	ACCATC	2	12	501733	501744	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	258404542
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9067	NC_013223	GAG	2	6	501936	501941	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258404543
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9089	NC_013223	GATC	2	8	502639	502646	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
9090	NC_013223	CCCTG	2	10	502775	502784	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
9091	NC_013223	TCGGCT	2	12	502812	502823	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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9096	NC_013223	AGC	2	6	502952	502957	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258404544
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9103	NC_013223	GACC	2	8	503279	503286	25 %	0 %	25 %	50 %	258404544
9104	NC_013223	CGG	2	6	503320	503325	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258404544
9105	NC_013223	G	7	7	503373	503379	0 %	0 %	100 %	0 %	258404544
9106	NC_013223	GGA	2	6	503471	503476	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258404544
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9109	NC_013223	GAT	2	6	503801	503806	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258404544
9110	NC_013223	TCCA	2	8	503844	503851	25 %	25 %	0 %	50 %	258404544
9111	NC_013223	CGG	2	6	503965	503970	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258404544
9112	NC_013223	GGCG	2	8	504000	504007	0 %	0 %	75 %	25 %	258404544
9113	NC_013223	C	6	6	504033	504038	0 %	0 %	0 %	100 %	258404544
9114	NC_013223	TC	3	6	504071	504076	0 %	50 %	0 %	50 %	258404544
9115	NC_013223	A	6	6	504147	504152	100 %	0 %	0 %	0 %	258404544
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9119	NC_013223	TGG	2	6	504333	504338	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258404545
9120	NC_013223	CGGAC	2	10	504354	504363	20 %	0 %	40 %	40 %	258404545
9121	NC_013223	GGC	2	6	504379	504384	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258404545
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9125	NC_013223	CTG	2	6	504626	504631	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258404545
9126	NC_013223	CG	4	8	504808	504815	0 %	0 %	50 %	50 %	258404545
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9129	NC_013223	T	6	6	504934	504939	0 %	100 %	0 %	0 %	258404545
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9147	NC_013223	CTTC	2	8	505692	505699	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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9243	NC_013223	GTC	2	6	510929	510934	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258404551
9244	NC_013223	GAC	2	6	510983	510988	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258404551
9245	NC_013223	GCC	2	6	510994	510999	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258404551
9246	NC_013223	TCA	2	6	511036	511041	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258404551
9247	NC_013223	GCA	2	6	511118	511123	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258404551
9248	NC_013223	ACC	2	6	511179	511184	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258404551
9249	NC_013223	ATCG	2	8	511202	511209	25 %	25 %	25 %	25 %	258404551
9250	NC_013223	GCTG	2	8	511240	511247	0 %	25 %	50 %	25 %	258404551
9251	NC_013223	CGTAGG	2	12	511273	511284	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	258404551
9252	NC_013223	CCT	2	6	511291	511296	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	258404551
9253	NC_013223	GCC	2	6	511298	511303	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258404551
9254	NC_013223	TGG	2	6	511315	511320	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258404551
9255	NC_013223	GC	3	6	511383	511388	0 %	0 %	50 %	50 %	258404551
9256	NC_013223	GCC	2	6	511520	511525	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258404551
9257	NC_013223	GCCC	2	8	511604	511611	0 %	0 %	25 %	75 %	258404551
9258	NC_013223	CGA	2	6	511612	511617	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258404551
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9260	NC_013223	GCT	2	6	511723	511728	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258404551
9261	NC_013223	GGCA	2	8	511845	511852	25 %	0 %	50 %	25 %	258404551
9262	NC_013223	GC	3	6	511876	511881	0 %	0 %	50 %	50 %	258404551
9263	NC_013223	CTG	2	6	511967	511972	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258404551
9264	NC_013223	GAC	2	6	512036	512041	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258404551
9265	NC_013223	CCT	2	6	512056	512061	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	258404551
9266	NC_013223	CGG	2	6	512070	512075	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258404551
9267	NC_013223	GCG	2	6	512112	512117	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258404551
9268	NC_013223	CGG	2	6	512206	512211	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258404551
9269	NC_013223	GCG	2	6	512320	512325	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258404551
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9271	NC_013223	TCG	2	6	512385	512390	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258404551
9272	NC_013223	C	6	6	512408	512413	0 %	0 %	0 %	100 %	258404551
9273	NC_013223	GAT	2	6	512426	512431	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258404551
9274	NC_013223	CGC	2	6	512461	512466	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258404551
9275	NC_013223	GTC	2	6	512538	512543	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258404551
9276	NC_013223	CAG	2	6	512573	512578	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258404551
9277	NC_013223	CCT	2	6	512581	512586	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	258404551
9278	NC_013223	GCA	2	6	512600	512605	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258404551
9279	NC_013223	GAG	2	6	512610	512615	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258404551
9280	NC_013223	CCG	2	6	512709	512714	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258404551
9281	NC_013223	ACT	2	6	512760	512765	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258404551
9282	NC_013223	C	6	6	512825	512830	0 %	0 %	0 %	100 %	258404551
9283	NC_013223	TGG	2	6	512859	512864	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258404551
9284	NC_013223	CCAG	2	8	512899	512906	25 %	0 %	25 %	50 %	258404551
9285	NC_013223	GTCA	2	8	512918	512925	25 %	25 %	25 %	25 %	258404551
9286	NC_013223	GGT	2	6	512939	512944	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258404551
9287	NC_013223	GCT	2	6	512973	512978	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258404551
9288	NC_013223	CGAC	2	8	512983	512990	25 %	0 %	25 %	50 %	258404551
9289	NC_013223	GGAT	2	8	513021	513028	25 %	25 %	50 %	0 %	258404551
9290	NC_013223	AG	3	6	513099	513104	50 %	0 %	50 %	0 %	258404551
9291	NC_013223	CCA	2	6	513115	513120	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258404551
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9296	NC_013223	CAG	2	6	513297	513302	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258404551
9297	NC_013223	TTGG	2	8	513332	513339	0 %	50 %	50 %	0 %	258404551
9298	NC_013223	TGT	2	6	513343	513348	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258404551
9299	NC_013223	TGC	2	6	513427	513432	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258404551
9300	NC_013223	AG	3	6	513468	513473	50 %	0 %	50 %	0 %	258404551
9301	NC_013223	TGC	2	6	513477	513482	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258404551
9302	NC_013223	GCAG	2	8	513577	513584	25 %	0 %	50 %	25 %	258404551
9303	NC_013223	CCG	2	6	513678	513683	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258404551
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9308	NC_013223	GGT	2	6	513854	513859	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258404552
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9310	NC_013223	CTT	2	6	513866	513871	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258404552
9311	NC_013223	AGAC	2	8	513890	513897	50 %	0 %	25 %	25 %	258404552
9312	NC_013223	TGT	2	6	513992	513997	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258404552
9313	NC_013223	A	8	8	514068	514075	100 %	0 %	0 %	0 %	258404552
9314	NC_013223	GCCCA	2	10	514114	514123	20 %	0 %	20 %	60 %	258404552
9315	NC_013223	GGT	2	6	514139	514144	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258404552
9316	NC_013223	GGT	2	6	514257	514262	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258404552
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9319	NC_013223	TGC	3	9	514307	514315	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258404552
9320	NC_013223	AGCCG	2	10	514367	514376	20 %	0 %	40 %	40 %	258404552
9321	NC_013223	CGC	2	6	514391	514396	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258404552
9322	NC_013223	GA	3	6	514429	514434	50 %	0 %	50 %	0 %	258404552
9323	NC_013223	CCG	2	6	514463	514468	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258404552
9324	NC_013223	CCT	2	6	514586	514591	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	258404552
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9326	NC_013223	CAG	3	9	514647	514655	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258404552
9327	NC_013223	TCC	2	6	514660	514665	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	258404552
9328	NC_013223	TGC	2	6	514667	514672	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258404552
9329	NC_013223	GGA	2	6	514721	514726	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258404552
9330	NC_013223	GA	3	6	514802	514807	50 %	0 %	50 %	0 %	258404552
9331	NC_013223	CGG	2	6	514829	514834	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258404552
9332	NC_013223	GGGC	2	8	514847	514854	0 %	0 %	75 %	25 %	258404552
9333	NC_013223	TGT	2	6	514983	514988	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258404552
9334	NC_013223	GGC	2	6	515126	515131	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258404553
9335	NC_013223	CGG	2	6	515175	515180	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258404553
9336	NC_013223	GCGCC	2	10	515228	515237	0 %	0 %	40 %	60 %	258404553
9337	NC_013223	CGC	2	6	515302	515307	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258404553
9338	NC_013223	TGA	2	6	515320	515325	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258404553
9339	NC_013223	CAT	2	6	515354	515359	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258404553
9340	NC_013223	CGG	3	9	515413	515421	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258404553
9341	NC_013223	CTC	2	6	515481	515486	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
9342	NC_013223	CTT	2	6	515530	515535	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258404554
9343	NC_013223	CTG	3	9	515594	515602	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258404554
9344	NC_013223	GCCGC	2	10	515622	515631	0 %	0 %	40 %	60 %	258404554
9345	NC_013223	CGG	2	6	515697	515702	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258404554
9346	NC_013223	CGC	2	6	515806	515811	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258404554
9347	NC_013223	GGCCAG	2	12	515816	515827	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	258404554
9348	NC_013223	GCA	2	6	515888	515893	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258404554
9349	NC_013223	TTC	2	6	515948	515953	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258404554
9350	NC_013223	CCCGC	2	10	516013	516022	0 %	0 %	20 %	80 %	258404554
9351	NC_013223	CGG	2	6	516118	516123	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258404554
9352	NC_013223	TCG	2	6	516135	516140	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258404554
9353	NC_013223	CGG	2	6	516148	516153	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258404554
9354	NC_013223	CTT	2	6	516178	516183	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258404554
9355	NC_013223	CGG	2	6	516192	516197	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258404554
9356	NC_013223	CGT	2	6	516259	516264	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258404554
9357	NC_013223	GACC	2	8	516265	516272	25 %	0 %	25 %	50 %	258404554
9358	NC_013223	GCA	2	6	516311	516316	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258404554
9359	NC_013223	GCC	2	6	516416	516421	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258404554
9360	NC_013223	GGC	2	6	516481	516486	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258404554
9361	NC_013223	CGG	2	6	516508	516513	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258404554
9362	NC_013223	CGT	2	6	516523	516528	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258404554
9363	NC_013223	GAC	2	6	516563	516568	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258404554
9364	NC_013223	T	6	6	516632	516637	0 %	100 %	0 %	0 %	258404554
9365	NC_013223	TCCT	2	8	516731	516738	0 %	50 %	0 %	50 %	258404554
9366	NC_013223	TGG	2	6	516799	516804	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258404554
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9368	NC_013223	CCA	2	6	517015	517020	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258404554
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9494	NC_013223	CG	3	6	523210	523215	0 %	0 %	50 %	50 %	258404558
9495	NC_013223	GGT	2	6	523230	523235	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258404558
9496	NC_013223	CTC	2	6	523263	523268	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	258404558
9497	NC_013223	TGC	2	6	523269	523274	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258404558
9498	NC_013223	T	7	7	523290	523296	0 %	100 %	0 %	0 %	258404558
9499	NC_013223	GC	3	6	523303	523308	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
9500	NC_013223	TTTG	2	8	523312	523319	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding

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