MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Desulfohalobium retbaense DSM 5692 chromosome

Total Repeats: 51711

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
8001	NC_013223	CGGGAG	2	12	444314	444325	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	258404494
8002	NC_013223	GGT	2	6	444439	444444	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258404494
8003	NC_013223	AGC	2	6	444486	444491	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258404494
8004	NC_013223	GCA	2	6	444543	444548	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258404494
8005	NC_013223	GCT	2	6	444616	444621	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258404494
8006	NC_013223	CGG	2	6	444627	444632	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258404494
8007	NC_013223	ATGC	2	8	444644	444651	25 %	25 %	25 %	25 %	258404494
8008	NC_013223	GCGG	2	8	444664	444671	0 %	0 %	75 %	25 %	258404494
8009	NC_013223	TGA	2	6	444717	444722	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258404494
8010	NC_013223	CGC	2	6	444843	444848	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258404494
8011	NC_013223	CCG	2	6	444892	444897	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258404494
8012	NC_013223	CCA	2	6	444898	444903	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258404494
8013	NC_013223	CG	3	6	444939	444944	0 %	0 %	50 %	50 %	258404494
8014	NC_013223	GC	3	6	445202	445207	0 %	0 %	50 %	50 %	258404494
8015	NC_013223	GGC	2	6	445355	445360	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258404494
8016	NC_013223	TTC	2	6	445422	445427	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258404494
8017	NC_013223	CTG	2	6	445448	445453	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258404494
8018	NC_013223	ACA	2	6	445455	445460	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258404494
8019	NC_013223	GAG	2	6	445505	445510	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258404494
8020	NC_013223	TGC	2	6	445552	445557	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258404494
8021	NC_013223	GCCG	2	8	445639	445646	0 %	0 %	50 %	50 %	258404494
8022	NC_013223	CGA	2	6	445657	445662	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258404494
8023	NC_013223	GTG	2	6	445709	445714	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258404494
8024	NC_013223	GCA	2	6	445716	445721	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258404494
8025	NC_013223	ACG	2	6	445761	445766	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258404494
8026	NC_013223	GTCA	2	8	445802	445809	25 %	25 %	25 %	25 %	258404494
8027	NC_013223	TCC	2	6	445857	445862	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	258404494
8028	NC_013223	CCGGTG	2	12	445916	445927	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
8029	NC_013223	CTT	2	6	446016	446021	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258404495
8030	NC_013223	CAG	2	6	446077	446082	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258404495
8031	NC_013223	TTGG	2	8	446153	446160	0 %	50 %	50 %	0 %	258404495
8032	NC_013223	TGA	2	6	446161	446166	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258404495
8033	NC_013223	CGG	2	6	446167	446172	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258404495
8034	NC_013223	TGA	2	6	446184	446189	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258404495
8035	NC_013223	TTC	2	6	446269	446274	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258404495
8036	NC_013223	TCT	2	6	446394	446399	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258404495
8037	NC_013223	GGC	2	6	446410	446415	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258404495
8038	NC_013223	CCGC	2	8	446485	446492	0 %	0 %	25 %	75 %	258404495
8039	NC_013223	CTT	2	6	446544	446549	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258404495
8040	NC_013223	TTG	2	6	446651	446656	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258404495
8041	NC_013223	TGA	2	6	446727	446732	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258404495
8042	NC_013223	TGC	2	6	446737	446742	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258404495
8043	NC_013223	CAA	2	6	446769	446774	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258404495
8044	NC_013223	CGA	2	6	446808	446813	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258404495
8045	NC_013223	GATC	2	8	446814	446821	25 %	25 %	25 %	25 %	258404495
8046	NC_013223	TCG	2	6	446825	446830	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258404495
8047	NC_013223	GAT	2	6	446866	446871	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258404495
8048	NC_013223	AT	3	6	446909	446914	50 %	50 %	0 %	0 %	258404495
8049	NC_013223	CGG	2	6	447013	447018	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8050	NC_013223	TGT	2	6	447035	447040	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8051	NC_013223	AGC	2	6	447047	447052	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8052	NC_013223	TGGGG	2	10	447053	447062	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
8053	NC_013223	AGT	2	6	447101	447106	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8054	NC_013223	TTG	2	6	447126	447131	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8055	NC_013223	TTTC	2	8	447140	447147	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
8056	NC_013223	GAT	2	6	447161	447166	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258404496
8057	NC_013223	CTT	2	6	447181	447186	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258404496
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8059	NC_013223	GAG	2	6	447425	447430	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258404496
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8061	NC_013223	ACG	2	6	447547	447552	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258404497
8062	NC_013223	CGG	2	6	447686	447691	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8063	NC_013223	CCG	2	6	447716	447721	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8064	NC_013223	CCG	2	6	447796	447801	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8065	NC_013223	GT	3	6	447822	447827	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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8067	NC_013223	TCTT	2	8	447859	447866	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
8068	NC_013223	GCC	2	6	447879	447884	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8069	NC_013223	CCG	2	6	448085	448090	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8070	NC_013223	AGCGGG	2	12	448126	448137	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
8071	NC_013223	TCT	2	6	448158	448163	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8072	NC_013223	CAG	2	6	448261	448266	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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8074	NC_013223	GC	3	6	448452	448457	0 %	0 %	50 %	50 %	258404498
8075	NC_013223	A	6	6	448542	448547	100 %	0 %	0 %	0 %	258404498
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8082	NC_013223	TG	3	6	449177	449182	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
8083	NC_013223	ACG	2	6	449207	449212	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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8096	NC_013223	TCG	2	6	449902	449907	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258404499
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8104	NC_013223	C	6	6	450227	450232	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
8105	NC_013223	TTG	2	6	450320	450325	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8106	NC_013223	GGA	2	6	450468	450473	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8107	NC_013223	GAG	2	6	450480	450485	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258404500
8108	NC_013223	GGAAG	2	10	450507	450516	40 %	0 %	60 %	0 %	258404500
8109	NC_013223	CGG	2	6	450528	450533	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258404500
8110	NC_013223	T	8	8	450571	450578	0 %	100 %	0 %	0 %	258404500
8111	NC_013223	CAG	2	6	450648	450653	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258404500
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8118	NC_013223	TTCG	2	8	450849	450856	0 %	50 %	25 %	25 %	258404500
8119	NC_013223	AACGG	2	10	451094	451103	40 %	0 %	40 %	20 %	258404501
8120	NC_013223	TAC	2	6	451117	451122	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258404501
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