MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Desulfohalobium retbaense DSM 5692 chromosome

Total Repeats: 51711

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6501	NC_013223	ATCCAC	2	12	362031	362042	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	258404430
6502	NC_013223	TCG	2	6	362093	362098	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258404430
6503	NC_013223	GAT	2	6	362139	362144	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258404430
6504	NC_013223	CTC	2	6	362196	362201	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	258404430
6505	NC_013223	GGC	2	6	362259	362264	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258404430
6506	NC_013223	GGC	2	6	362274	362279	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258404430
6507	NC_013223	CTG	2	6	362422	362427	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258404430
6508	NC_013223	CTT	2	6	362429	362434	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258404430
6509	NC_013223	GAG	2	6	362469	362474	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258404430
6510	NC_013223	CGA	2	6	362546	362551	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258404430
6511	NC_013223	GCA	2	6	362588	362593	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258404430
6512	NC_013223	CGG	2	6	362687	362692	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258404430
6513	NC_013223	TGG	3	9	362713	362721	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258404430
6514	NC_013223	ACG	2	6	362731	362736	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258404430
6515	NC_013223	AG	3	6	362825	362830	50 %	0 %	50 %	0 %	258404430
6516	NC_013223	TCC	2	6	362863	362868	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	258404430
6517	NC_013223	CGT	2	6	362954	362959	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258404430
6518	NC_013223	GCA	2	6	363001	363006	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258404430
6519	NC_013223	GCC	2	6	363019	363024	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258404430
6520	NC_013223	GT	3	6	363043	363048	0 %	50 %	50 %	0 %	258404430
6521	NC_013223	GCT	2	6	363155	363160	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258404430
6522	NC_013223	T	6	6	363185	363190	0 %	100 %	0 %	0 %	258404430
6523	NC_013223	TTG	2	6	363233	363238	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258404430
6524	NC_013223	GAA	2	6	363256	363261	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6525	NC_013223	GAA	2	6	363312	363317	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6526	NC_013223	GCATG	2	10	363320	363329	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
6527	NC_013223	A	6	6	363334	363339	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6528	NC_013223	ATG	2	6	363350	363355	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6529	NC_013223	T	7	7	363531	363537	0 %	100 %	0 %	0 %	258404431
6530	NC_013223	CGA	2	6	363591	363596	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258404431
6531	NC_013223	GTC	2	6	363652	363657	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258404431
6532	NC_013223	T	7	7	363663	363669	0 %	100 %	0 %	0 %	258404431
6533	NC_013223	CAGG	2	8	363688	363695	25 %	0 %	50 %	25 %	258404431
6534	NC_013223	AC	3	6	363742	363747	50 %	0 %	0 %	50 %	258404431
6535	NC_013223	GTG	2	6	363818	363823	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258404431
6536	NC_013223	TCC	2	6	363902	363907	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	258404431
6537	NC_013223	GCCC	2	8	363939	363946	0 %	0 %	25 %	75 %	258404431
6538	NC_013223	AGG	2	6	363947	363952	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258404431
6539	NC_013223	AAT	2	6	364075	364080	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	258404431
6540	NC_013223	GCG	2	6	364091	364096	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258404431
6541	NC_013223	CGC	2	6	364134	364139	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258404431
6542	NC_013223	GCG	2	6	364260	364265	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258404432
6543	NC_013223	GC	3	6	364293	364298	0 %	0 %	50 %	50 %	258404432
6544	NC_013223	G	6	6	364458	364463	0 %	0 %	100 %	0 %	258404432
6545	NC_013223	GC	4	8	364508	364515	0 %	0 %	50 %	50 %	258404432
6546	NC_013223	AG	3	6	364553	364558	50 %	0 %	50 %	0 %	258404432
6547	NC_013223	A	7	7	364622	364628	100 %	0 %	0 %	0 %	258404432
6548	NC_013223	ACCGG	2	10	364694	364703	20 %	0 %	40 %	40 %	258404432
6549	NC_013223	CGG	2	6	364750	364755	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258404432
6550	NC_013223	CAG	2	6	364808	364813	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258404432
6551	NC_013223	CATCCT	2	12	364838	364849	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	258404432
6552	NC_013223	GAT	2	6	364923	364928	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258404433
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6554	NC_013223	CTT	2	6	364973	364978	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258404433
6555	NC_013223	GAG	2	6	365008	365013	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258404433
6556	NC_013223	GCCG	2	8	365117	365124	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6557	NC_013223	GCT	2	6	365202	365207	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6558	NC_013223	GGC	2	6	365248	365253	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6559	NC_013223	TGCT	2	8	365264	365271	0 %	50 %	25 %	25 %	258404434
6560	NC_013223	ACC	2	6	365325	365330	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258404434
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6562	NC_013223	TTC	2	6	365483	365488	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258404434
6563	NC_013223	GCT	2	6	365584	365589	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258404434
6564	NC_013223	GAG	2	6	365591	365596	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258404434
6565	NC_013223	GGTA	2	8	365618	365625	25 %	25 %	50 %	0 %	258404434
6566	NC_013223	TCC	2	6	365796	365801	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	258404434
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6568	NC_013223	CGG	2	6	365980	365985	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258404434
6569	NC_013223	CAT	2	6	366017	366022	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258404434
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6571	NC_013223	GGC	2	6	366101	366106	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258404434
6572	NC_013223	CTT	2	6	366217	366222	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6573	NC_013223	GGGA	2	8	366284	366291	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
6574	NC_013223	TTG	2	6	366319	366324	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6575	NC_013223	GCC	2	6	366520	366525	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258404435
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6577	NC_013223	GTG	2	6	366794	366799	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258404435
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6580	NC_013223	AATG	2	8	367151	367158	50 %	25 %	25 %	0 %	258404436
6581	NC_013223	TGC	3	9	367179	367187	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258404436
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6583	NC_013223	TCC	2	6	367206	367211	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	258404436
6584	NC_013223	TCGGC	2	10	367249	367258	0 %	20 %	40 %	40 %	258404436
6585	NC_013223	TGC	2	6	367277	367282	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258404436
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6589	NC_013223	GAT	2	6	367471	367476	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258404436
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6593	NC_013223	GCC	2	6	367754	367759	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258404436
6594	NC_013223	T	6	6	367789	367794	0 %	100 %	0 %	0 %	258404436
6595	NC_013223	GTCCG	2	10	367958	367967	0 %	20 %	40 %	40 %	258404436
6596	NC_013223	CTG	2	6	367988	367993	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258404436
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6599	NC_013223	GCG	2	6	368049	368054	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258404436
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6602	NC_013223	GAT	2	6	368319	368324	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258404437
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6604	NC_013223	GTTCA	2	10	368520	368529	20 %	40 %	20 %	20 %	258404437
6605	NC_013223	AGC	2	6	368537	368542	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258404437
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6608	NC_013223	GTTG	2	8	368690	368697	0 %	50 %	50 %	0 %	258404437
6609	NC_013223	CGA	2	6	368708	368713	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258404437
6610	NC_013223	AG	3	6	368727	368732	50 %	0 %	50 %	0 %	258404437
6611	NC_013223	G	6	6	368732	368737	0 %	0 %	100 %	0 %	258404437
6612	NC_013223	GTC	3	9	368766	368774	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258404437
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6619	NC_013223	TGA	2	6	369128	369133	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258404437
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6992	NC_013223	TCAG	2	8	388554	388561	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
6993	NC_013223	CAA	2	6	388582	388587	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258404452
6994	NC_013223	CCCG	2	8	388593	388600	0 %	0 %	25 %	75 %	258404452
6995	NC_013223	AGGAG	2	10	388651	388660	40 %	0 %	60 %	0 %	258404452
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