MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774 chromosome

Total Repeats: 62562

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011883	CAGC	2	8	53	60	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
2	NC_011883	CCTGT	2	10	63	72	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
3	NC_011883	GCT	2	6	93	98	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_011883	GCA	2	6	139	144	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_011883	TCAC	2	8	206	213	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
6	NC_011883	GCT	2	6	296	301	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_011883	TA	3	6	361	366	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_011883	CAAA	2	8	374	381	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
9	NC_011883	GGC	2	6	436	441	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220903287
10	NC_011883	GAAC	2	8	466	473	50 %	0 %	25 %	25 %	220903287
11	NC_011883	GGC	2	6	505	510	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220903287
12	NC_011883	TGA	2	6	522	527	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	220903287
13	NC_011883	GTA	2	6	554	559	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	220903287
14	NC_011883	CAT	2	6	613	618	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	220903287
15	NC_011883	CCT	2	6	625	630	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
16	NC_011883	GCG	2	6	638	643	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_011883	GCC	2	6	654	659	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220903288
18	NC_011883	T	6	6	661	666	0 %	100 %	0 %	0 %	220903288
19	NC_011883	T	6	6	678	683	0 %	100 %	0 %	0 %	220903288
20	NC_011883	AG	3	6	751	756	50 %	0 %	50 %	0 %	220903288
21	NC_011883	T	6	6	798	803	0 %	100 %	0 %	0 %	220903288
22	NC_011883	CG	3	6	840	845	0 %	0 %	50 %	50 %	220903288
23	NC_011883	CG	3	6	984	989	0 %	0 %	50 %	50 %	220903288
24	NC_011883	GCA	2	6	1230	1235	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220903288
25	NC_011883	CCA	2	6	1389	1394	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	220903288
26	NC_011883	CAG	2	6	1546	1551	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220903288
27	NC_011883	GGC	2	6	1579	1584	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220903288
28	NC_011883	CGA	2	6	1602	1607	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220903288
29	NC_011883	A	6	6	1713	1718	100 %	0 %	0 %	0 %	220903288
30	NC_011883	CGC	2	6	1726	1731	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220903288
31	NC_011883	CCG	2	6	1757	1762	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220903288
32	NC_011883	TAC	2	6	1813	1818	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	220903288
33	NC_011883	CCG	2	6	1845	1850	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220903288
34	NC_011883	GAA	2	6	1913	1918	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	220903288
35	NC_011883	GGA	2	6	1921	1926	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	220903288
36	NC_011883	CGG	2	6	1947	1952	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220903288
37	NC_011883	CAA	2	6	2100	2105	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	220903288
38	NC_011883	GAG	2	6	2167	2172	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	220903288
39	NC_011883	T	7	7	2244	2250	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_011883	CAT	2	6	2273	2278	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_011883	CTGC	2	8	2289	2296	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
42	NC_011883	ATGAA	2	10	2309	2318	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
43	NC_011883	A	7	7	2425	2431	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_011883	CGG	2	6	2437	2442	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_011883	AGCA	2	8	2468	2475	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
46	NC_011883	GGC	2	6	2491	2496	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_011883	TAT	2	6	2636	2641	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	220903289
48	NC_011883	A	6	6	2646	2651	100 %	0 %	0 %	0 %	220903289
49	NC_011883	CTGG	2	8	2699	2706	0 %	25 %	50 %	25 %	220903289
50	NC_011883	GGT	2	6	2744	2749	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	220903289
51	NC_011883	GCC	2	6	2892	2897	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220903289
52	NC_011883	GCCC	2	8	2920	2927	0 %	0 %	25 %	75 %	220903289
53	NC_011883	C	6	6	2925	2930	0 %	0 %	0 %	100 %	220903289
54	NC_011883	GCA	2	6	2944	2949	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220903289
55	NC_011883	GCC	2	6	3036	3041	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220903289
56	NC_011883	GCC	2	6	3103	3108	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220903289
57	NC_011883	TTC	2	6	3109	3114	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	220903289
58	NC_011883	CCG	2	6	3142	3147	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220903289
59	NC_011883	CCCG	2	8	3150	3157	0 %	0 %	25 %	75 %	220903289
60	NC_011883	GCC	2	6	3174	3179	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220903289
61	NC_011883	TG	3	6	3200	3205	0 %	50 %	50 %	0 %	220903289
62	NC_011883	GAC	2	6	3255	3260	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220903289
63	NC_011883	CAGA	2	8	3329	3336	50 %	0 %	25 %	25 %	220903289
64	NC_011883	GCC	2	6	3399	3404	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220903289
65	NC_011883	TGG	2	6	3493	3498	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	220903289
66	NC_011883	GCT	2	6	3584	3589	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220903289
67	NC_011883	GGTG	2	8	3644	3651	0 %	25 %	75 %	0 %	220903289
68	NC_011883	TAA	2	6	3671	3676	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	220903289
69	NC_011883	A	6	6	3724	3729	100 %	0 %	0 %	0 %	220903289
70	NC_011883	CGG	2	6	3807	3812	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220903289
71	NC_011883	TA	3	6	3846	3851	50 %	50 %	0 %	0 %	220903289
72	NC_011883	GCC	2	6	3853	3858	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220903289
73	NC_011883	AT	3	6	3924	3929	50 %	50 %	0 %	0 %	220903289
74	NC_011883	TAA	2	6	3935	3940	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	220903289
75	NC_011883	TGAAA	2	10	3995	4004	60 %	20 %	20 %	0 %	220903289
76	NC_011883	A	6	6	4084	4089	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_011883	AAT	2	6	4139	4144	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_011883	TAA	2	6	4176	4181	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	220903290
79	NC_011883	ATC	2	6	4189	4194	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	220903290
80	NC_011883	ATT	2	6	4219	4224	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	220903290
81	NC_011883	CGG	2	6	4278	4283	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220903290
82	NC_011883	CAGGG	2	10	4369	4378	20 %	0 %	60 %	20 %	220903290
83	NC_011883	TGC	2	6	4415	4420	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220903290
84	NC_011883	CTG	2	6	4450	4455	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220903290
85	NC_011883	CGC	2	6	4468	4473	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220903290
86	NC_011883	GCG	2	6	4493	4498	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220903290
87	NC_011883	TTC	2	6	4562	4567	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	220903290
88	NC_011883	TGCC	2	8	4626	4633	0 %	25 %	25 %	50 %	220903290
89	NC_011883	ATG	2	6	4639	4644	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	220903290
90	NC_011883	CCA	2	6	4686	4691	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	220903290
91	NC_011883	ACG	2	6	4715	4720	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220903290
92	NC_011883	GCCT	2	8	4733	4740	0 %	25 %	25 %	50 %	220903290
93	NC_011883	AAG	2	6	4783	4788	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	220903290
94	NC_011883	GCA	2	6	4844	4849	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220903290
95	NC_011883	AAG	2	6	4964	4969	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	220903290
96	NC_011883	TCC	2	6	5038	5043	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	220903290
97	NC_011883	TCGGC	2	10	5078	5087	0 %	20 %	40 %	40 %	220903290
98	NC_011883	CGG	2	6	5112	5117	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220903290
99	NC_011883	AGAC	2	8	5186	5193	50 %	0 %	25 %	25 %	220903290
100	NC_011883	ATG	2	6	5194	5199	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	220903290
101	NC_011883	ATC	2	6	5260	5265	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	220903290
102	NC_011883	CGG	2	6	5339	5344	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220903291
103	NC_011883	CTT	2	6	5353	5358	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	220903291
104	NC_011883	TA	3	6	5409	5414	50 %	50 %	0 %	0 %	220903291
105	NC_011883	CG	4	8	5426	5433	0 %	0 %	50 %	50 %	220903291
106	NC_011883	GTG	2	6	5457	5462	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	220903291
107	NC_011883	ACA	2	6	5527	5532	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	220903291
108	NC_011883	CGTG	2	8	5540	5547	0 %	25 %	50 %	25 %	220903291
109	NC_011883	AAGG	2	8	5583	5590	50 %	0 %	50 %	0 %	220903291
110	NC_011883	CCG	2	6	5596	5601	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220903291
111	NC_011883	GGT	2	6	5606	5611	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	220903291
112	NC_011883	CGG	2	6	5630	5635	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220903291
113	NC_011883	CGG	2	6	5666	5671	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220903291
114	NC_011883	CAC	2	6	5825	5830	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	220903291
115	NC_011883	A	6	6	5892	5897	100 %	0 %	0 %	0 %	220903291
116	NC_011883	CAA	2	6	5921	5926	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	220903291
117	NC_011883	AC	3	6	5967	5972	50 %	0 %	0 %	50 %	220903291
118	NC_011883	GGC	2	6	5988	5993	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220903291
119	NC_011883	CGT	2	6	6062	6067	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220903291
120	NC_011883	CAA	2	6	6137	6142	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	220903291
121	NC_011883	AAGG	2	8	6153	6160	50 %	0 %	50 %	0 %	220903291
122	NC_011883	CGA	2	6	6269	6274	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220903291
123	NC_011883	TCA	2	6	6298	6303	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	220903291
124	NC_011883	GCCGCA	2	12	6314	6325	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	220903291
125	NC_011883	AGACCA	2	12	6337	6348	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	220903291
126	NC_011883	GTG	2	6	6387	6392	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	220903291
127	NC_011883	GAA	2	6	6417	6422	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	220903291
128	NC_011883	GCCCGC	2	12	6468	6479	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220903291
129	NC_011883	GCC	2	6	6483	6488	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220903291
130	NC_011883	CGC	2	6	6510	6515	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220903291
131	NC_011883	CGGC	2	8	6613	6620	0 %	0 %	50 %	50 %	220903291
132	NC_011883	CAA	2	6	6722	6727	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	220903291
133	NC_011883	GAC	2	6	6774	6779	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220903291
134	NC_011883	ATC	3	9	6810	6818	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	220903291
135	NC_011883	CA	3	6	6844	6849	50 %	0 %	0 %	50 %	220903291
136	NC_011883	CTG	3	9	6858	6866	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220903291
137	NC_011883	CTT	2	6	6869	6874	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	220903291
138	NC_011883	T	6	6	6873	6878	0 %	100 %	0 %	0 %	220903291
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250	NC_011883	T	6	6	11862	11867	0 %	100 %	0 %	0 %	220903294
251	NC_011883	TGG	2	6	12150	12155	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	220903294
252	NC_011883	AGCG	2	8	12173	12180	25 %	0 %	50 %	25 %	220903294
253	NC_011883	GCCC	2	8	12205	12212	0 %	0 %	25 %	75 %	220903294
254	NC_011883	CCGG	2	8	12241	12248	0 %	0 %	50 %	50 %	220903294
255	NC_011883	A	7	7	12287	12293	100 %	0 %	0 %	0 %	220903294
256	NC_011883	CGTG	2	8	12502	12509	0 %	25 %	50 %	25 %	220903294
257	NC_011883	CGA	2	6	12541	12546	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220903294
258	NC_011883	ATG	2	6	12569	12574	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	220903294
259	NC_011883	A	7	7	12583	12589	100 %	0 %	0 %	0 %	220903294
260	NC_011883	TCT	2	6	12629	12634	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	220903294
261	NC_011883	CCG	2	6	12635	12640	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220903294
262	NC_011883	GCA	2	6	12793	12798	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220903294
263	NC_011883	GCG	2	6	12849	12854	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220903294
264	NC_011883	TGC	2	6	13008	13013	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
265	NC_011883	GAC	2	6	13131	13136	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
266	NC_011883	CCG	2	6	13176	13181	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220903295
267	NC_011883	CG	3	6	13214	13219	0 %	0 %	50 %	50 %	220903295
268	NC_011883	GAA	2	6	13302	13307	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	220903295
269	NC_011883	CGG	2	6	13384	13389	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220903295
270	NC_011883	CAC	2	6	13451	13456	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	220903295
271	NC_011883	CCA	2	6	13508	13513	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	220903295
272	NC_011883	TGC	3	9	13573	13581	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220903295
273	NC_011883	GTC	2	6	13648	13653	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220903295
274	NC_011883	CTG	2	6	13671	13676	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220903295
275	NC_011883	GCC	2	6	13701	13706	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220903295
276	NC_011883	CTG	2	6	13806	13811	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220903295
277	NC_011883	ACT	2	6	13918	13923	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	220903295
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280	NC_011883	GGC	2	6	13970	13975	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220903295
281	NC_011883	GGCG	2	8	13979	13986	0 %	0 %	75 %	25 %	220903295
282	NC_011883	CGG	2	6	14018	14023	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220903295
283	NC_011883	GCC	2	6	14049	14054	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220903295
284	NC_011883	ATG	2	6	14076	14081	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	220903295
285	NC_011883	GGC	2	6	14090	14095	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220903295
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289	NC_011883	GAA	2	6	14395	14400	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
290	NC_011883	CAG	2	6	14452	14457	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220903296
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301	NC_011883	GAA	2	6	15223	15228	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	220903296
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319	NC_011883	AGC	2	6	16325	16330	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
320	NC_011883	GACG	2	8	16400	16407	25 %	0 %	50 %	25 %	220903297
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344	NC_011883	GC	4	8	17544	17551	0 %	0 %	50 %	50 %	220903298
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351	NC_011883	TAT	2	6	17857	17862	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
352	NC_011883	CT	3	6	17884	17889	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
353	NC_011883	T	6	6	17932	17937	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
354	NC_011883	GGA	2	6	17978	17983	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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365	NC_011883	T	6	6	18510	18515	0 %	100 %	0 %	0 %	220903299
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388	NC_011883	A	7	7	19606	19612	100 %	0 %	0 %	0 %	220903300
389	NC_011883	GCGG	2	8	19625	19632	0 %	0 %	75 %	25 %	220903300
390	NC_011883	T	6	6	19642	19647	0 %	100 %	0 %	0 %	220903300
391	NC_011883	GGC	2	6	19717	19722	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220903300
392	NC_011883	GGC	2	6	19816	19821	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220903300
393	NC_011883	GC	3	6	19837	19842	0 %	0 %	50 %	50 %	220903300
394	NC_011883	ATATTG	2	12	19914	19925	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	220903300
395	NC_011883	AAT	2	6	19949	19954	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	220903300
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397	NC_011883	TGGC	2	8	20060	20067	0 %	25 %	50 %	25 %	220903300
398	NC_011883	CAG	2	6	20102	20107	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220903300
399	NC_011883	GCTC	2	8	20113	20120	0 %	25 %	25 %	50 %	220903300
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414	NC_011883	A	6	6	20748	20753	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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452	NC_011883	ATA	2	6	22427	22432	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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