MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Desulfitobacterium hafniense DCB-2 chromosome

Total Repeats: 102184

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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69002	NC_011830	TCA	2	6	3557548	3557553	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219669338
69003	NC_011830	CGG	2	6	3557642	3557647	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219669338
69004	NC_011830	GCA	2	6	3557669	3557674	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219669338
69005	NC_011830	GATG	2	8	3557678	3557685	25 %	25 %	50 %	0 %	219669338
69006	NC_011830	TTC	2	6	3557803	3557808	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219669338
69007	NC_011830	GTG	2	6	3557896	3557901	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219669338
69008	NC_011830	CAG	2	6	3557925	3557930	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219669338
69009	NC_011830	ACT	2	6	3557980	3557985	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219669338
69010	NC_011830	T	6	6	3557988	3557993	0 %	100 %	0 %	0 %	219669338
69011	NC_011830	T	7	7	3558013	3558019	0 %	100 %	0 %	0 %	219669338
69012	NC_011830	T	6	6	3558110	3558115	0 %	100 %	0 %	0 %	219669339
69013	NC_011830	ATCCCA	2	12	3558136	3558147	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	219669339
69014	NC_011830	AAAT	2	8	3558148	3558155	75 %	25 %	0 %	0 %	219669339
69015	NC_011830	CTG	2	6	3558190	3558195	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219669339
69016	NC_011830	CAT	3	9	3558258	3558266	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219669339
69017	NC_011830	CAGC	2	8	3558279	3558286	25 %	0 %	25 %	50 %	219669339
69018	NC_011830	GT	3	6	3558344	3558349	0 %	50 %	50 %	0 %	219669339
69019	NC_011830	A	7	7	3558411	3558417	100 %	0 %	0 %	0 %	219669339
69020	NC_011830	GAT	2	6	3558501	3558506	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219669339
69021	NC_011830	CAG	2	6	3558588	3558593	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219669339
69022	NC_011830	CTTC	2	8	3558604	3558611	0 %	50 %	0 %	50 %	219669339
69023	NC_011830	TCC	2	6	3558678	3558683	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	219669339
69024	NC_011830	CAAA	2	8	3558779	3558786	75 %	0 %	0 %	25 %	219669339
69025	NC_011830	A	6	6	3558819	3558824	100 %	0 %	0 %	0 %	219669339
69026	NC_011830	AAG	2	6	3558941	3558946	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219669340
69027	NC_011830	A	6	6	3558956	3558961	100 %	0 %	0 %	0 %	219669340
69028	NC_011830	TCCTGT	2	12	3558991	3559002	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	219669340
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69030	NC_011830	AACC	2	8	3559043	3559050	50 %	0 %	0 %	50 %	219669340
69031	NC_011830	CTG	2	6	3559118	3559123	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219669340
69032	NC_011830	GAT	2	6	3559135	3559140	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219669340
69033	NC_011830	CCTG	2	8	3559147	3559154	0 %	25 %	25 %	50 %	219669340
69034	NC_011830	ATA	2	6	3559191	3559196	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	219669340
69035	NC_011830	GGA	2	6	3559472	3559477	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	219669340
69036	NC_011830	ATA	2	6	3559526	3559531	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	219669340
69037	NC_011830	CAA	2	6	3559670	3559675	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	219669340
69038	NC_011830	TC	3	6	3559691	3559696	0 %	50 %	0 %	50 %	219669340
69039	NC_011830	CTT	2	6	3559723	3559728	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219669340
69040	NC_011830	CCA	2	6	3559912	3559917	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219669340
69041	NC_011830	C	6	6	3559982	3559987	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
69042	NC_011830	TCC	2	6	3560211	3560216	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	219669341
69043	NC_011830	GCT	2	6	3560332	3560337	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219669341
69044	NC_011830	TAA	2	6	3560399	3560404	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
69045	NC_011830	CAT	2	6	3560410	3560415	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
69046	NC_011830	AGG	2	6	3560417	3560422	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
69047	NC_011830	AG	3	6	3560435	3560440	50 %	0 %	50 %	0 %	219669342
69048	NC_011830	GCA	2	6	3560444	3560449	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219669342
69049	NC_011830	CTTAC	2	10	3560499	3560508	20 %	40 %	0 %	40 %	219669342
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69052	NC_011830	GTC	2	6	3560625	3560630	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219669342
69053	NC_011830	GA	3	6	3560683	3560688	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
69054	NC_011830	GCGG	2	8	3560695	3560702	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
69055	NC_011830	CCG	2	6	3560711	3560716	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
69056	NC_011830	GCC	2	6	3560777	3560782	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
69057	NC_011830	AAT	2	6	3560817	3560822	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
69058	NC_011830	TCC	2	6	3560921	3560926	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	219669343
69059	NC_011830	GCC	3	9	3560948	3560956	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219669343
69060	NC_011830	AGGCCA	2	12	3560963	3560974	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219669343
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69062	NC_011830	ACC	2	6	3561089	3561094	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219669343
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69071	NC_011830	CGC	2	6	3561456	3561461	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219669343
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69080	NC_011830	GCCG	2	8	3561909	3561916	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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69084	NC_011830	A	7	7	3562092	3562098	100 %	0 %	0 %	0 %	219669345
69085	NC_011830	ACCCTG	2	12	3562128	3562139	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	219669345
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69089	NC_011830	AAAG	2	8	3562458	3562465	75 %	0 %	25 %	0 %	219669345
69090	NC_011830	ATG	2	6	3562483	3562488	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219669345
69091	NC_011830	T	6	6	3562498	3562503	0 %	100 %	0 %	0 %	219669345
69092	NC_011830	GAAT	2	8	3562570	3562577	50 %	25 %	25 %	0 %	219669345
69093	NC_011830	CTGG	2	8	3562703	3562710	0 %	25 %	50 %	25 %	219669345
69094	NC_011830	TGCT	2	8	3562726	3562733	0 %	50 %	25 %	25 %	219669345
69095	NC_011830	GCAA	2	8	3562783	3562790	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
69096	NC_011830	CAA	2	6	3562835	3562840	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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69101	NC_011830	TTTC	2	8	3563322	3563329	0 %	75 %	0 %	25 %	219669346
69102	NC_011830	TCT	2	6	3563340	3563345	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219669346
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69104	NC_011830	T	7	7	3563397	3563403	0 %	100 %	0 %	0 %	219669346
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69108	NC_011830	TAATCC	2	12	3563761	3563772	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219669347
69109	NC_011830	CTG	2	6	3563826	3563831	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219669347
69110	NC_011830	GCC	2	6	3563841	3563846	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219669347
69111	NC_011830	TGA	2	6	3563867	3563872	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219669347
69112	NC_011830	AT	3	6	3563904	3563909	50 %	50 %	0 %	0 %	219669347
69113	NC_011830	ACAA	2	8	3564011	3564018	75 %	0 %	0 %	25 %	219669347
69114	NC_011830	T	6	6	3564020	3564025	0 %	100 %	0 %	0 %	219669347
69115	NC_011830	ATAA	2	8	3564027	3564034	75 %	25 %	0 %	0 %	219669347
69116	NC_011830	CCT	2	6	3564038	3564043	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
69117	NC_011830	AAGG	2	8	3564071	3564078	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
69118	NC_011830	TAC	2	6	3564109	3564114	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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69120	NC_011830	CTTC	2	8	3564312	3564319	0 %	50 %	0 %	50 %	219669348
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69226	NC_011830	AAAAT	2	10	3569136	3569145	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
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69231	NC_011830	CTC	2	6	3569508	3569513	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	219669353
69232	NC_011830	A	6	6	3569591	3569596	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
69233	NC_011830	TGC	2	6	3569637	3569642	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219669354
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69236	NC_011830	TCA	2	6	3569829	3569834	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219669354
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69238	NC_011830	G	6	6	3569927	3569932	0 %	0 %	100 %	0 %	219669354
69239	NC_011830	AAAG	2	8	3569999	3570006	75 %	0 %	25 %	0 %	219669354
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69273	NC_011830	GCA	2	6	3571489	3571494	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219669354
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69343	NC_011830	A	6	6	3575290	3575295	100 %	0 %	0 %	0 %	219669359
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69352	NC_011830	AT	3	6	3575671	3575676	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
69353	NC_011830	CTCTT	2	10	3575678	3575687	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
69354	NC_011830	ATC	2	6	3575694	3575699	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
69355	NC_011830	TGA	2	6	3575732	3575737	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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