MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Delftia acidovorans SPH-1 chromosome

Total Repeats: 175253

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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12002	NC_010002	CAT	2	6	432658	432663	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	160895838
12003	NC_010002	GC	3	6	432769	432774	0 %	0 %	50 %	50 %	160895838
12004	NC_010002	GTG	2	6	432836	432841	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	160895838
12005	NC_010002	CAT	2	6	432862	432867	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	160895838
12006	NC_010002	GAA	2	6	432878	432883	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	160895838
12007	NC_010002	TCG	2	6	432891	432896	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	160895838
12008	NC_010002	AGA	2	6	432912	432917	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	160895838
12009	NC_010002	GCT	2	6	432949	432954	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	160895838
12010	NC_010002	CTG	3	9	432986	432994	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	160895838
12011	NC_010002	GGT	2	6	433106	433111	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	160895838
12012	NC_010002	TTC	2	6	433124	433129	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	160895838
12013	NC_010002	AAC	2	6	433130	433135	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	160895838
12014	NC_010002	CGAC	2	8	433161	433168	25 %	0 %	25 %	50 %	160895838
12015	NC_010002	CCG	2	6	433191	433196	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	160895838
12016	NC_010002	GAA	2	6	433265	433270	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	160895838
12017	NC_010002	A	6	6	433377	433382	100 %	0 %	0 %	0 %	160895839
12018	NC_010002	GCT	2	6	433430	433435	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	160895839
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12020	NC_010002	CAA	2	6	433537	433542	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	160895839
12021	NC_010002	CGCA	2	8	433568	433575	25 %	0 %	25 %	50 %	160895839
12022	NC_010002	TGA	2	6	433626	433631	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	160895839
12023	NC_010002	CTTG	2	8	433730	433737	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
12024	NC_010002	CTT	2	6	433797	433802	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12025	NC_010002	GCG	2	6	433864	433869	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
12026	NC_010002	CAAA	2	8	433882	433889	75 %	0 %	0 %	25 %	160895840
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12062	NC_010002	GCT	2	6	435985	435990	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	160895843
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12087	NC_010002	TCG	2	6	436844	436849	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	160895845
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12103	NC_010002	CA	3	6	437492	437497	50 %	0 %	0 %	50 %	160895846
12104	NC_010002	GC	3	6	437500	437505	0 %	0 %	50 %	50 %	160895846
12105	NC_010002	GAC	2	6	437536	437541	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	160895846
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12108	NC_010002	CGT	2	6	437639	437644	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	160895846
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12120	NC_010002	CGTCA	2	10	438007	438016	20 %	20 %	20 %	40 %	160895847
12121	NC_010002	TAC	2	6	438115	438120	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	160895847
12122	NC_010002	AAC	2	6	438263	438268	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12123	NC_010002	GCT	2	6	438278	438283	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	160895848
12124	NC_010002	GAAGT	2	10	438320	438329	40 %	20 %	40 %	0 %	160895848
12125	NC_010002	AACACG	2	12	438386	438397	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	160895848
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12135	NC_010002	ACC	2	6	438821	438826	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	160895850
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12149	NC_010002	TGC	2	6	439384	439389	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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12151	NC_010002	AGA	2	6	439488	439493	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	160895851
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12223	NC_010002	GCC	2	6	442370	442375	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	160895855
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12225	NC_010002	CGG	2	6	442443	442448	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	160895855
12226	NC_010002	CCTG	2	8	442486	442493	0 %	25 %	25 %	50 %	160895855
12227	NC_010002	CAC	2	6	442525	442530	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	160895855
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12229	NC_010002	CTT	2	6	442666	442671	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	160895855
12230	NC_010002	CTGCAA	2	12	442679	442690	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	160895855
12231	NC_010002	GC	3	6	442757	442762	0 %	0 %	50 %	50 %	160895856
12232	NC_010002	GCC	2	6	442941	442946	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	160895856
12233	NC_010002	GGC	2	6	442990	442995	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	160895856
12234	NC_010002	TGG	2	6	442997	443002	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	160895856
12235	NC_010002	GACC	2	8	443022	443029	25 %	0 %	25 %	50 %	160895856
12236	NC_010002	TGG	2	6	443066	443071	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	160895856
12237	NC_010002	CTGC	2	8	443077	443084	0 %	25 %	25 %	50 %	160895856
12238	NC_010002	TGG	2	6	443093	443098	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	160895856
12239	NC_010002	TGC	3	9	443117	443125	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	160895856
12240	NC_010002	GCAG	2	8	443324	443331	25 %	0 %	50 %	25 %	160895857
12241	NC_010002	GCG	2	6	443365	443370	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	160895857
12242	NC_010002	CAT	2	6	443386	443391	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	160895857
12243	NC_010002	TGA	2	6	443397	443402	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	160895857
12244	NC_010002	GCTG	2	8	443404	443411	0 %	25 %	50 %	25 %	160895857
12245	NC_010002	TGC	2	6	443430	443435	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	160895857
12246	NC_010002	GCAGGA	2	12	443452	443463	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	160895857
12247	NC_010002	CGCTG	2	10	443527	443536	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
12248	NC_010002	GCA	3	9	443610	443618	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12249	NC_010002	CG	3	6	443687	443692	0 %	0 %	50 %	50 %	160895858
12250	NC_010002	GTG	2	6	443693	443698	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	160895858
12251	NC_010002	GGT	2	6	443719	443724	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	160895858
12252	NC_010002	ACT	2	6	443727	443732	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	160895858
12253	NC_010002	CGA	2	6	443797	443802	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	160895858
12254	NC_010002	CTG	3	9	443873	443881	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	160895858
12255	NC_010002	GCC	3	9	443900	443908	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	160895858
12256	NC_010002	GTC	2	6	443972	443977	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	160895858
12257	NC_010002	CGA	2	6	443989	443994	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	160895858
12258	NC_010002	GGA	2	6	443998	444003	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	160895858
12259	NC_010002	GGT	2	6	444040	444045	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	160895858
12260	NC_010002	GC	3	6	444132	444137	0 %	0 %	50 %	50 %	160895858
12261	NC_010002	GCA	2	6	444139	444144	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	160895858
12262	NC_010002	GCT	3	9	444148	444156	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	160895858
12263	NC_010002	CGA	2	6	444157	444162	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	160895858
12264	NC_010002	TGG	2	6	444186	444191	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	160895858
12265	NC_010002	TGC	2	6	444216	444221	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	160895858
12266	NC_010002	TCA	2	6	444249	444254	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	160895858
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12268	NC_010002	GC	3	6	444293	444298	0 %	0 %	50 %	50 %	160895858
12269	NC_010002	GC	5	10	444324	444333	0 %	0 %	50 %	50 %	160895858
12270	NC_010002	GCCA	2	8	444335	444342	25 %	0 %	25 %	50 %	160895858
12271	NC_010002	GAC	2	6	444356	444361	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	160895858
12272	NC_010002	ATC	3	9	444365	444373	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	160895858
12273	NC_010002	CGT	2	6	444388	444393	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	160895858
12274	NC_010002	TCG	2	6	444396	444401	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	160895858
12275	NC_010002	CAT	2	6	444412	444417	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	160895858
12276	NC_010002	CGCCAG	2	12	444437	444448	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	160895858
12277	NC_010002	GAGCGC	2	12	444458	444469	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	160895858
12278	NC_010002	TGCA	2	8	444567	444574	25 %	25 %	25 %	25 %	160895858
12279	NC_010002	CGTGGG	2	12	444580	444591	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	160895858
12280	NC_010002	GCG	2	6	444624	444629	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	160895858
12281	NC_010002	GAG	3	9	444644	444652	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	160895858
12282	NC_010002	ACT	2	6	444762	444767	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	160895858
12283	NC_010002	GC	3	6	444790	444795	0 %	0 %	50 %	50 %	160895858
12284	NC_010002	GC	3	6	444841	444846	0 %	0 %	50 %	50 %	160895858
12285	NC_010002	TGCG	2	8	444852	444859	0 %	25 %	50 %	25 %	160895858
12286	NC_010002	GCG	3	9	444857	444865	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	160895858
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12290	NC_010002	CGA	2	6	445114	445119	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	160895858
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12293	NC_010002	GAAG	2	8	445187	445194	50 %	0 %	50 %	0 %	160895858
12294	NC_010002	CTG	2	6	445256	445261	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	160895858
12295	NC_010002	GTC	2	6	445310	445315	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	160895858
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12298	NC_010002	GCT	2	6	445396	445401	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	160895858
12299	NC_010002	GATT	2	8	445460	445467	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
12300	NC_010002	ATC	2	6	445484	445489	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12301	NC_010002	GCA	2	6	445497	445502	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12302	NC_010002	CT	3	6	445508	445513	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
12303	NC_010002	GCA	2	6	445583	445588	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12304	NC_010002	GCCA	2	8	445598	445605	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
12305	NC_010002	T	7	7	445628	445634	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12306	NC_010002	AGA	2	6	445645	445650	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12307	NC_010002	T	6	6	445698	445703	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12308	NC_010002	GCA	2	6	445754	445759	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12309	NC_010002	GCC	2	6	445786	445791	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12310	NC_010002	GCG	2	6	445797	445802	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
12311	NC_010002	GCG	2	6	445816	445821	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	160895859
12312	NC_010002	CTG	2	6	445827	445832	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	160895859
12313	NC_010002	GCGT	2	8	445873	445880	0 %	25 %	50 %	25 %	160895859
12314	NC_010002	CTT	2	6	445898	445903	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	160895859
12315	NC_010002	GC	3	6	446008	446013	0 %	0 %	50 %	50 %	160895859
12316	NC_010002	TCG	2	6	446041	446046	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	160895859
12317	NC_010002	ATG	2	6	446065	446070	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	160895859
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12345	NC_010002	TCG	2	6	447395	447400	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	160895860
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12347	NC_010002	CAG	2	6	447472	447477	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	160895860
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12352	NC_010002	GCT	3	9	447627	447635	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	160895861
12353	NC_010002	GCT	2	6	447799	447804	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	160895861
12354	NC_010002	GGA	2	6	447810	447815	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	160895861
12355	NC_010002	GCCGC	2	10	447914	447923	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
12356	NC_010002	CA	4	8	447938	447945	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
12357	NC_010002	ACAA	2	8	447946	447953	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
12358	NC_010002	CTGC	2	8	447955	447962	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
12359	NC_010002	GTT	2	6	447977	447982	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12360	NC_010002	CTG	2	6	447986	447991	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12361	NC_010002	CA	3	6	447993	447998	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
12362	NC_010002	GCC	3	9	448007	448015	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12363	NC_010002	AAC	2	6	448033	448038	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12364	NC_010002	GTCTG	2	10	448095	448104	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
12365	NC_010002	CGC	2	6	448133	448138	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	160895862
12366	NC_010002	GAG	2	6	448200	448205	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	160895862
12367	NC_010002	TG	3	6	448241	448246	0 %	50 %	50 %	0 %	160895862
12368	NC_010002	GTG	2	6	448254	448259	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	160895862
12369	NC_010002	GGT	2	6	448268	448273	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	160895862
12370	NC_010002	TGG	2	6	448282	448287	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	160895862
12371	NC_010002	GC	3	6	448313	448318	0 %	0 %	50 %	50 %	160895862
12372	NC_010002	GGT	2	6	448355	448360	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	160895862
12373	NC_010002	GC	4	8	448380	448387	0 %	0 %	50 %	50 %	160895862
12374	NC_010002	CGT	2	6	448388	448393	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	160895862
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12380	NC_010002	GCT	2	6	448523	448528	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	160895862
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12388	NC_010002	GGC	2	6	448835	448840	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	160895863
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12398	NC_010002	TCTG	2	8	449305	449312	0 %	50 %	25 %	25 %	160895863
12399	NC_010002	GT	3	6	449353	449358	0 %	50 %	50 %	0 %	160895863
12400	NC_010002	CAT	2	6	449375	449380	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	160895863
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12402	NC_010002	ATG	2	6	449442	449447	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	160895863
12403	NC_010002	ATCT	2	8	449457	449464	25 %	50 %	0 %	25 %	160895863
12404	NC_010002	TTTCC	2	10	449493	449502	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
12405	NC_010002	CTTTCT	2	12	449511	449522	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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12409	NC_010002	CTG	2	6	449751	449756	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	160895864
12410	NC_010002	TAGA	2	8	449806	449813	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
12411	NC_010002	GCT	2	6	449957	449962	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	160895865
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12440	NC_010002	CTGG	2	8	450950	450957	0 %	25 %	50 %	25 %	160895867
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12462	NC_010002	CAAG	2	8	452293	452300	50 %	0 %	25 %	25 %	160895867
12463	NC_010002	GTCTG	2	10	452314	452323	0 %	40 %	40 %	20 %	160895867
12464	NC_010002	CGC	2	6	452413	452418	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	160895867
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12467	NC_010002	CAT	2	6	452464	452469	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	160895868
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12469	NC_010002	AAG	2	6	452519	452524	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	160895868
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12472	NC_010002	GCCAA	2	10	452637	452646	40 %	0 %	20 %	40 %	160895868
12473	NC_010002	GTG	2	6	452708	452713	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	160895868
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12479	NC_010002	TCA	2	6	452994	452999	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	160895868
12480	NC_010002	GGT	2	6	453019	453024	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	160895868
12481	NC_010002	TGC	2	6	453033	453038	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	160895868
12482	NC_010002	GTC	2	6	453043	453048	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	160895868
12483	NC_010002	CGA	2	6	453124	453129	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	160895868
12484	NC_010002	GCT	2	6	453130	453135	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	160895868
12485	NC_010002	GC	3	6	453200	453205	0 %	0 %	50 %	50 %	160895868
12486	NC_010002	TGG	2	6	453207	453212	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	160895868
12487	NC_010002	TCA	2	6	453246	453251	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	160895868
12488	NC_010002	ACA	2	6	453270	453275	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	160895868
12489	NC_010002	TGGC	2	8	453318	453325	0 %	25 %	50 %	25 %	160895868
12490	NC_010002	GCT	2	6	453329	453334	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	160895868
12491	NC_010002	AGC	2	6	453341	453346	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12492	NC_010002	A	6	6	453370	453375	100 %	0 %	0 %	0 %	160895869
12493	NC_010002	GCAAG	2	10	453386	453395	40 %	0 %	40 %	20 %	160895869
12494	NC_010002	TGG	2	6	453418	453423	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	160895869
12495	NC_010002	CGCAA	2	10	453438	453447	40 %	0 %	20 %	40 %	160895869
12496	NC_010002	GCA	2	6	453503	453508	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	160895869
12497	NC_010002	CTG	2	6	453510	453515	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	160895869
12498	NC_010002	CAT	2	6	453635	453640	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	160895869
12499	NC_010002	CGA	2	6	453662	453667	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	160895869
12500	NC_010002	CTG	2	6	453750	453755	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	160895869

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