MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Dinoroseobacter shibae DFL 12 plasmid pDSHI02

Total Repeats: 3471

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2501	NC_009956	GCG	3	9	107293	107301	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159046422
2502	NC_009956	GGC	2	6	107313	107318	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159046422
2503	NC_009956	GC	3	6	107357	107362	0 %	0 %	50 %	50 %	159046422
2504	NC_009956	GC	3	6	107421	107426	0 %	0 %	50 %	50 %	159046422
2505	NC_009956	TGCCGA	2	12	107474	107485	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	159046422
2506	NC_009956	ACC	2	6	107515	107520	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	159046422
2507	NC_009956	C	6	6	107560	107565	0 %	0 %	0 %	100 %	159046422
2508	NC_009956	CGC	2	6	107574	107579	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159046422
2509	NC_009956	ATC	2	6	107587	107592	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	159046422
2510	NC_009956	CCA	2	6	107622	107627	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	159046422
2511	NC_009956	CCAG	2	8	107699	107706	25 %	0 %	25 %	50 %	159046422
2512	NC_009956	ACCG	2	8	107745	107752	25 %	0 %	25 %	50 %	159046422
2513	NC_009956	CG	4	8	107912	107919	0 %	0 %	50 %	50 %	159046422
2514	NC_009956	A	6	6	107922	107927	100 %	0 %	0 %	0 %	159046422
2515	NC_009956	CCA	2	6	107942	107947	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	159046422
2516	NC_009956	GA	3	6	107967	107972	50 %	0 %	50 %	0 %	159046422
2517	NC_009956	GCC	2	6	108000	108005	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159046422
2518	NC_009956	GCT	2	6	108036	108041	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159046422
2519	NC_009956	GCG	2	6	108057	108062	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2520	NC_009956	G	6	6	108078	108083	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
2521	NC_009956	CAA	2	6	108104	108109	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2522	NC_009956	GGTT	2	8	108124	108131	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
2523	NC_009956	GC	3	6	108139	108144	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2524	NC_009956	ATC	2	6	108178	108183	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2525	NC_009956	GACC	2	8	108211	108218	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
2526	NC_009956	CGG	2	6	108288	108293	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159046423
2527	NC_009956	AC	3	6	108436	108441	50 %	0 %	0 %	50 %	159046423
2528	NC_009956	CAT	2	6	108490	108495	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	159046423
2529	NC_009956	CA	3	6	108515	108520	50 %	0 %	0 %	50 %	159046423
2530	NC_009956	CGG	2	6	108549	108554	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159046423
2531	NC_009956	GTG	2	6	108584	108589	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	159046423
2532	NC_009956	GCG	2	6	108593	108598	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159046423
2533	NC_009956	CCCG	2	8	108602	108609	0 %	0 %	25 %	75 %	159046423
2534	NC_009956	CGC	2	6	108653	108658	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159046423
2535	NC_009956	GGT	2	6	108667	108672	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	159046423
2536	NC_009956	GC	3	6	108703	108708	0 %	0 %	50 %	50 %	159046423
2537	NC_009956	GC	3	6	108737	108742	0 %	0 %	50 %	50 %	159046423
2538	NC_009956	GAC	2	6	108758	108763	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159046423
2539	NC_009956	GCC	2	6	108787	108792	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159046423
2540	NC_009956	CAC	2	6	108815	108820	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	159046423
2541	NC_009956	G	6	6	108860	108865	0 %	0 %	100 %	0 %	159046423
2542	NC_009956	GCG	2	6	108880	108885	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159046423
2543	NC_009956	GAC	2	6	108890	108895	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159046423
2544	NC_009956	ATC	2	6	108900	108905	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	159046423
2545	NC_009956	CGA	2	6	108916	108921	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159046423
2546	NC_009956	ACG	2	6	108930	108935	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159046423
2547	NC_009956	TGG	2	6	108945	108950	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	159046423
2548	NC_009956	CCG	2	6	109008	109013	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159046423
2549	NC_009956	GAC	2	6	109048	109053	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159046423
2550	NC_009956	CGG	2	6	109061	109066	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159046423
2551	NC_009956	GAC	2	6	109075	109080	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159046423
2552	NC_009956	GCT	2	6	109114	109119	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159046423
2553	NC_009956	TCG	2	6	109145	109150	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159046423
2554	NC_009956	CAAGCG	2	12	109213	109224	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159046423
2555	NC_009956	GTG	2	6	109250	109255	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	159046423
2556	NC_009956	GGA	2	6	109270	109275	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	159046423
2557	NC_009956	CAG	2	6	109325	109330	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159046423
2558	NC_009956	GCA	2	6	109351	109356	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159046423
2559	NC_009956	ATC	2	6	109445	109450	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	159046423
2560	NC_009956	ACC	2	6	109481	109486	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	159046423
2561	NC_009956	TGA	2	6	109558	109563	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	159046423
2562	NC_009956	CTG	2	6	109650	109655	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159046423
2563	NC_009956	AGCG	2	8	109671	109678	25 %	0 %	50 %	25 %	159046423
2564	NC_009956	CAAGC	2	10	109691	109700	40 %	0 %	20 %	40 %	159046423
2565	NC_009956	CTCGG	2	10	109702	109711	0 %	20 %	40 %	40 %	159046423
2566	NC_009956	GCGT	2	8	109747	109754	0 %	25 %	50 %	25 %	159046423
2567	NC_009956	TTC	2	6	109827	109832	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2568	NC_009956	GCG	2	6	109842	109847	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2569	NC_009956	C	6	6	109852	109857	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
2570	NC_009956	C	6	6	109919	109924	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
2571	NC_009956	TCA	2	6	109928	109933	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2572	NC_009956	GCG	2	6	109983	109988	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2573	NC_009956	TTCA	2	8	110017	110024	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
2574	NC_009956	AC	3	6	110061	110066	50 %	0 %	0 %	50 %	159046424
2575	NC_009956	GCC	2	6	110083	110088	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159046424
2576	NC_009956	GCG	2	6	110153	110158	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159046424
2577	NC_009956	CGG	2	6	110213	110218	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159046424
2578	NC_009956	GCG	2	6	110233	110238	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159046424
2579	NC_009956	TGCCTT	2	12	110307	110318	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	159046424
2580	NC_009956	GCT	2	6	110322	110327	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159046424
2581	NC_009956	TCG	2	6	110336	110341	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159046424
2582	NC_009956	CAT	2	6	110343	110348	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	159046424
2583	NC_009956	ACG	2	6	110386	110391	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159046424
2584	NC_009956	TGC	2	6	110423	110428	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159046424
2585	NC_009956	GC	4	8	110441	110448	0 %	0 %	50 %	50 %	159046424
2586	NC_009956	GAT	2	6	110472	110477	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	159046424
2587	NC_009956	GCT	2	6	110508	110513	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159046424
2588	NC_009956	G	6	6	110585	110590	0 %	0 %	100 %	0 %	159046424
2589	NC_009956	GTT	2	6	110592	110597	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	159046424
2590	NC_009956	CG	3	6	110614	110619	0 %	0 %	50 %	50 %	159046424
2591	NC_009956	CCG	3	9	110630	110638	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159046424
2592	NC_009956	TGGCGC	2	12	110666	110677	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	159046425
2593	NC_009956	CCT	2	6	110695	110700	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	159046425
2594	NC_009956	CTG	2	6	110738	110743	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159046425
2595	NC_009956	GAC	2	6	110753	110758	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159046425
2596	NC_009956	CGA	2	6	110761	110766	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159046425
2597	NC_009956	CAC	2	6	110819	110824	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	159046425
2598	NC_009956	GCCCTG	2	12	110900	110911	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	159046425
2599	NC_009956	TGG	2	6	110916	110921	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	159046425
2600	NC_009956	CCGT	2	8	110973	110980	0 %	25 %	25 %	50 %	159046425
2601	NC_009956	CCT	2	6	111101	111106	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	159046426
2602	NC_009956	GGC	2	6	111127	111132	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159046426
2603	NC_009956	CGT	2	6	111135	111140	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159046426
2604	NC_009956	CCG	2	6	111229	111234	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159046426
2605	NC_009956	TCG	2	6	111263	111268	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159046426
2606	NC_009956	CT	3	6	111389	111394	0 %	50 %	0 %	50 %	159046426
2607	NC_009956	TTC	2	6	111400	111405	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	159046426
2608	NC_009956	CGGTC	2	10	111469	111478	0 %	20 %	40 %	40 %	159046426
2609	NC_009956	TTCG	2	8	111487	111494	0 %	50 %	25 %	25 %	159046426
2610	NC_009956	GGTC	2	8	111522	111529	0 %	25 %	50 %	25 %	159046426
2611	NC_009956	GCC	2	6	111538	111543	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159046426
2612	NC_009956	CG	3	6	111631	111636	0 %	0 %	50 %	50 %	159046426
2613	NC_009956	CGG	2	6	111642	111647	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159046426
2614	NC_009956	CGG	2	6	111705	111710	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159046426
2615	NC_009956	CG	3	6	111794	111799	0 %	0 %	50 %	50 %	159046426
2616	NC_009956	TCC	2	6	111848	111853	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	159046426
2617	NC_009956	GCG	2	6	111974	111979	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159046426
2618	NC_009956	AGC	2	6	111983	111988	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159046426
2619	NC_009956	GC	3	6	111999	112004	0 %	0 %	50 %	50 %	159046426
2620	NC_009956	AGC	2	6	112097	112102	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159046426
2621	NC_009956	CGG	2	6	112116	112121	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159046426
2622	NC_009956	GCC	2	6	112177	112182	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159046426
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2624	NC_009956	GCC	2	6	112222	112227	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159046426
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2632	NC_009956	CG	3	6	112489	112494	0 %	0 %	50 %	50 %	159046426
2633	NC_009956	G	6	6	112560	112565	0 %	0 %	100 %	0 %	159046426
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2743	NC_009956	GAC	2	6	118004	118009	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159046432
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2745	NC_009956	GCA	2	6	118224	118229	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159046432
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2859	NC_009956	TGCGA	2	10	123645	123654	20 %	20 %	40 %	20 %	159046437
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2869	NC_009956	CGTCC	2	10	124096	124105	0 %	20 %	20 %	60 %	159046437
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2990	NC_009956	CAC	2	6	129714	129719	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	159046441
2991	NC_009956	TCG	2	6	129811	129816	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159046441
2992	NC_009956	TCG	2	6	129835	129840	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159046441
2993	NC_009956	GCTCG	2	10	129857	129866	0 %	20 %	40 %	40 %	159046441
2994	NC_009956	CAT	2	6	129873	129878	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	159046441
2995	NC_009956	AC	3	6	129929	129934	50 %	0 %	0 %	50 %	159046441
2996	NC_009956	CCA	2	6	130043	130048	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	159046441
2997	NC_009956	CGAC	2	8	130109	130116	25 %	0 %	25 %	50 %	159046441
2998	NC_009956	CGG	2	6	130193	130198	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159046441
2999	NC_009956	CTC	2	6	130230	130235	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	159046441
3000	NC_009956	TCG	2	6	130372	130377	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159046441

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