MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Dinoroseobacter shibae DFL 12 plasmid pDSHI02

Total Repeats: 3471

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_009956	GACC	2	8	39652	39659	25 %	0 %	25 %	50 %	159046371
1002	NC_009956	GCC	2	6	39734	39739	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159046371
1003	NC_009956	CTT	2	6	39883	39888	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	159046371
1004	NC_009956	GCT	2	6	39925	39930	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159046371
1005	NC_009956	CTG	2	6	39935	39940	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159046371
1006	NC_009956	TGG	2	6	39972	39977	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	159046371
1007	NC_009956	GCCT	2	8	40017	40024	0 %	25 %	25 %	50 %	159046371
1008	NC_009956	GCCGTG	2	12	40025	40036	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	159046371
1009	NC_009956	GGC	2	6	40037	40042	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159046371
1010	NC_009956	GCCC	2	8	40048	40055	0 %	0 %	25 %	75 %	159046371
1011	NC_009956	CATGTC	2	12	40082	40093	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	159046371
1012	NC_009956	GC	3	6	40094	40099	0 %	0 %	50 %	50 %	159046371
1013	NC_009956	CACC	2	8	40132	40139	25 %	0 %	0 %	75 %	159046371
1014	NC_009956	GA	3	6	40165	40170	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1015	NC_009956	GTC	2	6	40176	40181	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159046372
1016	NC_009956	ACC	2	6	40199	40204	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	159046372
1017	NC_009956	GAG	2	6	40225	40230	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	159046372
1018	NC_009956	CTT	2	6	40293	40298	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	159046372
1019	NC_009956	CGA	2	6	40386	40391	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159046372
1020	NC_009956	TC	3	6	40409	40414	0 %	50 %	0 %	50 %	159046372
1021	NC_009956	AGG	2	6	40466	40471	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	159046372
1022	NC_009956	CGC	2	6	40552	40557	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159046372
1023	NC_009956	GCC	2	6	40567	40572	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159046372
1024	NC_009956	GCC	2	6	40582	40587	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159046372
1025	NC_009956	CG	3	6	40645	40650	0 %	0 %	50 %	50 %	159046372
1026	NC_009956	CTT	2	6	40674	40679	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	159046372
1027	NC_009956	CCA	2	6	40680	40685	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	159046372
1028	NC_009956	CGG	2	6	40700	40705	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159046372
1029	NC_009956	TGC	2	6	40718	40723	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159046372
1030	NC_009956	ATC	2	6	40738	40743	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	159046372
1031	NC_009956	CTG	2	6	40750	40755	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159046372
1032	NC_009956	GCG	2	6	40792	40797	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159046372
1033	NC_009956	CG	3	6	40812	40817	0 %	0 %	50 %	50 %	159046372
1034	NC_009956	GTGACG	2	12	40936	40947	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	159046372
1035	NC_009956	GCC	2	6	40969	40974	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159046372
1036	NC_009956	CG	3	6	40993	40998	0 %	0 %	50 %	50 %	159046372
1037	NC_009956	CGC	2	6	41016	41021	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159046372
1038	NC_009956	GCT	2	6	41052	41057	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159046372
1039	NC_009956	GCG	2	6	41090	41095	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159046372
1040	NC_009956	GCA	2	6	41097	41102	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159046372
1041	NC_009956	TGTCGG	2	12	41171	41182	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	159046372
1042	NC_009956	GCC	2	6	41197	41202	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159046372
1043	NC_009956	GCTC	2	8	41261	41268	0 %	25 %	25 %	50 %	159046372
1044	NC_009956	GCTGGT	2	12	41280	41291	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	159046372
1045	NC_009956	CG	3	6	41296	41301	0 %	0 %	50 %	50 %	159046372
1046	NC_009956	GCG	2	6	41335	41340	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159046372
1047	NC_009956	CGC	2	6	41357	41362	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159046372
1048	NC_009956	CGACGG	2	12	41412	41423	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	159046372
1049	NC_009956	GGA	2	6	41466	41471	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	159046372
1050	NC_009956	CAT	2	6	41475	41480	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	159046372
1051	NC_009956	AGG	2	6	41522	41527	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	159046372
1052	NC_009956	GC	3	6	41574	41579	0 %	0 %	50 %	50 %	159046372
1053	NC_009956	CGC	2	6	41625	41630	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159046372
1054	NC_009956	GGGCAT	2	12	41787	41798	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	159046373
1055	NC_009956	GCC	2	6	41887	41892	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159046373
1056	NC_009956	CAGCGC	2	12	41913	41924	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	159046373
1057	NC_009956	CCGCC	2	10	41936	41945	0 %	0 %	20 %	80 %	159046373
1058	NC_009956	CCA	2	6	41946	41951	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	159046373
1059	NC_009956	GC	4	8	41993	42000	0 %	0 %	50 %	50 %	159046373
1060	NC_009956	CAGCG	2	10	42025	42034	20 %	0 %	40 %	40 %	159046373
1061	NC_009956	CCA	2	6	42059	42064	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	159046373
1062	NC_009956	GTC	2	6	42075	42080	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159046373
1063	NC_009956	GC	3	6	42116	42121	0 %	0 %	50 %	50 %	159046373
1064	NC_009956	TCC	2	6	42142	42147	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	159046373
1065	NC_009956	CG	3	6	42150	42155	0 %	0 %	50 %	50 %	159046373
1066	NC_009956	GCC	2	6	42352	42357	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159046373
1067	NC_009956	GCT	2	6	42401	42406	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159046373
1068	NC_009956	GCC	2	6	42433	42438	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159046373
1069	NC_009956	CCG	2	6	42486	42491	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159046373
1070	NC_009956	CCG	2	6	42507	42512	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159046373
1071	NC_009956	GCC	2	6	42553	42558	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159046373
1072	NC_009956	GCC	3	9	42577	42585	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159046373
1073	NC_009956	CCG	2	6	42587	42592	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159046373
1074	NC_009956	GCA	2	6	42605	42610	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159046373
1075	NC_009956	GC	3	6	42636	42641	0 %	0 %	50 %	50 %	159046373
1076	NC_009956	CCG	2	6	42669	42674	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159046373
1077	NC_009956	TCT	2	6	42728	42733	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	159046373
1078	NC_009956	GCCCG	2	10	42815	42824	0 %	0 %	40 %	60 %	159046373
1079	NC_009956	GC	3	6	42838	42843	0 %	0 %	50 %	50 %	159046373
1080	NC_009956	ACC	2	6	42844	42849	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	159046373
1081	NC_009956	CGCCCG	2	12	42860	42871	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159046373
1082	NC_009956	ACC	2	6	42958	42963	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	159046373
1083	NC_009956	TCG	2	6	43036	43041	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159046373
1084	NC_009956	GGT	2	6	43053	43058	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	159046373
1085	NC_009956	TCG	2	6	43090	43095	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159046373
1086	NC_009956	CG	3	6	43110	43115	0 %	0 %	50 %	50 %	159046373
1087	NC_009956	GGCC	2	8	43122	43129	0 %	0 %	50 %	50 %	159046373
1088	NC_009956	CCT	2	6	43133	43138	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	159046373
1089	NC_009956	GCA	2	6	43175	43180	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159046373
1090	NC_009956	CCG	2	6	43194	43199	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159046374
1091	NC_009956	CAC	2	6	43210	43215	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	159046374
1092	NC_009956	CCT	2	6	43245	43250	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	159046374
1093	NC_009956	CG	3	6	43341	43346	0 %	0 %	50 %	50 %	159046374
1094	NC_009956	CG	3	6	43406	43411	0 %	0 %	50 %	50 %	159046374
1095	NC_009956	GGCC	2	8	43424	43431	0 %	0 %	50 %	50 %	159046374
1096	NC_009956	ACA	2	6	43464	43469	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	159046374
1097	NC_009956	CGC	2	6	43523	43528	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159046374
1098	NC_009956	CCGC	2	8	43536	43543	0 %	0 %	25 %	75 %	159046374
1099	NC_009956	GCG	2	6	43562	43567	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159046374
1100	NC_009956	TCG	2	6	43583	43588	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159046374
1101	NC_009956	GCC	2	6	43595	43600	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159046374
1102	NC_009956	GCC	2	6	43649	43654	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159046374
1103	NC_009956	CGC	2	6	43667	43672	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159046374
1104	NC_009956	ATC	2	6	43745	43750	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	159046374
1105	NC_009956	GTT	2	6	43756	43761	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	159046374
1106	NC_009956	GCA	2	6	43785	43790	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159046374
1107	NC_009956	CCT	2	6	43794	43799	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	159046374
1108	NC_009956	GCCTCC	2	12	43826	43837	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	159046374
1109	NC_009956	GCC	2	6	43913	43918	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159046374
1110	NC_009956	GCG	2	6	43942	43947	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159046374
1111	NC_009956	CCA	2	6	44007	44012	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	159046374
1112	NC_009956	GCC	2	6	44021	44026	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159046374
1113	NC_009956	CAG	2	6	44032	44037	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159046374
1114	NC_009956	TCC	2	6	44120	44125	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	159046374
1115	NC_009956	GGT	2	6	44182	44187	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	159046374
1116	NC_009956	CG	3	6	44281	44286	0 %	0 %	50 %	50 %	159046374
1117	NC_009956	CAC	2	6	44293	44298	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	159046374
1118	NC_009956	CGG	2	6	44316	44321	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159046374
1119	NC_009956	CGC	2	6	44392	44397	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159046374
1120	NC_009956	ATC	2	6	44417	44422	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	159046374
1121	NC_009956	ACTG	2	8	44423	44430	25 %	25 %	25 %	25 %	159046374
1122	NC_009956	GTTC	2	8	44448	44455	0 %	50 %	25 %	25 %	159046374
1123	NC_009956	CCT	2	6	44520	44525	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	159046374
1124	NC_009956	CGG	2	6	44557	44562	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159046374
1125	NC_009956	CGGG	2	8	44627	44634	0 %	0 %	75 %	25 %	159046374
1126	NC_009956	TCC	2	6	44759	44764	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	159046374
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1148	NC_009956	A	8	8	45692	45699	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1149	NC_009956	AAC	2	6	45741	45746	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1242	NC_009956	GCA	2	6	49532	49537	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159046380
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1244	NC_009956	CGG	2	6	49686	49691	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159046380
1245	NC_009956	ACC	2	6	49720	49725	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	159046380
1246	NC_009956	GC	3	6	49750	49755	0 %	0 %	50 %	50 %	159046380
1247	NC_009956	CCG	2	6	49760	49765	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159046380
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1250	NC_009956	G	7	7	49860	49866	0 %	0 %	100 %	0 %	159046380
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1380	NC_009956	GAG	2	6	56039	56044	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	159046386
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1382	NC_009956	GTC	2	6	56183	56188	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159046387
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1481	NC_009956	GTG	2	6	60663	60668	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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