MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Dinoroseobacter shibae DFL 12 plasmid pDSHI02

Total Repeats: 3471

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_009956	CG	3	6	19448	19453	0 %	0 %	50 %	50 %	159046351
502	NC_009956	CAG	2	6	19465	19470	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159046351
503	NC_009956	ATC	2	6	19484	19489	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	159046351
504	NC_009956	TCG	2	6	19490	19495	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159046351
505	NC_009956	ACC	2	6	19541	19546	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	159046351
506	NC_009956	CAGCTC	2	12	19552	19563	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	159046351
507	NC_009956	CCG	2	6	19626	19631	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159046351
508	NC_009956	ACC	2	6	19655	19660	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	159046351
509	NC_009956	GGC	2	6	19709	19714	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159046351
510	NC_009956	AG	4	8	19737	19744	50 %	0 %	50 %	0 %	159046351
511	NC_009956	GCC	2	6	19764	19769	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159046351
512	NC_009956	GCG	2	6	19841	19846	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159046351
513	NC_009956	CG	3	6	19870	19875	0 %	0 %	50 %	50 %	159046351
514	NC_009956	AGC	2	6	19877	19882	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159046351
515	NC_009956	GCA	2	6	19971	19976	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159046351
516	NC_009956	GTT	2	6	20074	20079	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	159046351
517	NC_009956	CCG	2	6	20094	20099	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159046351
518	NC_009956	CTT	2	6	20142	20147	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	159046351
519	NC_009956	CTT	2	6	20166	20171	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	159046352
520	NC_009956	CAG	2	6	20185	20190	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159046352
521	NC_009956	GTC	2	6	20199	20204	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159046352
522	NC_009956	GCG	2	6	20210	20215	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159046352
523	NC_009956	GCA	2	6	20351	20356	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159046352
524	NC_009956	TGT	2	6	20360	20365	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	159046352
525	NC_009956	CCG	2	6	20377	20382	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159046352
526	NC_009956	ATG	2	6	20443	20448	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	159046352
527	NC_009956	GGGC	2	8	20463	20470	0 %	0 %	75 %	25 %	159046352
528	NC_009956	CCA	2	6	20486	20491	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	159046352
529	NC_009956	CCA	2	6	20660	20665	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	159046352
530	NC_009956	GCC	2	6	20755	20760	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159046352
531	NC_009956	CG	3	6	20863	20868	0 %	0 %	50 %	50 %	159046352
532	NC_009956	CAG	2	6	20877	20882	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159046352
533	NC_009956	CG	3	6	20903	20908	0 %	0 %	50 %	50 %	159046352
534	NC_009956	GAT	2	6	20940	20945	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	159046352
535	NC_009956	CAC	2	6	20985	20990	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	159046352
536	NC_009956	CGG	2	6	21005	21010	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159046352
537	NC_009956	GGC	2	6	21057	21062	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159046352
538	NC_009956	TG	3	6	21073	21078	0 %	50 %	50 %	0 %	159046352
539	NC_009956	CCG	2	6	21089	21094	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159046352
540	NC_009956	GCG	2	6	21128	21133	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159046352
541	NC_009956	GGAT	2	8	21187	21194	25 %	25 %	50 %	0 %	159046352
542	NC_009956	GCGGA	2	10	21202	21211	20 %	0 %	60 %	20 %	159046352
543	NC_009956	CCG	2	6	21228	21233	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159046352
544	NC_009956	GCT	2	6	21320	21325	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159046352
545	NC_009956	CGC	2	6	21453	21458	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159046352
546	NC_009956	TCC	3	9	21498	21506	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
547	NC_009956	CGG	2	6	21538	21543	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159046353
548	NC_009956	GCA	2	6	21544	21549	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159046353
549	NC_009956	CG	3	6	21594	21599	0 %	0 %	50 %	50 %	159046353
550	NC_009956	CGC	3	9	21617	21625	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159046353
551	NC_009956	CTC	2	6	21659	21664	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	159046353
552	NC_009956	AGC	2	6	21681	21686	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159046353
553	NC_009956	CTTCG	2	10	21725	21734	0 %	40 %	20 %	40 %	159046353
554	NC_009956	CG	3	6	21746	21751	0 %	0 %	50 %	50 %	159046353
555	NC_009956	CAG	2	6	21827	21832	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159046353
556	NC_009956	AG	3	6	21849	21854	50 %	0 %	50 %	0 %	159046353
557	NC_009956	CG	3	6	21879	21884	0 %	0 %	50 %	50 %	159046353
558	NC_009956	GCC	2	6	21898	21903	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159046353
559	NC_009956	GTCC	2	8	21983	21990	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
560	NC_009956	GGC	2	6	21997	22002	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
561	NC_009956	CAA	2	6	22019	22024	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
562	NC_009956	GC	3	6	22068	22073	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
563	NC_009956	CAGA	2	8	22079	22086	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
564	NC_009956	CGA	2	6	22150	22155	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159046354
565	NC_009956	CCG	2	6	22182	22187	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159046354
566	NC_009956	ATC	2	6	22211	22216	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	159046354
567	NC_009956	TGCGG	2	10	22339	22348	0 %	20 %	60 %	20 %	159046354
568	NC_009956	CGGGG	2	10	22369	22378	0 %	0 %	80 %	20 %	159046354
569	NC_009956	ATC	2	6	22382	22387	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	159046354
570	NC_009956	CCGC	2	8	22398	22405	0 %	0 %	25 %	75 %	159046354
571	NC_009956	AGG	2	6	22428	22433	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	159046354
572	NC_009956	CCG	2	6	22549	22554	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159046354
573	NC_009956	GC	3	6	22576	22581	0 %	0 %	50 %	50 %	159046354
574	NC_009956	CCG	2	6	22587	22592	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159046354
575	NC_009956	CGA	2	6	22615	22620	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159046354
576	NC_009956	TCG	2	6	22644	22649	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159046354
577	NC_009956	GCG	2	6	22671	22676	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159046354
578	NC_009956	GCG	2	6	22752	22757	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159046354
579	NC_009956	AGG	2	6	22773	22778	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	159046354
580	NC_009956	GC	3	6	22786	22791	0 %	0 %	50 %	50 %	159046354
581	NC_009956	TCG	2	6	22812	22817	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159046354
582	NC_009956	CGG	2	6	22833	22838	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159046354
583	NC_009956	GC	3	6	22850	22855	0 %	0 %	50 %	50 %	159046354
584	NC_009956	GGC	2	6	22856	22861	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159046354
585	NC_009956	AGG	2	6	22869	22874	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	159046354
586	NC_009956	GC	3	6	22888	22893	0 %	0 %	50 %	50 %	159046354
587	NC_009956	TGCC	2	8	22937	22944	0 %	25 %	25 %	50 %	159046354
588	NC_009956	CGA	2	6	22966	22971	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159046354
589	NC_009956	GCCCG	2	10	23048	23057	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
590	NC_009956	TGC	2	6	23078	23083	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159046355
591	NC_009956	CGCGC	2	10	23148	23157	0 %	0 %	40 %	60 %	159046355
592	NC_009956	GTG	2	6	23170	23175	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	159046355
593	NC_009956	CGG	3	9	23178	23186	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159046355
594	NC_009956	GGC	2	6	23219	23224	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159046355
595	NC_009956	TGC	3	9	23237	23245	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159046355
596	NC_009956	CGA	2	6	23247	23252	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159046355
597	NC_009956	CGC	2	6	23313	23318	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159046355
598	NC_009956	GC	3	6	23317	23322	0 %	0 %	50 %	50 %	159046355
599	NC_009956	GTG	2	6	23356	23361	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	159046355
600	NC_009956	GAC	2	6	23386	23391	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159046355
601	NC_009956	CTG	2	6	23413	23418	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159046355
602	NC_009956	GGCC	2	8	23424	23431	0 %	0 %	50 %	50 %	159046355
603	NC_009956	TCA	2	6	23447	23452	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	159046355
604	NC_009956	CGC	2	6	23577	23582	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159046355
605	NC_009956	CGC	2	6	23657	23662	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159046355
606	NC_009956	CGA	2	6	23742	23747	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159046355
607	NC_009956	CCGA	2	8	23752	23759	25 %	0 %	25 %	50 %	159046355
608	NC_009956	CTGGTT	2	12	23763	23774	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	159046355
609	NC_009956	CTG	2	6	23806	23811	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159046355
610	NC_009956	CCG	2	6	23898	23903	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159046355
611	NC_009956	GCC	2	6	23975	23980	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159046355
612	NC_009956	CCA	2	6	23997	24002	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	159046355
613	NC_009956	GC	4	8	24050	24057	0 %	0 %	50 %	50 %	159046355
614	NC_009956	TCA	2	6	24215	24220	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	159046355
615	NC_009956	GTCA	2	8	24235	24242	25 %	25 %	25 %	25 %	159046355
616	NC_009956	TGC	2	6	24260	24265	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159046355
617	NC_009956	GGC	2	6	24311	24316	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159046355
618	NC_009956	GT	3	6	24327	24332	0 %	50 %	50 %	0 %	159046355
619	NC_009956	CGC	2	6	24344	24349	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159046355
620	NC_009956	CGG	2	6	24372	24377	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159046355
621	NC_009956	GC	3	6	24382	24387	0 %	0 %	50 %	50 %	159046355
622	NC_009956	C	6	6	24416	24421	0 %	0 %	0 %	100 %	159046355
623	NC_009956	CTG	2	6	24436	24441	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159046355
624	NC_009956	CTG	2	6	24466	24471	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159046355
625	NC_009956	CG	3	6	24570	24575	0 %	0 %	50 %	50 %	159046355
626	NC_009956	CCG	2	6	24587	24592	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159046355
627	NC_009956	GCC	2	6	24631	24636	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159046355
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629	NC_009956	ACC	2	6	24679	24684	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	159046355
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758	NC_009956	TCT	2	6	30090	30095	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	159046363
759	NC_009956	GCT	2	6	30096	30101	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159046363
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765	NC_009956	GATA	2	8	30309	30316	50 %	25 %	25 %	0 %	159046363
766	NC_009956	GC	4	8	30362	30369	0 %	0 %	50 %	50 %	159046363
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869	NC_009956	CGGAC	2	10	34068	34077	20 %	0 %	40 %	40 %	159046366
870	NC_009956	GC	3	6	34079	34084	0 %	0 %	50 %	50 %	159046366
871	NC_009956	TATGCC	2	12	34098	34109	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	159046366
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874	NC_009956	CCG	2	6	34168	34173	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159046366
875	NC_009956	GCT	2	6	34223	34228	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159046366
876	NC_009956	GC	4	8	34249	34256	0 %	0 %	50 %	50 %	159046366
877	NC_009956	GAG	2	6	34263	34268	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	159046366
878	NC_009956	CGC	2	6	34286	34291	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159046366
879	NC_009956	ACGGCT	2	12	34312	34323	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	159046366
880	NC_009956	GCG	2	6	34336	34341	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159046366
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882	NC_009956	GGCG	2	8	34364	34371	0 %	0 %	75 %	25 %	159046366
883	NC_009956	CCA	2	6	34375	34380	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	159046366
884	NC_009956	CGC	2	6	34385	34390	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159046366
885	NC_009956	CGC	2	6	34406	34411	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159046366
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