MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Dinoroseobacter shibae DFL 12 plasmid pDSHI01

Total Repeats: 3792

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_009955	CCGA	2	8	147394	147401	25 %	0 %	25 %	50 %	159046280
3002	NC_009955	GGC	2	6	147428	147433	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159046280
3003	NC_009955	CGA	2	6	147499	147504	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159046280
3004	NC_009955	CG	3	6	147511	147516	0 %	0 %	50 %	50 %	159046280
3005	NC_009955	G	6	6	147568	147573	0 %	0 %	100 %	0 %	159046280
3006	NC_009955	GGC	2	6	147669	147674	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159046280
3007	NC_009955	CGGA	2	8	147754	147761	25 %	0 %	50 %	25 %	159046280
3008	NC_009955	AAG	2	6	147792	147797	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	159046280
3009	NC_009955	GGCA	2	8	147820	147827	25 %	0 %	50 %	25 %	159046280
3010	NC_009955	AC	3	6	147832	147837	50 %	0 %	0 %	50 %	159046280
3011	NC_009955	TCG	2	6	147894	147899	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159046280
3012	NC_009955	TAG	2	6	147930	147935	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	159046280
3013	NC_009955	ACC	2	6	147936	147941	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	159046280
3014	NC_009955	GGA	2	6	147944	147949	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	159046280
3015	NC_009955	CAG	2	6	148046	148051	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159046280
3016	NC_009955	GTT	2	6	148055	148060	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	159046280
3017	NC_009955	CGC	2	6	148141	148146	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159046280
3018	NC_009955	GAT	2	6	148151	148156	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	159046280
3019	NC_009955	GAT	2	6	148160	148165	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	159046280
3020	NC_009955	TGA	2	6	148174	148179	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	159046280
3021	NC_009955	GTG	2	6	148253	148258	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3022	NC_009955	AGC	2	6	148333	148338	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159046281
3023	NC_009955	GGT	2	6	148515	148520	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	159046281
3024	NC_009955	GATG	2	8	148529	148536	25 %	25 %	50 %	0 %	159046281
3025	NC_009955	CCA	2	6	148680	148685	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	159046281
3026	NC_009955	CG	3	6	148698	148703	0 %	0 %	50 %	50 %	159046281
3027	NC_009955	GTCA	2	8	148807	148814	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3028	NC_009955	T	6	6	148838	148843	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3029	NC_009955	CAC	2	6	148883	148888	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3030	NC_009955	CAG	2	6	148932	148937	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3031	NC_009955	CGC	2	6	149108	149113	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159046282
3032	NC_009955	ATC	2	6	149316	149321	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	159046282
3033	NC_009955	TTG	2	6	149422	149427	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	159046282
3034	NC_009955	CTT	2	6	149447	149452	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	159046282
3035	NC_009955	CTC	2	6	149495	149500	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	159046282
3036	NC_009955	CCG	2	6	149524	149529	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159046282
3037	NC_009955	TTA	2	6	149554	149559	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	159046282
3038	NC_009955	TCT	2	6	149629	149634	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	159046282
3039	NC_009955	GCC	2	6	149703	149708	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159046282
3040	NC_009955	AGT	2	6	149742	149747	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	159046282
3041	NC_009955	GTT	2	6	149755	149760	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	159046282
3042	NC_009955	GGC	2	6	149773	149778	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159046282
3043	NC_009955	CTC	2	6	149798	149803	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	159046282
3044	NC_009955	CGC	2	6	149842	149847	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159046282
3045	NC_009955	CCG	2	6	149851	149856	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159046282
3046	NC_009955	CG	4	8	149865	149872	0 %	0 %	50 %	50 %	159046282
3047	NC_009955	GC	3	6	149882	149887	0 %	0 %	50 %	50 %	159046282
3048	NC_009955	CTC	2	6	149960	149965	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	159046282
3049	NC_009955	GCG	2	6	149980	149985	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159046282
3050	NC_009955	CGA	2	6	150007	150012	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159046282
3051	NC_009955	CGC	2	6	150093	150098	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159046282
3052	NC_009955	AG	3	6	150120	150125	50 %	0 %	50 %	0 %	159046282
3053	NC_009955	CTC	2	6	150182	150187	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	159046282
3054	NC_009955	GAG	2	6	150224	150229	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	159046282
3055	NC_009955	CAT	2	6	150230	150235	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	159046282
3056	NC_009955	GCT	2	6	150331	150336	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159046282
3057	NC_009955	TG	3	6	150406	150411	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3058	NC_009955	AAAG	2	8	150418	150425	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
3059	NC_009955	TCG	2	6	150444	150449	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3060	NC_009955	CTTTT	2	10	150529	150538	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
3061	NC_009955	T	6	6	150562	150567	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3062	NC_009955	GAA	2	6	150588	150593	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3063	NC_009955	TTGA	2	8	150713	150720	25 %	50 %	25 %	0 %	159046283
3064	NC_009955	TGGCT	2	10	150808	150817	0 %	40 %	40 %	20 %	159046283
3065	NC_009955	GTTC	2	8	150820	150827	0 %	50 %	25 %	25 %	159046283
3066	NC_009955	TC	3	6	150826	150831	0 %	50 %	0 %	50 %	159046283
3067	NC_009955	CTC	2	6	151066	151071	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	159046283
3068	NC_009955	ACA	2	6	151092	151097	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	159046283
3069	NC_009955	CG	3	6	151124	151129	0 %	0 %	50 %	50 %	159046283
3070	NC_009955	CGG	2	6	151187	151192	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159046283
3071	NC_009955	TCC	2	6	151265	151270	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	159046283
3072	NC_009955	CGG	2	6	151358	151363	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159046283
3073	NC_009955	CAAA	2	8	151432	151439	75 %	0 %	0 %	25 %	159046283
3074	NC_009955	TTGT	2	8	151577	151584	0 %	75 %	25 %	0 %	159046283
3075	NC_009955	TCCA	2	8	151669	151676	25 %	25 %	0 %	50 %	159046284
3076	NC_009955	CGT	2	6	151727	151732	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159046284
3077	NC_009955	TGA	2	6	151751	151756	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	159046284
3078	NC_009955	TCGTAT	2	12	151795	151806	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	159046284
3079	NC_009955	GAT	3	9	152139	152147	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	159046284
3080	NC_009955	GGTG	2	8	152233	152240	0 %	25 %	75 %	0 %	159046284
3081	NC_009955	GTAG	2	8	152270	152277	25 %	25 %	50 %	0 %	159046284
3082	NC_009955	CGG	2	6	152294	152299	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159046284
3083	NC_009955	AGG	2	6	152381	152386	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	159046284
3084	NC_009955	GAAG	2	8	152393	152400	50 %	0 %	50 %	0 %	159046284
3085	NC_009955	CCA	2	6	152468	152473	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	159046284
3086	NC_009955	TCG	2	6	152488	152493	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159046284
3087	NC_009955	CGA	2	6	152519	152524	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159046284
3088	NC_009955	GCG	2	6	152611	152616	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159046284
3089	NC_009955	GCCAG	2	10	152687	152696	20 %	0 %	40 %	40 %	159046284
3090	NC_009955	CT	3	6	152772	152777	0 %	50 %	0 %	50 %	159046284
3091	NC_009955	CCA	2	6	152924	152929	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	159046284
3092	NC_009955	AAAGAT	2	12	153059	153070	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
3093	NC_009955	CATG	2	8	153189	153196	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3094	NC_009955	CGC	2	6	153202	153207	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3095	NC_009955	TGG	2	6	153241	153246	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	159046285
3096	NC_009955	TCT	2	6	153325	153330	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	159046285
3097	NC_009955	GCC	2	6	153335	153340	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159046285
3098	NC_009955	GGA	2	6	153581	153586	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3099	NC_009955	GGC	2	6	153613	153618	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3100	NC_009955	A	6	6	153675	153680	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3101	NC_009955	GCG	2	6	153697	153702	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3102	NC_009955	AACAA	2	10	153715	153724	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
3103	NC_009955	CG	3	6	153747	153752	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3104	NC_009955	CAA	2	6	153753	153758	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3105	NC_009955	CG	3	6	153904	153909	0 %	0 %	50 %	50 %	159046286
3106	NC_009955	CAGG	2	8	153961	153968	25 %	0 %	50 %	25 %	159046286
3107	NC_009955	CAAGT	2	10	153977	153986	40 %	20 %	20 %	20 %	159046286
3108	NC_009955	AGA	2	6	154009	154014	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	159046286
3109	NC_009955	AAG	2	6	154043	154048	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	159046286
3110	NC_009955	GCC	2	6	154076	154081	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159046286
3111	NC_009955	CGC	2	6	154215	154220	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159046286
3112	NC_009955	ACC	2	6	154313	154318	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	159046286
3113	NC_009955	CCA	2	6	154476	154481	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	159046286
3114	NC_009955	CAGGC	2	10	154682	154691	20 %	0 %	40 %	40 %	159046286
3115	NC_009955	CTG	2	6	154694	154699	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159046286
3116	NC_009955	AGCG	2	8	154829	154836	25 %	0 %	50 %	25 %	159046286
3117	NC_009955	GAG	2	6	154862	154867	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	159046286
3118	NC_009955	ACA	2	6	154869	154874	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	159046286
3119	NC_009955	TGA	2	6	154908	154913	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	159046286
3120	NC_009955	ACTC	2	8	155044	155051	25 %	25 %	0 %	50 %	159046287
3121	NC_009955	TGA	2	6	155095	155100	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	159046287
3122	NC_009955	CGA	2	6	155205	155210	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159046287
3123	NC_009955	ATC	2	6	155224	155229	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	159046287
3124	NC_009955	CG	3	6	155245	155250	0 %	0 %	50 %	50 %	159046287
3125	NC_009955	GGA	2	6	155268	155273	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	159046287
3126	NC_009955	GC	3	6	155300	155305	0 %	0 %	50 %	50 %	159046287
3127	NC_009955	TGA	2	6	155352	155357	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	159046287
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3129	NC_009955	TTCA	2	8	155428	155435	25 %	50 %	0 %	25 %	159046287
3130	NC_009955	AT	3	6	155444	155449	50 %	50 %	0 %	0 %	159046287
3131	NC_009955	GC	3	6	155498	155503	0 %	0 %	50 %	50 %	159046287
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3134	NC_009955	GCT	2	6	155594	155599	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159046287
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3138	NC_009955	TAA	2	6	155964	155969	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3139	NC_009955	GTTTG	2	10	156029	156038	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
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3199	NC_009955	GACCG	2	10	159158	159167	20 %	0 %	40 %	40 %	159046292
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3202	NC_009955	GAC	2	6	159203	159208	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159046292
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3211	NC_009955	CATGG	2	10	159705	159714	20 %	20 %	40 %	20 %	159046294
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3233	NC_009955	CTT	2	6	161186	161191	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	159046295
3234	NC_009955	GAT	2	6	161204	161209	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	159046295
3235	NC_009955	CCA	2	6	161213	161218	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	159046295
3236	NC_009955	GGC	2	6	161235	161240	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159046295
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3239	NC_009955	GC	3	6	161424	161429	0 %	0 %	50 %	50 %	159046295
3240	NC_009955	CAT	2	6	161430	161435	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	159046295
3241	NC_009955	CAA	2	6	161489	161494	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	159046295
3242	NC_009955	GTG	2	6	161645	161650	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3243	NC_009955	T	6	6	161664	161669	0 %	100 %	0 %	0 %	159046296
3244	NC_009955	CTT	2	6	161704	161709	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	159046296
3245	NC_009955	CG	3	6	161730	161735	0 %	0 %	50 %	50 %	159046296
3246	NC_009955	GAT	2	6	161738	161743	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	159046296
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