MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Dinoroseobacter shibae DFL 12 plasmid pDSHI01

Total Repeats: 3792

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_009955	CCA	2	6	24438	24443	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	159046163
502	NC_009955	GAT	2	6	24459	24464	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	159046163
503	NC_009955	CAG	2	6	24496	24501	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159046163
504	NC_009955	GAT	2	6	24567	24572	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	159046163
505	NC_009955	CCAGG	2	10	24573	24582	20 %	0 %	40 %	40 %	159046163
506	NC_009955	TC	3	6	24593	24598	0 %	50 %	0 %	50 %	159046163
507	NC_009955	CGG	2	6	24655	24660	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159046164
508	NC_009955	GAAAAG	2	12	24704	24715	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	159046164
509	NC_009955	GAT	2	6	24833	24838	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	159046164
510	NC_009955	TGC	2	6	24926	24931	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159046164
511	NC_009955	AGA	2	6	25012	25017	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	159046164
512	NC_009955	GAT	2	6	25066	25071	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	159046164
513	NC_009955	GGT	2	6	25098	25103	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	159046164
514	NC_009955	CGC	3	9	25169	25177	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159046164
515	NC_009955	CGC	2	6	25222	25227	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159046164
516	NC_009955	TG	3	6	25253	25258	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
517	NC_009955	ATCG	2	8	25301	25308	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
518	NC_009955	CAA	2	6	25311	25316	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
519	NC_009955	GAA	2	6	25423	25428	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	159046165
520	NC_009955	G	6	6	25501	25506	0 %	0 %	100 %	0 %	159046165
521	NC_009955	ACG	2	6	25510	25515	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159046165
522	NC_009955	GCAC	2	8	25555	25562	25 %	0 %	25 %	50 %	159046165
523	NC_009955	CTC	2	6	25598	25603	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	159046165
524	NC_009955	ATC	2	6	25614	25619	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	159046165
525	NC_009955	CGGA	2	8	25706	25713	25 %	0 %	50 %	25 %	159046165
526	NC_009955	GCG	2	6	25740	25745	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159046165
527	NC_009955	GACC	2	8	25801	25808	25 %	0 %	25 %	50 %	159046165
528	NC_009955	CGA	2	6	25836	25841	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
529	NC_009955	GTTA	2	8	25870	25877	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
530	NC_009955	TTC	2	6	25989	25994	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	159046166
531	NC_009955	GC	3	6	26020	26025	0 %	0 %	50 %	50 %	159046166
532	NC_009955	GCG	2	6	26118	26123	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159046166
533	NC_009955	CTG	2	6	26139	26144	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159046166
534	NC_009955	CGG	2	6	26192	26197	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159046166
535	NC_009955	GCG	2	6	26241	26246	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159046166
536	NC_009955	GCT	2	6	26270	26275	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159046166
537	NC_009955	GCG	2	6	26310	26315	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159046166
538	NC_009955	TCG	3	9	26356	26364	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159046166
539	NC_009955	GA	3	6	26462	26467	50 %	0 %	50 %	0 %	159046166
540	NC_009955	GAG	2	6	26588	26593	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
541	NC_009955	CCG	2	6	26608	26613	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159046167
542	NC_009955	GCT	2	6	26636	26641	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159046167
543	NC_009955	GAG	2	6	26676	26681	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	159046167
544	NC_009955	CGA	2	6	26705	26710	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159046167
545	NC_009955	CGA	2	6	26771	26776	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159046167
546	NC_009955	CTC	2	6	26835	26840	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	159046167
547	NC_009955	CTG	2	6	26847	26852	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159046167
548	NC_009955	CGTGG	2	10	26853	26862	0 %	20 %	60 %	20 %	159046167
549	NC_009955	AG	3	6	26908	26913	50 %	0 %	50 %	0 %	159046167
550	NC_009955	CGT	2	6	26915	26920	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159046167
551	NC_009955	TCC	2	6	26956	26961	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	159046167
552	NC_009955	CGC	2	6	27078	27083	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159046167
553	NC_009955	CCG	2	6	27086	27091	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159046167
554	NC_009955	GCC	2	6	27101	27106	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159046167
555	NC_009955	ACC	2	6	27130	27135	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	159046167
556	NC_009955	GAG	2	6	27141	27146	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	159046167
557	NC_009955	TCG	2	6	27201	27206	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159046168
558	NC_009955	CCT	2	6	27234	27239	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	159046168
559	NC_009955	TCG	2	6	27254	27259	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159046168
560	NC_009955	CTT	2	6	27339	27344	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	159046168
561	NC_009955	CG	3	6	27345	27350	0 %	0 %	50 %	50 %	159046168
562	NC_009955	TCGC	2	8	27356	27363	0 %	25 %	25 %	50 %	159046168
563	NC_009955	CGG	2	6	27368	27373	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159046168
564	NC_009955	TCG	2	6	27410	27415	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159046168
565	NC_009955	TCA	2	6	27422	27427	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	159046168
566	NC_009955	CCA	2	6	27493	27498	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	159046168
567	NC_009955	GGT	2	6	27516	27521	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	159046168
568	NC_009955	GTC	2	6	27544	27549	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159046168
569	NC_009955	GCT	2	6	27564	27569	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159046168
570	NC_009955	TCA	2	6	27653	27658	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	159046168
571	NC_009955	CGG	2	6	27660	27665	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159046168
572	NC_009955	TCC	2	6	27674	27679	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	159046168
573	NC_009955	ACA	2	6	27683	27688	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	159046168
574	NC_009955	CT	3	6	27725	27730	0 %	50 %	0 %	50 %	159046168
575	NC_009955	CGG	2	6	27759	27764	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159046168
576	NC_009955	CGT	2	6	27816	27821	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159046168
577	NC_009955	TCA	2	6	27858	27863	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	159046168
578	NC_009955	GGC	2	6	27894	27899	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159046168
579	NC_009955	CGT	2	6	27912	27917	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159046168
580	NC_009955	AGG	2	6	28079	28084	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	159046168
581	NC_009955	GAC	2	6	28118	28123	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159046168
582	NC_009955	CCG	2	6	28315	28320	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159046169
583	NC_009955	TGG	2	6	28329	28334	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	159046169
584	NC_009955	TTG	2	6	28346	28351	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	159046169
585	NC_009955	CGG	2	6	28410	28415	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
586	NC_009955	GGC	2	6	28423	28428	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
587	NC_009955	AGA	2	6	28480	28485	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
588	NC_009955	CAG	2	6	28520	28525	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
589	NC_009955	TAT	2	6	28711	28716	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
590	NC_009955	GTAT	2	8	28718	28725	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
591	NC_009955	CTCG	2	8	28785	28792	0 %	25 %	25 %	50 %	159046170
592	NC_009955	T	6	6	28815	28820	0 %	100 %	0 %	0 %	159046170
593	NC_009955	GC	5	10	28834	28843	0 %	0 %	50 %	50 %	159046170
594	NC_009955	TGG	2	6	28884	28889	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	159046170
595	NC_009955	CGG	2	6	28936	28941	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159046170
596	NC_009955	CCG	2	6	28963	28968	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159046170
597	NC_009955	CAG	2	6	29022	29027	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159046170
598	NC_009955	CG	3	6	29140	29145	0 %	0 %	50 %	50 %	159046170
599	NC_009955	CTTC	2	8	29326	29333	0 %	50 %	0 %	50 %	159046170
600	NC_009955	TCG	2	6	29396	29401	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159046170
601	NC_009955	ACT	2	6	29444	29449	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	159046170
602	NC_009955	GCT	2	6	29525	29530	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
603	NC_009955	TGG	2	6	29592	29597	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
604	NC_009955	GAC	2	6	29674	29679	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
605	NC_009955	AGG	2	6	29680	29685	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
606	NC_009955	GCC	2	6	29719	29724	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159046171
607	NC_009955	GC	3	6	29849	29854	0 %	0 %	50 %	50 %	159046171
608	NC_009955	CAA	2	6	29900	29905	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	159046171
609	NC_009955	TCT	2	6	29926	29931	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	159046171
610	NC_009955	ACC	2	6	29937	29942	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	159046171
611	NC_009955	GCG	2	6	29985	29990	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159046171
612	NC_009955	AAG	2	6	29991	29996	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	159046171
613	NC_009955	GAG	2	6	30018	30023	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	159046171
614	NC_009955	CGAG	3	12	30105	30116	25 %	0 %	50 %	25 %	159046171
615	NC_009955	CA	3	6	30119	30124	50 %	0 %	0 %	50 %	159046171
616	NC_009955	CAAGG	2	10	30174	30183	40 %	0 %	40 %	20 %	159046171
617	NC_009955	TGC	3	9	30226	30234	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159046171
618	NC_009955	ATT	2	6	30238	30243	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	159046171
619	NC_009955	GTT	2	6	30269	30274	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	159046171
620	NC_009955	AAG	2	6	30357	30362	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	159046171
621	NC_009955	CTG	2	6	30405	30410	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159046171
622	NC_009955	GAGG	2	8	30411	30418	25 %	0 %	75 %	0 %	159046171
623	NC_009955	TGC	2	6	30442	30447	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159046171
624	NC_009955	CTG	2	6	30531	30536	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159046171
625	NC_009955	CGC	2	6	30633	30638	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159046172
626	NC_009955	CCG	2	6	30703	30708	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159046172
627	NC_009955	CGG	2	6	30713	30718	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159046172
628	NC_009955	CTGC	2	8	30727	30734	0 %	25 %	25 %	50 %	159046172
629	NC_009955	GC	3	6	30828	30833	0 %	0 %	50 %	50 %	159046172
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