MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Dinoroseobacter shibae DFL 12 chromosome

Total Repeats: 87795

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6001	NC_009952	GCG	2	6	252622	252627	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159042809
6002	NC_009952	CG	3	6	252654	252659	0 %	0 %	50 %	50 %	159042809
6003	NC_009952	GCG	2	6	252708	252713	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159042809
6004	NC_009952	GGA	2	6	252735	252740	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	159042809
6005	NC_009952	CGCGG	2	10	252771	252780	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
6006	NC_009952	GGC	2	6	252781	252786	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6007	NC_009952	CAGCG	2	10	252791	252800	20 %	0 %	40 %	40 %	159042810
6008	NC_009952	GCG	2	6	252853	252858	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159042810
6009	NC_009952	CCT	2	6	252891	252896	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	159042810
6010	NC_009952	CGG	3	9	252978	252986	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159042810
6011	NC_009952	GGCGC	2	10	253045	253054	0 %	0 %	60 %	40 %	159042810
6012	NC_009952	GGC	2	6	253057	253062	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159042810
6013	NC_009952	GCC	2	6	253073	253078	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159042810
6014	NC_009952	AGC	2	6	253089	253094	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159042810
6015	NC_009952	TTC	2	6	253103	253108	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	159042810
6016	NC_009952	GCCAG	2	10	253116	253125	20 %	0 %	40 %	40 %	159042810
6017	NC_009952	CGG	2	6	253128	253133	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159042810
6018	NC_009952	ATG	2	6	253139	253144	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	159042810
6019	NC_009952	GGT	2	6	253186	253191	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	159042810
6020	NC_009952	GC	3	6	253266	253271	0 %	0 %	50 %	50 %	159042810
6021	NC_009952	GTC	2	6	253288	253293	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159042810
6022	NC_009952	GC	4	8	253373	253380	0 %	0 %	50 %	50 %	159042810
6023	NC_009952	GCC	2	6	253391	253396	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159042810
6024	NC_009952	AGC	2	6	253397	253402	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159042810
6025	NC_009952	TA	3	6	253468	253473	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6026	NC_009952	GCC	2	6	253518	253523	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6027	NC_009952	CTGG	2	8	253623	253630	0 %	25 %	50 %	25 %	159042811
6028	NC_009952	ACA	2	6	253634	253639	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	159042811
6029	NC_009952	GCC	2	6	253720	253725	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159042811
6030	NC_009952	CAA	2	6	253752	253757	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	159042811
6031	NC_009952	AAC	2	6	253792	253797	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	159042811
6032	NC_009952	GCTGAA	2	12	253809	253820	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	159042811
6033	NC_009952	GCC	2	6	253831	253836	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159042811
6034	NC_009952	GCG	2	6	253851	253856	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159042811
6035	NC_009952	TGG	2	6	253961	253966	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	159042811
6036	NC_009952	CAC	2	6	253968	253973	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	159042811
6037	NC_009952	CGA	2	6	253979	253984	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159042811
6038	NC_009952	CGC	2	6	254079	254084	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159042811
6039	NC_009952	GCC	3	9	254095	254103	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159042811
6040	NC_009952	AAG	2	6	254104	254109	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	159042811
6041	NC_009952	TGA	2	6	254126	254131	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	159042811
6042	NC_009952	GGAGCC	2	12	254181	254192	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	159042811
6043	NC_009952	CTG	2	6	254233	254238	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159042811
6044	NC_009952	GAC	3	9	254245	254253	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159042811
6045	NC_009952	GAGGAC	2	12	254254	254265	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	159042811
6046	NC_009952	GACGAG	2	12	254320	254331	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	159042811
6047	NC_009952	TCGG	2	8	254341	254348	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
6048	NC_009952	GC	3	6	254379	254384	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6049	NC_009952	CGGG	2	8	254410	254417	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
6050	NC_009952	CG	3	6	254494	254499	0 %	0 %	50 %	50 %	159042812
6051	NC_009952	CG	3	6	254586	254591	0 %	0 %	50 %	50 %	159042812
6052	NC_009952	CTCG	2	8	254593	254600	0 %	25 %	25 %	50 %	159042812
6053	NC_009952	TCA	2	6	254816	254821	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	159042813
6054	NC_009952	CG	3	6	254823	254828	0 %	0 %	50 %	50 %	159042813
6055	NC_009952	GTC	2	6	254832	254837	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159042813
6056	NC_009952	TGCAGG	2	12	254860	254871	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	159042813
6057	NC_009952	GCG	2	6	254872	254877	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159042813
6058	NC_009952	CGG	2	6	254920	254925	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159042813
6059	NC_009952	CAG	2	6	254979	254984	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159042813
6060	NC_009952	CGG	2	6	255041	255046	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159042813
6061	NC_009952	GGC	2	6	255069	255074	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159042813
6062	NC_009952	CAG	2	6	255153	255158	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159042813
6063	NC_009952	GCG	2	6	255159	255164	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159042813
6064	NC_009952	GC	3	6	255239	255244	0 %	0 %	50 %	50 %	159042813
6065	NC_009952	GAT	2	6	255273	255278	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	159042813
6066	NC_009952	TCA	2	6	255284	255289	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	159042813
6067	NC_009952	CCA	2	6	255320	255325	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	159042813
6068	NC_009952	GCA	2	6	255396	255401	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159042813
6069	NC_009952	CGA	2	6	255443	255448	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159042813
6070	NC_009952	GC	4	8	255459	255466	0 %	0 %	50 %	50 %	159042813
6071	NC_009952	GGGT	2	8	255487	255494	0 %	25 %	75 %	0 %	159042813
6072	NC_009952	GTC	2	6	255586	255591	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159042813
6073	NC_009952	GCC	2	6	255602	255607	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159042813
6074	NC_009952	CCG	2	6	255623	255628	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159042813
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6077	NC_009952	GGGC	2	8	255723	255730	0 %	0 %	75 %	25 %	159042813
6078	NC_009952	CCT	2	6	255746	255751	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	159042813
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6080	NC_009952	CCG	2	6	255812	255817	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159042813
6081	NC_009952	AGC	2	6	255895	255900	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159042813
6082	NC_009952	GC	3	6	255899	255904	0 %	0 %	50 %	50 %	159042813
6083	NC_009952	CG	3	6	255920	255925	0 %	0 %	50 %	50 %	159042813
6084	NC_009952	GAC	2	6	255979	255984	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159042813
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6086	NC_009952	CA	3	6	256126	256131	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
6087	NC_009952	CGG	2	6	256171	256176	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6088	NC_009952	GC	3	6	256191	256196	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6089	NC_009952	GCG	2	6	256225	256230	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6090	NC_009952	GCA	2	6	256300	256305	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159042814
6091	NC_009952	GC	3	6	256309	256314	0 %	0 %	50 %	50 %	159042814
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6095	NC_009952	CTT	2	6	256456	256461	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	159042814
6096	NC_009952	CGG	2	6	256462	256467	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159042814
6097	NC_009952	C	6	6	256521	256526	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
6098	NC_009952	CCA	2	6	256545	256550	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6099	NC_009952	GCGT	2	8	256563	256570	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
6100	NC_009952	GCT	2	6	256586	256591	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6101	NC_009952	GC	4	8	256628	256635	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6102	NC_009952	GGT	2	6	256683	256688	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	159042815
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6105	NC_009952	CCGA	2	8	256793	256800	25 %	0 %	25 %	50 %	159042815
6106	NC_009952	CCG	2	6	256816	256821	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159042815
6107	NC_009952	AAG	2	6	256826	256831	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	159042815
6108	NC_009952	CCG	2	6	256836	256841	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159042815
6109	NC_009952	GACC	2	8	256885	256892	25 %	0 %	25 %	50 %	159042815
6110	NC_009952	AGG	2	6	257013	257018	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	159042815
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6112	NC_009952	GAC	3	9	257111	257119	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159042815
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6115	NC_009952	GGC	2	6	257223	257228	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6116	NC_009952	GCC	2	6	257270	257275	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6117	NC_009952	GCG	2	6	257276	257281	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6118	NC_009952	CCG	2	6	257350	257355	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159042816
6119	NC_009952	C	8	8	257371	257378	0 %	0 %	0 %	100 %	159042816
6120	NC_009952	CAT	2	6	257411	257416	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	159042816
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6122	NC_009952	CGC	2	6	257527	257532	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159042816
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6124	NC_009952	TTA	2	6	257540	257545	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	159042816
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6143	NC_009952	CCG	2	6	258554	258559	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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6228	NC_009952	GAT	2	6	262380	262385	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6229	NC_009952	AC	3	6	262399	262404	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
6230	NC_009952	GAA	2	6	262439	262444	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	159042822
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6239	NC_009952	CG	3	6	262662	262667	0 %	0 %	50 %	50 %	159042822
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6241	NC_009952	CGG	2	6	262712	262717	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159042822
6242	NC_009952	AAGG	2	8	262728	262735	50 %	0 %	50 %	0 %	159042822
6243	NC_009952	AGC	2	6	262778	262783	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159042822
6244	NC_009952	T	6	6	262855	262860	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6245	NC_009952	CAG	2	6	262897	262902	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6246	NC_009952	CAC	2	6	262985	262990	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	159042823
6247	NC_009952	CCGCGC	2	12	263018	263029	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159042823
6248	NC_009952	GATC	2	8	263157	263164	25 %	25 %	25 %	25 %	159042823
6249	NC_009952	TAT	2	6	263212	263217	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	159042823
6250	NC_009952	AGGC	2	8	263227	263234	25 %	0 %	50 %	25 %	159042823
6251	NC_009952	GAC	2	6	263290	263295	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159042823
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6253	NC_009952	TTGAC	2	10	263339	263348	20 %	40 %	20 %	20 %	159042823
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6256	NC_009952	CG	3	6	263427	263432	0 %	0 %	50 %	50 %	159042823
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6264	NC_009952	CGA	2	6	263622	263627	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159042823
6265	NC_009952	GC	3	6	263641	263646	0 %	0 %	50 %	50 %	159042823
6266	NC_009952	CTG	2	6	263707	263712	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159042823
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6268	NC_009952	CGTT	2	8	263774	263781	0 %	50 %	25 %	25 %	159042823
6269	NC_009952	CG	3	6	263858	263863	0 %	0 %	50 %	50 %	159042823
6270	NC_009952	GCG	2	6	263866	263871	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159042823
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6282	NC_009952	GC	3	6	264781	264786	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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6358	NC_009952	TGGGC	2	10	268232	268241	0 %	20 %	60 %	20 %	159042824
6359	NC_009952	CG	4	8	268242	268249	0 %	0 %	50 %	50 %	159042824
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6365	NC_009952	ACG	2	6	268469	268474	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159042824
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6367	NC_009952	CG	3	6	268545	268550	0 %	0 %	50 %	50 %	159042824
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6491	NC_009952	TGC	2	6	274191	274196	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159042826
6492	NC_009952	TGG	3	9	274254	274262	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	159042826
6493	NC_009952	GGT	2	6	274294	274299	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	159042826
6494	NC_009952	CCG	2	6	274300	274305	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159042826
6495	NC_009952	GGC	2	6	274306	274311	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159042826
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6497	NC_009952	CCG	2	6	274352	274357	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6498	NC_009952	G	6	6	274405	274410	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
6499	NC_009952	GTCC	2	8	274508	274515	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
6500	NC_009952	CG	3	6	274570	274575	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding

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