MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Desulfococcus oleovorans Hxd3 chromosome

Total Repeats: 85222

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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12002	NC_009943	CGG	2	6	548060	548065	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	158520499
12003	NC_009943	CTG	2	6	548078	548083	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	158520499
12004	NC_009943	GGC	2	6	548132	548137	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	158520499
12005	NC_009943	CCTG	2	8	548152	548159	0 %	25 %	25 %	50 %	158520499
12006	NC_009943	CTT	2	6	548196	548201	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	158520499
12007	NC_009943	GGCC	2	8	548237	548244	0 %	0 %	50 %	50 %	158520499
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12016	NC_009943	GCCCG	2	10	548659	548668	0 %	0 %	40 %	60 %	158520499
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12039	NC_009943	CCGG	2	8	549817	549824	0 %	0 %	50 %	50 %	158520501
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12089	NC_009943	ATATT	2	10	551965	551974	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
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12112	NC_009943	CGC	2	6	552820	552825	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	158520504
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12116	NC_009943	TGG	2	6	552964	552969	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	158520504
12117	NC_009943	GA	3	6	552993	552998	50 %	0 %	50 %	0 %	158520504
12118	NC_009943	TCA	2	6	552999	553004	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	158520504
12119	NC_009943	GGGAA	2	10	553054	553063	40 %	0 %	60 %	0 %	158520504
12120	NC_009943	AACTC	2	10	553065	553074	40 %	20 %	0 %	40 %	158520504
12121	NC_009943	GTCT	2	8	553081	553088	0 %	50 %	25 %	25 %	158520504
12122	NC_009943	C	7	7	553155	553161	0 %	0 %	0 %	100 %	158520504
12123	NC_009943	CGG	2	6	553167	553172	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	158520504
12124	NC_009943	ATT	2	6	553256	553261	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	158520504
12125	NC_009943	ACTG	2	8	553280	553287	25 %	25 %	25 %	25 %	158520504
12126	NC_009943	ATG	2	6	553299	553304	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	158520504
12127	NC_009943	AAT	2	6	553373	553378	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	158520505
12128	NC_009943	A	6	6	553385	553390	100 %	0 %	0 %	0 %	158520505
12129	NC_009943	AAG	2	6	553403	553408	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	158520505
12130	NC_009943	GCA	2	6	553423	553428	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	158520505
12131	NC_009943	ACC	2	6	553530	553535	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	158520505
12132	NC_009943	CCA	2	6	553552	553557	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	158520505
12133	NC_009943	CGAGGA	2	12	553655	553666	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	158520505
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12140	NC_009943	ATC	2	6	553964	553969	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	158520506
12141	NC_009943	ACACG	2	10	553984	553993	40 %	0 %	20 %	40 %	158520506
12142	NC_009943	GCT	2	6	554080	554085	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	158520506
12143	NC_009943	CGGCAG	2	12	554122	554133	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	158520506
12144	NC_009943	TGG	2	6	554229	554234	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	158520506
12145	NC_009943	AT	3	6	554296	554301	50 %	50 %	0 %	0 %	158520506
12146	NC_009943	ATG	2	6	554322	554327	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	158520506
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12148	NC_009943	GGC	2	6	554390	554395	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
12149	NC_009943	ATG	2	6	554438	554443	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	158520507
12150	NC_009943	GCCGT	2	10	554484	554493	0 %	20 %	40 %	40 %	158520507
12151	NC_009943	GTC	2	6	554501	554506	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	158520507
12152	NC_009943	CTG	2	6	554522	554527	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	158520507
12153	NC_009943	GAA	2	6	554571	554576	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	158520507
12154	NC_009943	CGG	2	6	554595	554600	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	158520507
12155	NC_009943	ACG	2	6	554646	554651	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	158520507
12156	NC_009943	TGGGAC	2	12	554654	554665	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	158520507
12157	NC_009943	CCT	2	6	554770	554775	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	158520507
12158	NC_009943	TAT	2	6	554831	554836	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	158520507
12159	NC_009943	GT	4	8	554837	554844	0 %	50 %	50 %	0 %	158520507
12160	NC_009943	GACGGT	2	12	554933	554944	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	158520507
12161	NC_009943	CCTGC	2	10	554979	554988	0 %	20 %	20 %	60 %	158520507
12162	NC_009943	ACG	3	9	555003	555011	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	158520507
12163	NC_009943	TGA	2	6	555094	555099	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	158520507
12164	NC_009943	CTA	2	6	555112	555117	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	158520507
12165	NC_009943	ACGG	2	8	555125	555132	25 %	0 %	50 %	25 %	158520507
12166	NC_009943	GCC	2	6	555173	555178	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	158520507
12167	NC_009943	TGA	2	6	555205	555210	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	158520507
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12169	NC_009943	CGA	2	6	555283	555288	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	158520507
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12171	NC_009943	TGA	2	6	555406	555411	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	158520507
12172	NC_009943	CGC	2	6	555418	555423	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	158520507
12173	NC_009943	CATC	2	8	555424	555431	25 %	25 %	0 %	50 %	158520507
12174	NC_009943	CAA	2	6	555451	555456	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	158520507
12175	NC_009943	CGA	2	6	555484	555489	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	158520507
12176	NC_009943	GGT	2	6	555499	555504	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	158520507
12177	NC_009943	CTA	2	6	555508	555513	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	158520507
12178	NC_009943	CCA	2	6	555546	555551	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	158520507
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12180	NC_009943	TGA	2	6	555694	555699	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	158520507
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12184	NC_009943	GAC	2	6	555818	555823	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	158520507
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12187	NC_009943	GT	3	6	555915	555920	0 %	50 %	50 %	0 %	158520507
12188	NC_009943	TAC	2	6	555995	556000	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	158520507
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12192	NC_009943	TCC	2	6	556109	556114	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	158520507
12193	NC_009943	TGG	2	6	556167	556172	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	158520507
12194	NC_009943	TCC	2	6	556181	556186	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	158520507
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12197	NC_009943	GC	3	6	556304	556309	0 %	0 %	50 %	50 %	158520507
12198	NC_009943	GGT	2	6	556378	556383	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	158520507
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12200	NC_009943	ACA	2	6	556476	556481	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	158520507
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12203	NC_009943	GCG	2	6	556584	556589	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	158520507
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12212	NC_009943	TGA	2	6	556804	556809	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	158520507
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12215	NC_009943	CCG	2	6	556908	556913	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	158520507
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12217	NC_009943	GGC	2	6	556934	556939	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	158520507
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12219	NC_009943	TGG	2	6	557100	557105	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	158520507
12220	NC_009943	GAAG	2	8	557152	557159	50 %	0 %	50 %	0 %	158520507
12221	NC_009943	ATG	2	6	557231	557236	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	158520507
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12223	NC_009943	CCG	2	6	557274	557279	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	158520507
12224	NC_009943	AGGCCA	2	12	557304	557315	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	158520507
12225	NC_009943	AGC	2	6	557387	557392	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	158520507
12226	NC_009943	TGG	2	6	557421	557426	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	158520507
12227	NC_009943	TTA	2	6	557433	557438	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	158520507
12228	NC_009943	AAT	2	6	557462	557467	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	158520507
12229	NC_009943	ACG	2	6	557562	557567	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	158520507
12230	NC_009943	CTG	2	6	557720	557725	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	158520507
12231	NC_009943	G	6	6	557742	557747	0 %	0 %	100 %	0 %	158520507
12232	NC_009943	CGGC	2	8	557876	557883	0 %	0 %	50 %	50 %	158520507
12233	NC_009943	CAG	2	6	557935	557940	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	158520507
12234	NC_009943	ACCA	2	8	557942	557949	50 %	0 %	0 %	50 %	158520507
12235	NC_009943	ACGG	2	8	557984	557991	25 %	0 %	50 %	25 %	158520507
12236	NC_009943	GCA	2	6	558036	558041	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	158520507
12237	NC_009943	CCACCC	2	12	558069	558080	16.67 %	0 %	0 %	83.33 %	158520507
12238	NC_009943	CAC	2	6	558262	558267	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	158520507
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12366	NC_009943	CTG	2	6	563435	563440	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	158520512
12367	NC_009943	CTG	2	6	563447	563452	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	158520512
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12487	NC_009943	TCCCGG	2	12	568799	568810	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	158520517
12488	NC_009943	CCAGC	2	10	568855	568864	20 %	0 %	20 %	60 %	158520517
12489	NC_009943	GAT	2	6	568912	568917	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	158520517
12490	NC_009943	CAG	2	6	568975	568980	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	158520517
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