MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Deinococcus geothermalis DSM 11300 plasmid pDGEO02

Total Repeats: 5180

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009939	CCA	2	6	38	43	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2	NC_009939	GCT	2	6	122	127	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_009939	GCT	2	6	199	204	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	158421419
4	NC_009939	GGC	3	9	232	240	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	158421419
5	NC_009939	ACCAGG	2	12	252	263	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	158421419
6	NC_009939	CAG	2	6	344	349	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	158421419
7	NC_009939	AGC	2	6	402	407	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	158421419
8	NC_009939	CGG	2	6	417	422	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	158421419
9	NC_009939	GC	3	6	563	568	0 %	0 %	50 %	50 %	158421420
10	NC_009939	CT	3	6	618	623	0 %	50 %	0 %	50 %	158421420
11	NC_009939	CAG	2	6	653	658	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	158421420
12	NC_009939	GCC	2	6	702	707	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	158421420
13	NC_009939	TGCCG	2	10	718	727	0 %	20 %	40 %	40 %	158421420
14	NC_009939	TGA	3	9	730	738	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	158421420
15	NC_009939	CTC	2	6	743	748	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	158421420
16	NC_009939	CAG	2	6	770	775	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	158421420
17	NC_009939	ACG	3	9	898	906	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_009939	CAG	2	6	951	956	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_009939	GC	4	8	967	974	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
20	NC_009939	CGG	2	6	994	999	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_009939	AC	3	6	1031	1036	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
22	NC_009939	GT	3	6	1095	1100	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
23	NC_009939	GGC	2	6	1128	1133	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_009939	G	6	6	1173	1178	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
25	NC_009939	GC	3	6	1184	1189	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
26	NC_009939	TCCCC	2	10	1192	1201	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
27	NC_009939	C	8	8	1198	1205	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
28	NC_009939	GGCT	2	8	1220	1227	0 %	25 %	50 %	25 %	158421421
29	NC_009939	CAGTT	2	10	1228	1237	20 %	40 %	20 %	20 %	158421421
30	NC_009939	GTC	2	6	1296	1301	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	158421421
31	NC_009939	CTG	2	6	1308	1313	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	158421421
32	NC_009939	CTCCA	2	10	1318	1327	20 %	20 %	0 %	60 %	158421421
33	NC_009939	GGC	2	6	1331	1336	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	158421421
34	NC_009939	CGG	2	6	1362	1367	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	158421421
35	NC_009939	GGT	2	6	1429	1434	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	158421421
36	NC_009939	GCG	3	9	1470	1478	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	158421421
37	NC_009939	CCT	2	6	1508	1513	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	158421421
38	NC_009939	GC	3	6	1575	1580	0 %	0 %	50 %	50 %	158421421
39	NC_009939	GCT	3	9	1586	1594	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	158421421
40	NC_009939	GCCA	2	8	1597	1604	25 %	0 %	25 %	50 %	158421421
41	NC_009939	CGG	2	6	1625	1630	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	158421421
42	NC_009939	AGT	2	6	1687	1692	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	158421421
43	NC_009939	GCT	2	6	1720	1725	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	158421422
44	NC_009939	TCC	2	6	1767	1772	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	158421422
45	NC_009939	CTG	2	6	1835	1840	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	158421422
46	NC_009939	CCA	2	6	1912	1917	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	158421422
47	NC_009939	TGCC	3	12	2021	2032	0 %	25 %	25 %	50 %	158421422
48	NC_009939	GTA	3	9	2081	2089	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	158421422
49	NC_009939	C	7	7	2096	2102	0 %	0 %	0 %	100 %	158421422
50	NC_009939	CTG	2	6	2135	2140	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	158421422
51	NC_009939	C	6	6	2152	2157	0 %	0 %	0 %	100 %	158421422
52	NC_009939	GC	4	8	2174	2181	0 %	0 %	50 %	50 %	158421422
53	NC_009939	TGC	2	6	2208	2213	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	158421422
54	NC_009939	ACC	2	6	2268	2273	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	158421422
55	NC_009939	CCT	2	6	2309	2314	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	158421423
56	NC_009939	CCCG	2	8	2318	2325	0 %	0 %	25 %	75 %	158421423
57	NC_009939	CG	3	6	2333	2338	0 %	0 %	50 %	50 %	158421423
58	NC_009939	CCT	2	6	2351	2356	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	158421423
59	NC_009939	GC	3	6	2383	2388	0 %	0 %	50 %	50 %	158421423
60	NC_009939	C	6	6	2460	2465	0 %	0 %	0 %	100 %	158421423
61	NC_009939	CAG	2	6	2508	2513	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	158421423
62	NC_009939	CCT	2	6	2540	2545	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	158421423
63	NC_009939	CGG	2	6	2597	2602	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	158421423
64	NC_009939	CGG	2	6	2627	2632	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	158421423
65	NC_009939	GCTG	2	8	2639	2646	0 %	25 %	50 %	25 %	158421423
66	NC_009939	CTC	2	6	2685	2690	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	158421423
67	NC_009939	CGGG	2	8	2695	2702	0 %	0 %	75 %	25 %	158421423
68	NC_009939	CGG	2	6	2716	2721	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	158421423
69	NC_009939	GA	3	6	2783	2788	50 %	0 %	50 %	0 %	158421423
70	NC_009939	CCT	2	6	2810	2815	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	158421423
71	NC_009939	CAG	2	6	2850	2855	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	158421423
72	NC_009939	TCCG	2	8	2857	2864	0 %	25 %	25 %	50 %	158421423
73	NC_009939	AGA	2	6	2868	2873	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	158421423
74	NC_009939	ACG	2	6	2932	2937	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	158421423
75	NC_009939	GTG	2	6	2938	2943	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	158421423
76	NC_009939	CGC	2	6	2954	2959	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	158421423
77	NC_009939	CGG	2	6	2996	3001	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	158421423
78	NC_009939	GCA	2	6	3002	3007	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	158421423
79	NC_009939	CTT	2	6	3063	3068	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	158421423
80	NC_009939	TCC	2	6	3091	3096	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	158421423
81	NC_009939	TCT	3	9	3120	3128	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	158421423
82	NC_009939	GT	3	6	3213	3218	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
83	NC_009939	GCC	2	6	3232	3237	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
84	NC_009939	GCT	2	6	3259	3264	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_009939	CAC	2	6	3286	3291	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
86	NC_009939	TTC	2	6	3335	3340	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	158421424
87	NC_009939	CA	3	6	3374	3379	50 %	0 %	0 %	50 %	158421424
88	NC_009939	ACCGC	2	10	3383	3392	20 %	0 %	20 %	60 %	158421424
89	NC_009939	TGG	2	6	3416	3421	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	158421424
90	NC_009939	CGC	2	6	3449	3454	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	158421424
91	NC_009939	GCT	2	6	3480	3485	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	158421424
92	NC_009939	C	6	6	3486	3491	0 %	0 %	0 %	100 %	158421424
93	NC_009939	CTG	2	6	3553	3558	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	158421424
94	NC_009939	GTG	2	6	3583	3588	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	158421424
95	NC_009939	CGG	2	6	3618	3623	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	158421424
96	NC_009939	TGC	2	6	3647	3652	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	158421424
97	NC_009939	TGG	2	6	3653	3658	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	158421424
98	NC_009939	CCCG	2	8	3679	3686	0 %	0 %	25 %	75 %	158421424
99	NC_009939	ATTCGG	2	12	3772	3783	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	158421424
100	NC_009939	ACA	2	6	3900	3905	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	158421425
101	NC_009939	ACTGA	2	10	3934	3943	40 %	20 %	20 %	20 %	158421425
102	NC_009939	CAGG	2	8	4067	4074	25 %	0 %	50 %	25 %	158421425
103	NC_009939	GAT	2	6	4091	4096	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	158421425
104	NC_009939	GGT	2	6	4145	4150	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	158421425
105	NC_009939	GAT	2	6	4325	4330	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	158421425
106	NC_009939	G	7	7	4349	4355	0 %	0 %	100 %	0 %	158421425
107	NC_009939	AGG	2	6	4414	4419	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	158421425
108	NC_009939	CCA	2	6	4451	4456	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
109	NC_009939	CAG	3	9	4493	4501	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_009939	CAG	2	6	4508	4513	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_009939	CTT	2	6	4736	4741	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	158421426
112	NC_009939	GCT	2	6	4753	4758	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	158421426
113	NC_009939	CCGC	2	8	4762	4769	0 %	0 %	25 %	75 %	158421426
114	NC_009939	CAG	2	6	4808	4813	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	158421426
115	NC_009939	GA	3	6	4825	4830	50 %	0 %	50 %	0 %	158421426
116	NC_009939	GGT	2	6	4925	4930	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	158421426
117	NC_009939	G	6	6	4981	4986	0 %	0 %	100 %	0 %	158421426
118	NC_009939	ACC	2	6	4998	5003	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	158421426
119	NC_009939	TCG	2	6	5091	5096	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	158421426
120	NC_009939	CCGAAT	2	12	5114	5125	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	158421426
121	NC_009939	CGGG	2	8	5211	5218	0 %	0 %	75 %	25 %	158421426
122	NC_009939	CAG	2	6	5243	5248	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	158421426
123	NC_009939	GCC	2	6	5273	5278	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	158421426
124	NC_009939	CAG	2	6	5339	5344	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	158421426
125	NC_009939	G	6	6	5406	5411	0 %	0 %	100 %	0 %	158421426
126	NC_009939	AGC	2	6	5412	5417	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	158421426
127	NC_009939	GCG	2	6	5443	5448	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	158421426
128	NC_009939	CCA	2	6	5476	5481	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	158421426
129	NC_009939	GCGGT	2	10	5505	5514	0 %	20 %	60 %	20 %	158421426
130	NC_009939	TG	3	6	5518	5523	0 %	50 %	50 %	0 %	158421426
131	NC_009939	GAA	2	6	5557	5562	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	158421426
132	NC_009939	GGT	2	6	5605	5610	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
133	NC_009939	AGC	2	6	5633	5638	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
134	NC_009939	CTG	2	6	5701	5706	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	158421427
135	NC_009939	CAT	2	6	5741	5746	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	158421427
136	NC_009939	GAA	2	6	5799	5804	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	158421427
137	NC_009939	TGC	2	6	5806	5811	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	158421427
138	NC_009939	AGTC	2	8	5828	5835	25 %	25 %	25 %	25 %	158421427
139	NC_009939	CCA	2	6	5872	5877	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	158421427
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143	NC_009939	TTC	2	6	6051	6056	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	158421427
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173	NC_009939	TGC	2	6	7519	7524	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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269	NC_009939	CCA	2	6	11095	11100	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	158421432
270	NC_009939	GAC	2	6	11180	11185	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	158421432
271	NC_009939	GCA	2	6	11190	11195	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	158421432
272	NC_009939	TGA	2	6	11206	11211	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	158421432
273	NC_009939	GTTG	2	8	11257	11264	0 %	50 %	50 %	0 %	158421432
274	NC_009939	AGC	2	6	11265	11270	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	158421432
275	NC_009939	CGA	2	6	11275	11280	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	158421432
276	NC_009939	GAGG	2	8	11294	11301	25 %	0 %	75 %	0 %	158421432
277	NC_009939	C	6	6	11313	11318	0 %	0 %	0 %	100 %	158421432
278	NC_009939	CAG	2	6	11366	11371	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	158421432
279	NC_009939	CG	3	6	11373	11378	0 %	0 %	50 %	50 %	158421432
280	NC_009939	GCC	2	6	11384	11389	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	158421432
281	NC_009939	ACCC	2	8	11390	11397	25 %	0 %	0 %	75 %	158421432
282	NC_009939	GAA	2	6	11429	11434	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	158421432
283	NC_009939	GATGGC	2	12	11483	11494	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	158421432
284	NC_009939	GCA	2	6	11497	11502	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	158421432
285	NC_009939	CAG	2	6	11507	11512	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	158421432
286	NC_009939	GC	3	6	11528	11533	0 %	0 %	50 %	50 %	158421432
287	NC_009939	GCGG	2	8	11569	11576	0 %	0 %	75 %	25 %	158421432
288	NC_009939	CAG	2	6	11602	11607	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	158421433
289	NC_009939	GCGCG	2	10	11622	11631	0 %	0 %	60 %	40 %	158421433
290	NC_009939	CGGG	3	12	11721	11732	0 %	0 %	75 %	25 %	158421433
291	NC_009939	GGA	2	6	11766	11771	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	158421433
292	NC_009939	GCGG	2	8	11772	11779	0 %	0 %	75 %	25 %	158421433
293	NC_009939	TTC	2	6	11783	11788	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	158421433
294	NC_009939	CTT	2	6	11824	11829	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	158421433
295	NC_009939	TGA	2	6	11892	11897	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	158421433
296	NC_009939	GGC	2	6	11905	11910	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	158421433
297	NC_009939	CTG	2	6	11911	11916	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	158421433
298	NC_009939	CGC	2	6	11952	11957	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	158421433
299	NC_009939	GCG	2	6	12002	12007	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	158421433
300	NC_009939	GAA	2	6	12034	12039	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	158421433
301	NC_009939	CCTTGT	2	12	12117	12128	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	158421433
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303	NC_009939	CCCG	2	8	12214	12221	0 %	0 %	25 %	75 %	158421433
304	NC_009939	CTGCCA	2	12	12238	12249	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	158421433
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307	NC_009939	AGA	2	6	12399	12404	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	158421433
308	NC_009939	CTG	2	6	12439	12444	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	158421433
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311	NC_009939	CCG	2	6	12638	12643	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	158421433
312	NC_009939	GTCCC	2	10	12725	12734	0 %	20 %	20 %	60 %	158421433
313	NC_009939	AGT	2	6	12735	12740	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	158421433
314	NC_009939	CAG	2	6	12781	12786	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	158421433
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317	NC_009939	CCT	2	6	12825	12830	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
318	NC_009939	GC	3	6	12905	12910	0 %	0 %	50 %	50 %	158421434
319	NC_009939	GGC	2	6	12923	12928	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	158421434
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343	NC_009939	GAG	2	6	14044	14049	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
344	NC_009939	GCT	2	6	14065	14070	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
345	NC_009939	GCT	2	6	14080	14085	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
346	NC_009939	CT	3	6	14147	14152	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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351	NC_009939	TG	3	6	14530	14535	0 %	50 %	50 %	0 %	158421435
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391	NC_009939	GC	3	6	16042	16047	0 %	0 %	50 %	50 %	158421436
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