MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Dehalococcoides sp. BAV1 chromosome

Total Repeats: 24556

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_009455	GAT	2	6	219368	219373	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4002	NC_009455	AGC	2	6	219581	219586	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	147668862
4003	NC_009455	TCA	2	6	219644	219649	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	147668862
4004	NC_009455	TCA	2	6	219659	219664	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	147668862
4005	NC_009455	TTTC	2	8	219781	219788	0 %	75 %	0 %	25 %	147668862
4006	NC_009455	TCA	2	6	219966	219971	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	147668862
4007	NC_009455	TAG	2	6	219995	220000	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	147668862
4008	NC_009455	CTT	2	6	220026	220031	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	147668862
4009	NC_009455	CGC	2	6	220110	220115	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	147668862
4010	NC_009455	T	7	7	220297	220303	0 %	100 %	0 %	0 %	147668862
4011	NC_009455	CAC	2	6	220339	220344	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	147668862
4012	NC_009455	GTC	2	6	220370	220375	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4013	NC_009455	TAT	2	6	220474	220479	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4014	NC_009455	TGC	2	6	220508	220513	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4015	NC_009455	ATG	2	6	220612	220617	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4016	NC_009455	TCT	2	6	220646	220651	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4017	NC_009455	GTA	2	6	220761	220766	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4018	NC_009455	TAT	2	6	220860	220865	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4019	NC_009455	AGG	2	6	220874	220879	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4020	NC_009455	GAG	2	6	220881	220886	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4021	NC_009455	ATG	2	6	220889	220894	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	147668863
4022	NC_009455	AGC	2	6	220959	220964	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	147668863
4023	NC_009455	GAA	2	6	221038	221043	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	147668863
4024	NC_009455	GCTC	2	8	221044	221051	0 %	25 %	25 %	50 %	147668863
4025	NC_009455	ATG	2	6	221130	221135	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	147668863
4026	NC_009455	TGA	2	6	221160	221165	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	147668863
4027	NC_009455	TAC	2	6	221209	221214	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	147668863
4028	NC_009455	AAG	2	6	221261	221266	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	147668863
4029	NC_009455	GGA	2	6	221276	221281	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	147668863
4030	NC_009455	TAAA	2	8	221332	221339	75 %	25 %	0 %	0 %	147668864
4031	NC_009455	GAT	2	6	221367	221372	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	147668864
4032	NC_009455	ACG	2	6	221512	221517	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	147668864
4033	NC_009455	TGA	2	6	221522	221527	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	147668864
4034	NC_009455	A	6	6	221547	221552	100 %	0 %	0 %	0 %	147668864
4035	NC_009455	AG	3	6	221598	221603	50 %	0 %	50 %	0 %	147668864
4036	NC_009455	GGC	2	6	221672	221677	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	147668864
4037	NC_009455	TAA	2	6	221678	221683	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	147668864
4038	NC_009455	AGG	2	6	221710	221715	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	147668864
4039	NC_009455	CTC	2	6	221796	221801	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	147668864
4040	NC_009455	TGC	2	6	221815	221820	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147668864
4041	NC_009455	TA	3	6	221836	221841	50 %	50 %	0 %	0 %	147668864
4042	NC_009455	ACT	2	6	221887	221892	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	147668864
4043	NC_009455	AAC	2	6	221907	221912	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	147668864
4044	NC_009455	GAT	2	6	221913	221918	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	147668864
4045	NC_009455	ATT	2	6	221948	221953	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	147668864
4046	NC_009455	AAGG	2	8	221957	221964	50 %	0 %	50 %	0 %	147668864
4047	NC_009455	GTT	2	6	221973	221978	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	147668864
4048	NC_009455	A	6	6	222012	222017	100 %	0 %	0 %	0 %	147668864
4049	NC_009455	AGG	2	6	222055	222060	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	147668864
4050	NC_009455	ATG	2	6	222061	222066	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	147668864
4051	NC_009455	TTA	2	6	222094	222099	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	147668864
4052	NC_009455	AG	3	6	222229	222234	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4053	NC_009455	TCT	2	6	222285	222290	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	147668865
4054	NC_009455	AAC	2	6	222354	222359	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	147668865
4055	NC_009455	AGT	2	6	222368	222373	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	147668865
4056	NC_009455	TGA	2	6	222386	222391	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	147668865
4057	NC_009455	TGC	2	6	222541	222546	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147668865
4058	NC_009455	GAG	2	6	222663	222668	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	147668865
4059	NC_009455	TTTA	2	8	222706	222713	25 %	75 %	0 %	0 %	147668865
4060	NC_009455	ACC	2	6	222722	222727	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	147668865
4061	NC_009455	GA	3	6	222760	222765	50 %	0 %	50 %	0 %	147668865
4062	NC_009455	AC	3	6	222770	222775	50 %	0 %	0 %	50 %	147668865
4063	NC_009455	AACCA	2	10	222790	222799	60 %	0 %	0 %	40 %	147668865
4064	NC_009455	GAAAG	2	10	222836	222845	60 %	0 %	40 %	0 %	147668865
4065	NC_009455	TCGCC	2	10	222886	222895	0 %	20 %	20 %	60 %	147668865
4066	NC_009455	CTG	2	6	222919	222924	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147668865
4067	NC_009455	CAT	2	6	222932	222937	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	147668865
4068	NC_009455	TTG	2	6	223122	223127	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	147668865
4069	NC_009455	CAA	2	6	223220	223225	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	147668865
4070	NC_009455	A	6	6	223224	223229	100 %	0 %	0 %	0 %	147668865
4071	NC_009455	ATT	2	6	223252	223257	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	147668865
4072	NC_009455	GAA	2	6	223275	223280	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	147668865
4073	NC_009455	AGT	2	6	223283	223288	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	147668865
4074	NC_009455	AAG	2	6	223384	223389	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	147668865
4075	NC_009455	AACC	2	8	223421	223428	50 %	0 %	0 %	50 %	147668865
4076	NC_009455	GAAA	2	8	223533	223540	75 %	0 %	25 %	0 %	147668865
4077	NC_009455	CTAG	2	8	223581	223588	25 %	25 %	25 %	25 %	147668865
4078	NC_009455	AG	3	6	223637	223642	50 %	0 %	50 %	0 %	147668865
4079	NC_009455	TTA	2	6	223678	223683	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	147668865
4080	NC_009455	ATT	2	6	223720	223725	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	147668865
4081	NC_009455	GAA	2	6	223749	223754	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	147668865
4082	NC_009455	TGG	2	6	223784	223789	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	147668865
4083	NC_009455	AGT	2	6	223792	223797	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	147668865
4084	NC_009455	ATA	2	6	223948	223953	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	147668866
4085	NC_009455	CAG	2	6	223965	223970	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	147668866
4086	NC_009455	GGC	2	6	224083	224088	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	147668866
4087	NC_009455	CGG	2	6	224134	224139	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	147668866
4088	NC_009455	CAGC	2	8	224256	224263	25 %	0 %	25 %	50 %	147668866
4089	NC_009455	CGG	2	6	224324	224329	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	147668866
4090	NC_009455	TTC	2	6	224396	224401	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	147668866
4091	NC_009455	T	6	6	224430	224435	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4092	NC_009455	CGG	2	6	224458	224463	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4093	NC_009455	TGG	2	6	224581	224586	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	147668867
4094	NC_009455	CGG	2	6	224679	224684	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	147668867
4095	NC_009455	ACTG	2	8	224961	224968	25 %	25 %	25 %	25 %	147668867
4096	NC_009455	ATCC	2	8	224970	224977	25 %	25 %	0 %	50 %	147668867
4097	NC_009455	CA	3	6	225012	225017	50 %	0 %	0 %	50 %	147668867
4098	NC_009455	CGG	2	6	225086	225091	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	147668867
4099	NC_009455	GCACC	2	10	225107	225116	20 %	0 %	20 %	60 %	147668867
4100	NC_009455	CAGA	2	8	225141	225148	50 %	0 %	25 %	25 %	147668867
4101	NC_009455	AGAT	2	8	225208	225215	50 %	25 %	25 %	0 %	147668867
4102	NC_009455	GGTT	2	8	225226	225233	0 %	50 %	50 %	0 %	147668867
4103	NC_009455	CTG	2	6	225263	225268	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147668867
4104	NC_009455	TAT	2	6	225315	225320	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	147668867
4105	NC_009455	TCA	2	6	225322	225327	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	147668867
4106	NC_009455	CGGG	2	8	225330	225337	0 %	0 %	75 %	25 %	147668867
4107	NC_009455	T	7	7	225491	225497	0 %	100 %	0 %	0 %	147668867
4108	NC_009455	TAT	2	6	225577	225582	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4109	NC_009455	ATCC	2	8	225584	225591	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
4110	NC_009455	T	6	6	225610	225615	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4111	NC_009455	CTT	2	6	225672	225677	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	147668868
4112	NC_009455	TGC	2	6	225692	225697	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147668868
4113	NC_009455	CTTTTA	2	12	225771	225782	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	147668868
4114	NC_009455	TGG	2	6	225865	225870	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	147668868
4115	NC_009455	TAG	2	6	225955	225960	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	147668868
4116	NC_009455	TA	3	6	225972	225977	50 %	50 %	0 %	0 %	147668868
4117	NC_009455	GGC	2	6	226022	226027	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	147668868
4118	NC_009455	CCA	2	6	226057	226062	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	147668868
4119	NC_009455	GGTG	2	8	226067	226074	0 %	25 %	75 %	0 %	147668868
4120	NC_009455	GGC	2	6	226106	226111	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	147668868
4121	NC_009455	CAC	2	6	226121	226126	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	147668868
4122	NC_009455	ATT	2	6	226137	226142	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	147668868
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4124	NC_009455	CTTT	2	8	226207	226214	0 %	75 %	0 %	25 %	147668868
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4369	NC_009455	A	6	6	238342	238347	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4370	NC_009455	CTGG	2	8	238364	238371	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
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4374	NC_009455	TAC	2	6	238608	238613	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	147668883
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4495	NC_009455	TGC	2	6	245155	245160	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147668892
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4497	NC_009455	CCTG	2	8	245464	245471	0 %	25 %	25 %	50 %	147668892
4498	NC_009455	TAT	2	6	245558	245563	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	147668892
4499	NC_009455	TGT	2	6	245580	245585	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	147668892
4500	NC_009455	G	6	6	245592	245597	0 %	0 %	100 %	0 %	147668892

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