MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Dehalococcoides sp. BAV1 chromosome

Total Repeats: 24556

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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3502	NC_009455	CTT	2	6	189076	189081	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	147668834
3503	NC_009455	AAAT	2	8	189139	189146	75 %	25 %	0 %	0 %	147668834
3504	NC_009455	TTC	2	6	189265	189270	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	147668834
3505	NC_009455	TCT	2	6	189300	189305	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	147668834
3506	NC_009455	AT	3	6	189326	189331	50 %	50 %	0 %	0 %	147668834
3507	NC_009455	TGA	2	6	189387	189392	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	147668834
3508	NC_009455	AAT	2	6	189588	189593	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	147668834
3509	NC_009455	AT	3	6	189679	189684	50 %	50 %	0 %	0 %	147668834
3510	NC_009455	AG	3	6	189769	189774	50 %	0 %	50 %	0 %	147668834
3511	NC_009455	TC	3	6	189788	189793	0 %	50 %	0 %	50 %	147668834
3512	NC_009455	ATT	2	6	189796	189801	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	147668834
3513	NC_009455	TTTG	2	8	189811	189818	0 %	75 %	25 %	0 %	147668834
3514	NC_009455	TTCT	2	8	189884	189891	0 %	75 %	0 %	25 %	147668834
3515	NC_009455	ATA	2	6	190002	190007	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	147668834
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3518	NC_009455	ATG	2	6	190130	190135	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	147668834
3519	NC_009455	GAAC	2	8	190157	190164	50 %	0 %	25 %	25 %	147668834
3520	NC_009455	TTC	2	6	190178	190183	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	147668834
3521	NC_009455	TCT	2	6	190232	190237	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	147668834
3522	NC_009455	TCC	2	6	190245	190250	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	147668834
3523	NC_009455	GCA	2	6	190259	190264	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	147668834
3524	NC_009455	GAT	2	6	190297	190302	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	147668834
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3528	NC_009455	GCTTT	2	10	190477	190486	0 %	60 %	20 %	20 %	147668834
3529	NC_009455	TA	3	6	190510	190515	50 %	50 %	0 %	0 %	147668834
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3535	NC_009455	TCA	2	6	190646	190651	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	147668834
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3537	NC_009455	ATTC	2	8	190701	190708	25 %	50 %	0 %	25 %	147668834
3538	NC_009455	TGA	2	6	190709	190714	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	147668834
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3541	NC_009455	CTTT	2	8	190761	190768	0 %	75 %	0 %	25 %	147668834
3542	NC_009455	AT	3	6	190799	190804	50 %	50 %	0 %	0 %	147668834
3543	NC_009455	AAG	2	6	190868	190873	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	147668834
3544	NC_009455	GTA	2	6	190982	190987	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	147668834
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3548	NC_009455	CGA	2	6	191115	191120	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	147668834
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3550	NC_009455	TTA	2	6	191177	191182	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	147668834
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3552	NC_009455	CAT	2	6	191230	191235	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3553	NC_009455	CCCCT	2	10	191243	191252	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
3554	NC_009455	TGCC	2	8	191280	191287	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
3555	NC_009455	CTT	2	6	191323	191328	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3556	NC_009455	GGC	2	6	191344	191349	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3557	NC_009455	TAG	2	6	191395	191400	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3558	NC_009455	TG	3	6	191494	191499	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3559	NC_009455	ATT	2	6	191509	191514	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3560	NC_009455	GTT	2	6	191519	191524	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3561	NC_009455	A	7	7	191555	191561	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3562	NC_009455	TTC	2	6	191598	191603	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	147668835
3563	NC_009455	GCTG	2	8	191619	191626	0 %	25 %	50 %	25 %	147668835
3564	NC_009455	TC	3	6	191634	191639	0 %	50 %	0 %	50 %	147668835
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3570	NC_009455	ATC	2	6	192063	192068	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	147668835
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3572	NC_009455	GTG	2	6	192155	192160	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	147668836
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3582	NC_009455	GTA	2	6	192919	192924	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	147668837
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3585	NC_009455	GATGG	2	10	193118	193127	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
3586	NC_009455	CTA	2	6	193287	193292	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3587	NC_009455	TTGA	2	8	193321	193328	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
3588	NC_009455	CTT	2	6	193483	193488	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3589	NC_009455	GAC	2	6	193490	193495	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3590	NC_009455	CTT	2	6	193529	193534	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3591	NC_009455	CTT	2	6	193564	193569	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3592	NC_009455	CAAT	2	8	193593	193600	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
3593	NC_009455	TCC	2	6	193655	193660	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3594	NC_009455	AATA	2	8	193678	193685	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3595	NC_009455	CT	3	6	193700	193705	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3596	NC_009455	CCG	2	6	193760	193765	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3597	NC_009455	TCTGCC	2	12	193804	193815	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
3598	NC_009455	A	7	7	193850	193856	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3599	NC_009455	A	6	6	193897	193902	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3600	NC_009455	A	6	6	193905	193910	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3601	NC_009455	GCTTC	2	10	194002	194011	0 %	40 %	20 %	40 %	147668838
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3604	NC_009455	CGG	2	6	194346	194351	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	147668838
3605	NC_009455	ATC	2	6	194371	194376	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	147668838
3606	NC_009455	TTGCCG	2	12	194396	194407	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147668838
3607	NC_009455	TGAG	2	8	194451	194458	25 %	25 %	50 %	0 %	147668838
3608	NC_009455	CACCCT	2	12	194635	194646	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	147668838
3609	NC_009455	TCA	2	6	194711	194716	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	147668838
3610	NC_009455	ACC	2	6	194996	195001	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	147668838
3611	NC_009455	TAG	2	6	195293	195298	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3612	NC_009455	TA	4	8	195346	195353	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3613	NC_009455	TAA	2	6	195385	195390	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	147668839
3614	NC_009455	GTC	2	6	195405	195410	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147668839
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3616	NC_009455	AAG	2	6	195502	195507	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	147668839
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3619	NC_009455	CAT	2	6	195772	195777	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	147668839
3620	NC_009455	ATAGG	2	10	195934	195943	40 %	20 %	40 %	0 %	147668839
3621	NC_009455	GTC	2	6	195949	195954	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147668839
3622	NC_009455	TGT	2	6	196033	196038	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3623	NC_009455	CAA	2	6	196079	196084	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3624	NC_009455	TA	3	6	196116	196121	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3626	NC_009455	TAT	2	6	196290	196295	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3999	NC_009455	CTTT	2	8	219235	219242	0 %	75 %	0 %	25 %	147668861
4000	NC_009455	A	6	6	219320	219325	100 %	0 %	0 %	0 %	147668861

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