MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Dehalococcoides sp. BAV1 chromosome

Total Repeats: 24556

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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3002	NC_009455	TGA	2	6	161902	161907	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	147668814
3003	NC_009455	CGG	2	6	161920	161925	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	147668814
3004	NC_009455	AAT	2	6	161966	161971	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	147668814
3005	NC_009455	TA	3	6	162079	162084	50 %	50 %	0 %	0 %	147668815
3006	NC_009455	CTG	2	6	162237	162242	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147668815
3007	NC_009455	TACGG	2	10	162245	162254	20 %	20 %	40 %	20 %	147668815
3008	NC_009455	AAG	2	6	162289	162294	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	147668815
3009	NC_009455	TAT	2	6	162369	162374	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	147668815
3010	NC_009455	CAA	2	6	162379	162384	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	147668815
3011	NC_009455	CAA	2	6	162398	162403	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	147668815
3012	NC_009455	AATA	2	8	162461	162468	75 %	25 %	0 %	0 %	147668815
3013	NC_009455	CAT	2	6	162513	162518	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	147668815
3014	NC_009455	GAT	2	6	162570	162575	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	147668815
3015	NC_009455	AAT	2	6	162600	162605	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	147668815
3016	NC_009455	A	6	6	162617	162622	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3017	NC_009455	GATA	2	8	162675	162682	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
3018	NC_009455	TGT	2	6	162750	162755	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3019	NC_009455	T	6	6	162854	162859	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3020	NC_009455	GTT	2	6	162899	162904	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3021	NC_009455	ACT	2	6	162930	162935	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3022	NC_009455	AGG	2	6	162979	162984	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3023	NC_009455	TGA	2	6	162988	162993	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	147668816
3024	NC_009455	TAG	2	6	163004	163009	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	147668816
3025	NC_009455	ACC	3	9	163134	163142	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	147668816
3026	NC_009455	CGGC	2	8	163192	163199	0 %	0 %	50 %	50 %	147668816
3027	NC_009455	AAT	2	6	163287	163292	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	147668816
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3030	NC_009455	TGC	2	6	163427	163432	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147668816
3031	NC_009455	GAA	2	6	163494	163499	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	147668816
3032	NC_009455	TCT	2	6	163505	163510	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	147668816
3033	NC_009455	GCCAG	2	10	163552	163561	20 %	0 %	40 %	40 %	147668816
3034	NC_009455	TTCG	2	8	163598	163605	0 %	50 %	25 %	25 %	147668816
3035	NC_009455	CCTG	2	8	163692	163699	0 %	25 %	25 %	50 %	147668816
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3039	NC_009455	CGG	2	6	163829	163834	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	147668816
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3042	NC_009455	GCCA	2	8	163986	163993	25 %	0 %	25 %	50 %	147668816
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3051	NC_009455	CGGCTT	3	18	164519	164536	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147668816
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3054	NC_009455	TGC	3	9	164651	164659	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147668816
3055	NC_009455	ACTGG	2	10	164687	164696	20 %	20 %	40 %	20 %	147668816
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3057	NC_009455	GAA	2	6	164741	164746	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	147668816
3058	NC_009455	CTG	2	6	164778	164783	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147668816
3059	NC_009455	AAG	2	6	164806	164811	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	147668816
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3092	NC_009455	AT	3	6	167459	167464	50 %	50 %	0 %	0 %	147668818
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3097	NC_009455	CCCTG	2	10	167567	167576	0 %	20 %	20 %	60 %	147668818
3098	NC_009455	AG	3	6	167588	167593	50 %	0 %	50 %	0 %	147668818
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3107	NC_009455	TCCA	2	8	168069	168076	25 %	25 %	0 %	50 %	147668818
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3109	NC_009455	CA	3	6	168142	168147	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3110	NC_009455	GCAG	2	8	168231	168238	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
3111	NC_009455	GCTTA	2	10	168246	168255	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
3112	NC_009455	AAAG	2	8	168270	168277	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
3113	NC_009455	C	6	6	168289	168294	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
3114	NC_009455	TGT	2	6	168295	168300	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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3118	NC_009455	CCG	2	6	168624	168629	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	147668819
3119	NC_009455	G	6	6	168690	168695	0 %	0 %	100 %	0 %	147668819
3120	NC_009455	A	7	7	168724	168730	100 %	0 %	0 %	0 %	147668819
3121	NC_009455	GCCG	2	8	168904	168911	0 %	0 %	50 %	50 %	147668819
3122	NC_009455	CCGC	2	8	168921	168928	0 %	0 %	25 %	75 %	147668819
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3496	NC_009455	TAAT	2	8	188774	188781	50 %	50 %	0 %	0 %	147668834
3497	NC_009455	GTG	2	6	188870	188875	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	147668834
3498	NC_009455	GCA	2	6	188935	188940	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	147668834
3499	NC_009455	AT	3	6	188990	188995	50 %	50 %	0 %	0 %	147668834
3500	NC_009455	CTC	2	6	189025	189030	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	147668834

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