MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Dehalococcoides sp. BAV1 chromosome

Total Repeats: 24556

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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21002	NC_009455	TGA	2	6	1146803	1146808	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	147669809
21003	NC_009455	AAT	2	6	1146822	1146827	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	147669809
21004	NC_009455	GTA	2	6	1146945	1146950	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	147669809
21005	NC_009455	CTG	2	6	1147054	1147059	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147669809
21006	NC_009455	GCA	2	6	1147144	1147149	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	147669809
21007	NC_009455	GCTG	2	8	1147153	1147160	0 %	25 %	50 %	25 %	147669809
21008	NC_009455	GTA	2	6	1147164	1147169	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	147669809
21009	NC_009455	AT	3	6	1147215	1147220	50 %	50 %	0 %	0 %	147669809
21010	NC_009455	A	6	6	1147297	1147302	100 %	0 %	0 %	0 %	147669810
21011	NC_009455	CGC	2	6	1147334	1147339	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	147669810
21012	NC_009455	AAC	2	6	1147382	1147387	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	147669810
21013	NC_009455	ACC	2	6	1147426	1147431	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	147669810
21014	NC_009455	G	6	6	1147529	1147534	0 %	0 %	100 %	0 %	147669810
21015	NC_009455	CCT	2	6	1147554	1147559	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	147669810
21016	NC_009455	AT	3	6	1147601	1147606	50 %	50 %	0 %	0 %	147669810
21017	NC_009455	ACT	2	6	1147675	1147680	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	147669810
21018	NC_009455	GGC	2	6	1147683	1147688	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	147669810
21019	NC_009455	AAC	2	6	1147705	1147710	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	147669810
21020	NC_009455	GTG	2	6	1147726	1147731	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	147669810
21021	NC_009455	TGG	2	6	1147865	1147870	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	147669810
21022	NC_009455	GA	3	6	1147871	1147876	50 %	0 %	50 %	0 %	147669810
21023	NC_009455	GCC	2	6	1147894	1147899	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	147669810
21024	NC_009455	TCCC	2	8	1147994	1148001	0 %	25 %	0 %	75 %	147669810
21025	NC_009455	AAT	2	6	1148109	1148114	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	147669810
21026	NC_009455	CAG	2	6	1148126	1148131	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	147669810
21027	NC_009455	TGG	2	6	1148225	1148230	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	147669810
21028	NC_009455	CAG	2	6	1148242	1148247	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	147669810
21029	NC_009455	ACT	2	6	1148273	1148278	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	147669810
21030	NC_009455	AGC	3	9	1148311	1148319	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	147669810
21031	NC_009455	CAG	2	6	1148322	1148327	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	147669810
21032	NC_009455	A	6	6	1148338	1148343	100 %	0 %	0 %	0 %	147669810
21033	NC_009455	GACA	2	8	1148449	1148456	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
21034	NC_009455	TAA	2	6	1148457	1148462	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
21035	NC_009455	AAGC	2	8	1148475	1148482	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
21036	NC_009455	ATTA	2	8	1148487	1148494	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
21037	NC_009455	TAAT	2	8	1148497	1148504	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
21038	NC_009455	AT	3	6	1148596	1148601	50 %	50 %	0 %	0 %	147669811
21039	NC_009455	CCA	2	6	1148617	1148622	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	147669811
21040	NC_009455	GGTCA	2	10	1148625	1148634	20 %	20 %	40 %	20 %	147669811
21041	NC_009455	CTT	2	6	1148675	1148680	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	147669811
21042	NC_009455	GCC	2	6	1148785	1148790	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	147669811
21043	NC_009455	TTTG	2	8	1148879	1148886	0 %	75 %	25 %	0 %	147669811
21044	NC_009455	CAC	2	6	1148889	1148894	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
21045	NC_009455	TAT	2	6	1148908	1148913	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
21046	NC_009455	TA	3	6	1148956	1148961	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
21047	NC_009455	TA	3	6	1148981	1148986	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
21048	NC_009455	TA	3	6	1149032	1149037	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
21049	NC_009455	TA	3	6	1149055	1149060	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
21050	NC_009455	A	7	7	1149082	1149088	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
21051	NC_009455	AT	3	6	1149095	1149100	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
21052	NC_009455	ATT	2	6	1149119	1149124	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
21053	NC_009455	ATT	2	6	1149200	1149205	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	147669812
21054	NC_009455	GCCT	2	8	1149353	1149360	0 %	25 %	25 %	50 %	147669812
21055	NC_009455	ATT	2	6	1149482	1149487	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	147669812
21056	NC_009455	CTG	2	6	1149509	1149514	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147669812
21057	NC_009455	CTG	2	6	1149545	1149550	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147669812
21058	NC_009455	T	6	6	1149569	1149574	0 %	100 %	0 %	0 %	147669812
21059	NC_009455	CTG	2	6	1149602	1149607	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147669812
21060	NC_009455	AT	4	8	1149608	1149615	50 %	50 %	0 %	0 %	147669812
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21062	NC_009455	GCA	2	6	1149734	1149739	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	147669812
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21064	NC_009455	T	6	6	1149796	1149801	0 %	100 %	0 %	0 %	147669812
21065	NC_009455	TCTGGC	2	12	1149856	1149867	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147669812
21066	NC_009455	T	6	6	1149874	1149879	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
21067	NC_009455	CCG	2	6	1150018	1150023	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	147669813
21068	NC_009455	T	6	6	1150061	1150066	0 %	100 %	0 %	0 %	147669813
21069	NC_009455	GAAAA	2	10	1150155	1150164	80 %	0 %	20 %	0 %	147669813
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21073	NC_009455	TGG	2	6	1150630	1150635	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	147669813
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21079	NC_009455	T	6	6	1151191	1151196	0 %	100 %	0 %	0 %	147669813
21080	NC_009455	CTG	2	6	1151274	1151279	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147669813
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21085	NC_009455	GCTG	2	8	1151564	1151571	0 %	25 %	50 %	25 %	147669813
21086	NC_009455	AT	3	6	1151611	1151616	50 %	50 %	0 %	0 %	147669813
21087	NC_009455	GCC	2	6	1151656	1151661	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	147669813
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21090	NC_009455	CGG	2	6	1151822	1151827	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	147669813
21091	NC_009455	GTT	2	6	1151864	1151869	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	147669813
21092	NC_009455	ACT	2	6	1151923	1151928	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	147669813
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21095	NC_009455	GT	3	6	1152253	1152258	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
21096	NC_009455	AAT	2	6	1152262	1152267	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	147669814
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21099	NC_009455	ATC	2	6	1152347	1152352	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	147669814
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21101	NC_009455	ATT	2	6	1152478	1152483	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	147669814
21102	NC_009455	TGG	2	6	1152489	1152494	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	147669814
21103	NC_009455	ATG	2	6	1152539	1152544	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	147669814
21104	NC_009455	ACCTT	2	10	1152632	1152641	20 %	40 %	0 %	40 %	147669814
21105	NC_009455	CCG	2	6	1152673	1152678	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	147669814
21106	NC_009455	AGT	3	9	1152712	1152720	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	147669814
21107	NC_009455	CTC	2	6	1152750	1152755	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	147669814
21108	NC_009455	TACGC	2	10	1152846	1152855	20 %	20 %	20 %	40 %	147669815
21109	NC_009455	GGC	2	6	1152932	1152937	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	147669815
21110	NC_009455	AGA	2	6	1152955	1152960	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	147669815
21111	NC_009455	CTA	2	6	1153072	1153077	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	147669815
21112	NC_009455	AAGGC	2	10	1153131	1153140	40 %	0 %	40 %	20 %	147669815
21113	NC_009455	TTC	2	6	1153156	1153161	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	147669815
21114	NC_009455	AAG	2	6	1153254	1153259	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	147669815
21115	NC_009455	G	6	6	1153320	1153325	0 %	0 %	100 %	0 %	147669815
21116	NC_009455	GAC	2	6	1153352	1153357	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	147669815
21117	NC_009455	CCATG	2	10	1153417	1153426	20 %	20 %	20 %	40 %	147669815
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21119	NC_009455	TA	3	6	1153488	1153493	50 %	50 %	0 %	0 %	147669815
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21476	NC_009455	CAG	2	6	1173487	1173492	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	147669838
21477	NC_009455	GGC	2	6	1173698	1173703	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	147669839
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21480	NC_009455	TA	3	6	1173849	1173854	50 %	50 %	0 %	0 %	147669839
21481	NC_009455	CAG	2	6	1173867	1173872	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	147669839
21482	NC_009455	GCT	2	6	1174014	1174019	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147669839
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21491	NC_009455	AT	3	6	1174608	1174613	50 %	50 %	0 %	0 %	147669839
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