MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Dehalococcoides sp. BAV1 chromosome

Total Repeats: 24556

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_009455	CAG	2	6	26398	26403	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	147668680
502	NC_009455	CCG	3	9	26420	26428	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	147668680
503	NC_009455	GGT	2	6	26521	26526	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	147668680
504	NC_009455	CTA	2	6	26595	26600	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	147668680
505	NC_009455	TA	4	8	26641	26648	50 %	50 %	0 %	0 %	147668680
506	NC_009455	GTA	2	6	26701	26706	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	147668680
507	NC_009455	CCA	2	6	26733	26738	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	147668680
508	NC_009455	GAA	2	6	26740	26745	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	147668680
509	NC_009455	AATAAG	2	12	26746	26757	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	147668680
510	NC_009455	GTT	2	6	26770	26775	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	147668680
511	NC_009455	CCG	2	6	26807	26812	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	147668680
512	NC_009455	GTA	2	6	26819	26824	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	147668680
513	NC_009455	CTG	2	6	26959	26964	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147668680
514	NC_009455	GCC	2	6	27049	27054	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	147668680
515	NC_009455	CTG	2	6	27110	27115	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147668680
516	NC_009455	AC	3	6	27117	27122	50 %	0 %	0 %	50 %	147668680
517	NC_009455	GGT	2	6	27130	27135	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	147668680
518	NC_009455	GGC	2	6	27220	27225	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	147668680
519	NC_009455	CAG	2	6	27304	27309	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	147668680
520	NC_009455	TGA	2	6	27327	27332	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	147668680
521	NC_009455	CCAC	2	8	27407	27414	25 %	0 %	0 %	75 %	147668680
522	NC_009455	TTAT	2	8	27449	27456	25 %	75 %	0 %	0 %	147668680
523	NC_009455	TTTA	2	8	27465	27472	25 %	75 %	0 %	0 %	147668681
524	NC_009455	AAT	2	6	27559	27564	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	147668681
525	NC_009455	ATT	2	6	27571	27576	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	147668681
526	NC_009455	ACA	2	6	27581	27586	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	147668681
527	NC_009455	TGG	2	6	27594	27599	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	147668681
528	NC_009455	CCG	2	6	27716	27721	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	147668681
529	NC_009455	TAA	2	6	27753	27758	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	147668681
530	NC_009455	AAG	2	6	27810	27815	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	147668681
531	NC_009455	TTG	2	6	27818	27823	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	147668681
532	NC_009455	TCGG	2	8	27952	27959	0 %	25 %	50 %	25 %	147668681
533	NC_009455	ACC	2	6	27977	27982	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	147668681
534	NC_009455	GCC	2	6	28001	28006	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	147668681
535	NC_009455	T	6	6	28014	28019	0 %	100 %	0 %	0 %	147668681
536	NC_009455	ACA	2	6	28043	28048	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	147668681
537	NC_009455	CCA	2	6	28179	28184	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	147668681
538	NC_009455	CTT	2	6	28239	28244	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	147668681
539	NC_009455	CCA	2	6	28260	28265	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	147668681
540	NC_009455	ACTC	2	8	28287	28294	25 %	25 %	0 %	50 %	147668681
541	NC_009455	CAGA	2	8	28482	28489	50 %	0 %	25 %	25 %	147668681
542	NC_009455	AGT	2	6	28549	28554	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	147668681
543	NC_009455	GGC	2	6	28555	28560	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	147668681
544	NC_009455	TCA	2	6	28601	28606	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	147668681
545	NC_009455	GGC	2	6	28672	28677	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	147668681
546	NC_009455	CAA	2	6	28743	28748	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	147668681
547	NC_009455	TCT	2	6	28763	28768	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	147668681
548	NC_009455	GCC	3	9	28804	28812	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	147668681
549	NC_009455	TC	3	6	28912	28917	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
550	NC_009455	ATG	2	6	28933	28938	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
551	NC_009455	TGA	2	6	28949	28954	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
552	NC_009455	GA	3	6	28953	28958	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
553	NC_009455	TCT	2	6	28973	28978	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
554	NC_009455	AT	3	6	28997	29002	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
555	NC_009455	GT	3	6	29037	29042	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
556	NC_009455	GCT	2	6	29076	29081	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
557	NC_009455	AAT	2	6	29086	29091	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
558	NC_009455	ATG	2	6	29106	29111	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
559	NC_009455	GTT	2	6	29112	29117	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
560	NC_009455	TATC	2	8	29151	29158	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
561	NC_009455	AAAT	2	8	29163	29170	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
562	NC_009455	AT	3	6	29169	29174	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
563	NC_009455	AT	4	8	29252	29259	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
564	NC_009455	GAAA	2	8	29266	29273	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
565	NC_009455	AAAT	2	8	29274	29281	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
566	NC_009455	AGG	2	6	29298	29303	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
567	NC_009455	TAT	2	6	29322	29327	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	147668682
568	NC_009455	GGA	2	6	29334	29339	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	147668682
569	NC_009455	GAA	2	6	29370	29375	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	147668682
570	NC_009455	AGTT	2	8	29405	29412	25 %	50 %	25 %	0 %	147668682
571	NC_009455	GAT	2	6	29431	29436	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	147668682
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575	NC_009455	ATTC	2	8	29584	29591	25 %	50 %	0 %	25 %	147668682
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581	NC_009455	CAT	2	6	29835	29840	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	147668682
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598	NC_009455	CTG	2	6	30711	30716	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147668683
599	NC_009455	TTC	2	6	30778	30783	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	147668683
600	NC_009455	TAT	2	6	30787	30792	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	147668683
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602	NC_009455	TGG	2	6	30900	30905	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	147668683
603	NC_009455	GTTT	2	8	30909	30916	0 %	75 %	25 %	0 %	147668683
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605	NC_009455	CGG	2	6	31127	31132	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	147668684
606	NC_009455	AAAT	2	8	31164	31171	75 %	25 %	0 %	0 %	147668684
607	NC_009455	T	7	7	31188	31194	0 %	100 %	0 %	0 %	147668684
608	NC_009455	CAG	2	6	31312	31317	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	147668684
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611	NC_009455	TA	3	6	31420	31425	50 %	50 %	0 %	0 %	147668684
612	NC_009455	CAAT	2	8	31497	31504	50 %	25 %	0 %	25 %	147668684
613	NC_009455	TTA	2	6	31523	31528	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	147668684
614	NC_009455	TCA	2	6	31542	31547	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	147668684
615	NC_009455	ACCGC	2	10	31563	31572	20 %	0 %	20 %	60 %	147668685
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618	NC_009455	AT	3	6	31865	31870	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
619	NC_009455	CAG	2	6	32002	32007	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
620	NC_009455	GTAT	2	8	32023	32030	25 %	50 %	25 %	0 %	147668686
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626	NC_009455	TCT	2	6	32440	32445	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	147668686
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