MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Dehalococcoides sp. BAV1 chromosome

Total Repeats: 24556

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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5502	NC_009455	ATC	2	6	299680	299685	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	147668936
5503	NC_009455	AGA	2	6	299739	299744	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	147668936
5504	NC_009455	ATT	2	6	299943	299948	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	147668936
5505	NC_009455	TAC	2	6	299964	299969	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	147668936
5506	NC_009455	ACTG	2	8	299995	300002	25 %	25 %	25 %	25 %	147668936
5507	NC_009455	GAG	2	6	300003	300008	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	147668936
5508	NC_009455	CT	3	6	300036	300041	0 %	50 %	0 %	50 %	147668936
5509	NC_009455	TCC	2	6	300051	300056	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	147668936
5510	NC_009455	AAT	2	6	300069	300074	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	147668936
5511	NC_009455	ACT	2	6	300085	300090	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	147668936
5512	NC_009455	TTTA	2	8	300128	300135	25 %	75 %	0 %	0 %	147668937
5513	NC_009455	ATT	2	6	300194	300199	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	147668937
5514	NC_009455	GAGAA	2	10	300383	300392	60 %	0 %	40 %	0 %	147668937
5515	NC_009455	T	6	6	300430	300435	0 %	100 %	0 %	0 %	147668937
5516	NC_009455	TTC	2	6	300464	300469	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	147668937
5517	NC_009455	ATA	2	6	300546	300551	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	147668937
5518	NC_009455	AAC	2	6	300653	300658	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	147668937
5519	NC_009455	GTA	2	6	300723	300728	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	147668937
5520	NC_009455	AACAA	2	10	300854	300863	80 %	0 %	0 %	20 %	147668937
5521	NC_009455	CTTT	2	8	300927	300934	0 %	75 %	0 %	25 %	147668937
5522	NC_009455	CGG	2	6	300961	300966	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	147668937
5523	NC_009455	GA	3	6	301009	301014	50 %	0 %	50 %	0 %	147668937
5524	NC_009455	TAA	2	6	301073	301078	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	147668937
5525	NC_009455	ATT	2	6	301088	301093	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	147668937
5526	NC_009455	A	6	6	301126	301131	100 %	0 %	0 %	0 %	147668937
5527	NC_009455	CTT	2	6	301177	301182	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	147668937
5528	NC_009455	AT	3	6	301241	301246	50 %	50 %	0 %	0 %	147668937
5529	NC_009455	TGA	2	6	301258	301263	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	147668937
5530	NC_009455	TGT	2	6	301312	301317	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	147668937
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5534	NC_009455	T	7	7	301584	301590	0 %	100 %	0 %	0 %	147668937
5535	NC_009455	TAT	2	6	301639	301644	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	147668937
5536	NC_009455	GTT	2	6	301699	301704	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	147668937
5537	NC_009455	GCGG	2	8	301723	301730	0 %	0 %	75 %	25 %	147668937
5538	NC_009455	T	6	6	301771	301776	0 %	100 %	0 %	0 %	147668937
5539	NC_009455	ATT	2	6	301824	301829	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	147668937
5540	NC_009455	AAG	2	6	301844	301849	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	147668937
5541	NC_009455	ATC	2	6	301946	301951	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5542	NC_009455	AATA	3	12	301958	301969	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5543	NC_009455	AT	3	6	301977	301982	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5544	NC_009455	TA	3	6	301983	301988	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5545	NC_009455	T	6	6	301989	301994	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5546	NC_009455	AT	3	6	302060	302065	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5547	NC_009455	TAG	2	6	302069	302074	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5548	NC_009455	ATT	2	6	302082	302087	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5549	NC_009455	TTTG	2	8	302173	302180	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
5550	NC_009455	TA	3	6	302278	302283	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5551	NC_009455	ATC	2	6	302340	302345	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5552	NC_009455	TGC	2	6	302442	302447	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5553	NC_009455	TGT	2	6	302494	302499	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5554	NC_009455	T	6	6	302540	302545	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5555	NC_009455	ATA	2	6	302552	302557	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5556	NC_009455	GATTA	2	10	302576	302585	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
5557	NC_009455	TAGA	2	8	302632	302639	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
5558	NC_009455	ATG	2	6	302644	302649	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5559	NC_009455	GATG	2	8	302670	302677	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
5560	NC_009455	TGGT	2	8	302710	302717	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5561	NC_009455	GAA	2	6	302727	302732	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5562	NC_009455	GAAT	2	8	302740	302747	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
5563	NC_009455	A	7	7	302801	302807	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5564	NC_009455	ATT	2	6	302884	302889	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5565	NC_009455	TTA	2	6	302931	302936	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	147668938
5566	NC_009455	AG	4	8	302937	302944	50 %	0 %	50 %	0 %	147668938
5567	NC_009455	TGA	2	6	302972	302977	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	147668938
5568	NC_009455	CGT	2	6	302986	302991	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147668938
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5572	NC_009455	ACTG	2	8	303265	303272	25 %	25 %	25 %	25 %	147668938
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5581	NC_009455	GTA	2	6	303734	303739	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5582	NC_009455	GAA	2	6	303792	303797	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5583	NC_009455	CGC	3	9	303819	303827	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5584	NC_009455	A	6	6	303857	303862	100 %	0 %	0 %	0 %	147668939
5585	NC_009455	CTG	2	6	303889	303894	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147668939
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5588	NC_009455	GGCT	2	8	304023	304030	0 %	25 %	50 %	25 %	147668939
5589	NC_009455	TCC	2	6	304046	304051	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	147668939
5590	NC_009455	ACC	2	6	304191	304196	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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5597	NC_009455	GA	3	6	304458	304463	50 %	0 %	50 %	0 %	147668940
5598	NC_009455	AATG	2	8	304523	304530	50 %	25 %	25 %	0 %	147668940
5599	NC_009455	ATGA	2	8	304575	304582	50 %	25 %	25 %	0 %	147668940
5600	NC_009455	AGAAC	2	10	304600	304609	60 %	0 %	20 %	20 %	147668940
5601	NC_009455	TA	3	6	304675	304680	50 %	50 %	0 %	0 %	147668940
5602	NC_009455	TTA	2	6	304698	304703	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	147668940
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5605	NC_009455	TGAAT	2	10	304954	304963	40 %	40 %	20 %	0 %	147668940
5606	NC_009455	CAA	2	6	304974	304979	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	147668941
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5609	NC_009455	GAT	2	6	305129	305134	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	147668941
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5615	NC_009455	TTAA	2	8	305526	305533	50 %	50 %	0 %	0 %	147668941
5616	NC_009455	TTG	2	6	305536	305541	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	147668941
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5618	NC_009455	A	7	7	305600	305606	100 %	0 %	0 %	0 %	147668941
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5621	NC_009455	TTTA	2	8	305748	305755	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5622	NC_009455	AT	3	6	305764	305769	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5623	NC_009455	TTA	2	6	305807	305812	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5624	NC_009455	AAT	2	6	305883	305888	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5625	NC_009455	AGG	2	6	305895	305900	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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