MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Dichelobacter nodosus VCS1703A chromosome

Total Repeats: 34048

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
34001	NC_009446	CGG	2	6	1386946	1386951	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146328746
34002	NC_009446	GTT	2	6	1387005	1387010	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	146328746
34003	NC_009446	CAT	2	6	1387085	1387090	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146328746
34004	NC_009446	AAG	2	6	1387138	1387143	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146328746
34005	NC_009446	ATG	2	6	1387201	1387206	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146328746
34006	NC_009446	TTTTA	2	10	1387215	1387224	20 %	80 %	0 %	0 %	146328746
34007	NC_009446	CAT	2	6	1387316	1387321	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146328746
34008	NC_009446	ATT	2	6	1387332	1387337	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	146328746
34009	NC_009446	A	7	7	1387377	1387383	100 %	0 %	0 %	0 %	146328746
34010	NC_009446	CGT	2	6	1387436	1387441	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146328746
34011	NC_009446	TGA	2	6	1387546	1387551	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146328746
34012	NC_009446	TTA	2	6	1387575	1387580	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	146328746
34013	NC_009446	CAC	2	6	1387636	1387641	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	146328746
34014	NC_009446	GAT	2	6	1387688	1387693	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146328746
34015	NC_009446	GTT	3	9	1387737	1387745	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	146328746
34016	NC_009446	ATT	2	6	1387775	1387780	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	146328746
34017	NC_009446	TTA	2	6	1387825	1387830	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	146328746
34018	NC_009446	T	7	7	1387930	1387936	0 %	100 %	0 %	0 %	146329489
34019	NC_009446	CAT	2	6	1387949	1387954	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146329489
34020	NC_009446	AAAG	2	8	1388040	1388047	75 %	0 %	25 %	0 %	146329489
34021	NC_009446	T	6	6	1388058	1388063	0 %	100 %	0 %	0 %	146329489
34022	NC_009446	T	6	6	1388092	1388097	0 %	100 %	0 %	0 %	146329489
34023	NC_009446	ATC	2	6	1388124	1388129	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146329489
34024	NC_009446	GTTG	2	8	1388135	1388142	0 %	50 %	50 %	0 %	146329489
34025	NC_009446	ATTT	2	8	1388187	1388194	25 %	75 %	0 %	0 %	146329489
34026	NC_009446	GCG	3	9	1388364	1388372	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146329489
34027	NC_009446	CAA	2	6	1388380	1388385	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	146329489
34028	NC_009446	CGT	2	6	1388420	1388425	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146329489
34029	NC_009446	GCA	2	6	1388430	1388435	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146329489
34030	NC_009446	TGA	2	6	1388476	1388481	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146329489
34031	NC_009446	TCG	3	9	1388506	1388514	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146329489
34032	NC_009446	T	6	6	1388525	1388530	0 %	100 %	0 %	0 %	146329489
34033	NC_009446	AAG	2	6	1388554	1388559	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146329489
34034	NC_009446	GCA	2	6	1388597	1388602	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146329489
34035	NC_009446	A	6	6	1388620	1388625	100 %	0 %	0 %	0 %	146329489
34036	NC_009446	CGC	2	6	1388629	1388634	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146329489
34037	NC_009446	T	6	6	1388635	1388640	0 %	100 %	0 %	0 %	146329489
34038	NC_009446	TTTTCG	2	12	1388674	1388685	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	146329489
34039	NC_009446	CAT	2	6	1388738	1388743	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146329489
34040	NC_009446	GATTG	2	10	1388930	1388939	20 %	40 %	40 %	0 %	146329489
34041	NC_009446	GCG	2	6	1388955	1388960	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146329489
34042	NC_009446	GAT	2	6	1388969	1388974	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146329489
34043	NC_009446	CGC	2	6	1389058	1389063	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146329489
34044	NC_009446	CG	3	6	1389135	1389140	0 %	0 %	50 %	50 %	146329489
34045	NC_009446	TTG	2	6	1389163	1389168	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	146329489
34046	NC_009446	ATT	3	9	1389197	1389205	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	146329489
34047	NC_009446	T	6	6	1389267	1389272	0 %	100 %	0 %	0 %	146329489
34048	NC_009446	T	6	6	1389332	1389337	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding

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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.