MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Dichelobacter nodosus VCS1703A chromosome

Total Repeats: 34048

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009446	A	6	6	14	19	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_009446	TTTC	2	8	57	64	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
3	NC_009446	GATCA	2	10	117	126	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
4	NC_009446	CA	3	6	140	145	50 %	0 %	0 %	50 %	146328959
5	NC_009446	GCAA	2	8	183	190	50 %	0 %	25 %	25 %	146328959
6	NC_009446	TTTGC	2	10	322	331	0 %	60 %	20 %	20 %	146328959
7	NC_009446	CAA	2	6	376	381	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	146328959
8	NC_009446	ATTT	2	8	383	390	25 %	75 %	0 %	0 %	146328959
9	NC_009446	TTG	2	6	470	475	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	146328959
10	NC_009446	GCG	2	6	499	504	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146328959
11	NC_009446	GTT	2	6	525	530	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	146328959
12	NC_009446	GGC	2	6	562	567	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146328959
13	NC_009446	ATGC	2	8	592	599	25 %	25 %	25 %	25 %	146328959
14	NC_009446	GAAA	2	8	626	633	75 %	0 %	25 %	0 %	146328959
15	NC_009446	GAA	2	6	655	660	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146328959
16	NC_009446	TTA	2	6	716	721	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	146328959
17	NC_009446	TTA	2	6	745	750	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	146328959
18	NC_009446	TGA	2	6	753	758	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146328959
19	NC_009446	AAG	2	6	791	796	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146328959
20	NC_009446	T	6	6	799	804	0 %	100 %	0 %	0 %	146328959
21	NC_009446	A	6	6	829	834	100 %	0 %	0 %	0 %	146328959
22	NC_009446	ATT	2	6	841	846	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	146328959
23	NC_009446	CGAT	2	8	888	895	25 %	25 %	25 %	25 %	146328959
24	NC_009446	GCC	2	6	936	941	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146328959
25	NC_009446	GAA	2	6	1015	1020	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146328959
26	NC_009446	AAT	2	6	1107	1112	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	146328959
27	NC_009446	A	8	8	1239	1246	100 %	0 %	0 %	0 %	146328959
28	NC_009446	ATTAC	2	10	1258	1267	40 %	40 %	0 %	20 %	146328959
29	NC_009446	TGA	2	6	1383	1388	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146328959
30	NC_009446	CTACGA	2	12	1636	1647	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_009446	TTG	2	6	1726	1731	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	146329375
32	NC_009446	ACTA	2	8	1745	1752	50 %	25 %	0 %	25 %	146329375
33	NC_009446	CAA	2	6	1785	1790	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	146329375
34	NC_009446	ATCA	2	8	1845	1852	50 %	25 %	0 %	25 %	146329375
35	NC_009446	TGA	2	6	1913	1918	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146329375
36	NC_009446	ATTA	2	8	1925	1932	50 %	50 %	0 %	0 %	146329375
37	NC_009446	CAA	2	6	1950	1955	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	146329375
38	NC_009446	TCA	2	6	2042	2047	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146329375
39	NC_009446	CTT	2	6	2062	2067	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146329375
40	NC_009446	TAAA	2	8	2083	2090	75 %	25 %	0 %	0 %	146329375
41	NC_009446	ATC	2	6	2151	2156	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146329375
42	NC_009446	GAA	2	6	2226	2231	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146329375
43	NC_009446	TGA	2	6	2354	2359	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146329375
44	NC_009446	AAC	2	6	2360	2365	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	146329375
45	NC_009446	AAC	2	6	2407	2412	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	146329375
46	NC_009446	CGCC	2	8	2438	2445	0 %	0 %	25 %	75 %	146329375
47	NC_009446	CAA	2	6	2559	2564	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	146329375
48	NC_009446	TTA	2	6	2595	2600	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	146329375
49	NC_009446	ACG	2	6	2641	2646	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146329375
50	NC_009446	CGTT	2	8	2648	2655	0 %	50 %	25 %	25 %	146329375
51	NC_009446	CG	3	6	2687	2692	0 %	0 %	50 %	50 %	146329375
52	NC_009446	CGG	2	6	2713	2718	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146329375
53	NC_009446	ATC	2	6	2730	2735	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146329375
54	NC_009446	TGA	2	6	2857	2862	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146329375
55	NC_009446	TCA	2	6	2890	2895	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146329375
56	NC_009446	TA	3	6	2906	2911	50 %	50 %	0 %	0 %	146329375
57	NC_009446	TGC	2	6	2955	2960	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_009446	T	6	6	2984	2989	0 %	100 %	0 %	0 %	146329635
59	NC_009446	TCA	2	6	3012	3017	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146329635
60	NC_009446	T	8	8	3069	3076	0 %	100 %	0 %	0 %	146329635
61	NC_009446	A	6	6	3096	3101	100 %	0 %	0 %	0 %	146329635
62	NC_009446	ATT	2	6	3133	3138	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	146329635
63	NC_009446	ATG	2	6	3287	3292	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146329635
64	NC_009446	T	6	6	3326	3331	0 %	100 %	0 %	0 %	146329635
65	NC_009446	GCT	2	6	3364	3369	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146329635
66	NC_009446	GCACAA	2	12	3464	3475	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	146329635
67	NC_009446	TGA	2	6	3498	3503	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146329635
68	NC_009446	GCGG	2	8	3506	3513	0 %	0 %	75 %	25 %	146329635
69	NC_009446	AAT	2	6	3562	3567	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	146329635
70	NC_009446	CCG	2	6	3575	3580	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146329635
71	NC_009446	GCA	2	6	3592	3597	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146329635
72	NC_009446	TTGGTT	2	12	3664	3675	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	146329635
73	NC_009446	GGC	2	6	3680	3685	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146329635
74	NC_009446	TTA	2	6	3689	3694	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	146329635
75	NC_009446	CG	4	8	3712	3719	0 %	0 %	50 %	50 %	146329635
76	NC_009446	CGC	2	6	3736	3741	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146329635
77	NC_009446	TGA	2	6	3744	3749	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146329635
78	NC_009446	CG	3	6	3813	3818	0 %	0 %	50 %	50 %	146329635
79	NC_009446	T	6	6	3970	3975	0 %	100 %	0 %	0 %	146329635
80	NC_009446	GGC	2	6	3992	3997	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146329635
81	NC_009446	TGT	2	6	4003	4008	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	146329635
82	NC_009446	CAA	2	6	4028	4033	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	146329635
83	NC_009446	ATA	2	6	4074	4079	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	146329635
84	NC_009446	GC	3	6	4116	4121	0 %	0 %	50 %	50 %	146329635
85	NC_009446	TGG	2	6	4122	4127	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	146329635
86	NC_009446	T	6	6	4159	4164	0 %	100 %	0 %	0 %	146329635
87	NC_009446	TAT	2	6	4211	4216	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	146329635
88	NC_009446	CG	3	6	4235	4240	0 %	0 %	50 %	50 %	146329635
89	NC_009446	AAC	3	9	4311	4319	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	146329635
90	NC_009446	TTG	2	6	4329	4334	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	146329635
91	NC_009446	TTG	2	6	4368	4373	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	146329635
92	NC_009446	CGT	2	6	4374	4379	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146329635
93	NC_009446	T	6	6	4442	4447	0 %	100 %	0 %	0 %	146329635
94	NC_009446	GC	3	6	4456	4461	0 %	0 %	50 %	50 %	146329635
95	NC_009446	ATT	2	6	4494	4499	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	146329635
96	NC_009446	CAA	2	6	4502	4507	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	146329635
97	NC_009446	CAT	2	6	4523	4528	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146329635
98	NC_009446	AATG	2	8	4541	4548	50 %	25 %	25 %	0 %	146329635
99	NC_009446	AGT	2	6	4577	4582	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146329635
100	NC_009446	T	6	6	4681	4686	0 %	100 %	0 %	0 %	146329635
101	NC_009446	GCC	2	6	4707	4712	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146329635
102	NC_009446	CGC	2	6	4730	4735	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146329635
103	NC_009446	GTT	2	6	4739	4744	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	146329635
104	NC_009446	GTTT	2	8	4805	4812	0 %	75 %	25 %	0 %	146329635
105	NC_009446	ATT	2	6	4850	4855	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	146329274
106	NC_009446	TGG	2	6	4868	4873	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	146329274
107	NC_009446	CGA	2	6	4918	4923	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146329274
108	NC_009446	T	6	6	4924	4929	0 %	100 %	0 %	0 %	146329274
109	NC_009446	CGG	2	6	4969	4974	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146329274
110	NC_009446	ATT	2	6	4977	4982	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	146329274
111	NC_009446	AGC	2	6	4988	4993	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146329274
112	NC_009446	CG	3	6	5017	5022	0 %	0 %	50 %	50 %	146329274
113	NC_009446	ATC	2	6	5034	5039	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146329274
114	NC_009446	TTGC	2	8	5041	5048	0 %	50 %	25 %	25 %	146329274
115	NC_009446	CGG	2	6	5068	5073	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146329274
116	NC_009446	TTG	2	6	5104	5109	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	146329274
117	NC_009446	GCT	2	6	5133	5138	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146329274
118	NC_009446	GCT	2	6	5196	5201	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146329274
119	NC_009446	A	7	7	5236	5242	100 %	0 %	0 %	0 %	146329274
120	NC_009446	GC	3	6	5256	5261	0 %	0 %	50 %	50 %	146329274
121	NC_009446	AATT	2	8	5281	5288	50 %	50 %	0 %	0 %	146329274
122	NC_009446	GC	3	6	5318	5323	0 %	0 %	50 %	50 %	146329274
123	NC_009446	ATT	2	6	5324	5329	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	146329274
124	NC_009446	CGCGCA	2	12	5333	5344	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	146329274
125	NC_009446	GTT	2	6	5411	5416	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	146329274
126	NC_009446	ATT	2	6	5442	5447	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	146329274
127	NC_009446	GCG	2	6	5452	5457	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146329274
128	NC_009446	CGG	2	6	5458	5463	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146329274
129	NC_009446	GC	3	6	5466	5471	0 %	0 %	50 %	50 %	146329274
130	NC_009446	CGG	2	6	5478	5483	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146329274
131	NC_009446	TTA	2	6	5613	5618	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	146329274
132	NC_009446	T	6	6	5720	5725	0 %	100 %	0 %	0 %	146329819
133	NC_009446	GGC	2	6	5752	5757	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146329819
134	NC_009446	TCAT	2	8	5802	5809	25 %	50 %	0 %	25 %	146329819
135	NC_009446	TGC	2	6	5814	5819	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146329819
136	NC_009446	CG	3	6	5825	5830	0 %	0 %	50 %	50 %	146329819
137	NC_009446	AAT	2	6	5876	5881	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	146329819
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267	NC_009446	ATAA	2	8	10858	10865	75 %	25 %	0 %	0 %	146329407
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397	NC_009446	A	6	6	16129	16134	100 %	0 %	0 %	0 %	146329042
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