MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Desulfovibrio alaskensis G20 chromosome

Total Repeats: 83836

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
54001	NC_007519	CTG	2	6	2416769	2416774	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
54002	NC_007519	GGA	2	6	2416791	2416796	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
54003	NC_007519	TCC	2	6	2416812	2416817	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
54004	NC_007519	GGC	2	6	2416832	2416837	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
54005	NC_007519	ACC	2	6	2416866	2416871	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78357436
54006	NC_007519	GTC	2	6	2417036	2417041	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78357436
54007	NC_007519	AGC	2	6	2417163	2417168	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78357436
54008	NC_007519	GTC	2	6	2417210	2417215	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78357436
54009	NC_007519	TGCG	2	8	2417218	2417225	0 %	25 %	50 %	25 %	78357436
54010	NC_007519	TCA	2	6	2417367	2417372	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78357436
54011	NC_007519	TCG	2	6	2417376	2417381	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78357436
54012	NC_007519	GCA	2	6	2417398	2417403	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78357436
54013	NC_007519	GCG	2	6	2417427	2417432	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78357436
54014	NC_007519	CGT	2	6	2417455	2417460	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78357436
54015	NC_007519	GCG	2	6	2417480	2417485	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78357436
54016	NC_007519	CGGACG	2	12	2417486	2417497	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	78357436
54017	NC_007519	CCG	2	6	2417536	2417541	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78357436
54018	NC_007519	GCA	2	6	2417547	2417552	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78357436
54019	NC_007519	CTG	2	6	2417560	2417565	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78357436
54020	NC_007519	TTC	2	6	2417567	2417572	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	78357436
54021	NC_007519	G	6	6	2417578	2417583	0 %	0 %	100 %	0 %	78357436
54022	NC_007519	GCA	2	6	2417589	2417594	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78357436
54023	NC_007519	CTT	2	6	2417614	2417619	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	78357436
54024	NC_007519	GCC	2	6	2417675	2417680	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78357436
54025	NC_007519	CTG	2	6	2417706	2417711	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78357436
54026	NC_007519	CCGCG	2	10	2417712	2417721	0 %	0 %	40 %	60 %	78357436
54027	NC_007519	CTT	2	6	2417752	2417757	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	78357436
54028	NC_007519	GCG	2	6	2417772	2417777	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78357436
54029	NC_007519	TCC	2	6	2417919	2417924	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	78357436
54030	NC_007519	TTC	2	6	2417983	2417988	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	78357436
54031	NC_007519	GC	3	6	2417999	2418004	0 %	0 %	50 %	50 %	78357436
54032	NC_007519	TGCG	2	8	2418007	2418014	0 %	25 %	50 %	25 %	78357436
54033	NC_007519	CAT	2	6	2418043	2418048	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78357436
54034	NC_007519	GGC	2	6	2418091	2418096	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78357436
54035	NC_007519	CGT	2	6	2418112	2418117	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78357436
54036	NC_007519	CCA	2	6	2418212	2418217	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78357437
54037	NC_007519	CTG	2	6	2418218	2418223	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78357437
54038	NC_007519	GTT	2	6	2418239	2418244	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	78357437
54039	NC_007519	CAT	2	6	2418314	2418319	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78357437
54040	NC_007519	TG	3	6	2418330	2418335	0 %	50 %	50 %	0 %	78357437
54041	NC_007519	CGG	2	6	2418340	2418345	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78357437
54042	NC_007519	GCT	2	6	2418361	2418366	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78357437
54043	NC_007519	TGG	2	6	2418376	2418381	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78357437
54044	NC_007519	GCCA	2	8	2418432	2418439	25 %	0 %	25 %	50 %	78357437
54045	NC_007519	AGC	2	6	2418540	2418545	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78357437
54046	NC_007519	CCCG	2	8	2418557	2418564	0 %	0 %	25 %	75 %	78357437
54047	NC_007519	GTC	2	6	2418623	2418628	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78357437
54048	NC_007519	AGC	2	6	2418720	2418725	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78357437
54049	NC_007519	GAT	3	9	2418743	2418751	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78357437
54050	NC_007519	AGA	2	6	2418781	2418786	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	78357437
54051	NC_007519	AAGG	2	8	2418815	2418822	50 %	0 %	50 %	0 %	78357437
54052	NC_007519	TCA	2	6	2418846	2418851	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78357437
54053	NC_007519	GAT	2	6	2418853	2418858	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78357437
54054	NC_007519	GGC	2	6	2418866	2418871	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78357437
54055	NC_007519	GTA	2	6	2418899	2418904	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78357437
54056	NC_007519	AG	3	6	2418945	2418950	50 %	0 %	50 %	0 %	78357437
54057	NC_007519	CCA	2	6	2418958	2418963	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78357437
54058	NC_007519	AC	3	6	2418973	2418978	50 %	0 %	0 %	50 %	78357437
54059	NC_007519	GC	3	6	2419006	2419011	0 %	0 %	50 %	50 %	78357437
54060	NC_007519	CGG	2	6	2419015	2419020	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78357437
54061	NC_007519	CGC	2	6	2419054	2419059	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78357437
54062	NC_007519	ATC	2	6	2419103	2419108	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78357437
54063	NC_007519	TGA	2	6	2419122	2419127	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78357437
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54065	NC_007519	CG	3	6	2419222	2419227	0 %	0 %	50 %	50 %	78357437
54066	NC_007519	TGA	2	6	2419264	2419269	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78357437
54067	NC_007519	GTC	2	6	2419370	2419375	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78357437
54068	NC_007519	CAG	3	9	2419421	2419429	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78357437
54069	NC_007519	CGG	2	6	2419447	2419452	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78357437
54070	NC_007519	CCA	2	6	2419471	2419476	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78357437
54071	NC_007519	CTT	2	6	2419486	2419491	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	78357437
54072	NC_007519	CTG	2	6	2419670	2419675	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78357437
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54074	NC_007519	TGA	2	6	2419927	2419932	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78357438
54075	NC_007519	TGCCG	2	10	2419933	2419942	0 %	20 %	40 %	40 %	78357438
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54082	NC_007519	ATC	2	6	2420218	2420223	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78357439
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54086	NC_007519	GCG	2	6	2420481	2420486	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
54087	NC_007519	GCT	2	6	2420508	2420513	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
54088	NC_007519	CGG	2	6	2420545	2420550	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
54089	NC_007519	A	7	7	2420594	2420600	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
54090	NC_007519	CTT	2	6	2420610	2420615	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
54091	NC_007519	AGCA	2	8	2420694	2420701	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
54092	NC_007519	GCCTCG	2	12	2420723	2420734	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
54093	NC_007519	GCG	2	6	2420783	2420788	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
54094	NC_007519	TCT	2	6	2420791	2420796	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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54097	NC_007519	CCCG	2	8	2420844	2420851	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
54098	NC_007519	CCGG	2	8	2420852	2420859	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
54099	NC_007519	AGC	2	6	2420878	2420883	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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54101	NC_007519	CTT	2	6	2420944	2420949	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	78357441
54102	NC_007519	CGCAC	2	10	2421066	2421075	20 %	0 %	20 %	60 %	78357441
54103	NC_007519	CAA	2	6	2421106	2421111	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	78357441
54104	NC_007519	GCA	2	6	2421130	2421135	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78357441
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54106	NC_007519	TCA	2	6	2421238	2421243	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78357441
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54112	NC_007519	CT	3	6	2421495	2421500	0 %	50 %	0 %	50 %	78357441
54113	NC_007519	GCG	2	6	2421510	2421515	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78357441
54114	NC_007519	TGG	2	6	2421538	2421543	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78357441
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54116	NC_007519	CG	3	6	2421560	2421565	0 %	0 %	50 %	50 %	78357441
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54118	NC_007519	CAG	3	9	2421590	2421598	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78357441
54119	NC_007519	TGTC	2	8	2421668	2421675	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
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54217	NC_007519	A	6	6	2426139	2426144	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
54218	NC_007519	GAAAAA	3	18	2426145	2426162	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
54219	NC_007519	CAG	2	6	2426204	2426209	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
54220	NC_007519	GCG	2	6	2426241	2426246	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
54221	NC_007519	ATGC	2	8	2426275	2426282	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
54222	NC_007519	CCGC	2	8	2426310	2426317	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
54223	NC_007519	A	8	8	2426385	2426392	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
54224	NC_007519	CGG	2	6	2426400	2426405	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
54225	NC_007519	CAA	2	6	2426437	2426442	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	78357451
54226	NC_007519	TACACA	2	12	2426448	2426459	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	78357451
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54228	NC_007519	GCC	2	6	2426501	2426506	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78357451
54229	NC_007519	GGA	2	6	2426526	2426531	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	78357451
54230	NC_007519	GGA	2	6	2426543	2426548	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	78357451
54231	NC_007519	CCG	2	6	2426554	2426559	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78357451
54232	NC_007519	GCT	2	6	2426579	2426584	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78357451
54233	NC_007519	A	7	7	2426610	2426616	100 %	0 %	0 %	0 %	78357451
54234	NC_007519	GCT	2	6	2426666	2426671	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78357451
54235	NC_007519	CTGC	2	8	2426681	2426688	0 %	25 %	25 %	50 %	78357451
54236	NC_007519	CGC	2	6	2426702	2426707	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78357451
54237	NC_007519	TGC	2	6	2426854	2426859	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78357451
54238	NC_007519	CGA	2	6	2426867	2426872	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78357451
54239	NC_007519	GGTC	2	8	2426902	2426909	0 %	25 %	50 %	25 %	78357451
54240	NC_007519	GCA	2	6	2426957	2426962	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78357451
54241	NC_007519	CG	3	6	2426977	2426982	0 %	0 %	50 %	50 %	78357451
54242	NC_007519	GGC	2	6	2426992	2426997	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78357451
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54245	NC_007519	GGC	2	6	2427118	2427123	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78357451
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54249	NC_007519	CCA	2	6	2427175	2427180	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78357451
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54251	NC_007519	TGGA	2	8	2427420	2427427	25 %	25 %	50 %	0 %	78357451
54252	NC_007519	TTCTG	2	10	2427487	2427496	0 %	60 %	20 %	20 %	78357451
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54262	NC_007519	GAA	2	6	2427921	2427926	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	78357451
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54266	NC_007519	GCACG	2	10	2428181	2428190	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
54267	NC_007519	GCC	2	6	2428208	2428213	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
54268	NC_007519	CGG	2	6	2428230	2428235	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
54269	NC_007519	TA	3	6	2428246	2428251	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
54270	NC_007519	CCG	2	6	2428283	2428288	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
54271	NC_007519	TCAA	2	8	2428302	2428309	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
54272	NC_007519	CTG	3	9	2428351	2428359	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78357452
54273	NC_007519	TGG	2	6	2428379	2428384	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78357452
54274	NC_007519	CGC	2	6	2428405	2428410	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78357452
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54277	NC_007519	TGC	2	6	2428583	2428588	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78357452
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54300	NC_007519	TCAG	2	8	2429393	2429400	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
54301	NC_007519	CA	3	6	2429438	2429443	50 %	0 %	0 %	50 %	78357453
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54307	NC_007519	GC	3	6	2429689	2429694	0 %	0 %	50 %	50 %	78357453
54308	NC_007519	GCTC	2	8	2429715	2429722	0 %	25 %	25 %	50 %	78357453
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54314	NC_007519	TC	3	6	2430000	2430005	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
54315	NC_007519	AT	3	6	2430016	2430021	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
54316	NC_007519	GCA	2	6	2430139	2430144	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78357454
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54320	NC_007519	GCC	2	6	2430411	2430416	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78357454
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54322	NC_007519	TGC	2	6	2430538	2430543	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78357454
54323	NC_007519	CTG	2	6	2430552	2430557	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78357454
54324	NC_007519	GGAC	2	8	2430584	2430591	25 %	0 %	50 %	25 %	78357454
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54326	NC_007519	TA	3	6	2430631	2430636	50 %	50 %	0 %	0 %	78357454
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54331	NC_007519	TTTGCC	2	12	2430822	2430833	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	78357454
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54339	NC_007519	A	6	6	2431345	2431350	100 %	0 %	0 %	0 %	78357454
54340	NC_007519	GCT	2	6	2431379	2431384	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78357454
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54343	NC_007519	CAA	2	6	2431502	2431507	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	78357454
54344	NC_007519	TGC	2	6	2431516	2431521	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78357454
54345	NC_007519	CTG	2	6	2431587	2431592	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78357454
54346	NC_007519	ACC	2	6	2431627	2431632	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78357454
54347	NC_007519	CAT	2	6	2431664	2431669	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78357454
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54349	NC_007519	GGA	2	6	2431808	2431813	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	78357454
54350	NC_007519	GC	3	6	2431839	2431844	0 %	0 %	50 %	50 %	78357454
54351	NC_007519	GAA	2	6	2431893	2431898	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	78357454
54352	NC_007519	GC	4	8	2431900	2431907	0 %	0 %	50 %	50 %	78357454
54353	NC_007519	AGC	2	6	2431965	2431970	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78357454
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54474	NC_007519	CAG	2	6	2437239	2437244	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347359999
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54477	NC_007519	GCCC	2	8	2437351	2437358	0 %	0 %	25 %	75 %	347359999
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