MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Dehalococcoides sp. CBDB1 chromosome

Total Repeats: 25647

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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4002	NC_007356	GCC	2	6	211623	211628	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	73748154
4003	NC_007356	ATT	2	6	211629	211634	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	73748154
4004	NC_007356	AAG	2	6	211720	211725	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	73748154
4005	NC_007356	CTGC	2	8	211791	211798	0 %	25 %	25 %	50 %	73748154
4006	NC_007356	TGC	2	6	211810	211815	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	73748154
4007	NC_007356	TAT	2	6	211877	211882	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	73748154
4008	NC_007356	ATT	2	6	211956	211961	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	73748154
4009	NC_007356	T	7	7	211969	211975	0 %	100 %	0 %	0 %	73748154
4010	NC_007356	TAG	2	6	212029	212034	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	73748154
4011	NC_007356	TA	3	6	212099	212104	50 %	50 %	0 %	0 %	73748154
4012	NC_007356	AGC	2	6	212127	212132	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	73748154
4013	NC_007356	TCA	2	6	212247	212252	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	73748154
4014	NC_007356	T	6	6	212299	212304	0 %	100 %	0 %	0 %	73748154
4015	NC_007356	A	6	6	212427	212432	100 %	0 %	0 %	0 %	73748154
4016	NC_007356	TAA	2	6	212489	212494	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	73748154
4017	NC_007356	CAA	2	6	212502	212507	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	73748154
4018	NC_007356	TTA	2	6	212508	212513	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	73748154
4019	NC_007356	AT	3	6	212585	212590	50 %	50 %	0 %	0 %	73748154
4020	NC_007356	AAT	2	6	212591	212596	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	73748154
4021	NC_007356	ACAG	2	8	212662	212669	50 %	0 %	25 %	25 %	73748154
4022	NC_007356	ATTT	2	8	212802	212809	25 %	75 %	0 %	0 %	73748155
4023	NC_007356	GAA	2	6	212822	212827	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	73748155
4024	NC_007356	ATT	2	6	212838	212843	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	73748155
4025	NC_007356	TCC	2	6	212901	212906	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	73748155
4026	NC_007356	T	6	6	212922	212927	0 %	100 %	0 %	0 %	73748155
4027	NC_007356	GAT	2	6	212966	212971	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	73748155
4028	NC_007356	ATC	2	6	213009	213014	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	73748155
4029	NC_007356	AGG	2	6	213088	213093	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	73748155
4030	NC_007356	GCA	2	6	213098	213103	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	73748155
4031	NC_007356	CTG	2	6	213107	213112	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	73748155
4032	NC_007356	GCG	2	6	213302	213307	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	73748155
4033	NC_007356	AT	3	6	213342	213347	50 %	50 %	0 %	0 %	73748155
4034	NC_007356	TAA	2	6	213409	213414	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4035	NC_007356	TTA	2	6	213430	213435	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4036	NC_007356	TTAT	2	8	213520	213527	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4037	NC_007356	CAAAT	2	10	213632	213641	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
4038	NC_007356	CAC	2	6	213651	213656	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4039	NC_007356	AGG	2	6	213751	213756	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4040	NC_007356	AGG	2	6	213806	213811	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4041	NC_007356	GCT	2	6	213901	213906	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	73748156
4042	NC_007356	TGG	2	6	213976	213981	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	73748156
4043	NC_007356	ATT	2	6	213995	214000	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	73748156
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4045	NC_007356	CTA	2	6	214049	214054	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	73748156
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4052	NC_007356	TGA	2	6	214419	214424	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	73748156
4053	NC_007356	GGC	2	6	214489	214494	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	73748156
4054	NC_007356	ATG	2	6	214580	214585	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	73748156
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4056	NC_007356	TGG	2	6	214700	214705	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	73748156
4057	NC_007356	GTG	2	6	214706	214711	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	73748156
4058	NC_007356	CGG	2	6	214850	214855	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	73748156
4059	NC_007356	CAC	2	6	214890	214895	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	73748156
4060	NC_007356	CAA	2	6	215010	215015	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	73748156
4061	NC_007356	GCTG	2	8	215121	215128	0 %	25 %	50 %	25 %	73748156
4062	NC_007356	CTT	3	9	215187	215195	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	73748156
4063	NC_007356	TTGC	2	8	215223	215230	0 %	50 %	25 %	25 %	73748156
4064	NC_007356	TGG	2	6	215251	215256	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	73748156
4065	NC_007356	TCT	2	6	215309	215314	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4066	NC_007356	TAA	2	6	215324	215329	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4067	NC_007356	CTC	2	6	215396	215401	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	73748157
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4070	NC_007356	TAA	2	6	215671	215676	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4071	NC_007356	GT	3	6	215694	215699	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4072	NC_007356	AAT	2	6	215768	215773	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4073	NC_007356	CGG	2	6	215779	215784	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4074	NC_007356	ATA	3	9	215847	215855	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	73748158
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4080	NC_007356	TGA	2	6	216230	216235	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	73748158
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4083	NC_007356	GATT	2	8	216391	216398	25 %	50 %	25 %	0 %	73748158
4084	NC_007356	TAT	2	6	216406	216411	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	73748158
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4089	NC_007356	GCTG	2	8	216797	216804	0 %	25 %	50 %	25 %	73748158
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4092	NC_007356	CTT	2	6	216887	216892	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	73748158
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4096	NC_007356	TTG	2	6	217117	217122	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4097	NC_007356	AGG	2	6	217156	217161	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4098	NC_007356	TGGAG	2	10	217188	217197	20 %	20 %	60 %	0 %	73748159
4099	NC_007356	TCA	2	6	217298	217303	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	73748159
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4107	NC_007356	CT	3	6	218179	218184	0 %	50 %	0 %	50 %	73748160
4108	NC_007356	CCA	2	6	218218	218223	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	73748160
4109	NC_007356	GAA	2	6	218447	218452	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	73748160
4110	NC_007356	CCGG	2	8	218522	218529	0 %	0 %	50 %	50 %	73748160
4111	NC_007356	ATA	2	6	218532	218537	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	73748160
4112	NC_007356	GGT	2	6	218656	218661	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	73748160
4113	NC_007356	AT	3	6	218691	218696	50 %	50 %	0 %	0 %	73748161
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4116	NC_007356	AAG	2	6	218872	218877	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	73748161
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4121	NC_007356	CCG	2	6	219217	219222	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	73748161
4122	NC_007356	T	6	6	219224	219229	0 %	100 %	0 %	0 %	73748161
4123	NC_007356	GA	3	6	219234	219239	50 %	0 %	50 %	0 %	73748161
4124	NC_007356	AAG	2	6	219566	219571	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	73748162
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4126	NC_007356	CTG	2	6	219683	219688	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	73748162
4127	NC_007356	CT	3	6	219733	219738	0 %	50 %	0 %	50 %	73748162
4128	NC_007356	GCCA	2	8	219827	219834	25 %	0 %	25 %	50 %	73748162
4129	NC_007356	TGA	2	6	219838	219843	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	73748162
4130	NC_007356	CTG	2	6	219914	219919	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	73748162
4131	NC_007356	TAC	2	6	219935	219940	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	73748162
4132	NC_007356	TA	4	8	219972	219979	50 %	50 %	0 %	0 %	73748162
4133	NC_007356	TA	3	6	219986	219991	50 %	50 %	0 %	0 %	73748162
4134	NC_007356	GAA	2	6	219998	220003	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	73748162
4135	NC_007356	A	6	6	220008	220013	100 %	0 %	0 %	0 %	73748162
4136	NC_007356	GGAT	2	8	220056	220063	25 %	25 %	50 %	0 %	73748162
4137	NC_007356	GGC	2	6	220092	220097	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	73748162
4138	NC_007356	GAG	2	6	220109	220114	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	73748162
4139	NC_007356	GAA	2	6	220150	220155	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	73748162
4140	NC_007356	CAG	2	6	220169	220174	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	73748162
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4142	NC_007356	AAGCA	2	10	220189	220198	60 %	0 %	20 %	20 %	73748162
4143	NC_007356	CTG	2	6	220202	220207	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	73748162
4144	NC_007356	GTG	2	6	220214	220219	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	73748162
4145	NC_007356	ACT	2	6	220265	220270	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	73748163
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4153	NC_007356	TAT	3	9	220499	220507	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	73748163
4154	NC_007356	GCT	2	6	220513	220518	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	73748163
4155	NC_007356	ATTGAA	2	12	220544	220555	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	73748163
4156	NC_007356	GAA	2	6	220619	220624	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	73748163
4157	NC_007356	ACC	2	6	220643	220648	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	73748163
4158	NC_007356	GCG	2	6	220688	220693	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	73748163
4159	NC_007356	GTG	2	6	220745	220750	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	73748163
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4164	NC_007356	GA	3	6	220917	220922	50 %	0 %	50 %	0 %	73748163
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4168	NC_007356	T	6	6	221117	221122	0 %	100 %	0 %	0 %	73748164
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4171	NC_007356	AT	3	6	221276	221281	50 %	50 %	0 %	0 %	73748164
4172	NC_007356	AAG	2	6	221500	221505	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	73748164
4173	NC_007356	A	6	6	221521	221526	100 %	0 %	0 %	0 %	73748164
4174	NC_007356	AGAGGA	2	12	221562	221573	50 %	0 %	50 %	0 %	73748164
4175	NC_007356	GCT	2	6	221668	221673	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	73748164
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4182	NC_007356	ATG	2	6	221979	221984	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	73748165
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4184	NC_007356	GGC	2	6	222138	222143	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	73748165
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4188	NC_007356	GGC	2	6	222245	222250	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	73748165
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4192	NC_007356	GGA	2	6	222422	222427	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	73748165
4193	NC_007356	T	6	6	222487	222492	0 %	100 %	0 %	0 %	73748165
4194	NC_007356	ATAA	2	8	222552	222559	75 %	25 %	0 %	0 %	73748165
4195	NC_007356	GCG	2	6	222607	222612	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	73748165
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4201	NC_007356	TA	3	6	223103	223108	50 %	50 %	0 %	0 %	73748165
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4205	NC_007356	CTG	2	6	223224	223229	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	73748165
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4221	NC_007356	GCT	2	6	224317	224322	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	73748167
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4230	NC_007356	GGCC	2	8	224908	224915	0 %	0 %	50 %	50 %	73748167
4231	NC_007356	CAG	2	6	224949	224954	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	73748167
4232	NC_007356	AGGCC	2	10	224962	224971	20 %	0 %	40 %	40 %	73748167
4233	NC_007356	ATT	2	6	225005	225010	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	73748167
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4235	NC_007356	AGA	2	6	225222	225227	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	73748168
4236	NC_007356	GGA	2	6	225255	225260	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	73748168
4237	NC_007356	TA	3	6	225327	225332	50 %	50 %	0 %	0 %	73748168
4238	NC_007356	AAT	2	6	225342	225347	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4239	NC_007356	GCC	2	6	225375	225380	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	73748169
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4242	NC_007356	TTA	2	6	225520	225525	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	73748169
4243	NC_007356	GGA	2	6	225536	225541	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	73748169
4244	NC_007356	ATC	2	6	225543	225548	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	73748169
4245	NC_007356	CTGC	2	8	225601	225608	0 %	25 %	25 %	50 %	73748169
4246	NC_007356	ATT	2	6	225621	225626	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	73748169
4247	NC_007356	CAT	2	6	225642	225647	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	73748169
4248	NC_007356	A	7	7	225677	225683	100 %	0 %	0 %	0 %	73748169
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4250	NC_007356	AAT	2	6	225792	225797	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	73748169
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