MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Dehalococcoides sp. CBDB1 chromosome

Total Repeats: 25647

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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24002	NC_007356	CAT	2	6	1306075	1306080	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	73749312
24003	NC_007356	CAATGG	2	12	1306101	1306112	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	73749312
24004	NC_007356	CCA	2	6	1306113	1306118	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	73749312
24005	NC_007356	CGG	2	6	1306170	1306175	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	73749312
24006	NC_007356	CAC	2	6	1306177	1306182	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	73749312
24007	NC_007356	AAGGC	2	10	1306200	1306209	40 %	0 %	40 %	20 %	73749312
24008	NC_007356	CCG	2	6	1306227	1306232	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	73749312
24009	NC_007356	TGG	2	6	1306275	1306280	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	73749312
24010	NC_007356	CAA	2	6	1306332	1306337	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	73749312
24011	NC_007356	TCA	2	6	1306491	1306496	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	73749312
24012	NC_007356	TTC	2	6	1306618	1306623	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	73749312
24013	NC_007356	TTC	2	6	1306678	1306683	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	73749312
24014	NC_007356	GAA	2	6	1306715	1306720	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	73749312
24015	NC_007356	GTA	2	6	1306781	1306786	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	73749312
24016	NC_007356	CTGG	2	8	1306792	1306799	0 %	25 %	50 %	25 %	73749312
24017	NC_007356	AAT	2	6	1306855	1306860	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	73749312
24018	NC_007356	CCG	2	6	1306880	1306885	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	73749312
24019	NC_007356	GCCA	2	8	1306906	1306913	25 %	0 %	25 %	50 %	73749312
24020	NC_007356	AGC	2	6	1306973	1306978	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	73749312
24021	NC_007356	CGAA	2	8	1307064	1307071	50 %	0 %	25 %	25 %	73749312
24022	NC_007356	ATGA	2	8	1307078	1307085	50 %	25 %	25 %	0 %	73749312
24023	NC_007356	AGA	2	6	1307102	1307107	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	73749312
24024	NC_007356	CCG	2	6	1307133	1307138	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	73749312
24025	NC_007356	CTA	2	6	1307142	1307147	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	73749312
24026	NC_007356	ACT	2	6	1307222	1307227	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	73749312
24027	NC_007356	ACCA	2	8	1307243	1307250	50 %	0 %	0 %	50 %	73749312
24028	NC_007356	TAAGGG	2	12	1307268	1307279	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	73749312
24029	NC_007356	TGAG	2	8	1307286	1307293	25 %	25 %	50 %	0 %	73749312
24030	NC_007356	GCC	2	6	1307350	1307355	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	73749312
24031	NC_007356	G	6	6	1307367	1307372	0 %	0 %	100 %	0 %	73749312
24032	NC_007356	GGT	2	6	1307401	1307406	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	73749312
24033	NC_007356	CTT	2	6	1307421	1307426	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	73749312
24034	NC_007356	CCG	2	6	1307432	1307437	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	73749312
24035	NC_007356	CGG	2	6	1307474	1307479	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	73749312
24036	NC_007356	TAT	2	6	1307491	1307496	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	73749312
24037	NC_007356	GCC	2	6	1307517	1307522	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	73749312
24038	NC_007356	GAA	3	9	1307656	1307664	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	73749312
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24040	NC_007356	GCTG	2	8	1307712	1307719	0 %	25 %	50 %	25 %	73749312
24041	NC_007356	CAGCT	2	10	1307791	1307800	20 %	20 %	20 %	40 %	73749312
24042	NC_007356	T	6	6	1307802	1307807	0 %	100 %	0 %	0 %	73749312
24043	NC_007356	TAC	2	6	1307854	1307859	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	73749312
24044	NC_007356	TGA	2	6	1307902	1307907	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	73749312
24045	NC_007356	GACTAA	2	12	1307916	1307927	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	73749312
24046	NC_007356	TGG	2	6	1307928	1307933	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	73749312
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24049	NC_007356	CGG	2	6	1308181	1308186	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	73749312
24050	NC_007356	ATA	2	6	1308221	1308226	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	73749312
24051	NC_007356	CAT	2	6	1308271	1308276	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	73749312
24052	NC_007356	GGC	2	6	1308277	1308282	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	73749312
24053	NC_007356	GAA	2	6	1308401	1308406	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	73749312
24054	NC_007356	GAGGT	2	10	1308410	1308419	20 %	20 %	60 %	0 %	73749312
24055	NC_007356	GGT	2	6	1308469	1308474	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	73749312
24056	NC_007356	AAG	2	6	1308588	1308593	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	73749312
24057	NC_007356	CTG	2	6	1308701	1308706	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	73749313
24058	NC_007356	TCTA	2	8	1308872	1308879	25 %	50 %	0 %	25 %	73749313
24059	NC_007356	ATA	3	9	1309002	1309010	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	73749313
24060	NC_007356	TCAATT	2	12	1309098	1309109	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	73749313
24061	NC_007356	TA	5	10	1309237	1309246	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
24062	NC_007356	TA	3	6	1309257	1309262	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
24063	NC_007356	T	7	7	1309399	1309405	0 %	100 %	0 %	0 %	73749314
24064	NC_007356	CAG	2	6	1309438	1309443	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	73749314
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24066	NC_007356	TC	3	6	1309500	1309505	0 %	50 %	0 %	50 %	73749314
24067	NC_007356	AGAAC	2	10	1309521	1309530	60 %	0 %	20 %	20 %	73749314
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24070	NC_007356	GACCA	2	10	1309615	1309624	40 %	0 %	20 %	40 %	73749314
24071	NC_007356	AGC	2	6	1309625	1309630	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	73749314
24072	NC_007356	TTA	3	9	1309650	1309658	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	73749314
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24074	NC_007356	CCA	2	6	1309747	1309752	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	73749315
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24083	NC_007356	TTG	2	6	1310198	1310203	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	73749315
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24090	NC_007356	GTT	2	6	1310863	1310868	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	73749315
24091	NC_007356	CCAGT	2	10	1310908	1310917	20 %	20 %	20 %	40 %	73749315
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24098	NC_007356	CCT	2	6	1311189	1311194	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
24099	NC_007356	ATT	2	6	1311198	1311203	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
24100	NC_007356	GAAT	2	8	1311210	1311217	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
24101	NC_007356	ATC	2	6	1311239	1311244	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
24102	NC_007356	TAT	2	6	1311295	1311300	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
24103	NC_007356	ACTC	2	8	1311314	1311321	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
24104	NC_007356	TAA	2	6	1311338	1311343	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
24105	NC_007356	TAG	2	6	1311394	1311399	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
24106	NC_007356	ATGAC	2	10	1311425	1311434	40 %	20 %	20 %	20 %	73749316
24107	NC_007356	CAT	2	6	1311471	1311476	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	73749316
24108	NC_007356	AAG	2	6	1311507	1311512	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	73749316
24109	NC_007356	ATA	2	6	1311589	1311594	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	73749316
24110	NC_007356	CAAG	2	8	1311779	1311786	50 %	0 %	25 %	25 %	73749316
24111	NC_007356	TCTG	2	8	1311798	1311805	0 %	50 %	25 %	25 %	73749316
24112	NC_007356	GCA	2	6	1312028	1312033	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	73749317
24113	NC_007356	CA	3	6	1312127	1312132	50 %	0 %	0 %	50 %	73749317
24114	NC_007356	GGCA	2	8	1312218	1312225	25 %	0 %	50 %	25 %	73749317
24115	NC_007356	CGG	2	6	1312356	1312361	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	73749317
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24119	NC_007356	CTG	2	6	1312565	1312570	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	73749317
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24226	NC_007356	GT	3	6	1318536	1318541	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
24227	NC_007356	TAAT	2	8	1318614	1318621	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
24228	NC_007356	CTGGAA	2	12	1318655	1318666	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	73749322
24229	NC_007356	TC	3	6	1318744	1318749	0 %	50 %	0 %	50 %	73749322
24230	NC_007356	A	6	6	1318910	1318915	100 %	0 %	0 %	0 %	73749322
24231	NC_007356	ATG	2	6	1319000	1319005	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	73749322
24232	NC_007356	AGA	2	6	1319020	1319025	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	73749322
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24234	NC_007356	AGA	2	6	1319144	1319149	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
24235	NC_007356	G	8	8	1319156	1319163	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
24236	NC_007356	C	8	8	1319176	1319183	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
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