MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Dehalococcoides sp. CBDB1 chromosome

Total Repeats: 25647

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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23502	NC_007356	AGA	3	9	1280763	1280771	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	73749292
23503	NC_007356	GCA	2	6	1280775	1280780	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	73749292
23504	NC_007356	ACA	2	6	1280781	1280786	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	73749292
23505	NC_007356	CAA	2	6	1280793	1280798	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	73749292
23506	NC_007356	ATAA	2	8	1280860	1280867	75 %	25 %	0 %	0 %	73749292
23507	NC_007356	CTG	3	9	1280899	1280907	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	73749292
23508	NC_007356	AGA	2	6	1280913	1280918	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	73749292
23509	NC_007356	TGA	2	6	1280925	1280930	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	73749292
23510	NC_007356	AG	3	6	1280969	1280974	50 %	0 %	50 %	0 %	73749292
23511	NC_007356	GCA	2	6	1281165	1281170	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	73749292
23512	NC_007356	GAA	2	6	1281210	1281215	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	73749292
23513	NC_007356	A	6	6	1281319	1281324	100 %	0 %	0 %	0 %	73749292
23514	NC_007356	TTC	2	6	1281337	1281342	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	73749292
23515	NC_007356	ACC	2	6	1281343	1281348	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	73749292
23516	NC_007356	AG	3	6	1281429	1281434	50 %	0 %	50 %	0 %	73749292
23517	NC_007356	ACT	2	6	1281451	1281456	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	73749292
23518	NC_007356	TCA	2	6	1281458	1281463	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	73749292
23519	NC_007356	TGG	2	6	1281554	1281559	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	73749292
23520	NC_007356	GAT	2	6	1281562	1281567	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	73749292
23521	NC_007356	GCT	2	6	1281582	1281587	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	73749292
23522	NC_007356	GTT	2	6	1281619	1281624	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	73749292
23523	NC_007356	CGA	2	6	1281633	1281638	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	73749292
23524	NC_007356	ATG	2	6	1281677	1281682	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	73749292
23525	NC_007356	GAA	2	6	1281899	1281904	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	73749292
23526	NC_007356	TTC	2	6	1281916	1281921	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23527	NC_007356	A	6	6	1281944	1281949	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
23528	NC_007356	GACA	2	8	1281959	1281966	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
23529	NC_007356	GCTT	2	8	1282126	1282133	0 %	50 %	25 %	25 %	73749293
23530	NC_007356	TGGGCA	2	12	1282222	1282233	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	73749293
23531	NC_007356	CGG	2	6	1282253	1282258	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	73749293
23532	NC_007356	ATA	2	6	1282356	1282361	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	73749293
23533	NC_007356	TAC	2	6	1282407	1282412	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	73749293
23534	NC_007356	TCC	2	6	1282432	1282437	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
23535	NC_007356	TCA	2	6	1282501	1282506	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23536	NC_007356	GAGT	2	8	1282581	1282588	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
23537	NC_007356	TAAA	2	8	1282643	1282650	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
23538	NC_007356	A	6	6	1282648	1282653	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
23539	NC_007356	CAG	2	6	1282749	1282754	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	73749294
23540	NC_007356	AAT	2	6	1282829	1282834	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	73749294
23541	NC_007356	AGA	2	6	1282930	1282935	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	73749294
23542	NC_007356	GCAA	2	8	1282951	1282958	50 %	0 %	25 %	25 %	73749294
23543	NC_007356	TCCAA	2	10	1282959	1282968	40 %	20 %	0 %	40 %	73749294
23544	NC_007356	ACATT	2	10	1282970	1282979	40 %	40 %	0 %	20 %	73749294
23545	NC_007356	ATC	2	6	1283031	1283036	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	73749295
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23548	NC_007356	GGT	3	9	1283217	1283225	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	73749295
23549	NC_007356	TCAA	2	8	1283296	1283303	50 %	25 %	0 %	25 %	73749295
23550	NC_007356	TCA	2	6	1283399	1283404	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	73749295
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23552	NC_007356	CAT	2	6	1283517	1283522	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	73749295
23553	NC_007356	ATA	2	6	1283569	1283574	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	73749295
23554	NC_007356	AGT	2	6	1283603	1283608	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	73749295
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23556	NC_007356	GGA	2	6	1283678	1283683	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	73749295
23557	NC_007356	TTTGGC	2	12	1283688	1283699	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	73749295
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23566	NC_007356	TGG	2	6	1284056	1284061	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	73749295
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23568	NC_007356	GCC	2	6	1284189	1284194	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	73749295
23569	NC_007356	CT	3	6	1284316	1284321	0 %	50 %	0 %	50 %	73749295
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23573	NC_007356	CAT	2	6	1284377	1284382	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	73749295
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23577	NC_007356	AGCT	2	8	1284574	1284581	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
23578	NC_007356	CCTT	2	8	1284588	1284595	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
23579	NC_007356	GCC	2	6	1284616	1284621	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
23580	NC_007356	TTTTTA	2	12	1284624	1284635	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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23584	NC_007356	TAA	2	6	1284931	1284936	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
23585	NC_007356	AT	3	6	1284957	1284962	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
23586	NC_007356	AAT	2	6	1284963	1284968	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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23590	NC_007356	GTA	2	6	1285232	1285237	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	73749296
23591	NC_007356	GCT	2	6	1285318	1285323	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	73749296
23592	NC_007356	GTA	2	6	1285364	1285369	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	73749296
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23599	NC_007356	A	6	6	1285612	1285617	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
23600	NC_007356	C	6	6	1285631	1285636	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
23601	NC_007356	TAAT	2	8	1285646	1285653	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
23602	NC_007356	T	6	6	1285669	1285674	0 %	100 %	0 %	0 %	73749297
23603	NC_007356	CAG	2	6	1285708	1285713	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	73749297
23604	NC_007356	CAG	2	6	1285738	1285743	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	73749297
23605	NC_007356	AGTA	2	8	1285801	1285808	50 %	25 %	25 %	0 %	73749297
23606	NC_007356	CTA	2	6	1285824	1285829	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	73749297
23607	NC_007356	TCA	2	6	1285875	1285880	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	73749297
23608	NC_007356	TATT	2	8	1285935	1285942	25 %	75 %	0 %	0 %	73749297
23609	NC_007356	CCT	2	6	1285947	1285952	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	73749298
23610	NC_007356	CCG	2	6	1285991	1285996	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	73749298
23611	NC_007356	CCA	2	6	1286014	1286019	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	73749298
23612	NC_007356	CTGC	2	8	1286067	1286074	0 %	25 %	25 %	50 %	73749298
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23614	NC_007356	CAGC	2	8	1286203	1286210	25 %	0 %	25 %	50 %	73749298
23615	NC_007356	GTGG	2	8	1286251	1286258	0 %	25 %	75 %	0 %	73749298
23616	NC_007356	GGCA	2	8	1286328	1286335	25 %	0 %	50 %	25 %	73749298
23617	NC_007356	TTA	2	6	1286456	1286461	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	73749298
23618	NC_007356	A	6	6	1286776	1286781	100 %	0 %	0 %	0 %	73749298
23619	NC_007356	GGC	2	6	1286807	1286812	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	73749298
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23985	NC_007356	TAC	2	6	1305186	1305191	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	73749311
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23993	NC_007356	TTAC	2	8	1305652	1305659	25 %	50 %	0 %	25 %	73749312
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24000	NC_007356	TAC	2	6	1305997	1306002	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	73749312

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