MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Dehalococcoides sp. CBDB1 chromosome

Total Repeats: 25647

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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19002	NC_007356	GATA	2	8	1033059	1033066	50 %	25 %	25 %	0 %	73749036
19003	NC_007356	GGC	2	6	1033071	1033076	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	73749036
19004	NC_007356	CTA	2	6	1033136	1033141	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	73749036
19005	NC_007356	ACA	2	6	1033187	1033192	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	73749036
19006	NC_007356	ATT	2	6	1033303	1033308	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	73749036
19007	NC_007356	AGA	2	6	1033314	1033319	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	73749036
19008	NC_007356	CATC	2	8	1033508	1033515	25 %	25 %	0 %	50 %	73749036
19009	NC_007356	AAT	2	6	1033522	1033527	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	73749036
19010	NC_007356	GTG	2	6	1033591	1033596	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	73749036
19011	NC_007356	AGT	2	6	1033599	1033604	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	73749036
19012	NC_007356	AAT	2	6	1033782	1033787	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	73749036
19013	NC_007356	ATG	2	6	1033879	1033884	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	73749036
19014	NC_007356	ACA	2	6	1033918	1033923	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	73749036
19015	NC_007356	GGA	2	6	1033956	1033961	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	73749036
19016	NC_007356	AGC	2	6	1034055	1034060	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	73749037
19017	NC_007356	CTG	2	6	1034068	1034073	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	73749037
19018	NC_007356	T	6	6	1034118	1034123	0 %	100 %	0 %	0 %	73749037
19019	NC_007356	CTG	2	6	1034200	1034205	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	73749037
19020	NC_007356	C	6	6	1034355	1034360	0 %	0 %	0 %	100 %	73749037
19021	NC_007356	AGG	2	6	1034394	1034399	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	73749037
19022	NC_007356	AGT	2	6	1034409	1034414	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	73749037
19023	NC_007356	AAG	2	6	1034461	1034466	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	73749037
19024	NC_007356	GGTA	2	8	1034505	1034512	25 %	25 %	50 %	0 %	73749037
19025	NC_007356	TGC	3	9	1034519	1034527	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	73749037
19026	NC_007356	CTT	2	6	1034625	1034630	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	73749037
19027	NC_007356	ATA	2	6	1034665	1034670	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	73749037
19028	NC_007356	ACC	2	6	1034851	1034856	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	73749037
19029	NC_007356	AAC	2	6	1034866	1034871	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	73749037
19030	NC_007356	ATG	2	6	1034968	1034973	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	73749037
19031	NC_007356	GAC	2	6	1035013	1035018	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	73749037
19032	NC_007356	GTA	2	6	1035121	1035126	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	73749037
19033	NC_007356	ATAAA	2	10	1035189	1035198	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
19034	NC_007356	GAA	2	6	1035203	1035208	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	73749038
19035	NC_007356	GCT	2	6	1035210	1035215	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	73749038
19036	NC_007356	ACT	2	6	1035343	1035348	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	73749038
19037	NC_007356	AGC	2	6	1035377	1035382	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	73749038
19038	NC_007356	AGA	2	6	1035569	1035574	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	73749038
19039	NC_007356	TGG	2	6	1035700	1035705	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	73749039
19040	NC_007356	GTT	2	6	1035770	1035775	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	73749039
19041	NC_007356	ACTTAT	2	12	1035975	1035986	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	73749039
19042	NC_007356	ATAACC	2	12	1036134	1036145	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	73749039
19043	NC_007356	AGC	2	6	1036194	1036199	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	73749039
19044	NC_007356	TTGG	2	8	1036216	1036223	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
19045	NC_007356	TAA	2	6	1036246	1036251	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	73749040
19046	NC_007356	CAG	2	6	1036275	1036280	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	73749040
19047	NC_007356	TGA	2	6	1036342	1036347	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	73749040
19048	NC_007356	TAC	2	6	1036376	1036381	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	73749040
19049	NC_007356	GGT	2	6	1036476	1036481	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	73749040
19050	NC_007356	TACC	2	8	1036574	1036581	25 %	25 %	0 %	50 %	73749040
19051	NC_007356	AAC	2	6	1036650	1036655	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	73749040
19052	NC_007356	GGC	2	6	1036710	1036715	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	73749040
19053	NC_007356	ATG	2	6	1036765	1036770	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	73749040
19054	NC_007356	TAT	2	6	1036806	1036811	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	73749040
19055	NC_007356	TAC	2	6	1036817	1036822	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	73749040
19056	NC_007356	AT	3	6	1036942	1036947	50 %	50 %	0 %	0 %	73749040
19057	NC_007356	TA	3	6	1037015	1037020	50 %	50 %	0 %	0 %	73749040
19058	NC_007356	CAT	2	6	1037096	1037101	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	73749040
19059	NC_007356	CCA	2	6	1037137	1037142	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	73749040
19060	NC_007356	TGA	2	6	1037279	1037284	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	73749040
19061	NC_007356	ATA	2	6	1037340	1037345	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	73749040
19062	NC_007356	AT	3	6	1037363	1037368	50 %	50 %	0 %	0 %	73749040
19063	NC_007356	GCA	2	6	1037458	1037463	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19064	NC_007356	A	6	6	1037489	1037494	100 %	0 %	0 %	0 %	73749041
19065	NC_007356	TAT	2	6	1037558	1037563	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	73749041
19066	NC_007356	TCC	2	6	1037567	1037572	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	73749041
19067	NC_007356	TGCTGA	2	12	1037575	1037586	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	73749041
19068	NC_007356	ACC	2	6	1037610	1037615	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	73749041
19069	NC_007356	TA	3	6	1037636	1037641	50 %	50 %	0 %	0 %	73749041
19070	NC_007356	CGG	2	6	1037687	1037692	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	73749041
19071	NC_007356	CAGTA	2	10	1037780	1037789	40 %	20 %	20 %	20 %	73749041
19072	NC_007356	TTA	2	6	1037822	1037827	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	73749041
19073	NC_007356	CAGC	2	8	1037842	1037849	25 %	0 %	25 %	50 %	73749041
19074	NC_007356	CAC	2	6	1037867	1037872	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	73749041
19075	NC_007356	CT	3	6	1037930	1037935	0 %	50 %	0 %	50 %	73749041
19076	NC_007356	CGG	2	6	1038014	1038019	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	73749041
19077	NC_007356	TGA	2	6	1038068	1038073	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	73749041
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19079	NC_007356	TGC	2	6	1038173	1038178	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	73749041
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19082	NC_007356	TAT	2	6	1038330	1038335	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	73749041
19083	NC_007356	CTG	2	6	1038337	1038342	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	73749041
19084	NC_007356	TA	4	8	1038403	1038410	50 %	50 %	0 %	0 %	73749041
19085	NC_007356	ATC	2	6	1038504	1038509	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	73749041
19086	NC_007356	GGC	2	6	1038549	1038554	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	73749041
19087	NC_007356	AAC	2	6	1038665	1038670	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	73749041
19088	NC_007356	GCA	2	6	1038697	1038702	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	73749041
19089	NC_007356	TTG	2	6	1038706	1038711	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	73749041
19090	NC_007356	AAT	2	6	1038743	1038748	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	73749041
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19094	NC_007356	GGT	3	9	1039026	1039034	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	73749041
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19099	NC_007356	TCA	2	6	1039425	1039430	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	73749042
19100	NC_007356	G	6	6	1039498	1039503	0 %	0 %	100 %	0 %	73749042
19101	NC_007356	ACC	3	9	1039596	1039604	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	73749042
19102	NC_007356	GAT	2	6	1039608	1039613	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	73749042
19103	NC_007356	ACG	2	6	1039688	1039693	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	73749043
19104	NC_007356	AGA	2	6	1039702	1039707	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	73749043
19105	NC_007356	GGCA	2	8	1039861	1039868	25 %	0 %	50 %	25 %	73749043
19106	NC_007356	GGC	2	6	1039876	1039881	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	73749043
19107	NC_007356	ATCT	2	8	1039897	1039904	25 %	50 %	0 %	25 %	73749043
19108	NC_007356	TAT	2	6	1039909	1039914	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	73749043
19109	NC_007356	TGCC	2	8	1039920	1039927	0 %	25 %	25 %	50 %	73749043
19110	NC_007356	TAC	2	6	1040074	1040079	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	73749043
19111	NC_007356	GTA	2	6	1040087	1040092	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	73749043
19112	NC_007356	TTA	2	6	1040178	1040183	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	73749043
19113	NC_007356	CTGG	2	8	1040194	1040201	0 %	25 %	50 %	25 %	73749043
19114	NC_007356	ATT	2	6	1040219	1040224	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	73749043
19115	NC_007356	GAA	2	6	1040309	1040314	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	73749043
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19117	NC_007356	TTG	2	6	1040475	1040480	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	73749043
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