MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Dehalococcoides sp. CBDB1 chromosome

Total Repeats: 25647

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
11501	NC_007356	CTT	2	6	621196	621201	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	73748594
11502	NC_007356	TGC	2	6	621227	621232	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	73748594
11503	NC_007356	CCA	2	6	621253	621258	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	73748594
11504	NC_007356	ATT	2	6	621261	621266	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	73748594
11505	NC_007356	TCC	2	6	621299	621304	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	73748594
11506	NC_007356	TGG	2	6	621313	621318	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	73748594
11507	NC_007356	GGT	2	6	621447	621452	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	73748594
11508	NC_007356	AAG	2	6	621478	621483	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	73748594
11509	NC_007356	ACT	2	6	621522	621527	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	73748594
11510	NC_007356	GCC	2	6	621528	621533	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	73748594
11511	NC_007356	ATG	2	6	621675	621680	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	73748594
11512	NC_007356	TCAC	2	8	621696	621703	25 %	25 %	0 %	50 %	73748594
11513	NC_007356	GGTG	2	8	621713	621720	0 %	25 %	75 %	0 %	73748594
11514	NC_007356	TGAA	2	8	621739	621746	50 %	25 %	25 %	0 %	73748594
11515	NC_007356	GCG	2	6	621749	621754	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	73748594
11516	NC_007356	TCAA	2	8	621837	621844	50 %	25 %	0 %	25 %	73748594
11517	NC_007356	GAT	2	6	621848	621853	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	73748594
11518	NC_007356	GGTT	2	8	621894	621901	0 %	50 %	50 %	0 %	73748594
11519	NC_007356	CGGTAG	2	12	621910	621921	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	73748594
11520	NC_007356	CGG	2	6	621983	621988	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	73748594
11521	NC_007356	AGC	2	6	622058	622063	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	73748594
11522	NC_007356	ATT	2	6	622143	622148	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	73748594
11523	NC_007356	TAAA	2	8	622209	622216	75 %	25 %	0 %	0 %	73748595
11524	NC_007356	TCTTT	2	10	622228	622237	0 %	80 %	0 %	20 %	73748595
11525	NC_007356	GTT	2	6	622245	622250	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	73748595
11526	NC_007356	AATA	2	8	622392	622399	75 %	25 %	0 %	0 %	73748595
11527	NC_007356	ACC	2	6	622421	622426	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	73748595
11528	NC_007356	GT	3	6	622658	622663	0 %	50 %	50 %	0 %	73748595
11529	NC_007356	AT	3	6	622671	622676	50 %	50 %	0 %	0 %	73748595
11530	NC_007356	AGC	2	6	622727	622732	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	73748595
11531	NC_007356	GGC	2	6	622753	622758	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	73748595
11532	NC_007356	TCA	2	6	622764	622769	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	73748595
11533	NC_007356	TA	3	6	622775	622780	50 %	50 %	0 %	0 %	73748595
11534	NC_007356	ATA	2	6	622845	622850	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11535	NC_007356	CTGC	2	8	622956	622963	0 %	25 %	25 %	50 %	73748596
11536	NC_007356	TTCA	2	8	622967	622974	25 %	50 %	0 %	25 %	73748596
11537	NC_007356	TTTAT	2	10	622987	622996	20 %	80 %	0 %	0 %	73748596
11538	NC_007356	TAT	2	6	623043	623048	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	73748596
11539	NC_007356	TA	3	6	623106	623111	50 %	50 %	0 %	0 %	73748596
11540	NC_007356	CTC	2	6	623136	623141	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	73748596
11541	NC_007356	CTG	2	6	623154	623159	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	73748596
11542	NC_007356	T	7	7	623185	623191	0 %	100 %	0 %	0 %	73748596
11543	NC_007356	T	6	6	623204	623209	0 %	100 %	0 %	0 %	73748596
11544	NC_007356	AAC	2	6	623214	623219	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	73748596
11545	NC_007356	TCA	2	6	623333	623338	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	73748596
11546	NC_007356	GTT	2	6	623360	623365	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	73748596
11547	NC_007356	TTATAG	2	12	623377	623388	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	73748596
11548	NC_007356	GCAA	2	8	623460	623467	50 %	0 %	25 %	25 %	73748596
11549	NC_007356	CGC	2	6	623538	623543	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	73748597
11550	NC_007356	CAG	2	6	623561	623566	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	73748597
11551	NC_007356	CGG	2	6	623576	623581	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	73748597
11552	NC_007356	TGG	2	6	623646	623651	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	73748597
11553	NC_007356	GAT	2	6	623673	623678	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	73748597
11554	NC_007356	TGGT	2	8	623680	623687	0 %	50 %	50 %	0 %	73748597
11555	NC_007356	A	6	6	623772	623777	100 %	0 %	0 %	0 %	73748597
11556	NC_007356	CCTG	2	8	623823	623830	0 %	25 %	25 %	50 %	73748597
11557	NC_007356	CGG	2	6	623831	623836	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	73748597
11558	NC_007356	GAA	2	6	623895	623900	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	73748597
11559	NC_007356	GCC	2	6	623901	623906	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	73748597
11560	NC_007356	ACC	2	6	623973	623978	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	73748597
11561	NC_007356	A	6	6	623982	623987	100 %	0 %	0 %	0 %	73748597
11562	NC_007356	CAC	2	6	624035	624040	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	73748597
11563	NC_007356	GAT	2	6	624111	624116	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	73748597
11564	NC_007356	GAA	2	6	624126	624131	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	73748597
11565	NC_007356	GAA	2	6	624360	624365	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	73748597
11566	NC_007356	TGAT	2	8	624436	624443	25 %	50 %	25 %	0 %	73748597
11567	NC_007356	GAA	2	6	624453	624458	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	73748597
11568	NC_007356	TGCACC	2	12	624487	624498	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	73748597
11569	NC_007356	GAT	2	6	624612	624617	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	73748597
11570	NC_007356	GCC	2	6	624631	624636	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	73748597
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11572	NC_007356	TG	3	6	624672	624677	0 %	50 %	50 %	0 %	73748597
11573	NC_007356	GGA	2	6	624698	624703	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	73748597
11574	NC_007356	CCGT	2	8	624715	624722	0 %	25 %	25 %	50 %	73748597
11575	NC_007356	TA	3	6	624771	624776	50 %	50 %	0 %	0 %	73748597
11576	NC_007356	TCC	2	6	624904	624909	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	73748598
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11578	NC_007356	A	6	6	624964	624969	100 %	0 %	0 %	0 %	73748598
11579	NC_007356	TGG	2	6	624977	624982	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	73748598
11580	NC_007356	CCG	2	6	625044	625049	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	73748598
11581	NC_007356	TGG	2	6	625091	625096	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	73748598
11582	NC_007356	TGC	2	6	625116	625121	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	73748598
11583	NC_007356	CGGG	2	8	625122	625129	0 %	0 %	75 %	25 %	73748598
11584	NC_007356	CTA	3	9	625130	625138	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	73748598
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11587	NC_007356	TC	3	6	625395	625400	0 %	50 %	0 %	50 %	73748598
11588	NC_007356	CAG	2	6	625534	625539	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	73748598
11589	NC_007356	GTCTT	2	10	625540	625549	0 %	60 %	20 %	20 %	73748598
11590	NC_007356	GAT	2	6	625609	625614	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	73748598
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11593	NC_007356	AT	3	6	625754	625759	50 %	50 %	0 %	0 %	73748598
11594	NC_007356	AGGCA	2	10	625763	625772	40 %	0 %	40 %	20 %	73748598
11595	NC_007356	CGG	2	6	625817	625822	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	73748598
11596	NC_007356	AGA	2	6	626009	626014	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	73748598
11597	NC_007356	CTG	2	6	626017	626022	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	73748598
11598	NC_007356	TTC	3	9	626111	626119	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	73748599
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11601	NC_007356	GGTT	2	8	626197	626204	0 %	50 %	50 %	0 %	73748599
11602	NC_007356	TTG	2	6	626284	626289	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	73748599
11603	NC_007356	CGC	2	6	626304	626309	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	73748599
11604	NC_007356	C	6	6	626331	626336	0 %	0 %	0 %	100 %	73748599
11605	NC_007356	ACC	2	6	626349	626354	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	73748599
11606	NC_007356	TGA	2	6	626357	626362	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	73748599
11607	NC_007356	CCG	2	6	626396	626401	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	73748599
11608	NC_007356	CTA	2	6	626446	626451	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	73748599
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11612	NC_007356	CTG	2	6	626592	626597	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	73748599
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11615	NC_007356	CCG	2	6	626696	626701	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	73748599
11616	NC_007356	GAAGC	2	10	626738	626747	40 %	0 %	40 %	20 %	73748599
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11618	NC_007356	GA	3	6	626809	626814	50 %	0 %	50 %	0 %	73748599
11619	NC_007356	ACG	2	6	626857	626862	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	73748600
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11621	NC_007356	TAA	2	6	627027	627032	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	73748600
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11623	NC_007356	GCG	2	6	627077	627082	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	73748600
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11995	NC_007356	AT	3	6	648028	648033	50 %	50 %	0 %	0 %	73748623
11996	NC_007356	GCC	2	6	648052	648057	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	73748623
11997	NC_007356	AT	3	6	648099	648104	50 %	50 %	0 %	0 %	73748623
11998	NC_007356	G	6	6	648157	648162	0 %	0 %	100 %	0 %	73748623
11999	NC_007356	TCC	2	6	648163	648168	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	73748623
12000	NC_007356	TCA	2	6	648314	648319	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	73748623

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