MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Dehalococcoides sp. CBDB1 chromosome

Total Repeats: 25647

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_007356	GGT	2	6	26807	26812	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	73747984
502	NC_007356	GGC	2	6	26897	26902	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	73747984
503	NC_007356	CAG	2	6	26981	26986	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	73747984
504	NC_007356	TGA	2	6	27004	27009	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	73747984
505	NC_007356	CCAC	2	8	27084	27091	25 %	0 %	0 %	75 %	73747984
506	NC_007356	TTAT	2	8	27126	27133	25 %	75 %	0 %	0 %	73747984
507	NC_007356	TTTA	2	8	27142	27149	25 %	75 %	0 %	0 %	73747985
508	NC_007356	AAT	2	6	27236	27241	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	73747985
509	NC_007356	ATT	2	6	27248	27253	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	73747985
510	NC_007356	ACA	2	6	27258	27263	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	73747985
511	NC_007356	TGG	2	6	27271	27276	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	73747985
512	NC_007356	CCG	2	6	27393	27398	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	73747985
513	NC_007356	TAA	2	6	27430	27435	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	73747985
514	NC_007356	AAG	2	6	27487	27492	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	73747985
515	NC_007356	TTG	2	6	27495	27500	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	73747985
516	NC_007356	CGGT	2	8	27630	27637	0 %	25 %	50 %	25 %	73747985
517	NC_007356	ACC	2	6	27654	27659	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	73747985
518	NC_007356	GCC	2	6	27678	27683	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	73747985
519	NC_007356	T	6	6	27691	27696	0 %	100 %	0 %	0 %	73747985
520	NC_007356	ACA	2	6	27720	27725	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	73747985
521	NC_007356	CCA	2	6	27856	27861	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	73747985
522	NC_007356	CTT	2	6	27916	27921	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	73747985
523	NC_007356	CCA	2	6	27937	27942	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	73747985
524	NC_007356	ACTC	2	8	27964	27971	25 %	25 %	0 %	50 %	73747985
525	NC_007356	AGT	2	6	28226	28231	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	73747985
526	NC_007356	GGC	2	6	28232	28237	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	73747985
527	NC_007356	TCA	2	6	28278	28283	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	73747985
528	NC_007356	GGC	2	6	28349	28354	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	73747985
529	NC_007356	CAA	2	6	28420	28425	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	73747985
530	NC_007356	GCC	3	9	28481	28489	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	73747985
531	NC_007356	TC	3	6	28589	28594	0 %	50 %	0 %	50 %	73747986
532	NC_007356	ATG	2	6	28610	28615	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	73747986
533	NC_007356	TGA	2	6	28626	28631	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	73747986
534	NC_007356	GA	3	6	28630	28635	50 %	0 %	50 %	0 %	73747986
535	NC_007356	TCT	2	6	28650	28655	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	73747986
536	NC_007356	AT	3	6	28674	28679	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
537	NC_007356	GT	3	6	28714	28719	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
538	NC_007356	GCT	2	6	28753	28758	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
539	NC_007356	AAT	2	6	28763	28768	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
540	NC_007356	ATG	2	6	28783	28788	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
541	NC_007356	GTG	2	6	28798	28803	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	73747987
542	NC_007356	GAGG	2	8	28915	28922	25 %	0 %	75 %	0 %	73747987
543	NC_007356	GTC	2	6	28966	28971	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	73747987
544	NC_007356	AGC	2	6	29068	29073	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	73747987
545	NC_007356	ATA	2	6	29159	29164	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	73747987
546	NC_007356	TAT	2	6	29185	29190	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	73747987
547	NC_007356	TA	3	6	29211	29216	50 %	50 %	0 %	0 %	73747987
548	NC_007356	ACC	2	6	29219	29224	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	73747987
549	NC_007356	TAA	2	6	29235	29240	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	73747987
550	NC_007356	CGG	2	6	29265	29270	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	73747987
551	NC_007356	CAG	2	6	29356	29361	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	73747987
552	NC_007356	CCAG	2	8	29376	29383	25 %	0 %	25 %	50 %	73747987
553	NC_007356	ATTT	2	8	29386	29393	25 %	75 %	0 %	0 %	73747987
554	NC_007356	GGA	2	6	29396	29401	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	73747987
555	NC_007356	A	6	6	29427	29432	100 %	0 %	0 %	0 %	73747987
556	NC_007356	CCG	2	6	29630	29635	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	73747987
557	NC_007356	AGG	2	6	29648	29653	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	73747987
558	NC_007356	ATG	2	6	29654	29659	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	73747987
559	NC_007356	A	6	6	29664	29669	100 %	0 %	0 %	0 %	73747987
560	NC_007356	CAGTTT	2	12	29677	29688	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	73747987
561	NC_007356	T	7	7	29721	29727	0 %	100 %	0 %	0 %	73747987
562	NC_007356	ATT	2	6	29763	29768	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
563	NC_007356	AT	4	8	29833	29840	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
564	NC_007356	GAAA	2	8	29847	29854	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
565	NC_007356	AAAT	2	8	29855	29862	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
566	NC_007356	AGG	2	6	29879	29884	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
567	NC_007356	TAT	2	6	29903	29908	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	73747988
568	NC_007356	GGA	2	6	29915	29920	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	73747988
569	NC_007356	GAA	2	6	29951	29956	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	73747988
570	NC_007356	AGTT	2	8	29986	29993	25 %	50 %	25 %	0 %	73747988
571	NC_007356	GAT	2	6	30012	30017	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	73747988
572	NC_007356	CCA	2	6	30065	30070	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	73747988
573	NC_007356	TTGCT	2	10	30124	30133	0 %	60 %	20 %	20 %	73747988
574	NC_007356	GAT	2	6	30147	30152	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	73747988
575	NC_007356	ATTC	2	8	30165	30172	25 %	50 %	0 %	25 %	73747988
576	NC_007356	TTTA	2	8	30189	30196	25 %	75 %	0 %	0 %	73747988
577	NC_007356	GGC	2	6	30205	30210	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	73747988
578	NC_007356	GCC	2	6	30234	30239	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	73747988
579	NC_007356	ATT	2	6	30240	30245	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	73747988
580	NC_007356	GCTG	2	8	30248	30255	0 %	25 %	50 %	25 %	73747988
581	NC_007356	CAT	2	6	30416	30421	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	73747988
582	NC_007356	GAA	2	6	30506	30511	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	73747988
583	NC_007356	TCT	2	6	30537	30542	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	73747989
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585	NC_007356	TGGT	2	8	30614	30621	0 %	50 %	50 %	0 %	73747989
586	NC_007356	TAA	2	6	30650	30655	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	73747989
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588	NC_007356	TGG	2	6	30794	30799	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	73747989
589	NC_007356	TGG	2	6	30839	30844	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	73747989
590	NC_007356	ATT	2	6	30913	30918	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	73747989
591	NC_007356	TAT	2	6	30939	30944	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	73747989
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593	NC_007356	T	6	6	31025	31030	0 %	100 %	0 %	0 %	73747989
594	NC_007356	TAT	2	6	31104	31109	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	73747989
595	NC_007356	ATT	2	6	31171	31176	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	73747989
596	NC_007356	CGG	2	6	31215	31220	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	73747989
597	NC_007356	GCGT	2	8	31244	31251	0 %	25 %	50 %	25 %	73747989
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599	NC_007356	TTC	2	6	31359	31364	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	73747989
600	NC_007356	TAT	2	6	31368	31373	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	73747989
601	NC_007356	GCT	2	6	31443	31448	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	73747989
602	NC_007356	T	6	6	31476	31481	0 %	100 %	0 %	0 %	73747989
603	NC_007356	GTTT	2	8	31490	31497	0 %	75 %	25 %	0 %	73747989
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605	NC_007356	CGG	2	6	31708	31713	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	73747990
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611	NC_007356	TA	3	6	32001	32006	50 %	50 %	0 %	0 %	73747990
612	NC_007356	CAG	2	6	32085	32090	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	73747990
613	NC_007356	TTA	2	6	32104	32109	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	73747990
614	NC_007356	TCA	2	6	32123	32128	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	73747990
615	NC_007356	ACCGC	2	10	32144	32153	20 %	0 %	20 %	60 %	73747991
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619	NC_007356	AT	3	6	32446	32451	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
620	NC_007356	CAG	2	6	32583	32588	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
621	NC_007356	GTAT	2	8	32604	32611	25 %	50 %	25 %	0 %	73747992
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627	NC_007356	TCT	2	6	33021	33026	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	73747992
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