MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Desulfovibrio vulgaris str. Hildenborough chromosome

Total Repeats: 79621

< Previous12...148149150151152153154155156157158159160Next >

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
79501	NC_002937	GC	3	6	3564884	3564889	0 %	0 %	50 %	50 %	46581790
79502	NC_002937	AGG	3	9	3564940	3564948	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46581790
79503	NC_002937	GCC	2	6	3564962	3564967	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46581790
79504	NC_002937	AGG	2	6	3564973	3564978	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46581790
79505	NC_002937	GC	3	6	3565035	3565040	0 %	0 %	50 %	50 %	46581790
79506	NC_002937	CCGT	2	8	3565088	3565095	0 %	25 %	25 %	50 %	46581790
79507	NC_002937	CAT	2	6	3565109	3565114	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	46581790
79508	NC_002937	CTG	2	6	3565197	3565202	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	46581790
79509	NC_002937	GC	3	6	3565203	3565208	0 %	0 %	50 %	50 %	46581790
79510	NC_002937	CAC	2	6	3565214	3565219	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	46581790
79511	NC_002937	GGA	2	6	3565250	3565255	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46581790
79512	NC_002937	CTCG	2	8	3565256	3565263	0 %	25 %	25 %	50 %	46581790
79513	NC_002937	CGT	2	6	3565415	3565420	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	46581790
79514	NC_002937	CGA	2	6	3565499	3565504	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	46581790
79515	NC_002937	AAG	2	6	3565593	3565598	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	46581790
79516	NC_002937	GCAC	2	8	3565599	3565606	25 %	0 %	25 %	50 %	46581790
79517	NC_002937	GCC	2	6	3565645	3565650	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46581790
79518	NC_002937	TGG	2	6	3565708	3565713	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	46581790
79519	NC_002937	CGC	2	6	3565822	3565827	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46581790
79520	NC_002937	GAA	2	6	3565835	3565840	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	46581790
79521	NC_002937	CGA	3	9	3565910	3565918	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	46581790
79522	NC_002937	AGA	2	6	3565924	3565929	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	46581790
79523	NC_002937	AGA	2	6	3565993	3565998	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
79524	NC_002937	GAA	2	6	3566085	3566090	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
79525	NC_002937	CCA	2	6	3566103	3566108	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
79526	NC_002937	GAG	2	6	3566192	3566197	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	304569742
79527	NC_002937	CGC	2	6	3566215	3566220	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	304569742
79528	NC_002937	GAC	2	6	3566276	3566281	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	304569742
79529	NC_002937	ACCTGT	2	12	3566320	3566331	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	304569742
79530	NC_002937	TTC	2	6	3566357	3566362	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	304569742
79531	NC_002937	CAG	2	6	3566383	3566388	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	304569742
79532	NC_002937	CGC	2	6	3566391	3566396	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	304569742
79533	NC_002937	GCA	2	6	3566430	3566435	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	304569742
79534	NC_002937	CCG	2	6	3566438	3566443	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	304569742
79535	NC_002937	TGG	2	6	3566472	3566477	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	304569742
79536	NC_002937	GAA	2	6	3566512	3566517	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	304569742
79537	NC_002937	CCG	2	6	3566540	3566545	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	304569742
79538	NC_002937	GTCC	2	8	3566607	3566614	0 %	25 %	25 %	50 %	304569742
79539	NC_002937	CT	3	6	3566633	3566638	0 %	50 %	0 %	50 %	304569742
79540	NC_002937	TCA	2	6	3566667	3566672	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	304569742
79541	NC_002937	GGC	2	6	3566692	3566697	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	304569742
79542	NC_002937	CAC	2	6	3566772	3566777	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
79543	NC_002937	GCGA	2	8	3566816	3566823	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
79544	NC_002937	CGG	2	6	3566832	3566837	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
79545	NC_002937	CTG	2	6	3566856	3566861	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
79546	NC_002937	CGG	2	6	3566877	3566882	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
79547	NC_002937	GCACG	2	10	3566889	3566898	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
79548	NC_002937	GCA	2	6	3566943	3566948	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
79549	NC_002937	CCG	2	6	3566972	3566977	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
79550	NC_002937	ATG	2	6	3566994	3566999	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
79551	NC_002937	CGG	2	6	3567046	3567051	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
79552	NC_002937	CA	3	6	3567105	3567110	50 %	0 %	0 %	50 %	46581792
79553	NC_002937	AAC	2	6	3567146	3567151	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	46581792
79554	NC_002937	AGC	2	6	3567185	3567190	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	46581792
79555	NC_002937	GCCT	2	8	3567199	3567206	0 %	25 %	25 %	50 %	46581792
79556	NC_002937	CAG	2	6	3567221	3567226	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	46581792
79557	NC_002937	AAC	2	6	3567300	3567305	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	46581792
79558	NC_002937	C	7	7	3567316	3567322	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
79559	NC_002937	AAT	2	6	3567344	3567349	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
79560	NC_002937	ACG	2	6	3567376	3567381	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
79561	NC_002937	AC	3	6	3567397	3567402	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
79562	NC_002937	GGAG	2	8	3567464	3567471	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
79563	NC_002937	CGA	2	6	3567506	3567511	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	46581793
79564	NC_002937	CCGTG	2	10	3567518	3567527	0 %	20 %	40 %	40 %	46581793
79565	NC_002937	TCG	2	6	3567562	3567567	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	46581793
79566	NC_002937	GCC	2	6	3567618	3567623	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46581793
79567	NC_002937	TGG	2	6	3567691	3567696	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	46581793
79568	NC_002937	CCA	2	6	3567709	3567714	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	46581793
79569	NC_002937	GCC	2	6	3567843	3567848	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46581793
79570	NC_002937	TTC	4	12	3567888	3567899	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	46581793
79571	NC_002937	GCGG	2	8	3567930	3567937	0 %	0 %	75 %	25 %	46581793
79572	NC_002937	C	7	7	3567951	3567957	0 %	0 %	0 %	100 %	46581793
79573	NC_002937	ACG	2	6	3567970	3567975	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	46581793
79574	NC_002937	CAT	2	6	3567986	3567991	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	46581793
79575	NC_002937	CAC	2	6	3568032	3568037	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	46581793
79576	NC_002937	GCA	2	6	3568052	3568057	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	46581793
79577	NC_002937	GCAT	2	8	3568201	3568208	25 %	25 %	25 %	25 %	46581793
79578	NC_002937	CTT	2	6	3568244	3568249	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	46581793
79579	NC_002937	CTG	2	6	3568328	3568333	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	46581793
79580	NC_002937	ACCA	2	8	3568338	3568345	50 %	0 %	0 %	50 %	46581793
79581	NC_002937	GCAAC	2	10	3568409	3568418	40 %	0 %	20 %	40 %	46581793
79582	NC_002937	AAC	2	6	3568560	3568565	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	46581793
79583	NC_002937	GCC	2	6	3568665	3568670	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46581793
79584	NC_002937	GAC	2	6	3568758	3568763	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	46581793
79585	NC_002937	C	6	6	3568823	3568828	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
79586	NC_002937	AGC	2	6	3568915	3568920	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	46581794
79587	NC_002937	GC	3	6	3568962	3568967	0 %	0 %	50 %	50 %	46581794
79588	NC_002937	CCG	2	6	3568997	3569002	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46581794
79589	NC_002937	TGA	2	6	3569009	3569014	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	46581794
79590	NC_002937	ATG	2	6	3569043	3569048	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	46581794
79591	NC_002937	AGC	2	6	3569170	3569175	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	46581795
79592	NC_002937	AAG	2	6	3569193	3569198	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	46581795
79593	NC_002937	CA	3	6	3569216	3569221	50 %	0 %	0 %	50 %	46581795
79594	NC_002937	GA	3	6	3569232	3569237	50 %	0 %	50 %	0 %	46581795
79595	NC_002937	CCG	2	6	3569245	3569250	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46581795
79596	NC_002937	ACA	2	6	3569284	3569289	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
79597	NC_002937	GTG	2	6	3569366	3569371	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
79598	NC_002937	CGT	2	6	3569399	3569404	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	46581796
79599	NC_002937	CTT	2	6	3569506	3569511	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	46581796
79600	NC_002937	TCA	2	6	3569535	3569540	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	46581796
79601	NC_002937	GA	3	6	3569684	3569689	50 %	0 %	50 %	0 %	46581796
79602	NC_002937	CCG	2	6	3569714	3569719	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46581796
79603	NC_002937	TTC	2	6	3569870	3569875	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	46581796
79604	NC_002937	TTG	2	6	3569948	3569953	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	46581796
79605	NC_002937	TAG	2	6	3569954	3569959	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	46581796
79606	NC_002937	TCG	2	6	3569975	3569980	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	46581796
79607	NC_002937	GCG	2	6	3570026	3570031	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46581796
79608	NC_002937	CG	3	6	3570228	3570233	0 %	0 %	50 %	50 %	46581796
79609	NC_002937	ATGG	2	8	3570250	3570257	25 %	25 %	50 %	0 %	46581796
79610	NC_002937	GTC	3	9	3570316	3570324	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	46581796
79611	NC_002937	TGG	2	6	3570357	3570362	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	46581796
79612	NC_002937	GAC	2	6	3570502	3570507	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	46581796
79613	NC_002937	GCT	2	6	3570531	3570536	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	46581796
79614	NC_002937	AGG	2	6	3570613	3570618	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46581796
79615	NC_002937	GCGA	2	8	3570627	3570634	25 %	0 %	50 %	25 %	46581796
79616	NC_002937	AGCC	2	8	3570680	3570687	25 %	0 %	25 %	50 %	46581796
79617	NC_002937	AAC	2	6	3570747	3570752	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
79618	NC_002937	AGG	2	6	3570772	3570777	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
79619	NC_002937	GCGG	2	8	3570782	3570789	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
79620	NC_002937	GAG	2	6	3570808	3570813	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
79621	NC_002937	GCC	2	6	3570820	3570825	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding

< Previous12...148149150151152153154155156157158159160Next >

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.