MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Deinococcus radiodurans R1 chromosome 2

Total Repeats: 10587

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
10501	NC_001264	AGC	2	6	407905	407910	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15808024
10502	NC_001264	GTG	2	6	407925	407930	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15808024
10503	NC_001264	GCCA	2	8	407941	407948	25 %	0 %	25 %	50 %	15808024
10504	NC_001264	CG	3	6	408000	408005	0 %	0 %	50 %	50 %	15808024
10505	NC_001264	CG	3	6	408026	408031	0 %	0 %	50 %	50 %	15808024
10506	NC_001264	GTC	2	6	408058	408063	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15808024
10507	NC_001264	GCGA	2	8	408101	408108	25 %	0 %	50 %	25 %	15808024
10508	NC_001264	CGC	2	6	408112	408117	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15808024
10509	NC_001264	GCG	2	6	408233	408238	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15808025
10510	NC_001264	CCA	2	6	408259	408264	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15808025
10511	NC_001264	TGT	2	6	408274	408279	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15808025
10512	NC_001264	GGC	2	6	408298	408303	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15808025
10513	NC_001264	GCG	2	6	408324	408329	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15808025
10514	NC_001264	AGCG	2	8	408332	408339	25 %	0 %	50 %	25 %	15808025
10515	NC_001264	CTT	2	6	408347	408352	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15808025
10516	NC_001264	TAG	2	6	408387	408392	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15808025
10517	NC_001264	CTGGT	2	10	408429	408438	0 %	40 %	40 %	20 %	15808025
10518	NC_001264	GCA	2	6	408520	408525	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15808025
10519	NC_001264	GCT	2	6	408695	408700	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15808025
10520	NC_001264	A	6	6	408863	408868	100 %	0 %	0 %	0 %	15808025
10521	NC_001264	TTG	2	6	408870	408875	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15808025
10522	NC_001264	ACC	2	6	408900	408905	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15808025
10523	NC_001264	GAA	2	6	408953	408958	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15808025
10524	NC_001264	GCC	2	6	409075	409080	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15808025
10525	NC_001264	CGT	3	9	409168	409176	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15808025
10526	NC_001264	GCC	2	6	409193	409198	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15808025
10527	NC_001264	TG	3	6	409201	409206	0 %	50 %	50 %	0 %	15808025
10528	NC_001264	GCT	2	6	409238	409243	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15808025
10529	NC_001264	CTGC	2	8	409266	409273	0 %	25 %	25 %	50 %	15808025
10530	NC_001264	TGT	2	6	409317	409322	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15808025
10531	NC_001264	TCGT	2	8	409323	409330	0 %	50 %	25 %	25 %	15808025
10532	NC_001264	TCGT	2	8	409353	409360	0 %	50 %	25 %	25 %	15808025
10533	NC_001264	GGGGCC	2	12	409402	409413	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15808026
10534	NC_001264	CTG	2	6	409419	409424	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15808026
10535	NC_001264	CGC	2	6	409446	409451	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15808026
10536	NC_001264	GCT	2	6	409508	409513	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15808026
10537	NC_001264	TGC	2	6	409551	409556	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15808026
10538	NC_001264	GGC	2	6	409563	409568	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15808026
10539	NC_001264	TC	3	6	409604	409609	0 %	50 %	0 %	50 %	15808026
10540	NC_001264	TCACG	2	10	409628	409637	20 %	20 %	20 %	40 %	15808026
10541	NC_001264	ACC	2	6	409651	409656	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15808026
10542	NC_001264	CGCC	2	8	409661	409668	0 %	0 %	25 %	75 %	15808026
10543	NC_001264	TGA	2	6	409697	409702	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15808026
10544	NC_001264	GCA	2	6	409730	409735	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15808026
10545	NC_001264	TCT	2	6	409781	409786	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15808026
10546	NC_001264	CGG	2	6	409823	409828	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15808026
10547	NC_001264	ACC	2	6	409840	409845	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15808026
10548	NC_001264	CAG	2	6	409851	409856	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15808026
10549	NC_001264	GCG	3	9	409875	409883	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15808026
10550	NC_001264	TCG	2	6	409918	409923	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15808026
10551	NC_001264	GACGCG	2	12	409943	409954	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	15808026
10552	NC_001264	CCG	2	6	410083	410088	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15808026
10553	NC_001264	TGC	2	6	410119	410124	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15808026
10554	NC_001264	GAG	2	6	410144	410149	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15808026
10555	NC_001264	CGC	2	6	410211	410216	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15808026
10556	NC_001264	AGC	2	6	410290	410295	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15808026
10557	NC_001264	CG	3	6	410296	410301	0 %	0 %	50 %	50 %	15808026
10558	NC_001264	CTG	2	6	410318	410323	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15808026
10559	NC_001264	CGC	2	6	410363	410368	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15808026
10560	NC_001264	A	6	6	410427	410432	100 %	0 %	0 %	0 %	15808026
10561	NC_001264	CGG	2	6	410437	410442	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15808026
10562	NC_001264	GCG	2	6	410449	410454	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15808026
10563	NC_001264	TCA	2	6	410459	410464	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15808026
10564	NC_001264	CCT	2	6	410559	410564	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15808026
10565	NC_001264	G	6	6	410593	410598	0 %	0 %	100 %	0 %	15808026
10566	NC_001264	CAGG	3	12	410777	410788	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
10567	NC_001264	ACTG	2	8	410840	410847	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
10568	NC_001264	CGC	2	6	410962	410967	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10569	NC_001264	GAGC	2	8	410979	410986	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
10570	NC_001264	GCAG	2	8	411006	411013	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
10571	NC_001264	GCG	2	6	411121	411126	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15808027
10572	NC_001264	CCG	2	6	411149	411154	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15808027
10573	NC_001264	TCG	2	6	411157	411162	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15808027
10574	NC_001264	CTT	2	6	411230	411235	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15808027
10575	NC_001264	TCG	2	6	411274	411279	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15808027
10576	NC_001264	CAG	2	6	411300	411305	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15808027
10577	NC_001264	AGTC	2	8	411377	411384	25 %	25 %	25 %	25 %	15808027
10578	NC_001264	C	6	6	411462	411467	0 %	0 %	0 %	100 %	15808027
10579	NC_001264	GTC	2	6	411849	411854	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15808027
10580	NC_001264	CCG	2	6	411908	411913	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15808027
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10582	NC_001264	CGT	2	6	412001	412006	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15808027
10583	NC_001264	GT	3	6	412012	412017	0 %	50 %	50 %	0 %	15808027
10584	NC_001264	CGC	2	6	412024	412029	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15808027
10585	NC_001264	GTC	2	6	412099	412104	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15808027
10586	NC_001264	GAGC	2	8	412289	412296	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
10587	NC_001264	TCG	2	6	412324	412329	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding

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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.