MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Deinococcus radiodurans R1 chromosome 1

Total Repeats: 68158

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_001263	A	6	6	158959	158964	100 %	0 %	0 %	0 %	15805194
4002	NC_001263	A	7	7	158986	158992	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4003	NC_001263	CGGG	2	8	159032	159039	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
4004	NC_001263	AG	3	6	159061	159066	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4005	NC_001263	GTC	2	6	159069	159074	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4006	NC_001263	CTG	2	6	159108	159113	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4007	NC_001263	AGC	2	6	159134	159139	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4008	NC_001263	GCG	2	6	159150	159155	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15805195
4009	NC_001263	GGA	2	6	159159	159164	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15805195
4010	NC_001263	GC	3	6	159195	159200	0 %	0 %	50 %	50 %	15805195
4011	NC_001263	GCT	2	6	159218	159223	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15805195
4012	NC_001263	CAC	2	6	159225	159230	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15805195
4013	NC_001263	GCG	2	6	159247	159252	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15805195
4014	NC_001263	GCCA	2	8	159281	159288	25 %	0 %	25 %	50 %	15805195
4015	NC_001263	GAG	2	6	159318	159323	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15805195
4016	NC_001263	GCG	2	6	159334	159339	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15805195
4017	NC_001263	GGC	2	6	159371	159376	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15805195
4018	NC_001263	CGG	3	9	159395	159403	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15805195
4019	NC_001263	TGC	2	6	159412	159417	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15805195
4020	NC_001263	CG	3	6	159468	159473	0 %	0 %	50 %	50 %	15805195
4021	NC_001263	GGC	2	6	159478	159483	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15805195
4022	NC_001263	GCA	2	6	159488	159493	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15805195
4023	NC_001263	GTG	2	6	159507	159512	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15805195
4024	NC_001263	CGCC	2	8	159535	159542	0 %	0 %	25 %	75 %	15805195
4025	NC_001263	CGCC	2	8	159568	159575	0 %	0 %	25 %	75 %	15805195
4026	NC_001263	GGC	3	9	159638	159646	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15805195
4027	NC_001263	GCA	2	6	159728	159733	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15805195
4028	NC_001263	GGT	2	6	159821	159826	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15805195
4029	NC_001263	CGTGC	2	10	159848	159857	0 %	20 %	40 %	40 %	15805195
4030	NC_001263	GCC	2	6	159922	159927	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15805195
4031	NC_001263	CAC	2	6	159945	159950	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15805195
4032	NC_001263	CGGCG	2	10	159960	159969	0 %	0 %	60 %	40 %	15805195
4033	NC_001263	CAT	2	6	159992	159997	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15805195
4034	NC_001263	CGG	2	6	160024	160029	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15805195
4035	NC_001263	CGG	2	6	160039	160044	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15805195
4036	NC_001263	CAT	2	6	160100	160105	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15805195
4037	NC_001263	GCC	2	6	160130	160135	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15805195
4038	NC_001263	GGCG	2	8	160234	160241	0 %	0 %	75 %	25 %	15805196
4039	NC_001263	CCG	2	6	160270	160275	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15805196
4040	NC_001263	ACT	2	6	160326	160331	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15805196
4041	NC_001263	ACC	2	6	160383	160388	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15805196
4042	NC_001263	CCG	2	6	160389	160394	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15805196
4043	NC_001263	GCT	2	6	160408	160413	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15805196
4044	NC_001263	AGC	2	6	160419	160424	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15805196
4045	NC_001263	GCT	2	6	160432	160437	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15805196
4046	NC_001263	CGC	2	6	160489	160494	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15805196
4047	NC_001263	CAC	2	6	160498	160503	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15805196
4048	NC_001263	TGC	2	6	160509	160514	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15805196
4049	NC_001263	GTG	3	9	160523	160531	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15805196
4050	NC_001263	T	6	6	160541	160546	0 %	100 %	0 %	0 %	15805196
4051	NC_001263	ACG	2	6	160554	160559	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15805196
4052	NC_001263	GACGCC	2	12	160598	160609	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	15805196
4053	NC_001263	CTG	2	6	160631	160636	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15805196
4054	NC_001263	ACGC	2	8	160657	160664	25 %	0 %	25 %	50 %	15805196
4055	NC_001263	ATT	2	6	160751	160756	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15805196
4056	NC_001263	CGG	2	6	160762	160767	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15805196
4057	NC_001263	GAAC	2	8	160771	160778	50 %	0 %	25 %	25 %	15805196
4058	NC_001263	CGC	2	6	160795	160800	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15805196
4059	NC_001263	TTCA	2	8	160887	160894	25 %	50 %	0 %	25 %	15805197
4060	NC_001263	GGT	2	6	160944	160949	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15805197
4061	NC_001263	CCGGC	2	10	160955	160964	0 %	0 %	40 %	60 %	15805197
4062	NC_001263	GCC	3	9	160980	160988	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15805197
4063	NC_001263	CGC	2	6	161006	161011	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15805197
4064	NC_001263	TGC	2	6	161012	161017	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15805197
4065	NC_001263	TC	3	6	161031	161036	0 %	50 %	0 %	50 %	15805197
4066	NC_001263	GGCGC	2	10	161136	161145	0 %	0 %	60 %	40 %	15805197
4067	NC_001263	GCT	2	6	161166	161171	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15805197
4068	NC_001263	GCA	2	6	161235	161240	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15805197
4069	NC_001263	GCG	2	6	161243	161248	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15805197
4070	NC_001263	GGT	2	6	161331	161336	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15805197
4071	NC_001263	CG	3	6	161361	161366	0 %	0 %	50 %	50 %	15805197
4072	NC_001263	CCCA	2	8	161377	161384	25 %	0 %	0 %	75 %	15805197
4073	NC_001263	CACGGT	2	12	161385	161396	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	15805197
4074	NC_001263	GGC	2	6	161398	161403	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15805197
4075	NC_001263	CCG	2	6	161444	161449	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15805197
4076	NC_001263	ACG	2	6	161516	161521	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15805197
4077	NC_001263	CCG	2	6	161558	161563	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15805197
4078	NC_001263	CGA	2	6	161583	161588	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15805197
4079	NC_001263	CG	3	6	161635	161640	0 %	0 %	50 %	50 %	15805197
4080	NC_001263	CGG	2	6	161657	161662	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15805197
4081	NC_001263	CGG	2	6	161712	161717	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15805197
4082	NC_001263	GAA	2	6	161767	161772	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15805197
4083	NC_001263	CGC	2	6	161793	161798	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15805197
4084	NC_001263	CAGC	2	8	161808	161815	25 %	0 %	25 %	50 %	15805197
4085	NC_001263	AACGA	2	10	161848	161857	60 %	0 %	20 %	20 %	15805197
4086	NC_001263	TGA	2	6	161885	161890	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15805197
4087	NC_001263	AGCCC	2	10	161936	161945	20 %	0 %	20 %	60 %	15805197
4088	NC_001263	TGC	2	6	161948	161953	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15805197
4089	NC_001263	GCTG	2	8	161954	161961	0 %	25 %	50 %	25 %	15805197
4090	NC_001263	CAT	2	6	161964	161969	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15805197
4091	NC_001263	GCT	3	9	161985	161993	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15805197
4092	NC_001263	GCG	2	6	162015	162020	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15805197
4093	NC_001263	CGGCG	2	10	162033	162042	0 %	0 %	60 %	40 %	15805197
4094	NC_001263	GCT	3	9	162048	162056	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15805197
4095	NC_001263	ACGCC	2	10	162074	162083	20 %	0 %	20 %	60 %	15805197
4096	NC_001263	TCG	2	6	162101	162106	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15805197
4097	NC_001263	CCG	2	6	162107	162112	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15805197
4098	NC_001263	GCT	3	9	162132	162140	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15805197
4099	NC_001263	GCG	2	6	162141	162146	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15805197
4100	NC_001263	TCG	2	6	162188	162193	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15805197
4101	NC_001263	CGT	2	6	162195	162200	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15805197
4102	NC_001263	CGTGG	2	10	162256	162265	0 %	20 %	60 %	20 %	15805197
4103	NC_001263	GCT	3	9	162273	162281	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15805197
4104	NC_001263	GCT	2	6	162402	162407	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15805197
4105	NC_001263	CGC	2	6	162424	162429	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15805197
4106	NC_001263	GGC	2	6	162442	162447	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15805197
4107	NC_001263	CGC	2	6	162522	162527	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15805197
4108	NC_001263	TGC	2	6	162587	162592	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15805197
4109	NC_001263	CGG	2	6	162594	162599	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15805197
4110	NC_001263	GCT	2	6	162671	162676	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15805197
4111	NC_001263	TCTGGG	2	12	162678	162689	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	15805197
4112	NC_001263	GCT	3	9	162708	162716	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15805197
4113	NC_001263	CGG	2	6	162770	162775	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15805197
4114	NC_001263	GC	4	8	162801	162808	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4115	NC_001263	GTC	2	6	162818	162823	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15805198
4116	NC_001263	TAC	2	6	162830	162835	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15805198
4117	NC_001263	CGA	2	6	162853	162858	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15805198
4118	NC_001263	TGC	2	6	162912	162917	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15805198
4119	NC_001263	CGG	2	6	162930	162935	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15805198
4120	NC_001263	CTG	2	6	163001	163006	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15805198
4121	NC_001263	CTG	2	6	163016	163021	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15805198
4122	NC_001263	GCG	3	9	163029	163037	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15805198
4123	NC_001263	CAAGA	2	10	163046	163055	60 %	0 %	20 %	20 %	15805198
4124	NC_001263	AGC	2	6	163058	163063	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15805198
4125	NC_001263	GCT	2	6	163105	163110	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15805198
4126	NC_001263	GCG	2	6	163165	163170	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15805198
4127	NC_001263	GCG	2	6	163191	163196	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15805198
4128	NC_001263	CGT	2	6	163204	163209	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15805198
4129	NC_001263	CG	3	6	163255	163260	0 %	0 %	50 %	50 %	15805198
4130	NC_001263	CGG	2	6	163264	163269	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15805198
4131	NC_001263	GCT	3	9	163279	163287	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15805198
4132	NC_001263	CGG	2	6	163296	163301	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15805198
4133	NC_001263	CG	3	6	163338	163343	0 %	0 %	50 %	50 %	15805198
4134	NC_001263	C	6	6	163365	163370	0 %	0 %	0 %	100 %	15805198
4135	NC_001263	GCT	2	6	163387	163392	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15805198
4136	NC_001263	GCG	2	6	163405	163410	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15805198
4137	NC_001263	GAC	2	6	163442	163447	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15805198
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4139	NC_001263	CGCT	2	8	163457	163464	0 %	25 %	25 %	50 %	15805198
4140	NC_001263	GCC	2	6	163469	163474	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15805198
4141	NC_001263	GCC	4	12	163568	163579	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15805198
4142	NC_001263	CGA	2	6	163630	163635	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15805198
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4144	NC_001263	CGC	2	6	163669	163674	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15805198
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4146	NC_001263	GGC	3	9	163838	163846	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15805199
4147	NC_001263	TGC	2	6	163907	163912	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15805199
4148	NC_001263	CGG	2	6	163988	163993	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15805199
4149	NC_001263	TGA	2	6	164027	164032	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15805199
4150	NC_001263	CGG	2	6	164061	164066	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15805199
4151	NC_001263	CAG	2	6	164082	164087	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15805199
4152	NC_001263	CAA	2	6	164253	164258	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15805199
4153	NC_001263	ATG	2	6	164272	164277	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15805199
4154	NC_001263	CTG	2	6	164278	164283	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15805199
4155	NC_001263	TCA	2	6	164309	164314	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15805199
4156	NC_001263	GAGCC	2	10	164339	164348	20 %	0 %	40 %	40 %	15805199
4157	NC_001263	CCTA	2	8	164349	164356	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
4158	NC_001263	AGCC	2	8	164360	164367	25 %	0 %	25 %	50 %	15805200
4159	NC_001263	CGC	2	6	164387	164392	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15805200
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4161	NC_001263	TACCG	2	10	164414	164423	20 %	20 %	20 %	40 %	15805200
4162	NC_001263	GCT	2	6	164437	164442	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15805200
4163	NC_001263	CTG	2	6	164444	164449	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15805200
4164	NC_001263	GCC	2	6	164462	164467	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15805200
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4168	NC_001263	CGG	2	6	164539	164544	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15805200
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4171	NC_001263	TGC	2	6	164607	164612	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15805200
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4173	NC_001263	GCAGTC	2	12	164671	164682	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	15805200
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4182	NC_001263	TCG	2	6	165117	165122	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15805200
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4193	NC_001263	GCT	2	6	165535	165540	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15805200
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4196	NC_001263	GGA	2	6	165730	165735	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15805200
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4200	NC_001263	CAGCGC	2	12	165833	165844	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	15805200
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4203	NC_001263	GCT	4	12	165880	165891	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15805200
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4210	NC_001263	GCT	2	6	166069	166074	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15805200
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4213	NC_001263	TG	3	6	166185	166190	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4214	NC_001263	TGC	2	6	166335	166340	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15805201
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4225	NC_001263	GACC	2	8	166702	166709	25 %	0 %	25 %	50 %	15805201
4226	NC_001263	CGA	2	6	166720	166725	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15805201
4227	NC_001263	GGC	2	6	166760	166765	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15805201
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4230	NC_001263	GCG	2	6	166866	166871	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15805201
4231	NC_001263	GGCT	2	8	166904	166911	0 %	25 %	50 %	25 %	15805201
4232	NC_001263	TCC	2	6	166971	166976	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15805201
4233	NC_001263	GCC	2	6	166992	166997	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15805201
4234	NC_001263	TGG	2	6	167001	167006	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15805201
4235	NC_001263	GTAC	2	8	167071	167078	25 %	25 %	25 %	25 %	15805201
4236	NC_001263	TCG	2	6	167181	167186	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15805201
4237	NC_001263	GTG	2	6	167231	167236	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15805201
4238	NC_001263	CAA	2	6	167241	167246	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4239	NC_001263	A	6	6	167245	167250	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4240	NC_001263	CTT	2	6	167274	167279	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4241	NC_001263	T	6	6	167278	167283	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4242	NC_001263	CAGC	2	8	167295	167302	25 %	0 %	25 %	50 %	15805202
4243	NC_001263	CCAG	2	8	167306	167313	25 %	0 %	25 %	50 %	15805202
4244	NC_001263	GGCC	2	8	167350	167357	0 %	0 %	50 %	50 %	15805202
4245	NC_001263	GCG	2	6	167428	167433	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15805202
4246	NC_001263	GGT	2	6	167465	167470	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15805202
4247	NC_001263	TCG	2	6	167584	167589	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15805202
4248	NC_001263	CGAA	2	8	167624	167631	50 %	0 %	25 %	25 %	15805202
4249	NC_001263	CGGT	2	8	167650	167657	0 %	25 %	50 %	25 %	15805202
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4370	NC_001263	TGG	2	6	172530	172535	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15805207
4371	NC_001263	GCTG	2	8	172628	172635	0 %	25 %	50 %	25 %	15805208
4372	NC_001263	GCG	2	6	172644	172649	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15805208
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4397	NC_001263	CTC	2	6	174120	174125	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15807620
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4399	NC_001263	TCG	2	6	174187	174192	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15807620
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4403	NC_001263	CTG	2	6	174309	174314	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15807620
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4432	NC_001263	C	6	6	175494	175499	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
4433	NC_001263	CGT	2	6	175510	175515	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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4435	NC_001263	C	6	6	175528	175533	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
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4445	NC_001263	AGCA	2	8	175824	175831	50 %	0 %	25 %	25 %	161579494
4446	NC_001263	TGC	2	6	175867	175872	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161579494
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4494	NC_001263	GC	3	6	177734	177739	0 %	0 %	50 %	50 %	15805212
4495	NC_001263	GC	3	6	177766	177771	0 %	0 %	50 %	50 %	15805212
4496	NC_001263	GGC	2	6	177799	177804	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15805212
4497	NC_001263	AGA	2	6	177836	177841	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15805212
4498	NC_001263	CGC	2	6	177893	177898	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15805212
4499	NC_001263	TGAG	2	8	177958	177965	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
4500	NC_001263	C	6	6	177966	177971	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding

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