MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Deinococcus radiodurans R1 chromosome 1

Total Repeats: 68158

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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63002	NC_001263	TGG	2	6	2451631	2451636	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15807440
63003	NC_001263	CCG	2	6	2451657	2451662	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15807440
63004	NC_001263	GTG	2	6	2451684	2451689	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15807440
63005	NC_001263	GGGC	2	8	2451752	2451759	0 %	0 %	75 %	25 %	15807440
63006	NC_001263	TCA	2	6	2451802	2451807	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15807440
63007	NC_001263	TGG	2	6	2451853	2451858	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15807440
63008	NC_001263	GCCGC	2	10	2451865	2451874	0 %	0 %	40 %	60 %	15807440
63009	NC_001263	GACG	2	8	2451983	2451990	25 %	0 %	50 %	25 %	15807440
63010	NC_001263	CTG	2	6	2452029	2452034	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15807440
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63012	NC_001263	GCC	2	6	2452095	2452100	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15807440
63013	NC_001263	CTC	2	6	2452202	2452207	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15807440
63014	NC_001263	GC	3	6	2452235	2452240	0 %	0 %	50 %	50 %	15807440
63015	NC_001263	CGG	2	6	2452254	2452259	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15807440
63016	NC_001263	GCC	2	6	2452272	2452277	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15807440
63017	NC_001263	CGA	2	6	2452328	2452333	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15807440
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63020	NC_001263	CCG	2	6	2452498	2452503	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15807440
63021	NC_001263	AAGGC	2	10	2452558	2452567	40 %	0 %	40 %	20 %	15807440
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63024	NC_001263	CGCC	2	8	2452636	2452643	0 %	0 %	25 %	75 %	15807440
63025	NC_001263	GCG	2	6	2452723	2452728	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15807440
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63033	NC_001263	CTGT	2	8	2452959	2452966	0 %	50 %	25 %	25 %	15807440
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63035	NC_001263	CAG	2	6	2453272	2453277	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15807442
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63049	NC_001263	GTCG	2	8	2453772	2453779	0 %	25 %	50 %	25 %	15807443
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63052	NC_001263	GCG	2	6	2453927	2453932	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
63053	NC_001263	GAA	2	6	2453954	2453959	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15807444
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63055	NC_001263	CGGT	2	8	2453990	2453997	0 %	25 %	50 %	25 %	15807444
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63068	NC_001263	GCC	2	6	2454385	2454390	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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63101	NC_001263	GCAG	2	8	2455670	2455677	25 %	0 %	50 %	25 %	15807448
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63118	NC_001263	TGA	2	6	2456399	2456404	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15807448
63119	NC_001263	TGC	2	6	2456411	2456416	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15807448
63120	NC_001263	CAC	2	6	2456427	2456432	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15807448
63121	NC_001263	GGC	2	6	2456466	2456471	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15807448
63122	NC_001263	GC	3	6	2456470	2456475	0 %	0 %	50 %	50 %	15807448
63123	NC_001263	CGG	2	6	2456531	2456536	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15807448
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63125	NC_001263	G	6	6	2456670	2456675	0 %	0 %	100 %	0 %	15807448
63126	NC_001263	CGC	2	6	2456721	2456726	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15807448
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63129	NC_001263	C	6	6	2456894	2456899	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
63130	NC_001263	GCG	2	6	2456930	2456935	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
63131	NC_001263	GCGCG	2	10	2456990	2456999	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
63132	NC_001263	CCG	2	6	2457013	2457018	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
63133	NC_001263	CCT	2	6	2457083	2457088	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
63134	NC_001263	GCA	2	6	2457188	2457193	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15807449
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63149	NC_001263	GCC	2	6	2457694	2457699	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15807449
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63179	NC_001263	AGG	2	6	2458935	2458940	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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63181	NC_001263	C	7	7	2459002	2459008	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
63182	NC_001263	AGG	2	6	2459010	2459015	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
63183	NC_001263	GGC	2	6	2459047	2459052	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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63218	NC_001263	CGA	3	9	2460302	2460310	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15807451
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63221	NC_001263	GCC	2	6	2460342	2460347	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15807451
63222	NC_001263	CGT	2	6	2460371	2460376	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15807451
63223	NC_001263	C	6	6	2460413	2460418	0 %	0 %	0 %	100 %	15807451
63224	NC_001263	TCAAGG	2	12	2460442	2460453	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	15807451
63225	NC_001263	GAA	2	6	2460507	2460512	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15807451
63226	NC_001263	T	6	6	2460575	2460580	0 %	100 %	0 %	0 %	15807451
63227	NC_001263	CG	3	6	2460661	2460666	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
63228	NC_001263	CGC	2	6	2460674	2460679	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
63229	NC_001263	GCA	2	6	2460694	2460699	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
63230	NC_001263	TGG	2	6	2460716	2460721	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
63231	NC_001263	CT	3	6	2460751	2460756	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
63232	NC_001263	GGT	2	6	2460809	2460814	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15807452
63233	NC_001263	ACCG	2	8	2460819	2460826	25 %	0 %	25 %	50 %	15807452
63234	NC_001263	CGG	2	6	2460877	2460882	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15807452
63235	NC_001263	CCACGC	2	12	2460899	2460910	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	15807452
63236	NC_001263	CAT	2	6	2460917	2460922	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15807452
63237	NC_001263	GGT	2	6	2460953	2460958	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15807452
63238	NC_001263	GCA	2	6	2460977	2460982	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15807452
63239	NC_001263	AAGGC	2	10	2461090	2461099	40 %	0 %	40 %	20 %	15807452
63240	NC_001263	GAA	2	6	2461125	2461130	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15807452
63241	NC_001263	CCA	2	6	2461138	2461143	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15807452
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63243	NC_001263	CGC	2	6	2461174	2461179	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15807452
63244	NC_001263	CGG	2	6	2461192	2461197	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15807452
63245	NC_001263	CAT	2	6	2461199	2461204	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15807452
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63247	NC_001263	CGG	2	6	2461253	2461258	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15807452
63248	NC_001263	GCT	2	6	2461259	2461264	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15807452
63249	NC_001263	CACT	2	8	2461308	2461315	25 %	25 %	0 %	50 %	15807452
63250	NC_001263	CGC	2	6	2461339	2461344	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15807452
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63252	NC_001263	GCC	4	12	2461395	2461406	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15807452
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63254	NC_001263	GCA	2	6	2461459	2461464	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15807452
63255	NC_001263	CGG	2	6	2461484	2461489	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15807452
63256	NC_001263	GGC	2	6	2461649	2461654	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15807452
63257	NC_001263	GTG	2	6	2461677	2461682	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15807452
63258	NC_001263	GAC	2	6	2461701	2461706	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15807452
63259	NC_001263	CCG	2	6	2461780	2461785	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15807452
63260	NC_001263	CGGCG	2	10	2461841	2461850	0 %	0 %	60 %	40 %	15807452
63261	NC_001263	CACC	2	8	2461911	2461918	25 %	0 %	0 %	75 %	15807452
63262	NC_001263	GCG	2	6	2461960	2461965	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15807453
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63266	NC_001263	GCATCG	2	12	2462100	2462111	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	15807453
63267	NC_001263	CCT	2	6	2462113	2462118	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15807453
63268	NC_001263	ACG	2	6	2462127	2462132	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15807453
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63272	NC_001263	CGC	2	6	2462241	2462246	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15807453
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63281	NC_001263	CGC	2	6	2462486	2462491	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15807453
63282	NC_001263	GCT	2	6	2462534	2462539	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15807453
63283	NC_001263	GGC	2	6	2462600	2462605	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15807453
63284	NC_001263	GC	4	8	2462604	2462611	0 %	0 %	50 %	50 %	15807453
63285	NC_001263	GCC	2	6	2462629	2462634	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
63286	NC_001263	TCG	2	6	2462649	2462654	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
63287	NC_001263	CGCC	2	8	2462683	2462690	0 %	0 %	25 %	75 %	15807454
63288	NC_001263	CGC	2	6	2462707	2462712	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15807454
63289	NC_001263	CGA	2	6	2462728	2462733	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15807454
63290	NC_001263	ATGG	2	8	2462765	2462772	25 %	25 %	50 %	0 %	15807454
63291	NC_001263	CG	3	6	2462777	2462782	0 %	0 %	50 %	50 %	15807454
63292	NC_001263	CGT	2	6	2462842	2462847	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15807454
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63298	NC_001263	CGCCAG	2	12	2463221	2463232	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	15807455
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63300	NC_001263	ACC	2	6	2463294	2463299	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15807455
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63341	NC_001263	GCA	2	6	2464391	2464396	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15807456
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63348	NC_001263	TGG	2	6	2464578	2464583	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15807457
63349	NC_001263	ATG	2	6	2464640	2464645	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15807457
63350	NC_001263	GCT	2	6	2464651	2464656	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15807457
63351	NC_001263	GAT	2	6	2464663	2464668	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15807457
63352	NC_001263	CGA	2	6	2464710	2464715	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15807457
63353	NC_001263	GGC	2	6	2464732	2464737	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15807457
63354	NC_001263	CGCC	2	8	2464796	2464803	0 %	0 %	25 %	75 %	15807457
63355	NC_001263	CAG	2	6	2464807	2464812	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15807457
63356	NC_001263	CGG	2	6	2464821	2464826	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15807457
63357	NC_001263	CGCGC	2	10	2464863	2464872	0 %	0 %	40 %	60 %	15807457
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63361	NC_001263	CGCC	2	8	2465057	2465064	0 %	0 %	25 %	75 %	15807457
63362	NC_001263	CTGC	2	8	2465133	2465140	0 %	25 %	25 %	50 %	15807457
63363	NC_001263	CGTGA	2	10	2465179	2465188	20 %	20 %	40 %	20 %	15807457
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63453	NC_001263	CGT	2	6	2469125	2469130	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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63455	NC_001263	CAC	2	6	2469208	2469213	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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63457	NC_001263	CGC	2	6	2469346	2469351	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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63461	NC_001263	CA	3	6	2469503	2469508	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
63462	NC_001263	TG	3	6	2469532	2469537	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
63463	NC_001263	CCGC	2	8	2469712	2469719	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
63464	NC_001263	GAAG	2	8	2469731	2469738	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
63465	NC_001263	CT	3	6	2469766	2469771	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
63466	NC_001263	CTGC	2	8	2469911	2469918	0 %	25 %	25 %	50 %	15807460
63467	NC_001263	GGT	2	6	2469919	2469924	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15807460
63468	NC_001263	GT	3	6	2469951	2469956	0 %	50 %	50 %	0 %	15807460
63469	NC_001263	GACC	2	8	2469958	2469965	25 %	0 %	25 %	50 %	15807460
63470	NC_001263	CGG	2	6	2469996	2470001	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15807460
63471	NC_001263	GCGG	2	8	2470016	2470023	0 %	0 %	75 %	25 %	15807460
63472	NC_001263	GCG	2	6	2470057	2470062	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15807460
63473	NC_001263	CAA	2	6	2470100	2470105	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15807460
63474	NC_001263	CCTGG	2	10	2470162	2470171	0 %	20 %	40 %	40 %	15807460
63475	NC_001263	CGG	2	6	2470187	2470192	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15807460
63476	NC_001263	CGA	2	6	2470225	2470230	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15807460
63477	NC_001263	GGC	2	6	2470240	2470245	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15807460
63478	NC_001263	GCG	2	6	2470261	2470266	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15807460
63479	NC_001263	CTG	2	6	2470298	2470303	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15807460
63480	NC_001263	GCG	2	6	2470342	2470347	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15807460
63481	NC_001263	GGT	2	6	2470358	2470363	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15807460
63482	NC_001263	GAC	2	6	2470364	2470369	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15807460
63483	NC_001263	CTG	2	6	2470370	2470375	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15807460
63484	NC_001263	G	6	6	2470396	2470401	0 %	0 %	100 %	0 %	15807460
63485	NC_001263	AAG	2	6	2470530	2470535	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15807460
63486	NC_001263	CCG	2	6	2470550	2470555	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15807460
63487	NC_001263	GCCGC	2	10	2470581	2470590	0 %	0 %	40 %	60 %	15807460
63488	NC_001263	CG	3	6	2470614	2470619	0 %	0 %	50 %	50 %	15807460
63489	NC_001263	CCTA	2	8	2470641	2470648	25 %	25 %	0 %	50 %	15807460
63490	NC_001263	CCT	2	6	2470715	2470720	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15807460
63491	NC_001263	GGC	2	6	2470742	2470747	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15807460
63492	NC_001263	CCTG	2	8	2470758	2470765	0 %	25 %	25 %	50 %	15807460
63493	NC_001263	GCC	2	6	2470813	2470818	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15807460
63494	NC_001263	ACG	2	6	2470839	2470844	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15807460
63495	NC_001263	CG	3	6	2470872	2470877	0 %	0 %	50 %	50 %	15807460
63496	NC_001263	GCG	2	6	2470894	2470899	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15807460
63497	NC_001263	AG	3	6	2470959	2470964	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
63498	NC_001263	GTT	2	6	2471011	2471016	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
63499	NC_001263	ACGC	2	8	2471020	2471027	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
63500	NC_001263	GTC	2	6	2471100	2471105	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15807461

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